Colwellia psychrerythraea: CPS_4481
Help
Entry
CPS_4481 CDS
T00258
Name
(RefSeq) sensor histidine kinase/response regulator
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
TPR_12
HisKA
TPR_1
TPR_2
TPR_10
Hpt
TPR_MalT
SNAP
TPR_19
HATPase_c_3
RNPP_C
TPR_16
HATPase_c_2
UPF0154
Vpu
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ28275
UniProt:
Q47VP3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4719688..4722636)
Genome browser
AA seq
982 aa
AA seq
DB search
MSFKYLMMQRLTQIILLFFLLTVASLTTVDKTWAQDSQLTKKLIEINKKADKKAALEALL
NLYKSAELDSGEKAEVSLNQGKVLFTLHQYDQGIDAVNNAIELAHESNHFSLKAQAHKML
GILYYYQGELKSALKAYQASLVYYQTNQADDINNFAIERANLFNNVALVYTYLGESDLAL
VNYQFAESLYTQYGDEADQIDVRYNIASLLISLRRYDSAIDMLKVIIDKRIQLNDSYGIA
SARADIGIAYKHSGQFKLGKENILAALTYFQKHDYTHDIASQLHNMSEIYNDTFDVEQAI
LYAQQALIVSKEVGHQKAYAGSLQSLAKAYFYSGDLVQAEQYIERSIAVGQKIDYQTLLT
ENLSISSLISASQQQFIKALSEHQRYEKSYLITSNNMLNDKLAEFESEQLSQKIVDLEQR
RKLQILQSAKVEQQRNIIILTLILVLVVAFFIYRRYLEKRLTQELELRVKQRTHELEDLT
IELEKANQVKSQFLANMSHEIRTPLTAIVGHAEAIIHDDIDKDKVHEDIEVIHGNSLHLL
ELINDILDLSRIEANKFELEVQPLDLAELIQDLSHTFTSQAQQKQLDFTIEHQLPAPFII
HIDSLRLKQILLNLCANAIKFTESGQVMLSITQQKEELVFTVTDTGIGLSEEHLAQVFEI
FTQADNSISRRFGGSGLGLTLSNQLAKLMLGNIEVTSELGKGSCFCLTLPYQHDTDDSVN
TLTDLPPVECSEIFFSGKILLAEDHDDNRRLIARLLTSLGLEVIVARNGKEAVKLCVEHQ
PDLVLLDIQMPEMDGVEAFKALRALGCNQPIYALTANAMSHEVSQYLGLGFTGHLKKPIE
RKLFIATIAKYFTAHNEKILFTDQKNKSAEHALTANEVVNKVDKSLSQVDLSDLVAEFKA
NLSNDKRDLILYSDNDDIKKISYLAHRLAGAAQMFGFVELNQAAKELETIIKRESMTDKP
AHLLIGELTHCLIDEINLIEQQ
NT seq
2949 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagctttaaatacctgatgatgcaacgcctaacacaaataatattgctatttttttta
ctaacggtggcaagtctgacaacggttgataaaacgtgggcacaggatagccaattaact
aaaaagcttatcgagattaacaaaaaagcagataaaaaggccgcgttagaagcgttatta
aatctctataaatcagcagaactcgattctggtgagaaggctgaagtttcacttaatcaa
ggaaaggtactgtttaccttacatcaatatgaccaaggtatcgatgcagttaataacgcc
atcgaattggcccatgaatctaatcatttcagcttaaaagcacaagcccataagatgcta
ggtatattgtattattatcagggtgaattaaaatcagcactaaaggcttatcaagcatca
ttagtctattatcagacgaaccaagctgatgatataaataattttgcgattgaacgagca
aatttatttaataatgttgcccttgtttatacttatttgggtgaatcagatttagcttta
gtaaattatcaatttgcggagtcactctatacacaatatggcgatgaagctgaccaaata
gacgttagatacaacatagcttcacttctcatcagcttaaggcgttacgatagcgcaatt
gatatgttgaaagtaattattgataagcgtatccagttgaatgatagctatggtattgca
tcagcaagagctgatattggtattgcttataaacattcaggacaattcaagttaggtaag
gaaaatatattagcggctttaacgtactttcaaaaacatgactatacgcatgatatcgct
tcacagttgcataatatgtctgaaatatataatgatacctttgatgttgaacaagccatt
ttatatgctcaacaggcgttaattgttagtaaagaagtagggcatcaaaaagcctatgca
ggaagcttacagagtcttgctaaagcttacttttattctggagatctagtacaagcggaa
caatacattgaacgctcaattgcggtagggcaaaaaattgattatcaaacattacttact
gaaaatttgtcaatttcgtctctgataagtgccagtcaacaacaatttattaaggcactt
tctgaacatcaacgttatgagaaaagttatctaattacctcgaacaatatgctgaatgac
aagttggcagaattcgaatcagagcagcttagtcagaaaatagtcgatttagaacagcgt
agaaaactgcagatattacaatcagccaaagtcgagcagcaacgtaatattattatttta
accctaatattagtgctcgtggtggccttttttatctatcgccgttaccttgaaaagcgc
ttaacacaagagttggagttgcgggtaaaacagcgcacgcatgaacttgaagatttgacc
atagaattagagaaagcgaatcaagttaaaagtcaatttttagctaatatgagtcatgag
attcgcacaccgctaactgccattgttggtcatgcggaagccattatccatgacgatatt
gataaagataaagtacatgaagatattgaagtaatccatggcaatagtttacatttactt
gaactcattaatgatattttggacctaagccgtattgaagcaaataaatttgaactagaa
gtgcagccacttgatttggctgaattaattcaagatttgtcacatacctttacctctcaa
gctcaacaaaaacagttggattttactattgagcatcaattacctgcaccttttattatt
catattgacagtttacggttaaaacaaattttacttaacttatgtgctaacgcgattaaa
ttcactgaaagcggtcaggtaatgctaagtattactcagcaaaaagaagaactcgttttt
acggtaactgataccggcataggcttaagtgaagagcatttagctcaagtctttgaaatt
ttcactcaagcagataatagcatcagcaggcgttttggcggctcaggacttggactgact
ttatcaaaccagctagcaaaattaatgttaggaaatatcgaggtaaccagtgagttaggg
aaggggagttgtttttgtttaacgctaccttatcaacatgatactgacgacagtgtaaat
accttaactgatttaccgcctgttgaatgtagtgaaatattctttagcggaaaaatctta
ttggctgaggatcatgatgataatcgacggttgatagctcgtttattgacgagtttaggt
ctagaagttattgtcgccagaaatggtaaggaagcagtgaaactttgcgttgagcatcaa
cccgatttagtgctcttggatattcaaatgcccgaaatggatggcgttgaagcttttaaa
gccttacgtgctttaggttgtaatcaacctatttatgctttaaccgctaacgccatgtcc
catgaagttagccaatacctagggttaggttttactgggcatttaaagaaacctattgaa
agaaaactctttattgccactattgctaagtacttcactgctcataatgaaaaaatatta
tttactgaccaaaaaaataagtcagcagagcatgctttgacagcaaatgaagttgttaat
aaagtggataaaagcttatcccaagttgacttaagcgatttagtcgctgaatttaaagcc
aacctcagtaacgataagcgagaccttattctctatagcgataatgatgatataaagaaa
atttcttatctcgcacatcgcttagctggggcggcacaaatgtttggctttgtggaactt
aatcaagcagcaaaagagttagagactataattaagagagaatcaatgacagataagcca
gcacacttattaattggtgaattgactcattgtttgattgatgaaattaatttgattgag
caacagtag
DBGET
integrated database retrieval system
