Candidatus Carsonella ruddii PC: A357_0208
Help
Entry
A357_0208 CDS
T02198
Symbol
lysA
Name
(GenBank) diaminopimelate decarboxylase
KO
K01586
diaminopimelate decarboxylase [EC:
4.1.1.20
]
Organism
crv
Candidatus Carsonella ruddii PC
Pathway
crv00300
Lysine biosynthesis
crv00470
D-Amino acid metabolism
crv01100
Metabolic pathways
crv01110
Biosynthesis of secondary metabolites
crv01120
Microbial metabolism in diverse environments
crv01230
Biosynthesis of amino acids
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
crv00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00300 Lysine biosynthesis
A357_0208 (lysA)
09106 Metabolism of other amino acids
00470 D-Amino acid metabolism
A357_0208 (lysA)
Enzymes [BR:
crv01000
]
4. Lyases
4.1 Carbon-carbon lyases
4.1.1 Carboxy-lyases
4.1.1.20 diaminopimelate decarboxylase
A357_0208 (lysA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Orn_Arg_deC_N
Orn_DAP_Arg_deC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFP84404
UniProt:
J3Z2J9
LinkDB
All DBs
Position
155457..156653
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MIETNKNIYINNISIKSIFSKFSLPIYIYDYKKILKNLYLIKKTKIFCFYSIKSNNNKFL
LKLVSKIIKNFDVVSIEEINNIIYINKKKKYIIFSGSGKTISEILISINLNIFSINVESV
QELFKIFFFCNKYKKNINLMIRLNPNIDSLSHDKITTGKINNKFGINISNIKHFLLLINI
MNFNFIGYDFHIGSQISKLSPIKKLFKIIKIINKYKKVNFVDIGGGKSINYYENKICINF
NNYYLSIIKMIKKYNFNFKLIIELGRFFFGNTCIILSKVNYLKFNKILKIAILNVGMNDI
IRPSLYNSYHKIESNNIGYKIKNIFGPICESSDKYNNINSFKINNNNLVIIYSCGSYCKV
MSSNYNSKKKIFDIIIYKNKIKIIFKKEKFNNLINNYV
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaactaataaaaatatttatataaataatattagcattaaaagtatattttca
aaattttctttgccaatatatatatatgattataaaaaaatattaaaaaatttatattta
attaaaaaaacaaaaattttttgtttttattctattaaatcaaataataataagttttta
ttaaaattagtaagcaaaattataaaaaattttgatgttgtatcaattgaagaaattaat
aatataatttatataaataaaaaaaaaaaatatataatattttctggaagtggtaaaacc
atatctgaaattttaatttcaataaatttaaatatttttagtattaatgttgaatcagta
caagaattatttaaaattttttttttttgcaataaatataaaaaaaacataaatttaatg
ataagactaaatccaaatattgattcattgtctcatgataaaatcacaactggtaaaatt
aataataaatttggaattaatatttctaatattaaacattttttattgttaataaatatt
atgaattttaattttattggatatgattttcatattggatcacaaataagtaaattatca
ccaattaaaaaattgtttaaaataataaaaattataaataaatataaaaaagttaatttt
gtagatattggtggaggaaaaagtattaattattatgaaaataaaatttgtataaatttt
aataattattatttgtcaataattaagatgattaaaaaatataattttaactttaaatta
attatagaattaggaagatttttttttggaaatacttgtatcattttatctaaagttaat
tatttaaaatttaataaaattttaaaaatagcaattttaaacgtaggaatgaatgatatt
atcagaccatctttatataattcgtatcataaaattgaaagtaataatattggatataaa
attaaaaatatatttggtccaatatgtgaatcaagtgataaatataataatattaatagt
tttaaaattaataataataacttagtcattatttattcatgtggaagttattgtaaagtt
atgagttctaattacaatagtaaaaaaaaaatttttgatattattatatacaaaaataaa
ataaaaataatttttaaaaaagaaaaatttaataatttaattaacaattatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system