Cylindrospermum stagnale: Cylst_3235
Help
Entry
Cylst_3235 CDS
T02398
Name
(GenBank) putative low-complexity protein
Organism
csg
Cylindrospermum stagnale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pentapeptide
TPR_1
TPR_2
TPR_11
Pentapeptide_4
TPR_17
TPR_16
Pentapeptide_3
TPR_8
TPR_9
TPR_12
TPR_6
TPR_14
TPR_19
ANAPC3
MukF_M
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ25398
UniProt:
K9WYW2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3704683..3706413)
Genome browser
AA seq
576 aa
AA seq
DB search
MTKEMKLANTQQRGLKKFFAAITLLTPLMMAVPVYAEKPEQVKQLLDTNKCPKCDLSRAN
LRRRNLIRADLYQANLSSADLEGADLSGADLRNTDLSSAKLFRANLFRVDLGSANLSGAD
LSGVNLSGADLRNANLSSTNLSNADLNGVNLSGVNFSNANLRGVRLDNVNLRGVNLNGVD
LSDVDLRNFNFNGVSFNGVNLSRANLNGFNLRGVELRNGNLSYANLQNADLSNAQLNGAN
LQGANLYSADLRGADLIGSNLSGASLGNADLRGANLDASSLPDNIRADAGDYSKWGDNQY
SKREYKSAIAYYNQAIALNPQDTQGYTSRGLAFSQLKDYQAALADFNRAIEIDPNYAKAY
NSRGLTRIEQQDYQNALVDFEQAIRLNPNYAEAYNGRATIRRIQKDYAAVIVDASLAIRI
NSKFGAAYNNRGLARFAQQDYQGAIKDYDSAIGNSSNWAWAYFNRGLAKYTIGEYKDATG
DYDRAIDIDQNYVDAYYQRSLARFARKKYEDAIKDCDRVIQKDPNYGEAYENQGNSFLAL
KKKPEAKQAFEQAARIYSQKQHNTSLQRVQQIITGL
NT seq
1731 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaagagatgaaacttgctaatacccagcaaagaggtttgaaaaagttcttcgct
gctattactttattgacacccctgatgatggcggttccggtttatgctgaaaaacctgaa
caggtcaaacagttgctggacacgaataaatgtcccaaatgtgacttaagccgtgcaaac
ctgaggcgcagaaatttaattcgcgctgatctctatcaggctaacctcagtagtgcagac
ttggagggtgcagacttaagcggtgcagacttgagaaatactgatttaagtagcgccaag
ctgtttcgtgctaacctgtttcgtgttgacttggggagtgctaacctcagtggtgctgat
ttgagcggggtaaatttgagtggtgcagacttgagaaatgccaacttaagtagtacaaat
ttaagcaatgctgacctgaatggtgtaaacctcagtggtgttaatttcagtaatgccaat
ctcaggggcgtgcgactcgataatgttaacctcagaggagtgaacctgaatggtgtagac
ctgagtgatgtagacctgaggaattttaactttaacggtgtctcattcaatggtgtcaac
ctcagtagagcaaatttgaatggttttaatttgcggggtgtagaactgaggaatgggaat
cttagttatgccaatttgcaaaatgctgacttaagtaatgcccaacttaatggtgctaac
ttgcaaggtgctaatctctatagtgctgacttgcggggtgctgatttgattggtagcaat
ctcagtggtgctagcttggggaatgctgatttgcggggcgctaacctagatgcaagtagt
ttacctgacaatattcgtgctgatgctggtgattacagcaaatggggagataatcagtat
agcaaacgtgaatacaagagtgcgatcgcctattacaatcaagcgatcgcacttaatccc
caagatacccaaggttatactagtcgcggtcttgcttttagccaattaaaagattatcaa
gccgcattagccgatttcaaccgagcaatcgaaattgaccctaactatgccaaagcgtac
aacagtcggggtttgacgcggattgagcaacaagattatcaaaacgcgttagttgatttt
gagcaagcaattcgccttaaccctaactacgctgaagcttacaacggtagggccacaatt
cgccgtatccaaaaagactatgcagcagtgattgttgatgcatccctggcgattagaatc
aattctaaattcggggcagcatataataacagaggtttagctagatttgcccagcaagat
tatcagggtgcgattaaagattatgactcagctattggtaattctagcaactgggcttgg
gcatattttaaccgagggcttgccaaatatacgattggtgaatataaagacgccactgga
gattatgacagggcgattgacatagatcaaaactatgttgacgcttactatcagcgcagt
ttagctcgctttgcccgcaagaaatatgaagatgcgattaaagattgcgatcgcgtaatt
caaaaagatccaaattatggagaagcttacgaaaatcagggtaattcttttttggctttg
aaaaagaaaccagaagcaaagcaggcttttgagcaagctgcgagaatctattcgcaaaaa
cagcataatactagtctgcaacgagtgcagcaaattatcactgggctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
