KEGG   Clostridium saccharoperbutylacetonicum: Cspa_c19820
Entry
Cspa_c19820       CDS       T02467                                 
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
csr  Clostridium saccharoperbutylacetonicum
Pathway
csr04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:csr00001]
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    Cspa_c19820
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:csr00536]
    Cspa_c19820
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:csr00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   Cspa_c19820
SSDB
Motif
Pfam: Collagen Disaggr_repeat TGFb_propeptide
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGF55748
UniProt: M1MHH8
LinkDB
Position
complement(2188938..2192225)
AA seq 1095 aa
MPIVLLSPTDDAYISQLNPNTNFGLSSFLFTGRFVQPNDVFRSLLKFDLSGVIPPGNTLL
NASLNLFVYRKDLPDAVLSPQNVSVFTNASDFSENTVTWNNAPALNATSDFTTVTDADVG
TFIRINITDIVAQWVNNIIPNNGITLVGIENIIDTIIGYFSDEWTVTTQRPFLNIEFIPS
GATGTTGATGATGATGATGATGVTGTTGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGSTGATGAT
GATGTTGATGATGTTGATGVTGATGVTGATGSTGSTGVTGATGDTGATGATGVTGATGVT
GSTGSTGVTGATGDTGATGATGVTGATGVTGSTGVTGSTGVTGATGVTGSTGATGATGAT
GATGTTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGSTGATGVTGATGDTGATGATGTTGATGVTGAT
GVTGATGTTGATGVTGVTGATGVTGATGDTGTTGATGATGVTGATGDTGATGVTGATGVT
GATGVTGATGVTGATGATGTTGATGATGATGITGTTGATGATGATGVTGATGVTGATGVT
GSTGATGATGATGVTGSTGVTGSTGVTGATGVTGSTGATGATGATGTTGATGATGTTGAT
GVTGATGVTGATGVTGVTGSTGATGVTGATGDTGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGVTGATGATGATGATGVTGATGVTGATGATGATGATGVTGATGDTGVTGATGVT
GATGDTGATGATGATGATGATGATGVTGSTGSTGATGSTGATGVTGATGATGATGATGVT
GATGVTGATGATGATGVTGATGDTGVTGATGVTGATGATGVTGATGTTGATGVTGATGVT
GSTGATGVTGATGDTGTTGATGATGVTGATGATGVTGATGVTGATGITGTTGATGATGAT
GVTGATGVTGTTGATGATGVTGATGATGVTGATGVTGTTGATGATGATGATGTTGATGAT
GITGAPQLFFNEISGSITVFPPLNTEITVASETVTATIGQNIKIDSVVAVETITTANSDQ
TFEVRLYANGTLINSRITQRSIASAGTQRFQIPNTYVDTATVTGPIVYQLRVIFTVANNV
TSGTAVNRSINSITF
NT seq 3288 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcccattgtacttcttagtcctaccgatgatgcgtatatatcgcagctaaatcctaat
acaaactttggtttatcaagttttttgtttacaggaagatttgttcagccaaacgatgtg
tttagaagtttattaaagtttgatttatctggtgtcattcccccaggaaacactctatta
aatgcctcactaaatttatttgtttatagaaaagatctaccagatgcagtgttatcacca
caaaatgttagtgtatttacaaatgcaagtgacttttctgagaacactgttacctggaat
aatgcacctgcattgaatgcaacttctgattttacaactgttacagatgcagatgttggt
acttttattagaattaatataaccgatatagtagctcagtgggtcaataacatcatacca
aacaatggtattacgttagttggaatagaaaatataattgacactataataggttatttt
tcagatgaatggacggttacaacacaaaggccattcttaaatatagaatttattccaagc
ggtgctactggaactacaggtgctactggcgctaccggagctactggtgctacaggagct
actggtgttactggtactactggcgtaactggtgctacaggagttactggtgttaccggt
gctactggtgttaccggtgctactggcgttactggttctactggagctactggcgctacc
ggagctactggtactaccggagctactggtgctactggaactactggtgctaccggagtt
accggtgctactggtgtcactggtgctactggttctactggttctactggcgttaccggt
gctactggagacacaggtgctactggtgctaccggagttactggcgctactggtgttact
ggttctactggttctactggcgttaccggtgctactggtgacactggtgctactggtgct
actggcgttactggtgctaccggagttactggttctactggcgttaccggttctactggc
gttaccggtgctactggcgttactggttctactggcgctactggcgctaccggagctact
ggtgctactggaactactggtgctaccggagttaccggtgctactggcgtcactggtgct
actggcgtaactggtgttactggttctactggtgctactggcgttaccggtgctactgga
gacacaggtgctactggtgctaccggtactaccggtgctactggcgttactggagctacc
ggagttactggtgctaccggtactaccggtgctactggcgttactggagttactggtgct
actggcgttaccggtgctactggagacactggtactaccggagctactggtgctactggc
gttaccggtgctactggagacacaggtgctactggcgttactggtgctactggtgttacc
ggagctactggcgttactggtgctactggcgttaccggtgctactggcgctaccggaact
actggtgctacaggtgccaccggagctactggtattactggaactactggtgctacaggt
gctactggagctactggcgttactggtgctaccggagttactggtgctaccggagttact
ggttctactggagctactggagctactggtgctaccggagttactggttctactggcgtt
accggttctactggcgttaccggtgctactggcgttactggttctactggagctactggc
gctaccggagctactggtactaccggagctactggtgctactggaactactggtgctacc
ggagttaccggtgctactggcgtcactggtgctactggcgtcactggtgttactggttct
actggtgctactggcgttaccggtgctactggagacacaggtgctactggagctactggc
gctactggtgctactggcgccaccggagctactggtgctactggcgccaccggagctact
ggtgctaccggcgctactggcgtaaccggtgctactggagctactggtgctaccggtgct
actggtgttactggtgctactggcgtaaccggagctactggtgctactggtgctactgga
gctactggtgtaaccggtgctactggtgacactggcgttaccggtgctactggcgttact
ggtgctactggagacactggcgctactggtgctactggcgctactggtgctactggcgcc
accggtgctaccggagttactggttctactggttctactggtgctactggttctaccggc
gctactggcgtaaccggtgctactggagctactggtgctaccggtgctactggtgttact
ggtgctactggcgtaaccggagctactggtgctactggagctactggtgtaaccggtgct
actggtgacactggcgttaccggtgctactggcgttaccggtgctactggagctaccgga
gttactggtgctaccggtactaccggtgctactggcgttactggagctaccggagttact
ggttctactggtgctactggcgttaccggtgctactggagacactggtactaccggagct
actggtgctactggcgttactggtgctacaggtgctactggtgttaccggagctactggc
gttaccggtgctactggtattactggaactactggtgctacaggtgctactggagctact
ggcgttactggtgctaccggagttactggtactactggcgctaccggagctactggtgtt
accggagctactggtgctactggcgttactggtgctactggtgttaccggaactactggt
gctactggtgccaccggagctactggtgctactggaactactggcgctactggtgctact
ggcataactggtgctcctcaattattctttaatgagatttctggctcaattacagtattt
cctcctcttaacactgagataacagtagcatctgaaactgtaactgcaacaattggacaa
aatattaaaatcgattctgttgttgctgtggaaactataactacagcaaactctgatcaa
acttttgaagtaaggttatacgccaacggcactttaattaattcaagaataacccaaaga
tctattgcttcagctggaactcaacgttttcaaatccctaacacttacgttgatacagca
acagtaactggtcctattgtttatcaacttcgagttatctttactgtagcaaataacgtt
acttctggaactgccgttaatagaagtattaattctataactttctaa

DBGET integrated database retrieval system