Chlamydia trachomatis L2b/Canada1: L2BCAN1_00936
Help
Entry
L2BCAN1_00936 CDS
T02567
Name
(GenBank) chlamydial polymorphic outer membrane protein repeat
Organism
ctlc
Chlamydia trachomatis L2b/Canada1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ChlamPMP_M
Autotransporter
Chlam_PMP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCP92773
LinkDB
All DBs
Position
1028456..1031497
Genome browser
AA seq
1013 aa
AA seq
DB search
MQTSFHKFFLSMILAYSCCSLNGGGYAAEIMVPQGIYDGETLTVSFPYTVIGDPSGTTVF
SAGELTLKNLDNSIAALPLSCFGNLLGSFTVLGRGHSLTFENIRTSTNGAALSNSAADGL
FTIEGFKELSFSNCNSLLAVLPAATTNKGSQTPTTTSTPSNGTIYSKTDLLLLNNEKFSF
YSNLVSGDGGAIDAKSLTVQGISKLCVFQENTAQADGGACQVVTSFSAMANEAPIAFVAN
VAGVRGGGIAAVQDGQQGVSSSTSTEDPVVSFSRNTAVEFDGNVARVGGGIYSYGNVAFL
NNGKTLFLNNVASPVYIAAKQPTNGQASNTSNNYGDGGAIFCKNGAQAAGSNNSGSVSFD
GEGVVFFSSNVAAGKGGAIYAKKLSVANCGPVQFLRNIANDGGAIYLGESGELSLSADYG
DIIFDGNLKRTAKENAADVNGVTVSSQAISMGSGGKITTLRAKAGHQILFNDPIEMANGN
NQPAQSSKLLKINDGEGYTGDIVFANGSSTLYQNVTIEQGRIVLREKAKLSVNSLSQTGG
SLYMEAGSTLDFVTPQPPQQPPAANQLITLSNLHLSLSSLLANNAVTNPPTNPPAQDSHP
AVIGSTTAGSVTISGPIFFEDLDDTAYDRYDWLGSNQKINVLKLQLGTKPPANAPSDLTL
GNEMPKYGYQGSWKLAWDPNTANNGPYTLKATWTKTGYNPGPERVASLVPNSLWGSILDI
RSAHSAIQASVDGRSYCRGLWVSGVSNFFYHDRDALGQGYRYISGGYSLGANSYFGSSMF
GLAFTEVFGRSKDYVVCRSNHHACIGSVYLSTQQALCGSYLFGDAFIRASYGFGNQHMKT
SYTFAEESDVRWDNNCLAGEIGAGLPIVITPSKLYLNELRPFVQAEFSYADHESFTEEGD
QARAFKSGHLLNLSVPVGVKFDRCSSTHPNKYSFMAAYICDAYRTISGTETTLLSHQETW
TTDAFHLARHGVVVRGSMYASLTSNIEVYGHGRYEYRDASRGYGLSAGSRVRF
NT seq
3042 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacgtctttccataagttctttctttcaatgattctagcttattcttgctgctct
ttaaatggggggggatatgcagcagaaatcatggttcctcaaggaatttacgatggggag
acgttaactgtatcatttccctatactgttataggagatccgagtgggactactgttttt
tctgcaggagagttaacattaaaaaatcttgacaattctattgcagctttgcctttaagt
tgttttgggaacttattagggagttttactgttttagggagaggacactcgttgactttc
gagaacatacggacttctacaaatggggcagctctaagtaatagcgctgctgatggactg
tttactattgagggttttaaagaattatccttttccaattgcaattcattacttgccgta
ctgcctgctgcaacgactaataagggtagccagactccgacgacaacatctacaccgtct
aatggtactatttattctaaaacagatcttttgttactcaataatgagaagttctcattc
tatagtaatttagtctctggagatgggggagctatagatgctaagagcttaacggttcaa
ggaattagcaagctttgtgtcttccaagaaaatactgctcaagctgatgggggagcttgt
caagtagtcaccagtttctctgctatggctaacgaggctcctattgcctttgtagcgaat
gttgcaggagtaagagggggagggattgctgctgttcaggatgggcagcagggagtgtca
tcatctacttcaacagaagatccagtagtaagtttttccagaaatactgcggtagagttt
gatgggaacgtagcccgagtaggaggagggatttactcctacgggaacgttgctttcctg
aataatggaaaaaccttgtttctcaacaatgttgcttctcctgtttacattgctgctaag
caaccaacaaatggacaggcttctaatacgagtaataattacggagatggaggagctatc
ttctgtaagaatggtgcgcaagcagcaggatccaataactctggatcagtttcctttgat
ggagagggagtagttttctttagtagcaatgtagctgctgggaaagggggagctatttat
gccaaaaagctctcggttgctaactgtggccctgtacaatttttaaggaatatcgctaat
gatggtggagcgatttatttaggagaatctggagagctcagtttatctgctgattatgga
gatattattttcgatgggaatcttaaaagaacagccaaagagaatgctgccgatgttaat
ggcgtaactgtgtcctcacaagccatttcgatgggatcgggagggaaaataacgacatta
agagctaaagcagggcatcagattctctttaatgatcccatcgagatggcaaacggaaat
aaccagccagcgcagtcttccaaacttctaaaaattaacgatggtgaaggatacacaggg
gatattgtttttgctaatggaagcagtactttgtaccaaaatgttacgatagagcaagga
aggattgttcttcgtgaaaaggcaaaattatcagtgaattctctaagtcagacaggtggg
agtctgtatatggaagctgggagtacattggattttgtaactccacaaccaccacaacag
cctcctgccgctaatcagttgatcacgctttccaatctgcatttgtctctttcttctttg
ttagcaaacaatgcagttacgaatcctcctaccaatcctccagcgcaagattctcatcct
gcagtcattggtagcacaactgctggttctgttacaattagtgggcctatcttttttgag
gatttggatgatacagcttatgataggtatgattggctaggttctaatcaaaaaatcaat
gtcctgaaattacagttagggactaagcccccagctaatgccccatcagatttgactcta
gggaatgagatgcctaagtatggctatcaaggaagctggaagcttgcgtgggatcctaat
acagcaaataatggtccttatactctgaaagctacatggactaaaactgggtataatcct
gggcctgagcgagtagcttctttggttccaaatagtttatggggatccattttagatata
cgatctgcgcattcagcaattcaagcaagtgtggatgggcgctcttattgtcgaggatta
tgggtttctggagtttcgaatttcttctatcatgaccgcgatgctttaggtcagggatat
cggtatattagtgggggttattccttaggagcaaactcctactttggatcatcgatgttt
ggtctagcatttaccgaagtatttggtagatctaaagattatgtagtgtgtcgttccaat
catcatgcttgcataggatccgtttatctatctacccaacaagctttatgtggatcctat
ttgttcggagatgcgtttatccgtgctagctacgggtttgggaatcagcatatgaaaacc
tcatatacatttgcagaggagagcgatgttcgttgggataataactgtctggctggagag
attggagcgggattaccgattgtgattactccatctaagctctatttgaatgagttgcgt
cctttcgtgcaagctgagttttcttatgccgatcatgaatcttttacagaggaaggcgat
caagctcgggcattcaagagcggacatctcctaaatctatcagttcctgttggagtgaag
tttgatcgatgttctagtacacatcctaataaatatagctttatggcggcttatatctgt
gatgcttatcgcaccatctctggtactgagacaacgctcctatcccatcaagagacatgg
acaacagatgcctttcatttagcaagacatggagttgtggttagaggatctatgtatgct
tctctaacaagtaatatagaagtatatggccatggaagatatgagtatcgagatgcttct
cgaggctatggtttgagtgcaggaagtagagtccggttctaa
DBGET
integrated database retrieval system