Rippkaea orientalis PCC 8801: PCC8801_3109
Help
Entry
PCC8801_3109 CDS
T00806
Name
(GenBank) DNA polymerase I
Organism
cyp
Rippkaea orientalis PCC 8801
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
DNA_pol_A_exo1
5_3_exonuc
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACK67090
UniProt:
B7JXA2
LinkDB
All DBs
Position
3250004..3252922
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MQTQQSLPLLILIDGHSLAFRSYYAFAKARKGPLRTSKGIPTSVCFGFLNSLMQVIESQK
PEYLAIAFDRSEPTFRHEADENYKADREETPEDFIIDMANLQELLEALNLTIVTFPGYEA
DDVLGTLANQGSESGYQVKIVSGDRDLFQLVDEAKNISVLYLERNAVKGSSEGYTEFNSE
AVEAKLGIKPVQVVDYKALCGDKSDSIPGIDGIGEKTAVKLLKEYGTIQEVYNNLDKIKG
TLNKKLKDGVKEAEHSQYLAKIVVDVPVDIDFKNCQLKGFNLSILEPLLQKLELNKFLKQ
INHLQQKFGGEVKPVDQATSQPLDHPQQLSLFPEQNLPAHSVEPLVIKTIPEVSPITPKI
ITTLDDLNHLINKLEQYTDVEYPVAWDTETTSLEPRNAELVGIGCCWGEKSTDIAYIPTG
HNKGNQLKKEAVLQALKPILESDRYPKVFQNTKFDRLIFYHQGINLKGVVFDTLLASYVL
HPEMSHNLSDLCYRYLSGITSQSYKELAIPKGKTIASLDIETVANYCGLDAYATFLLVSK
LKQELKSFPSLEKLLLEVEQPLEPVLAAMEDIGIRIDTDYLQQLSQQLEQDLHIIEQQAY
QEAGEIFNLGSPKQLGEILFEKLELNRKKSRKTKTGYSTDHATLEKLQGDHPIIDHILDY
RTLSKLKSTYVDALPALVRPDTQRVHTNFNQTVTATGRLSSSNPNLQNIPIRTEFSRKIR
QAFIPQENWLLVSADYSQIELRILAHLSQEVVLLEAYRNNQDVHSVTAKLLFDKETITPQ
ERNLGKTINFGVIYGMGAQRFAREAGVSAAEGKTFINKYRQRYAKVFDYLERMKKEAIAD
GFVTTILGRRRYFNFITESLQKLKGSDPEKINLEVLNINYADAQLLRAAANAPIQGSSAD
IIKIAMIKMQEILSHYQARLLLQVHDELVFEIPLNEWEELQTKIKETMENAVTLTVPLVV
EIHSGNNWMEAK
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacgcagcaatccttaccgcttttaatcttaattgatgggcattccttagccttt
cgctcttattatgcctttgctaaagcgagaaaaggtcctttgcgtacttctaaaggtatt
ccgacgagtgtttgttttgggttccttaattcattgatgcaagtgattgagtctcagaaa
cctgaatatttagccattgcttttgatcgttctgaaccaacttttcgtcatgaagctgat
gaaaattataaagctgatagggaggaaacccctgaagattttattatcgatatggctaat
cttcaagagttattagaagcgttaaatttaaccattgttactttccccggatatgaagca
gatgatgtattaggaacccttgctaaccaaggaagtgagtcaggatatcaagtaaaaatt
gtcagtggcgatcgcgatctgtttcaattagttgatgaagctaaaaatattagtgtttta
tatttagaaagaaatgcggttaaaggttcatcggaaggctatacagaatttaactccgag
gcagtggaagcaaaattaggtattaaacccgttcaagttgttgattataaagcactttgt
ggcgataagtctgatagtattccagggattgatggaattggtgaaaaaaccgcagtgaaa
ttattaaaagaatacggtactattcaagaagtttataacaatttagacaaaatcaaagga
acactaaacaagaaattaaaagacggagtaaaagaagcagaacattctcaatatttggct
aaaattgtcgttgatgttcctgtggatattgactttaaaaactgtcaattaaaaggattt
aatttatctatactcgaaccgcttttacaaaagctagaattaaataagtttttaaaacaa
attaatcacttacaacaaaaatttgggggagaagttaaacccgttgatcaagcaacttct
caaccgttagatcaccctcagcaactgtctctatttccagagcaaaatttacccgctcat
tctgttgaacccttagtgattaaaactatcccagaagtctctcctataactcctaaaatt
attacgacgttagatgacttaaatcacttaattaacaagctagaacaatatactgatgtt
gaatatcctgttgcatgggatacggagacaacatccttagaaccgaggaatgcagagtta
gtcggaattggctgttgttggggagagaaatccactgatattgcctatattcccacggga
cataacaaagggaatcaactcaaaaaagaagccgtattacaagcattaaaacctatttta
gaaagcgatcgctatcccaaagtattccagaatactaagtttgatcgcttgattttttat
catcaaggaattaacctaaaaggagtcgtctttgacactttattagcgagttatgttttg
catcctgaaatgagtcataatctcagtgatttatgttatcgctatttatcaggaattacc
tcgcaaagctacaaagaattagctatcccaaaaggtaaaactattgccagtttagacatt
gaaactgttgctaattactgcggactcgatgcttatgcgacgtttttattagtcagtaag
ttaaaacaagaattaaaatcctttcctagtttagaaaaattgctgctagaagtagaacaa
cccctagaacctgtactagcagcaatggaagatatcgggattcgtatcgataccgactat
ttacaacaattatctcaacaattagaacaagatttacatattattgaacaacaagcgtat
caagaagcaggagaaatctttaacctaggttctcccaaacaactcggagaaatcttattt
gaaaaactcgaattgaaccgtaaaaagtctcgcaaaacaaaaaccgggtattctactgat
cacgctaccctagaaaagttacaaggagatcatccaattattgatcatattttagactat
cgtactttatcgaaattaaaatcaacttatgtcgatgctttacctgccttagttcgtcct
gatactcaacgagttcacaccaattttaatcaaacagtaaccgcaaccggaagattatct
tcttctaaccctaacctacaaaatatcccgattcggacagaattttcccgtaaaattcgg
caagcatttattccccaagaaaattggttattggtgtcagcagactattctcaaattgaa
ctcagaattttagcgcatttaagtcaagaagttgtcttattagaagcctatcgaaataat
caagatgtccatagtgtgacagctaaattattatttgataaagaaacaattactccacaa
gaaagaaatttaggtaaaacgattaactttggtgttatctatggaatgggtgctcaaaga
tttgccagagaagcaggagtaagcgcagcagaaggaaagacatttattaataaatatcgt
cagcgatatgctaaagtatttgactatttagaaaggatgaaaaaagaagcgatcgctgat
ggattcgtcacaacgattttaggaagaagacgctattttaattttatcaccgagagttta
caaaagctcaaaggatctgatcctgaaaagattaacttagaagtcttaaatattaattat
gccgatgctcaattattacgcgctgctgctaatgcacccatccaaggatcaagtgccgat
attattaaaatagctatgattaaaatgcaagaaattttaagtcattatcaagctagatta
ctgctacaagttcatgatgaattagtgtttgaaattcctctcaatgaatgggaagaatta
caaacaaaaatcaaagaaactatggagaatgctgttaccttaaccgttcctttagtggtt
gaaattcattcaggtaacaattggatggaagctaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
