Daucus carota (carrot): 108224292
Help
Entry
108224292 CDS
T05350
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g20770
Organism
dcr
Daucus carota (carrot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
TPR_19
TPR_17
SVA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108224292
NCBI-ProteinID:
XP_017254315
LinkDB
All DBs
Position
6:18291855..18296936
Genome browser
AA seq
785 aa
AA seq
DB search
MMSKSTTYIANLLKTCIDKKSHISGKLIHAHILRLGLYDDTFLSNRLIELYNKCCQINTA
RHLFDQMPHKNIYSCNAMLSAYCKSSKLEDAYLLFDEMPERNEVSWNTLISALVRNGMAE
KAVGVYRGMKWEGFVPTHFTLASVVSACGMMGDVKCGRGEHCVAIKIGLDENVYVGNALL
SMYAKCGCIGDAVKAFEDLVEPNEVSFTAMMGVLAETDQVEEALKMFRLMYRIGISVDSI
SLSCVLGVFSRSGIGNTTGLLGNAHGRLIHGLIIRLGFEKDLHLGNSLLDMYAKTRDMES
AEAVFNSLPQVSNVSWNVMIGGYGQDYQIGKALDYMQMMKEYGFEADEVTHVNMLAACIK
SGNVETARKIFSNMACPSLVSWNAMLSGYFQDEKFKEAIKLFREMQFRNVQADRTTLAII
LNSCAVLGLFEWGKAVHCTCIKGLNHTDIYVGSGLIGLYSKCNQADVAKSIFDRMPGRDI
VCWNSMIAGLSLNSLDKEAFNLFKQMMGKGLYPTQFSYATILSSCAKSSSVPQGRQVHTQ
IVKDGVVNDVYVGSALIDMYSKCGEVHEARVFFDTMPFKNTITWNEMIHGYAQNGCGDKA
IDLYNEMIQSGEKLDGITFLAVLTACSHSGLVDHGIAIFNSMQSEHGVEPLSDHYTCMID
TLGRAGRFHEIEVLVDKMPCKDDPIVWEVLLSSCRFHDNVTLARRAADALFSLDPKNSAP
YVLLANMYSSLGRWDEVKYVRDMMSKKSIVKNPGYSWLEHKNEKQHMVNHYSYMEMPDSE
AVCIL
NT seq
2358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgagcaaaagcacaacctacatagcgaatctcttaaagacttgcattgacaaaaaa
tcacacatttcaggcaagctcatccacgcccacattctccgtcttggtctctatgacgac
actttcctctccaaccgtctcatagagctctacaacaaatgttgccaaatcaacactgcg
cgccacctgtttgatcaaatgccgcataagaatatttattcttgtaatgccatgttgagt
gcttattgcaagtctagtaagttagaggatgcttatttgttgtttgatgaaatgcctgag
aggaatgaggtgtcgtggaacacgttgatcagtgctctggttcgaaatgggatggcggag
aaagcggtgggtgtttatcgcgggatgaaatgggagggttttgtgccgacccattttacg
ctggcgagtgttgtgagtgcgtgtgggatgatgggggatgttaagtgtgggagaggggag
cattgtgttgcgattaagattggattggatgagaatgtgtatgtgggcaatgctttgttg
agtatgtatgctaagtgtgggtgtattggtgatgctgttaaggcttttgaggatttggtt
gaacctaatgaggtgtcttttacggctatgatgggggttttagcagagacggatcaagtc
gaagaggcattgaaaatgttcagattaatgtataggattggtattagtgtggactctatc
tcattatcttgtgttttgggggttttttcaagaagtgggattggtaacacaacgggatta
ttgggtaacgctcatggtcggcttatacatgggctcataattagacttggttttgagaaa
gaccttcacttgggtaattctctacttgatatgtatgctaagacacgagatatggagagt
gctgaagccgtgttcaattctttgcctcaagttagtaatgtttcatggaatgtcatgata
ggtgggtatggtcaggattatcaaattggtaaggcgttagattatatgcagatgatgaaa
gaatatggttttgaagctgatgaagtcactcacgtcaatatgcttgcagcatgtatcaag
tcggggaatgtcgaaactgcgcgtaaaatatttagtaacatggcatgtccaagcttagtt
tcatggaatgcaatgctctcagggtattttcaagatgaaaaattcaaagaggctatcaag
ctcttcagggaaatgcagtttaggaatgtccaagctgatcgaactactttggctatcatc
ctcaattcatgtgctgttttggggcttttcgaatgggggaaagcagttcattgtacctgc
atcaagggtctgaatcacactgatatttatgttggcagtgggcttattggcctttattca
aaatgcaatcaggcagatgttgcaaaatctatatttgataggatgccaggcagagatatt
gtctgttggaattctatgatagctggattatcactgaattcgcttgataaggaagcattc
aatctttttaaacaaatgatgggaaaagggttgtatcctactcaattttcttatgctacc
atcttgagtagttgtgccaaatcatcatctgttccccagggaagacaagtacatacacag
atagtcaaagatggagttgttaatgatgtatatgtaggaagtgctctgattgacatgtac
tctaaatgtggtgaagttcatgaagccagagtattctttgatacaatgcccttcaaaaac
actatcacatggaacgaaatgatacatgggtatgctcagaatggatgcggcgacaaggct
attgatctctataatgaaatgattcaatctggtgaaaaactggatggaataacatttctt
gccgttttaactgcttgtagccattcaggactggttgatcatggaatcgcaatattcaac
tcaatgcagtcagagcatggagtagagcctctttctgatcattatacttgtatgatagat
actctgggccgtgctggtcggttccatgaaattgaggtattagtggataagatgccgtgc
aaagatgatcccattgtgtgggaagttttgcttagttcttgtaggttccatgataatgtg
accttggcaagaagagcagcagatgcacttttttctttggacccgaaaaattctgcccct
tatgttcttttggccaatatgtattcttcattaggaagatgggatgaagtgaaatatgtg
agagatatgatgagtaagaagagcattgtcaagaatccaggttatagctggcttgaacat
aagaatgagaagcaacacatggttaatcattacagctatatggagatgcctgactcagaa
gcagtctgtattctgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
