Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0271000
Help
Entry
DDB_G0271000 CDS
T00245
Symbol
pks3
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
NAD_binding_4
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
PS-DH
PP-binding
Thiolase_N
PKS_DH_N
adh_short
ADH_N
Methyltransf_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617404
NCBI-ProteinID:
XP_646445
dictyBase:
DDB_G0271000
UniProt:
Q55CN6
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3963577..3972340)
Genome browser
AA seq
2837 aa
AA seq
DB search
MNVSAYLPTCLPTYLPTCLPTYLPTYLPTYLPICLSEENNGIGIIGIGFRLPGGGSGKSL
GNPSELWKELVNGYDGIIETNERWSDNFNKLGEINNRYGGLLPMDEVKSFDPLFFGISPP
EATAIDPQQRLLLKCTWEAIEDAMIDPINLRGSNTSVFIGNTTHEYRDLNRTIDSIQTNI
FSSSSHSSSNRVSNIFDFHGPSITIDTACSSSSNAVVLGCKSIIEGNSKMSIVGGTSLIF
DANTPKSFSYMNMLSKDGRCKSFDANADGYVKSECIGVLLLKDLNQAIIDGDRVYCVIKG
TSSNVDGNGYSDKSNFYSPSAQSQAENIKMALSSGNINAKDVDYVEAHGTGTPVGDPIEV
EGISSIFKDNHSKENPLLIGSFKSMIGHCEASSGIASLVKCCLMFKNRYFIPNLHFKTPN
PLIKFNEWNLKVVVEPTPFPKKEITMAVNNFGVTGSNVCIILKDFNYNHNSSSDNNNTIN
LKQQQHQNNIEYLIPFSANSTKSLEQYQSLISNFNQETMEFNDFVKEQIMSKSNSLYQRS
VILGSNWNDFKDNLISTNNNIKTIKTTSSNISIKSKNPIIIMVFCGQGSQYNTMALELYK
NEPIFRKTMDMLDNKLSKYYGFSILEKLRSIPVDDMKSIHNPALAQPAICMVQISLFELY
KHWGIKPTFIVGHSLGEVTAAYCSGMIDLETECYLIYHRSIAQSTTTGCGRMLSINISPE
KFIEQFSSRYPDVEISCYNSPTSIVIGGKEDQLNKISEELKSKGEFTSMLGSLSSFHTSS
QKAIKEYILSLDYKSKESEIPIFSTVTTNLFDYKTTPYSPKYTYENILKSVNFTQTIENL
YKHIENNQLGTDIVFIELAPHPTLQFYLKQMIPKDSSYFGKGDSISIYSPLHKKKNDVKE
IRQTISQLYCQNGYNINFKCQFENINRSIVPTHKLPLYQWDEKQFWKINSLYENYYLTGP
PIDILGNSITDSPFVKSYQTFINIKRKPFQYLKGHVVKGKFYFPGCGYIDNLLKIYPSQD
ITISTLEFSTPFIFTDDSVNHCLQTNIYPTGKTEYKVLFHFKDQKKNEWIQSSFGNFQLF
KHNGEKSLKIFNQKYNIKDLIEKRCNLTKLTKEDLYDHIKLKTGLTYSGMFQAVSMCYLG
DNCSLSVVSLELPKHLPDQKSFFNSSILDCCLHGMIGLVDEHCQLVFDRIEGFNLYSSNI
PSARDQHTNVYVYSSLNAKMGDSYFASIVVMLEDGTVLIEIDNAACTSLTPIQDSLKIEA
PTNELYSTYLQSKDSLILPPQTFESLYQQEKGQNDILVGTIIKQSLVPFVNEKMVFRILD
FSSGFADYNGTTFHSSNNVLEKFNQLLKEFPLCEIDIEYTFGSVPQSLTSSIKDKLSHIN
ERVSILYRDYSINDPLLLEDNQLKPSQYDIVLINDLEKETNDIKATLYMIYNLMVPNGQL
ILINNDGNNLIEIKELLDQCNFKDTIISNDKKSIIQTRKPQLLSELSPNPNIDSYDQIII
YSNDDSEICNKFLKSLESTDDKILSIISTISKFNEFVEKQSITDKSVIYFIKTMEQLTLD
NFKSITFEYIEINRKLLKLNSMCKHVLITSDSRKDNYLASSVIGAARYFDEFQQLQLFTL
DFDKESIIEYTHNNNEKNLVSLIELLTDKKISIQKEYLIRNGKVYFERIKKEQNLRKKFK
SESYQDLVENDLVAVLSPNLEYELKPMTKDLEPFEVQVEIKSFALNYKDYLTYIGSVPPE
MVNHKTGDINDPEFGSDFSGVITRVSKNNCSEFKVGDQVYGTAYNTASSKSIIDSGSIYF
KPNNLSHEQASTIPVVYSTSLHSIYNIGNLKNYESILIHSASGGVGLSSLNILKWKGHCS
YIFLTVGSPEKEKYLRDTYGSLITGIYSTRDKSYVQKIKDKLKELGSDKTGVDLILNTLS
SDYMDSNFNCLSKSGRIVDLSITHLNSNEYIDNKKFKFNYGYHNVELLFIAAPILKKLLK
SISKAIENNELINNLPITQYSNVNIKNAFEYINQRKHIGKIVVNHDTDLVGNLIKEKINS
TSNLDFTLLKSNYQININNLGKNIIVTGQSGIVFEIIKWIVKFAPLVENIIILSKSSMKW
QLELLVNRNKHIKFHFKSVDVGDINSMGKAIDEVSNDIDNIDSIFHYAFHQITKNVEAIN
MDTLDISFGAKTIGAIILHDQSIKRGWKLKNFIIASSVTSSLGSESQCSYVCANNVLESF
SQYRKSLGLPSICTSYGLIKSTGFVSRNENVSVMFENLGFNPLSINTILGSLDLQIQNQE
LSTNLIVSSFNFSNITKYNPQKNNFSKIDYQVSLEEKNKVNQLGHDGNQDNKNSVNQMFL
EKVSEVLSIEISKINIDIKLSAYGADSLSIVQLKNWVDKELSGNIITIQQLQTNTISSSI
KIITNSLDKKKEGKNKSSTVVNNTNEITTTTKTFEYWKNEAKLDETIIASSIKSDLIIDN
KMDKVILLSGSTGFLGGYLLLNLVKMKNCSKIYCLTRSGHLSDQIDLMNKIIDNLKHHKL
FEMFEQSELEKIFPVRGDLRKSKLGLSDKMYLEISNQVNLILSCGADINLNANYDEIKPT
NVDSTKEFIKLSVSKGTNKPMIPIVNLSSFSIFFGQKLNDEIEFDEYQVGIPSLSNLNNL
PGGYIQSKLICEHLLLEASSRGIPAMTIRLPSIFSNPHTGIGHSGDLLQLIIKSISVTKY
FPIEPTSLFISPVTWVAQNIINLIFNEGCWSKTKINTLNIISLNGELQTTNEIFLMIKKN
FNYKETTLINWKKMISESNDKTCIRLRTFHPLDFTPTKYHMSKEFKISKNTKSLLISFGS
YDGWNITEQMVLNLLKQ
NT seq
8514 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtgtctgcctacctacctacctgtctgcctacctacctacctacctgtctgcct
acctacctacctacctacctacctacctacctacctatctgtctgtctgaagaaaataat
ggtattgggattattggaattgggtttagattaccaggtggtggtagtggcaagagttta
ggtaatccaagtgaactttggaaagaattagttaatggttatgatggtattattgaaact
aatgaaagatggagtgataatttcaacaaattgggcgagattaataatagatatggtggt
ttattaccaatggatgaagttaaatcattcgatcctttattctttggtataagtccacca
gaggcaactgcaatagatccacaacaacgtttacttttaaaatgtacatgggaagccatt
gaagatgcaatgattgatccaattaatttacgcggttcaaatacctctgttttcattggg
aatacaactcacgaatatagagatttaaatagaactatcgattcaattcaaaccaacata
ttttcatcatcatcacattcatcatcaaatcgtgtctcaaacatttttgattttcatggt
ccatcaataacaatagatacagcttgttcgtcatcatcaaatgctgtggttttaggttgt
aaatctatcattgaaggaaactctaaaatgtcaattgttggtggtacaagtttaattttt
gatgcaaataccccaaaatcattttcatatatgaatatgttaagtaaagacggaagatgt
aaaagttttgatgcaaatgcagatggttatgtaaaaagtgaatgtattggggtattatta
ttaaaagatttaaaccaagcaattattgatggtgatagagtttattgtgttattaaaggt
acaagttcaaatgttgatggtaatggatatagtgataaatcaaatttctattcaccatca
gcacaatcacaagctgaaaatattaaaatggcattatcatctggtaatatcaatgcaaaa
gatgtagactatgttgaagcacatggtacaggtactccagttggtgatccaattgaagta
gaaggtatttcaagtattttcaaagacaatcattcaaaagaaaatccattattaataggt
tcgtttaaatcaatgattggtcattgtgaagcatcttctggtattgcatcattggttaaa
tgctgtttaatgtttaaaaatagatactttataccaaatttacattttaaaacaccaaat
ccattaataaaatttaatgaatggaatttaaaagtagtggtagaaccaactccattccca
aaaaaagaaattaccatggctgttaataattttggagttacaggttcaaacgtttgtatt
attttaaaagatttcaattataatcataatagtagcagtgataataataatacaataaat
ttaaaacaacaacaacatcagaacaatattgaatatttaattccattttcagcaaattca
actaaatcattagaacaatatcaatctttaatttcaaattttaatcaagaaactatggag
tttaatgattttgtaaaggaacaaataatgagtaaatcaaattcattataccaacgttca
gttattttaggttcaaattggaatgattttaaagataatttaatatcaactaataataat
attaaaacaatcaaaacaacatcatcaaacatttcaataaaatcaaagaatccaattatt
attatggtattttgtggtcaaggttcacaatataatacaatggcattggaattatataaa
aatgaaccaatatttagaaaaactatggatatgttggataataaattatcaaaatattat
ggtttctcgatattagagaaattaagatccattccggtagatgatatgaaatcaattcat
aatccagcattagcacaacctgcaatttgtatggtacaaatttcactattcgaattatat
aaacactggggtattaaaccaacatttatagttggtcatagtcttggtgaagttactgcc
gcttattgttcaggtatgattgatttagaaactgaatgttatttaatttatcatagatca
atagcccagagtacaacaacaggttgtggtagaatgttatcaattaatatttcacctgaa
aagtttattgaacaattttcatcaagatatcctgatgtagaaatttcatgttataattca
ccaacatcaattgtaattggaggaaaagaggatcaactaaataaaatttcagaagaatta
aaaagtaaaggtgaatttacatcaatgttaggttcattatcatctttccatacatcaagt
caaaaagcaattaaagaatatatcctttcattggactataaatccaaagaatcggaaata
ccaatattttctacagtaacaacaaatttatttgattataaaactactccatattcacca
aaatatacttatgaaaatattttaaaatcagtgaactttactcaaacaattgaaaatcta
tacaaacatatagaaaataatcaactgggaactgatattgtttttattgaattggctcct
catccaactttacaattttatttaaaacaaatgataccaaaagattcaagttactttgga
aaaggtgatagtatttcaatttattcaccacttcacaagaaaaagaatgatgttaaagag
ataagacaaaccatttctcaattatattgtcagaatgggtataatataaactttaaatgt
caatttgaaaatataaatagatcaatagtaccaactcataaattaccactataccaatgg
gatgaaaaacaattttggaaaattaattcactctatgagaattattatttaacaggtcca
ccaattgatatattaggtaattcaattactgattcaccatttgtaaaatcttatcaaaca
tttataaacataaagagaaaaccattccaatatctaaaaggtcatgttgtaaaagggaaa
ttctatttcccaggttgtggttatattgataatttattaaaaatttatccatcacaagat
ataactattagtacattggaatttagtactccatttatttttacagatgattcagtaaat
cattgtttacaaacaaacatttatccaactggaaaaacagaatataaagtattattccat
tttaaagatcaaaaaaagaatgaatggattcaatcatcgtttggtaattttcaattattt
aaacacaatggtgaaaagtctttaaaaatattcaatcaaaaatacaatattaaagatttg
attgaaaaacgttgcaatttaaccaaattgacaaaagaagatttatatgaccacataaag
ttaaaaactggtttaacatatagtggaatgtttcaagctgtatcgatgtgttatttaggt
gataattgttcattatcagtggtttcattagaacttccaaaacatttaccagatcaaaag
tcatttttcaactcttcaattttagattgttgtttacatggtatgattggtttagttgat
gaacattgtcaattggttttcgatagaattgaaggttttaatctatattcatcaaatata
ccatcagcaagggatcaacatacaaacgtatatgtttattcatcattaaatgcaaaaatg
ggtgattcttactttgcatctattgtagtaatgttagaagatggtactgtattaattgaa
atcgataatgcagcatgtacttcattaacaccaattcaagattcattaaaaattgaagca
ccaacaaatgaattatattccacctaccttcaatcaaaggattcattaattttaccacca
caaacattcgaatcactttaccaacaagaaaaaggacaaaatgatattttagtaggtaca
attattaagcaatcacttgtaccatttgtaaatgaaaaaatggtatttagaatattagat
ttttcaagcggttttgcagattacaatggaaccacatttcattcatcaaataatgtttta
gagaaatttaatcaattattaaaagagtttccattgtgtgaaattgatattgaatatact
tttggtagtgtcccacaatcattaacctcatcaatcaaggataaactatcacacatcaat
gaacgtgttagcatactttatagagattatagcattaatgatcctttgttactcgaagat
aatcaattaaaaccttcacaatatgatattgtattaataaatgatttagaaaaggaaaca
aatgatattaaggctacactttatatgatttataatttaatggtaccaaatggtcaatta
atattaataaataatgatggaaataacttaattgaaataaaagagttattagatcaatgt
aattttaaagatacaatcatttcaaatgataaaaaatcaatcattcaaacaagaaaacca
caattactatcagaattatcaccaaatccaaatatagactcttatgatcaaattataatt
tatagtaatgatgacagtgaaatttgtaataaatttttaaaatcactagaatcaactgat
gacaagatattaagtataatatcaacaatcagtaaatttaatgaatttgtagaaaaacaa
tcaataaccgataaatctgtgatttattttataaaaacaatggaacaattaacattggat
aattttaaatcaattacatttgaatacatagaaattaatagaaaactattaaaacttaat
tcaatgtgcaaacatgtattgataacatcagattcaagaaaagataattatttagcatca
tcagttataggtgctgcaagatatttcgatgaatttcaacaactacaactattcacatta
gatttcgataaagaatcaattattgaatacactcataataataatgaaaagaatttagta
tcattgattgaattattaacagataagaaaatatctattcaaaaagaatatttaattaga
aatggtaaagtttattttgaaagaataaagaaagaacaaaatcttagaaaaaaattcaaa
tctgaatcatatcaagatttagttgaaaatgatttagtagcagttttatcaccaaattta
gaatatgaattaaaaccaatgacaaaagatttagaaccatttgaagtccaagttgaaatt
aaatcatttgcattaaattataaagattatcttacatacattggaagtgtgccacctgaa
atggtcaatcataaaacgggtgatattaatgacccagaatttggtagtgacttttctggt
gtcattacaagagtatccaaaaacaattgtagtgaatttaaagttggtgaccaagtttat
ggtactgcatataacactgcatcatccaaatctattatagattcaggttcaatttatttt
aaaccaaataacttaagtcatgaacaagcatcaacaataccagtagtttattcaacatct
cttcatagtatttacaatattggtaatttaaaaaattatgaatcaattttaattcattca
gcatccggtggtgttggtttatcttcattaaatattttaaaatggaaaggtcattgttct
tatattttccttacagttggatcaccagagaaagagaaatatctacgtgacacctatgga
tctttaattacaggtatttattcaacaagagataagagttatgttcaaaaaataaaagat
aaacttaaagaattaggctcggataaaacaggtgtagatttaatattaaatacattatca
agtgattatatggattcaaatttcaattgtctttcaaaaagtggtagaattgtagattta
tcaatcactcatttgaattcaaatgagtatattgataataagaaatttaaattcaactat
ggttatcataatgtagaattactttttatagctgcaccaattttaaagaaattattaaaa
tcaatatcaaaagcaattgaaaataatgaattaattaataatttaccaataactcaatat
tcaaatgttaatattaaaaatgcatttgaatatattaatcaacgtaaacatattggtaaa
attgttgttaatcatgatacagatttagtgggtaatttaataaaggagaaaatcaattca
acttccaatttagattttacattattaaaatcaaattatcaaatcaatataaataattta
ggaaagaatataatagttactggtcaatctggtatagtttttgaaattataaaatggata
gttaaatttgcgccattagttgaaaatataattatcctttcaaaatcatcaatgaaatgg
cagttagaactattagtaaatagaaataaacatataaaatttcatttcaagagcgttgat
gttggtgatataaactcgatgggaaaagcaatcgatgaagtttcaaatgatattgataac
attgattcaatattccactatgcattccatcaaataacaaagaatgtagaagctatcaat
atggatactctggatatttcatttggcgcaaaaacaattggtgcaatcattttacacgat
caatcaattaaaaggggatggaaattaaaaaactttataattgcatcatcagttacctca
tcattaggttctgaaagccaatgtagttatgtttgtgcaaataatgttttagaatcattc
tcacagtatagaaaatcacttggcttaccatcaatttgcacaagttatggtttaataaaa
tcaactggatttgtatcaagaaatgaaaatgtttcagtaatgtttgaaaatttaggattc
aatccactttcaatcaatacaattttaggttcattagatttacaaatccaaaatcaagaa
ctatcaacaaatttaatagtttcaagttttaatttctcaaatataacaaaatataatcca
caaaaaaataatttttcaaagattgattatcaagtttctttagaagaaaagaataaagtt
aatcaattgggtcatgatggtaatcaggataataaaaactctgtaaatcaaatgttttta
gagaaagtttcagaggtattatcaattgaaatatcaaagattaatatcgatattaaactt
tctgcatatggtgctgattctttatcaatcgttcaattaaaaaattgggtagataaagaa
ttatcaggtaatattattacaattcaacaacttcaaacaaatacaatttcatcatcaatt
aaaattataacaaattcattagataaaaagaaagaaggtaaaaataaaagtagtacagtg
gttaataataccaatgaaataacaacaacaacaaaaacatttgaatattggaagaatgaa
gcaaaattagatgaaacaataattgcatcatcaattaaatcagatttaattattgataat
aaaatggataaagttatattattaagtggttcaactggatttttaggaggttatctttta
ttgaatttagtaaaaatgaaaaactgttcaaaaatttattgtttaacaagatcaggtcat
ttatctgaccaaatcgatttaatgaataaaataattgacaatttaaaacaccataaatta
tttgaaatgtttgaacaatcagaattggaaaagattttcccagtccgtggagatttaaga
aagagtaaacttggattatctgataaaatgtatttagaaatttcaaatcaagtaaattta
attttaagttgtggtgctgatattaatttaaatgcaaattatgatgaaattaaaccaacc
aatgtagactcaactaaagagtttataaagctatcagtttcgaaaggtacaaataaacca
atgataccaattgtaaatttatcttcattttcaattttctttggtcaaaaattaaatgat
gaaatcgaatttgatgaataccaagttggaataccttcattaagtaatttaaataattta
ccaggtggctatattcaaagtaaacttatctgtgaacatttactattagaagcatcatca
agaggtattccagcaatgacaattagattaccatcaatattttcaaatccacatactggt
attggtcatagtggagatttgcttcaattaataattaaatccattagtgttactaaatat
ttcccaattgaaccaacttcattatttattagtccagtaacatgggtagcacaaaatatt
attaatttaatctttaatgaaggttgttggtcaaaaacaaaaataaatactttaaatatt
atttcattaaatggtgaattgcaaacaacaaatgaaatatttctaatgataaaaaaaaat
tttaattacaaagaaaccactttaataaattggaaaaaaatgatttcagaatcaaatgat
aaaacttgtatcagattaagaacttttcatcctttagattttactcccacaaaatatcac
atgtctaaagaatttaaaatttcaaaaaatacaaaatcacttttaatttcttttggttct
tatgatggttggaatattactgaacaaatggtattaaatttattaaaacaatag
DBGET
integrated database retrieval system
