Dokdonia sp. MED134: MED134_07144
Help
Entry
MED134_07144 CDS
T03275
Name
(GenBank) cytochrome c assembly protein
Organism
dok
Dokdonia sp. MED134
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EAQ40512
LinkDB
All DBs
Position
51882..55181
Genome browser
AA seq
1099 aa
AA seq
DB search
MQKKIASILFSTRLMGILFIAYFVAMAVGTFLDQGQETSPTPYSRYWIYDAWWFTLIHIL
FVVNFIGNIFRYKLLRKEKITTLIFHLSFVLILIGAGITRYVSYEGVMPIEEGASENSFL
SEKTYLEVFIDGEQNGQPMRRAVEKELSLSPRLNNDFTWTEDFVHDTNNRSDKTTFTFDF
NKFIDGAQDGFVEDENGLWHLKIVETGTDNQRHEHFLVEGELVNIHNVLYAFNKPTDGAI
NIGFDGENYTFKSPFAGSVTVMATQDESEVPEDVEQPLKLRALYNLGGKLLVIPDQAIRG
RTGIVAKEVKEKNQEDALFVDVTVNGETKTVGLLGGRGYSNDKKQIEVGGHKIYLAYGSK
AMPLPFSIKLNEFIARRYPGTQNVYSSFESKITVEDTEESFDYDIYMNHVLDHKGFRFFQ
ASFFPDESGTILSVSHDFWGTWVTYIGYFLLYIGMMMILFDKGSRFGELKRRLDKVKLKK
SKLMMIVFLIAFAKAGYAQEDISNQTTEVSNGNVVVQDSVSVTGENIGDILGLESHTGPQ
HEQRMPSQEEIKKLIVENAIPLEHAEKFGRLIIQEDGRMMPINTYSSMLLRKLSRSDTYE
GLTADQVMLSMMENPQIWSFAEIIYLPKGNDSLRNVIGVPSDRKYFKQMDFFTSDFKYKL
SPFLPDAYAEANPTKISKEFIDVSERMNLLDRTLVKEVLRIFPKPDDSNNTWISPIQVKD
VPYKATDSVIANQIFPAYLLSLKKGRLSGDYSDADKVLQGIEKFQRSHSNDIMPSVEKRD
AEIFYNKYDVFTKLYWMYMLAAVFMMVFVIVAIFKPNKFVSIMTKLGAAAIVVLFIVHTI
GLIWRWYIAGHAPWSNAYESVLYVGWATVFFGLAFGRKSQLTIASTAFVGAFILWAASMN
WMNPEIENLQAVLDSYWLMIHTAVIVASYGPFTLGAILGIVSLLLMIFTTDKNREKMDLN
IKEITIINELALTVGMVLLAIGTFLGGQWANESWGRYWGWDPKETWALISLIVYAFVIHM
RLIPGLRSKWLFNFVSIISLGSILFTYFGVNYYLSGLHSYQSGGEIADQKILITAAVLTV
FGAISYIQYRKHYVKKKSA
NT seq
3300 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaagaaaattgcttctattttattctccacacgcttaatggggattctctttata
gcctactttgttgcaatggcagtaggaacgtttttagaccaaggtcaagaaacgtcacct
acaccatactcaagatactggatttatgatgcgtggtggtttactcttatacacatctta
tttgttgtgaactttatagggaatatattcaggtacaaactactgcgaaaagagaagata
actacgcttatttttcacctttcttttgtgcttatcttaataggagcgggtattacaaga
tatgtaagttatgaaggggtgatgcctatagaagagggtgcctcagaaaattctttttta
agcgagaaaacgtatctagaagtttttatagatggtgagcaaaatggacagcctatgcgt
cgcgctgtagaaaaagaactctcactttcaccaaggctaaacaacgactttacgtggaca
gaagattttgtgcacgatacaaataacagaagtgataagaccacatttacatttgatttt
aacaaatttatagatggagcacaagatggttttgtagaagatgaaaatggattatggcat
cttaaaatagttgagaccggtacagataaccagcgtcacgagcactttctagtagaaggt
gagttagtaaacatacacaatgtactctatgcttttaataaacctacagatggtgcaata
aacataggttttgatggagaaaactacacttttaagtcaccatttgcaggttctgtaact
gtaatggcaacacaagatgagagcgaagtgccagaagatgtagagcagccacttaaactg
cgagcactatacaacctaggaggtaagttacttgtgataccagaccaggctatacgcggt
cgtactggtattgttgcaaaggaggtaaaagaaaaaaatcaagaagatgcactctttgta
gatgtaaccgtaaacggagagactaagacggtagggttactaggcggtcgaggttatagc
aatgataaaaagcaaatagaagtaggtgggcacaaaatttatttagcatacggtagtaag
gctatgccgctaccattttctataaagcttaatgaatttatagcgagaaggtatcctggt
acacaaaacgtatactcttcttttgagagtaaaattactgtagaagatacagaagaaagt
tttgattacgacatctatatgaatcacgtactagaccacaagggtttcaggttttttcag
gcgagtttctttccagatgagtctggtaccatactttctgtaagtcacgatttctggggt
acttgggtgacatatataggttactttttattgtatataggtatgatgatgatattattt
gataaggggtcacgtttcggtgagctcaaaagacgtcttgataaagtaaaacttaagaag
tctaagcttatgatgattgtgtttttgatcgctttcgcgaaagcgggatacgcacaagaa
gatatatctaatcaaactaccgaagtaagtaacggaaacgtagtcgtacaagattccgtt
tctgtaacgggcgaaaacataggtgatatacttggtctagaaagtcatacaggaccacag
cacgagcagcgtatgccatctcaagaagagattaaaaaactcatcgttgagaatgccata
cctttagaacacgcagaaaaatttggacgtcttatcatacaagaagatgggcgtatgatg
cctattaatacatactcaagtatgctactacgtaagttaagtagaagcgatacttatgaa
gggcttacggcagaccaagtaatgctctctatgatggaaaacccacagatatggagcttt
gcagagattatttacttacctaagggtaacgatagtttgcgtaatgtgataggagtgccg
tcagacaggaagtactttaaacaaatggatttctttacttcagatttcaagtataagctt
tctccatttttgccagatgcttatgcagaggcaaacccgactaaaatatcaaaggagttt
atagacgtctctgagcgtatgaatcttcttgatagaacgcttgtaaaagaggtattaaga
atctttccaaaacctgatgattcaaataatacctggatatcgcctattcaagttaaagat
gtaccctataaggcgacagactctgtaattgcaaatcaaatttttccagcatatttatta
agcctcaaaaaaggaaggctaagtggtgactactcagacgcagataaggtattgcagggt
atagaaaaatttcaacgtagtcacagtaatgatattatgccttctgtagagaagcgtgat
gcagagattttttataataaatatgatgtttttacaaaactgtactggatgtatatgctg
gctgcagtttttatgatggtatttgtaatagtagctatttttaagcctaataagttcgtt
agtataatgactaagcttggagctgcagctattgttgtgctctttatcgttcatactata
ggtttaatatggagatggtatatcgcggggcacgcaccgtggagtaatgcgtatgagtct
gtactctatgtgggatgggcaacagttttctttggtcttgccttcgggagaaagagtcaa
cttactatagccagtaccgcatttgtaggtgcttttatactttgggcagcctcaatgaac
tggatgaatccagagattgaaaatttacaagctgtattagatagttactggttaatgatt
catactgctgtaattgtagcaagttatggtccttttacacttggagctattctgggtatt
gtatcattactccttatgatatttactacagataaaaaccgagaaaaaatggatctcaac
attaaggagattactattataaatgagcttgctcttaccgtagggatggtgttactagcg
ataggtactttcttagggggtcaatgggcaaatgaaagctggggacgttactggggatgg
gacccaaaagagacttgggcgcttatctcacttatcgtatatgcatttgtgatacatatg
cgtttaattccaggtttacgcagtaaatggctgtttaactttgtatctatcatctcatta
ggaagtatactctttacttactttggggtaaactattacctctcaggattacactcatac
caaagcggtggagagatagcagatcaaaaaattctaatcacagcagcagttcttacggtc
tttggcgctatatcttacatacagtatagaaaacactatgtcaaaaagaaatctgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
