KEGG   ENZYME: 1.21.98.4Help
Entry
EC 1.21.98.4                Enzyme                                 

Name
PqqA peptide cyclase;
pqqE (gene name)
Class
Oxidoreductases;
Catalysing the reaction X-H + Y-H = X-Y;
With other, known, physiological acceptors
BRITE hierarchy
Sysname
PqqA peptide:S-adenosyl-L-methionine oxidoreductase (cyclizing)
Reaction(IUBMB)
a PqqA peptide + S-adenosyl-L-methionine = a PqqA peptide with linked Glu-Tyr residues + 5'-deoxyadenosine + L-methionine
Substrate
PqqA peptide;
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019]
Product
PqqA peptide with linked Glu-Tyr residues;
5'-deoxyadenosine [CPD:C05198];
L-methionine [CPD:C00073]
Comment
This bacterial enzyme, which is a member of the radical SAM protein family, catalyses the formation of a C-C bond between C-4 of glutamate and C-3 of tyrosine residues of the PqqA protein (which are separated by three amino acid residues). This is the first enzymic step in the biosynthesis of the bacterial enzyme cofactor pyrroloquinoline quinone (PQQ). The reaction is dependent on the presence of a reductant (flavodoxin) and the accessory protein PqqD.
History
EC 1.21.98.4 created 2018
Orthology
K06139  PqqA peptide cyclase
Genes
ECLE: ECNIH2_10520
ECLI: ECNIH5_09670
ECLX: LI66_09895
ECLY: LI62_10660
ECLZ: LI64_09960
EHM: AB284_15140
EXF: BFV63_10075
ECLA: ECNIH3_09680
ECLC: ECR091_09655
ESA: ESA_02996
CSK: ES15_3084(pqqE)
CTU: CTU_08700(pqqE)
KPN: KPN_01812
KPU: KP1_2864(pqqE)
KPP: A79E_2423
KPT: VK055_0676(pqqE)
KPE: KPK_2541(pqqE)
KPR: KPR_2416(pqqE)
KPJ: N559_2487
KPX: PMK1_04152(moaA1)
KPNU: LI86_12340
KPNK: BN49_2910(pqqE)
KVA: Kvar_2487
EAE: EAE_19575
EAR: CCG29970
KQV: B8P98_13480(pqqE)
CLAP: NCTC11466_01757(moaA)
KOT: EH164_01075(pqqE)
IZH: FEM41_01630(pqqE)
EBU: CUC76_02050(pqqE)
SRL: SOD_c22480(pqqE)
SPLY: Q5A_012585(mftC)
SMAF: D781_2271
SMW: SMWW4_v1c09280(pqqE1) SMWW4_v1c24110(pqqE2)
SMAR: SM39_1857(pqqE)
SMAC: SMDB11_1672(pqqE)
SERF: L085_16610
SERM: CLM71_11730(pqqE)
RAA: Q7S_24831
SOD: Sant_1506(pqqE)
PES: SOPEG_1905(pqqE)
ETA: ETA_28860(pqqE)
EPY: EpC_05750(pqqE)
EPR: EPYR_00598(pqqE)
EAM: EAMY_3079(pqqE)
EAY: EAM_0516(pqqE)
EBI: EbC_37750(pqqE)
ERJ: EJP617_05270(pqqE)
EGE: EM595_0235(pqqE)
EPE: CI789_15575(pqqE)
PAM: PANA_1857(pqqE)
PLF: PANA5342_2340(pqqE)
PAJ: PAJ_1190(pqqE)
PVA: Pvag_1286(pqqE)
PAGG: AL522_13695(pqqE)
PGZ: C2E15_01385(pqqE)
PCD: C2E16_01445(pqqE)
TPTY: NCTC11468_01821(moaA)
XCC: XCC2940(pqqE)
XCB: XC_1169
XCP: XCR_3310(pqqE)
XCV: XCV3248(pqqE)
XAX: XACM_3036(pqqE)
XAC: XAC3117(pqqE)
XCI: XCAW_03403(pqqE)
XFU: XFF4834R_chr15150(pqqE)
XOO: XOO1733(pqqE)
XOM: XOO1633(XOO1633)
XOP: PXO_01588(pqqE)
XOR: XOC_3321(pqqE)
XPH: XppCFBP6546_03190(XppCFBP6546P_03190)
LAB: LA76x_3898(pqqE)
LAQ: GLA29479_3372(pqqE)
LCP: LC55x_3921(pqqE)
LEZ: GLE_3759(pqqE)
LEM: LEN_1383(pqqE)
DKO: I596_3132
PAE: PA1989(pqqE)
PAEV: N297_2052(pqqE)
PAEI: N296_2052(pqqE)
PAU: PA14_38780(pqqE)
PAP: PSPA7_3305(pqqE)
PAG: PLES_33341(pqqE)
PAF: PAM18_3056(pqqE)
PNC: NCGM2_2963(pqqE)
PAEB: NCGM1900_4498(pqqE)
PAEP: PA1S_15750
PAEM: U769_15335
PAEL: T223_17025
PAEU: BN889_02165(pqqE)
PAEG: AI22_18025
PAEC: M802_2050(pqqE)
PAEO: M801_2051(pqqE)
PMY: Pmen_1969
PMK: MDS_2932
PRE: PCA10_31280(pqqE)
PPSE: BN5_2337(pqqE)
PCQ: PcP3B5_36390(moaA_3)
PPU: PP_0376(pqqE)
PPF: Pput_0401
PPT: PPS_0371
PPI: YSA_05759
PPX: T1E_2177(pqqE)
PPUH: B479_02355
PPUT: L483_01920
PPUN: PP4_04060(pqqE)
PPUD: DW66_0385
PMON: X969_00180
PMOT: X970_00180
PST: PSPTO_0509(pqqE)
PSB: Psyr_4674
PSYR: N018_02425
PSP: PSPPH_4708(pqqE)
PAVL: BKM03_02850(pqqE)
PFL: PFL_5677(pqqE)
PPRC: PFLCHA0_c56280(pqqE2)
PPRO: PPC_5621
PFS: PFLU_5602(pqqE)
PFE: PSF113_5387(pqqE)
PFC: PflA506_4903(pqqE)
PFW: PF1751_v1c50290(pqqE)
PFB: VO64_2489
PEN: PSEEN0394(pqqE)
PSZ: PSTAB_1970(pqqE)
PSR: PSTAA_2101(pqqE-2) PSTAA_2108(pqqE)
PSTT: CH92_10990
PPUU: PputUW4_02938(pqqE1) PputUW4_04969(pqqE2)
PKC: PKB_2787(pqqE)
PSEM: TO66_28775
PSEC: CCOS191_4949(pqqE)
PSOS: POS17_5608
PANR: A7J50_5333
PSET: THL1_2869
AVN: Avin_41640(pqqE)
AVL: AvCA_41640(pqqE)
AVD: AvCA6_41640(pqqE)
ACX: Achr_8820(pqqE)
PALI: A3K91_1274
PSYA: AOT82_366
ABM: ABSDF1983(pqqE)
ABY: ABAYE1878(pqqE)
ABN: AB57_1992
ABB: ABBFA_001731(pqqE)
ABX: ABK1_2257
ABH: M3Q_2151
ABAD: ABD1_17550(ppqE)
ABAZ: P795_8385
ABAU: IX87_19760
ABAA: IX88_10775
ACC: BDGL_001130(pqqE)
ACI: ACIAD2507(pqqE)
SWD: Swoo_2249
CPS: CPS_0857(pqqE)
MHC: MARHY3254(pqqE)
MAD: HP15_3137
MBS: MRBBS_1218(pqqE)
MARA: D0851_08185(pqqE) D0851_09770(pqqE)
AMAL: I607_15620
AMAE: I876_15920
AMAO: I634_15865
AMAD: I636_15780
AMAI: I635_16420
AMAG: I533_15505
AMAC: MASE_15520
ASP: AOR13_197
ALR: DS731_15120(pqqE)
MCA: MCA1449(pqqE)
METL: U737_22045(pqqE)
MAH: MEALZ_0595(pqqE)
MMAI: sS8_2219
MEC: Q7C_1402
CYQ: Q91_0457(pqqE)
CZA: CYCME_2187(pqqE)
NOC: Noc_2623
NHL: Nhal_3513
NWA: Nwat_0494
NWR: E3U44_06645(pqqE)
GAI: IMCC3135_24225(mftC)
CSA: Csal_0848
HVN: EI420_18150(pqqE)
ADI: B5T_02551
AXE: P40_12335
PSE: NH8B_3462(pqqE) NH8B_4040(pqqE)
RIN: ACS15_4558(pqqE)
REH: H16_B1049(pqqE)
CNC: CNE_2c10110(pqqE) CNE_BB1p04390(pqqE)
CTI: RALTA_B0442(pqqE2) RALTA_B0668(pqqE1)
CGD: CR3_1420(pqqE)
BVE: AK36_5991(pqqE)
BCN: Bcen_3249
BCJ: BCAM2360(pqqE)
BCEN: DM39_5483(pqqE)
BCEW: DM40_5679(pqqE)
BCEO: I35_6256(pqqE)
BAM: Bamb_6168
BMU: Bmul_5965
BMJ: BMULJ_05561(pqqE)
BMK: DM80_6414(pqqE)
BMUL: NP80_5658(pqqE)
BCT: GEM_4430
BCED: DM42_5627(pqqE)
BDL: AK34_5446(pqqE)
BCON: NL30_00660
BUB: BW23_3517(pqqE)
BLAT: WK25_18615
BTEI: WS51_29270
BSEM: WJ12_31740
BPSL: WS57_02305
BMEC: WJ16_30180
BGU: KS03_3688(pqqE)
BGO: BM43_6662(pqqE)
BUK: MYA_5947
BUE: BRPE67_BCDS01120(pqqE)
BGP: BGL_2c29000(pqqE)
BXE: Bxe_B2470(pqqE)
BXB: DR64_4797(pqqE)
BPH: Bphy_6512
BFN: OI25_3472(pqqE)
PLG: NCTC10937_04973(moaA_2)
AMIM: MIM_c14260(pqqE)
PNA: Pnap_0729
VEI: Veis_4038
VPD: VAPA_1c31190(pqqE)
HYR: BSY239_1085(pqqE)
HYC: E5678_01675(pqqE)
MPT: Mpe_A2588
JAJ: EKL02_13045(pqqE)
MALI: EYF70_16440(pqqE)
LCH: Lcho_0248
THI: THI_0495(pqqE)
RGE: RGE_40550(pqqE)
METR: BSY238_2142(pqqE)
MFA: Mfla_1680
MMB: Mmol_0997
MEH: M301_1195
MEP: MPQ_1589
MBAC: BN1209_0759(pqqE)
MBAT: BN1208_0723(pqqE)
DAR: Daro_1702
AZO: azo1190(pqqE)
AZA: AZKH_0824(pqqE) AZKH_1538(pqqE)
AOA: dqs_1304
SULR: B649_05195
DGG: DGI_4008
BMX: BMS_3126
MESM: EJ066_29990(pqqE)
SME: SM_b20208(pqqE)
SMX: SM11_pD1403(pqqE)
SMI: BN406_06456(pqqE)
SMEL: SM2011_b20208(pqqE)
SMER: DU99_32325
SMD: Smed_3915
SFH: SFHH103_05873(pqqE) SFHH103_06434(pqqE)
SFD: USDA257_c31250(pqqE)
SIX: BSY16_5730(pqqE) BSY16_6310(pqqE)
SAME: SAMCFNEI73_pC0402(pqqE)
ARA: Arad_8719(pqqE)
RGA: RGR602_PC01538(pqqE)
RHT: NT26_3278(pqqE)
NEN: NCHU2750_46890(pqqE)
BJA: blr6739(pqqE)
BRA: BRADO5797(pqqE)
BBT: BBta_6304(pqqE)
BRS: S23_15740(pqqE)
AOL: S58_18220(pqqE)
BRAD: BF49_4914
BRO: BRAD285_1512(pqqE)
BRK: CWS35_34285(pqqE)
BOT: CIT37_20935(pqqE)
BRQ: CIT40_25540(pqqE)
BGQ: X265_09545(pqqE)
RPA: RPA1950(pqqE)
RPB: RPB_3419
RPC: RPC_0883
RPD: RPD_2033
RPE: RPE_0843
RPT: Rpal_2161
NWI: Nwi_0689
VGO: GJW-30_1_00290(albA)
XAU: Xaut_1799
SNO: Snov_1057
MEX: Mext_1817
MEA: Mex_1p1748(pqqE)
MDI: METDI2500(pqqE)
MCH: Mchl_2153
MPO: Mpop_1769
MET: M446_5768
MNO: Mnod_5988
MOR: MOC_0672(pqqE)
META: Y590_08700
MAQU: Maq22A_c05275(pqqE)
MEE: DA075_10650(pqqE)
METD: C0214_10455(pqqE)
METS: DK389_20585(pqqE)
METI: DK427_18590(pqqE)
BID: Bind_3319
MSL: Msil_1151
MTUN: MTUNDRAET4_0660(pqqE)
MLG: CWB41_08990(pqqE)
HMC: HYPMC_1634(pqqE)
RVA: Rvan_0684
PHL: KKY_2337
FIL: BN1229_v1_0593(pqqE)
FIY: BN1229_v1_0595(pqqE)
DEQ: XM25_03190(PqqE)
MSC: BN69_3487
MROS: EHO51_08825(pqqE)
PLEO: OHA_1_04315(pqqE)
BRN: D1F64_22520(pqqE)
MCG: GL4_2351
HDI: HDIA_2204(pqqE)
RBM: TEF_06420
SIL: SPO1500(pqqE)
RUA: D1823_18665(pqqE)
RSP: RSP_0790(pqqE)
RDE: RD1_1150(pqqE)
RLI: RLO149_c036960(pqqE)
PDE: Pden_2359
PAMN: JCM7685_2823(pqqE)
DSH: Dshi_0454(pqqE)
KVU: EIO_2509(pqqE)
KVL: KVU_2027(pqqE)
KRO: BVG79_02153(pqqE)
PGD: Gal_03896
LEJ: ETW24_02690(pqqE)
RHC: RGUI_0968
RMM: ROSMUCSMR3_01477(mftC)
SAGU: CDO87_19425(pqqE)
NTD: EGO55_18335(pqqE)
GOX: GOX0983
GOH: B932_1173
GOY: GLS_c10610(pqqE)
ACR: Acry_0081
AMV: ACMV_01060(pqqE)
GDI: GDI1267(pqqE)
GDJ: Gdia_1978
GXY: GLX_18130
GXL: H845_3151
KSC: CD178_01100(albA)
APT: APA01_21290(pqqE)
APW: APA42C_21290(pqqE)
APF: APA03_21290(pqqE)
APU: APA07_21290(pqqE)
APG: APA12_21290(pqqE)
APQ: APA22_21290(pqqE)
APX: APA26_21290(pqqE)
APZ: APA32_21290(pqqE)
APK: APA386B_987(pqqE)
ASZ: ASN_1017(pqqE)
ABG: Asbog_02838(pqqE)
AZL: AZL_a10000(pqqE)
ALI: AZOLI_p30586(pqqE)
ABS: AZOBR_100320(pqqE)
TMO: TMO_3110(pqqE)
NAO: Y958_31010(pqqE)
ABAW: D5400_04015(pqqE)
LPIL: LIP_1139
MSM: MSMEG_3721(pqqE)
SBH: SBI_02092
SLD: T261_0177
SRW: TUE45_01242(albA_1)
SNR: SNOUR_05320(pqqE)
SMAL: SMALA_7070
SALF: SMD44_07100(pqqE)
SFK: KY5_6898
GOB: Gobs_2456
SEN: SACE_4425(pqqE)
AMD: AMED_7866(pqqE)
AMN: RAM_40425
AMM: AMES_7748(pqqE)
AMZ: B737_7748(pqqE)
AOI: AORI_6698(pqqE)
AJA: AJAP_05630(pqqE)
AMQ: AMETH_4534(pqqE)
PDX: Psed_0740
PSEA: WY02_28695
PSEH: XF36_14250
SESP: BN6_07630(pqqE)
ACTA: C1701_07940(pqqE)
SNA: Snas_2175
CTHE: Chro_2520
KBS: EPA93_15945(pqqE)
MIN: Minf_1237
ABAS: ACPOL_5431
HTH: HTH_1213(pqqE)
MARN: LN42_01355
NMV: NITMOv2_0771(pqqE)
NJA: NSJP_1025(pqqE)
SSO: SSO0546(pqqE-1)
SOL: Ssol_1588
SSOA: SULA_1619
SSOL: SULB_1620
SSOF: SULC_1619
SIC: SiL_1473
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Taxonomy
Reference
1  [PMID:20737074]
  Authors
Wecksler SR, Stoll S, Iavarone AT, Imsand EM, Tran H, Britt RD, Klinman JP
  Title
Interaction of PqqE and PqqD in the pyrroloquinoline quinone (PQQ) biosynthetic pathway links PqqD to the radical SAM superfamily.
  Journal
Chem Commun (Camb) 46:7031-3 (2010)
DOI:10.1039/c0cc00968g
Reference
2  [PMID:25817994]
  Authors
Latham JA, Iavarone AT, Barr I, Juthani PV, Klinman JP
  Title
PqqD is a novel peptide chaperone that forms a ternary complex with the radical S-adenosylmethionine protein PqqE in the pyrroloquinoline quinone biosynthetic pathway.
  Journal
J Biol Chem 290:12908-18 (2015)
DOI:10.1074/jbc.M115.646521
Reference
3  [PMID:26961875]
  Authors
Barr I, Latham JA, Iavarone AT, Chantarojsiri T, Hwang JD, Klinman JP
  Title
Demonstration That the Radical S-Adenosylmethionine (SAM) Enzyme PqqE Catalyzes de Novo Carbon-Carbon Cross-linking within a Peptide Substrate PqqA in the Presence of the Peptide Chaperone PqqD.
  Journal
J Biol Chem 291:8877-84 (2016)
DOI:10.1074/jbc.C115.699918
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 1.21.98.4
IUBMB Enzyme Nomenclature: 1.21.98.4
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 1.21.98.4
BRENDA, the Enzyme Database: 1.21.98.4
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