Entamoeba dispar: EDI_113170
Help
Entry
EDI_113170 CDS
T01083
Name
(RefSeq) DNA polymerase alpha catalytic subunit
KO
K02320
DNA polymerase alpha subunit A [EC:
2.7.7.7
]
Organism
edi
Entamoeba dispar
Pathway
edi03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
edi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
EDI_113170
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
edi03032
]
EDI_113170
Enzymes [BR:
edi01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
EDI_113170
DNA replication proteins [BR:
edi03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
DNA polymerase alpha / primase complex
EDI_113170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
DNA_pol_B_exo1
DUF1744
Tmemb_55A
c-SKI_SMAD_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5878671
NCBI-ProteinID:
XP_001733786
UniProt:
B0E5W4
LinkDB
All DBs
AA seq
1132 aa
AA seq
DB search
MSRRHQNEKDQALELLEKAREGKIDMEEVAINCIAQDGFDDIDDIDIEDLKNENIKEESK
EEVGGKKMVQQKLVIEGKINPEIKEMIKEKTEITISKEKAPPIKLPKKFILNVPKRTDAN
ILKNVPTQNLDFFYIDLVSVTTMKGCVFLIGKVKGDNGFISCSILVKGIRRVLFVEPKKE
FINKPKEVIEELKKYYKSTNVVFAEATKEMIINPQDTNDNKELLEKKVIKGIQVECYFDD
KELNDTGKTYEKVYQKTLTCEEVFLSNYSIFGPSWIKFNGLTVVRTSVEQKSWCLREYIL
DLKKVNPKTSIKTSITNTMIPPLNICSIETICLNEEKTKKPMMVSLDVVKSVPMSHSMKA
WRDDIYTFYINQGVKCSKGMEAKDQKELLLKVCNFIQQHDIDLIISHDMTTTLMPFFDTI
ESSGEVSAYSKFGRLKRTLTNTKSKDNKDNTFAGKIFFSGRLLADTFVLSKEFLRSEKIN
DLNTLTSHYLGIQREYNIDDLTCSSDIEFALQDKTKIDSIRNYLEENSRLVIKLCNQMNA
IAMTKELTNLAGNIWSHSFFGKRAERVEYLLLHEFIKQTTLYILPDKKFGEGSQHKKYAG
GLVLEPVKDFYSDPILLIDFKSLYPSIIMEFGVCFLNSQLGGENNKSMLPEIIKKLVMRR
RQIVSEMEKLGDKDEIKKAQLNTQQLSVKVMTNSIYGCLGFKGSRFYCQKIAEWITGKGR
TILTNTCEQVQKMDIQVIYGDTDSLMVRPPKISLKDLKNFGNNLCAQINKSYKSLEIEID
AIFEKLLLLRKKRYAATMILDGGKKKKELKGLDVVRREWCPLSKEIGYYCIDLILSDPGL
VKMQQILETYFKNIAEKLRSGKVDIHQLVITKGLNKDPQSYPQKIDHVAAALKSSKHYKA
GDQIKYLIEKGDNTKSSSDRSIPLDVVEKLDKFEPDYEYYLDTQIYAPVSRLFEVFPSIN
IKIREWLGLSPTTTLYSRIAVTANKSGSWLGFEIECGECKKVFTYRAYQERDMKCRCPEC
KKLYTSTDLVSKGKQYMEKVLDDYLKQKVSCNDCGKIYTKAGNNAVYDDSFDCCGKNYEF
NIKKNDIIEKLTSLYVITSSRLNDQQKIDYDIDALHSSVKGFLDKPCLQRGR
NT seq
3399 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacgaagacatcaaaatgaaaaggaccaagcacttgaacttctagaaaaagctcga
gaaggcaaaatcgatatggaagaagtagcaataaattgtattgcacaagatggattcgat
gacattgatgatattgatattgaagatttaaagaatgaaaacattaaagaagaatcaaaa
gaagaggttggaggtaagaagatggtccaacaaaagttagttattgaaggaaaaattaat
ccagaaattaaagaaatgattaaagaaaaaaccgaaattactatttcaaaagaaaaggct
ccaccaatcaaattaccaaaaaaatttattcttaatgtccctaaaagaacagacgctaat
atattaaaaaatgtcccaacacaaaatttagatttcttctatattgatttagtaagtgtt
actacaatgaagggttgtgtctttttaataggaaaagtaaaaggagataatggatttatt
tcttgttcaattcttgtcaaaggtattagaagagttttgtttgttgaaccaaaaaaagaa
tttatcaataagccaaaagaagtgatagaagaattaaagaaatattataaatcaacaaat
gtagtttttgcagaagcgacaaaagaaatgattattaatccacaggacacaaatgacaat
aaagagttattagaaaaaaaagttatcaaagggattcaggttgaatgttattttgatgat
aaagaattaaatgatactggaaaaacttatgaaaaagtttatcaaaaaacattgacatgt
gaagaagtctttcttagtaattattcaatatttggtccatcttggattaaatttaatgga
ttaactgttgtacgtacttctgtagaacaaaagtcatggtgtttaagagagtatatttta
gacctcaaaaaagttaatcctaaaacgtcaattaaaacttctataacaaacacaatgatt
cctcccttaaatatttgttctattgaaacaatttgtttaaatgaagagaaaacaaaaaaa
ccaatgatggtctcattagatgtagttaaaagtgttcctatgagtcatagtatgaaagca
tggagagatgatatttatacattttatataaatcaaggagttaaatgttcaaaaggaatg
gaagcaaaagaccaaaaagaacttttgttaaaagtatgtaacttcattcaacaacatgac
attgatctgattatatcacatgatatgacaacaacattaatgccattttttgatactatt
gaatcatcaggggaagtttctgcttattctaaatttggaagattaaaaagaacacttact
aacactaaatcaaaagataataaagataatacctttgcaggaaaaatatttttttctgga
agattattagcggatacgtttgtgttatcaaaagaatttttaaggtcagaaaaaattaat
gatttaaatactctaactagtcattatcttggaattcaaagagaatataatattgatgat
ttgacatgttcaagtgatattgaatttgcattacaagataaaactaaaattgatagtatt
agaaattatcttgaagaaaattctaggttagttataaaactttgtaatcaaatgaatgca
attgcaatgacaaaagaattaactaatttggctggtaatatttggagtcattctttcttt
ggaaagagggcagaacgagttgagtatttacttcttcatgaatttattaaacaaacaaca
ttgtatattttaccagataaaaagtttggggaaggaagccaacataaaaaatatgctggt
ggtttggttttagaacctgtcaaagatttttactcagacccaattttattaatagacttc
aaatcattatacccatcaattattatggaatttggtgtttgttttcttaattctcaactt
ggaggagaaaataataaatcaatgttaccagaaattattaaaaaactggttatgagaaga
agacaaattgtaagtgaaatggaaaagttaggagataaagatgaaattaaaaaagcacaa
ttaaatacacaacaactatctgtaaaagtaatgactaactctatttatggttgtcttggt
tttaaaggaagtagattttattgtcaaaaaattgctgagtggattactggtaaaggaaga
actattttaacaaatacatgtgaacaggttcaaaaaatggatatccaagtaatttatgga
gatactgattcattaatggttagaccaccaaaaattagtttgaaagatttaaagaatttt
ggtaataatttatgtgcacaaattaataaaagttataaatcattagaaattgaaatcgat
gctatatttgaaaaattattattattaagaaagaagagatacgctgctacaatgattctt
gatggaggtaaaaagaaaaaagaattaaaaggattagacgttgtaaggagagaatggtgt
ccattatctaaagaaataggatattattgtatagacttaatactgtctgatccaggatta
gttaaaatgcaacaaatattagaaacttattttaaaaatatagcagaaaaattaagaagt
ggtaaagttgatattcaccaattagttattactaaaggactgaacaaagatcctcaatca
tatccacaaaaaattgatcatgtagctgctgcattaaaatcaagtaaacactataaggct
ggagatcaaattaaatacttaattgaaaaaggagataatacaaagtcaagtagtgataga
tcaattccacttgatgttgttgaaaaattagataaatttgaacctgattatgaatattat
ttagatacacaaatttatgcaccagtttcaagattatttgaagtatttcctagtataaat
attaaaattagagaatggcttggattaagtccaacaacaactttgtatagtagaattgct
gtgacagcaaataaaagtggttcatggttaggttttgaaattgaatgtggtgaatgtaaa
aaagtatttacatatagagcatatcaagaaagggacatgaaatgtaggtgtccagaatgc
aagaaattatatacatctactgatttagtttctaaaggaaaacaatacatggaaaaggta
ttagatgattatttaaaacaaaaagtttcttgtaatgattgtggaaaaatttatacaaag
gctggaaataatgcagtttatgatgactcttttgattgttgtggaaagaattatgaattt
aatattaaaaagaatgatatcattgaaaaattaacaagtctttatgttattacatcatca
agacttaatgaccaacaaaaaattgattatgatattgatgcattacattcatcagtaaaa
ggatttttagataaaccatgtttacaaagaggaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
