Elizabethkingia meningoseptica: BBD33_15830
Help
Entry
BBD33_15830 CDS
T04744
Name
(GenBank) c-type cytochrome biogenesis protein CcsB
Organism
emg
Elizabethkingia meningoseptica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX06630
UniProt:
A0A1V3TZE2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3509266..3512535)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MKKLQDILISTRTMAVLLLVYAIAMAAATFIENDHGTPTAKALIYNAKWFELVMLLLIIN
FIGNIQRYRLLRKEKWPVLVFHLAFIFIFIGGAITRYVSFEGMMLIREGETSNQIVSDKQ
YFKIQIEDKGDVLNYEDVPYIMSPLHHDFKATYDYRGDKFVINTLDYIQRKKDSLVATAN
GKDYLHLVSTNDQGRENIYIAPGEAKSVNGMLVTYNRKIEGAVEIHDENGFLQIKSPSEA
QYMTMATRKTGVAKKDELDSLKLRSLYTIGDLKLVVPEGVKKGKLIEYEGDKKKDAATPD
LLRLMVKGPKTQQPVDILVDKNNPNMAKQIMVDGKNIMLGFGPKVLQTPFSIKLDKFVME
TYPGSNSPSAYESHVQIIENGKQTPYKIYMNHVLNHGGYRFFQAGFDPDRKGTHLSVNHD
WWGTNITYVGYTFLFLGLFVSLFWKGTRFWQLNKMLKDVSKKKAVAVAFLLFSFAAVNAQ
TYNDGKGKIDMHGQESHGAPNVKKVEGGMNAGPMRPKVLDPEAVVKDAHISKEHADKFGY
ALVQNIEGRIVPVNTLALDVLRKLYKKDSFHGMDANQWFLSITTNPFMWTQVPIIKVPEK
GGDELHGKAKANEDDYTTLLNLFPMDPVTGQPRFVLEEDYNTAFRKKPGEQTMYDKGVIE
LNDKVQVFNGILSGQYMRIVPVPNDNNYTWHSWLDNNFEPDEASQKVMGPYFASVLDATK
NGDWSTADKELVKLQDYQHKWGSKIMPSDTKVKVEVFMNDLNLFFKLLIGYTVIGGLLLI
LGFIYLFKPNKTLNKVINIVIWIGIIGYISHFFGLVGRWYVSGHAPWSNGYEAIMFISWV
GITAGLILYRNSNALIPAAGFMVAVIMMGFAHGGAQLDPQITPLVPVLKSYWLIVHVAII
TSSYGFFALSAIIAVITLFFYIVTNAEVYKVHNDKTIKELTIVSEMSLTIGLFALTVGNF
LGGIWANESWGRYWSWDPKETWAFISIIIYAFVLHMRLVPGLRGRYTFHVVTMFAFCSMI
MTYFGVNYYLSGLHSYAAGDPIPVPLWVYLSLAFMLTLSIVAWFKYKKLHIQKTANKVKK
VEERTESEP
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaattacaagatatactgatctccaccaggacgatggcagtattattattagtg
tatgccattgcgatggcagcggcaacttttatagaaaatgatcacggtacacctacggct
aaagctttaatctataatgctaaatggtttgagctggtgatgctgcttttgattattaat
tttataggaaatatccagcgttacagacttcttagaaaagaaaaatggccggtgctggta
ttccaccttgcatttatctttatatttattgggggtgccatcacacgttatgttagtttt
gagggaatgatgctgattcgtgaaggggaaacttctaatcagattgttagtgataagcaa
tattttaaaatacagatagaagataagggggatgttcttaattatgaagatgtaccttat
attatgtcacccttacaccatgatttcaaagcaacttatgattacagaggtgataaattt
gtaattaatactttagattatattcagagaaaaaaggattctttagttgcaacggccaat
ggtaaagattaccttcatctggtttcaacaaatgatcagggacgtgaaaatatttatatc
gctcctggtgaggctaaaagtgttaacggtatgctggtgacttacaatcgtaagattgaa
ggggctgttgaaatccacgatgaaaatggattccttcagattaaatctccttccgaagca
cagtatatgacgatggcaacacgaaaaacaggtgttgctaaaaaggatgaattggattcc
cttaaacttagaagtttatatactattggtgatctgaaacttgttgtacctgaaggtgtg
aaaaaaggtaagcttatcgaatatgaaggagataagaaaaaagatgctgctacaccggac
ttattaaggttaatggttaaaggacctaaaacacaacagcctgtggatatattagtagat
aagaataatcctaatatggcaaagcagattatggtggatggtaaaaatattatgttgggg
tttggtcctaaagttttacaaacaccattctctataaaactggataaattcgtcatggaa
acttatccgggaagtaattcaccatcggcatacgaatcgcatgttcagattatagaaaac
ggaaaacaaacgccttataaaatctatatgaaccacgtattgaatcatggtggttatcgt
ttctttcaggcaggttttgacccggacagaaaaggaacgcacctttctgttaatcacgac
tggtggggaactaatattacttatgtaggatacacattccttttcttaggattgtttgtt
tcgttattctggaaaggaacacgtttctggcagttaaacaaaatgctaaaagatgttagc
aagaaaaaagctgttgcagtagcattcctgttattttcttttgcagctgtaaatgctcag
acttacaatgatggtaaggggaaaattgatatgcacggacaagagtctcacggtgcacca
aatgtaaaaaaagttgagggtggaatgaatgcaggtcctatgaggcctaaagtcctggat
cctgaagctgtggttaaagatgctcatattagtaaagagcatgccgataagtttggttat
gcattggtacagaatatagaagggcgtattgttccggtgaatacactggcattagatgtc
cttagaaaattatacaagaaagattctttccatggaatggatgccaaccagtggttcctg
tccattaccacaaatccttttatgtggactcaggttccaattattaaggttcctgaaaag
ggtggggatgaattacacggaaaagcaaaagccaatgaggatgattatacgacattgctt
aatcttttcccaatggatcctgtgacggggcagcctcgttttgtattggaagaggattat
aatacagctttccgcaaaaaaccgggagagcaaactatgtatgataaaggggtaattgaa
ctgaatgataaagttcaggttttcaatggtatactttccggtcagtatatgcgtattgtt
ccggttccgaatgataataattatacgtggcattcatggttggataataatttcgaaccg
gatgaagcatcgcagaaagttatggggccttattttgcaagtgtactggatgcaactaaa
aacggtgactggagtacagcggataaagaacttgtaaaattacaggactaccagcataag
tggggatcgaagattatgccttctgataccaaagtgaaagttgaggtgtttatgaatgat
ctgaatctgttctttaaacttcttatcggctatactgtaattggtggtttacttttgata
ttaggtttcatttatctgtttaagccaaacaagactttaaataaagttatcaatatcgtt
atctggattggtattatagggtatatatcgcatttctttggacttgtaggacgttggtac
gtttcaggacatgctccttggagtaatggctacgaagctattatgtttatttcctgggtt
gggattacagccgggcttatcttatatagaaattccaatgcacttattccggcagccgga
ttcatggtagctgttattatgatgggatttgctcatggcggtgcacagcttgatccgcag
attacgccgctggtgcctgtattgaaatcatactggttaattgtccatgttgcgattatt
acttcaagttatggtttctttgccctgtcggcaattattgcggtaattacattattcttc
tatattgtaacgaatgccgaggtctataaagtacataacgataaaacgataaaagagctg
actattgttagtgagatgtctttaactattggtttattcgcgcttacagttggtaacttc
cttggaggtatctgggcgaatgaaagctggggtcgttactggtcttgggatcctaaagaa
acatgggcatttatctctattatcatttatgcatttgtattacacatgcgtttagtacca
gggcttagaggtagatatactttccatgtagttaccatgtttgcattctgttctatgatt
atgacgtatttcggggttaattattatctgtccggattacactcctatgcagcaggtgat
ccgattccggttcctctatgggtgtatctgagtttagcttttatgcttactctaagtata
gtagcatggtttaagtacaaaaaactgcatattcaaaaaacagctaataaggtgaaaaag
gttgaagaaagaaccgagtcagaaccttaa
DBGET
integrated database retrieval system