KEGG   Echinicola vietnamensis: Echvi_1965
Entry
Echvi_1965        CDS       T02388                                 
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain protein
Organism
evi  Echinicola vietnamensis
SSDB
Motif
Pfam: SpvB RHS_repeat FG-GAP_3 TcdB_toxin_midN FG-GAP DUF6443
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGA78219
UniProt: L0FWD9
LinkDB
Position
complement(2304519..2314811)
AA seq 3430 aa
MNNKDIITKIASFLLIFFFLGNDLVASVRAVIHFPTEKTSPVRITKVPERNRVTKNPKAS
PNRYNKENAVKRSSGASRLIFNAQEAEAYLGKHEKDPMGLPVNDFFAIEVDKDIREYSYA
YLEYQIRGLEDGLSIPKSVNNEPVYTGSPVKPGTEWQTIRQKLDRTEIKQGVNQVRFSLS
RFYKFPVTIKNVRLQLSNETMKAGDMLKEERIQAKEEDFKVMEGKEGHVFKLRDVDMPSI
PDGIRNVSRNAWGYFYQSQSEKTVKVSIGVNKEILASGKSLAEVQIFYFNKKDRVWKPAH
VEHVDMAKTNLEGSVPSNTNYFAGLITAPEMPEAKAHVPTAMSDIKAANPAAGMNIIQPP
SISNTGEAGIQYPLEIPEGRNGMAPNLNLTYSSDAGTGWMGMGWNISIPSVSIDSRWGVP
TFPTKQAEVYMLNGNSLVEEGGYKGNRNPTTRTGGDVRFFEHVQSSYKEIVRKGGSTSDY
RWIETTANHTTFYYGTTDGSTVAEDAVLRNSSNASGDIVRWYLKKVKDKWGNFMTYSYSD
ISGSGGIKNGARGKVLSSIQYTSHESTSGRYSIEFDLASGTRRDGKVTMNLGFPELDDRL
LEQIRVMYDSEEVKRFEFNYKNDDTTMFKTLLTSVEEYRKGSLFYDHNFKYYEGTLEYSG
AETINLSYFNNSLLGDIPSEVSSLTAPLSTQAYPSPISTTTTLGWGTNGSIGVGVAPLTD
VPNKAFTFSGRLGYSQTFNKDQYTLSDVNGDGLPDLIYNHQGKTRFLPLQRNGSGGLQFG
NYKTVNYGGRLKRSGGSSFTYGFDFALPLNIFYFGMNWNRTKSSTSTYLTDYNADGISDV
VSGRSGENGVVHFGRVDANGDIKYSVSSISTPNVVKQGVAVAQSEDTDEVLKDLEIVRVW
EAPFDGEIEINGWAELLRESEDEVSVGVQQNNSFLIPMRSLYPTVPEEITEVTQVDRGDL
LMFRVRANENGYDDLVEWNPEVEYIDLAEGDLSKTDPNGIDYLNSTYEDGFLLSAGEGVS
FRGDELASVNWPPFSAGPFTDDVILRVYARISDPTNNSLVDEYVYKMKIAAGNTRNPIPS
QFVDYFGSEEILDLSNIPGFEPHYVCDLSFEIFSHSNVKWKEISWRPQITITSGDCNMEK
HFYPVVYYKNWNKVEKMDAPLLVEGPNTYMTSPSIDESIIESLFDDENAPDSYKLYFVTK
QKGVASVSPQDGLGTKIMILLTPGDGIQYFHVPEWGDEPGEEIPPGEITENNDFTVGSED
NEVYAEFYTDSKEVAQLLRETASVNLYSSGGPIVEEAEEFNIYYRDHNVLQDYFLHWGQF
CWSDSVADPILTSELYIPAQDVAENNDYSDESTPDTSTMSSLKDDMNPMDWQFFPLSAKR
GENQGQLRDYIKSYSLSPNPEYLDRWIALGTHVGTYSHMGITAPGKLGEEEPLGDPESPS
VPDPTYGASTALPLSRGLSLGMSWGSGPVVDSKTFTSSNYGNWSLSSAMDINGDGYPDIL
RSESALRAQVTDALGGYGSEYSYDPDKSLGYSLSDNLGRSISGKFLNEDPRFQDVGNSAS
GNFGQDYTKVEWQDMNGDGLADRISSGNSGTDVELNTGKGLKSPVDIGTSNHNQSSNLAF
SLGASYSNMDNGFESTGMSFSGGIGLSRSGGKSKRLLIDLNGDGLPDQVSVSGGNVSVSL
NTGTGFETYTEASIDELDNLNRSDALGISANVAGTYSFYVMFFLLAVLKVSISGGVQGNF
AINKLSSSLRDMNGDGVLDFIETDNKGNLKIYKSKLGKQNLLKEVTNPLGGGFVIDYGQE
GNKYGDYPTRIQTHDTPERDRMIWDMPNSKWVMRQVDVFDGLDIQNGSGEDVDGTDTLHY
YFAYDGGVKSRRERSFLGFTRTETRYEANREEPIQDHPKIYITEVTDYPKPLKNDPGYRK
RFEYMQGITEDHYTLYHKEVLEQVDIQGGGYQWVYNHYIKLMEHRENRYVYKEVDQNTGL
ATSNVVDWNAIGETQTVFPALSVIKKISVPQVEDSTTFFTTKDTINYDSYFNVKRYMQEA
SDPTTGMGDSIELEPMIVTSYEYDTLEFFFSDITNGNSPFDAGSIDPETGMVCHTISNSG
FDPIDYCVPGHFDSNFIYNIKNNPCYDSSGLYTEATQFEIVFRKEVSDTIHRKRARYNTT
YHGALIAVMEYYNPTMARNQTNMLKWHKVYFGSTDDDSLRRYVKVEALQDQKAPSLIWNY
LNDEDYAETDVTYDDKGNVIEVIGPVNDDGQRLRVQYDYDTEVEQYVTHINNLSYGEERC
MIYDYETGNLMEEKDVNGHSIAYRYDDKSRLVSVFGPREFEDPSSAPTMSFAYFPEGTVS
GNGVPVAFTYHNMDVAEEPSGEGQGDLEGGCSEPADLDGRPEITTAMQTSTFMDGMQRVI
QVKKDASQSGNIKREVSGMIAYDYLGREAKKTISHLENHSVSPGVMDFSPSSFLLYKKRY
DYAGRIKELVEYNEDYDSVMTGFAYDWSTGIIQANEKDFYTESSKEGFISRKYKDVRGNI
IGTSLSSDGYALAKMYYDPLKQLKTVKDPIGEITTYEYDNFGRTTQESHPDRGISEFQYD
LAGNLIEAITAENPDGIVMNYDYLRLKEKIMPPGTGYTGDVNNVEYTYGSPGDGKNGAGR
IVEIIQGNNFKTEEYKYDELGNLIWEYTNIGIPNAGFREYEMSYRYDSWGRMRWIKYPDN
EQVEYVYTDAGELESFSRIAGPGGTVDIVSEVQYDGFGNIAEIQYGNNTHTQFTYNGFTR
RLQYSELHDADGMPMLDKEYAYSDRGNVESIDNSSGVYQSPLTSNELGGGYNFSYTYDAL
SRLSNASGSATFTGDASHEYNVGMEYYADGRIRKKLQTHTIDEAPTKYDYDMTYIYNDEN
KRHQIDYISQVVDDPFFGETTFENVYSYNEEGSVTGVEINSEFALFEPPYYKWDEMQQLN
ASFNPLYGTQHYLYDQNRERILKGNMREVDGETNGEGGDPEYVMDSYTFYLNPYYVVTHY
DETTEGSKHYYMGSQRVASSMISYIVTEAIYEGTLEPSLETTSGSIKNLDDILYDVQEQG
LMEGFTVESIDYNEFLAIPILQEAIPFAGGLEEEMDGCEGDEQCLCEQSIFHAREQYGIA
CEQIQVMYWYHPDYLGNTEWVSNRPGYGHQYFWYSPWGEALHEDHDRGQFESRYLFNAKE
QDIETDNYYYGMRYYDPQISMWLSVDRLAAKYPAWTPYNFTMNNPVNLIDPNGDSVKTSQ
EGYDIINQGLTSTLGESHPFGYDQDKGAVTFDQNFDRSKYNKDQLDVIDRYSSLVISESD
MVNVSVVNFEENISEINQSLADRGAGGVTVPYSIKNSKTGERIGTEQNVYIARNPQRKIG
TDPFGNARYQAERPYYPGLTSIHEIGGHAYLHVKQPGVSNHNQLVESFENRVRNFYMYKG
APIKGFARKH
NT seq 10293 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaataaagatattataacaaaaatcgcgtcctttttattgatattcttctttttg
gggaatgatttggtcgccagcgtaagggctgtaatacattttccgactgagaaaacaagt
cctgtaagaataaccaaagttcctgaaagaaatcgagtaacaaaaaatcccaaagcttcg
cctaatcgttacaataaggaaaatgcagtaaaaagaagctccggtgcttcccgtttaatt
tttaatgcacaagaagccgaagcttacctcggtaaacacgaaaaagatccgatgggactt
cccgtgaatgatttctttgccatagaagttgacaaagatataagggaatattcgtacgca
tatctcgaataccaaatccgggggttggaagatgggctgagtatacccaagtcggtcaac
aatgaacccgtgtatactggatcaccggtaaagccgggtacggaatggcaaactattcgt
caaaaactggatcgcacggagattaaacagggggtcaatcaagtgcgatttagcctgtcc
cgtttttataagttcccggtaacgattaaaaatgtgcgcctccaactttcaaatgagaca
atgaaagcgggagatatgctgaaagaagaaaggattcaggcgaaggaggaagactttaag
gtaatggaaggaaaggaagggcatgtctttaaattaagggatgtggacatgccatcgatt
cccgacggtatacgcaatgtgagccgcaatgcctggggatatttttatcaatcccaaagc
gaaaagactgtaaaggtttccattggggtaaataaagaaatactggcttctgggaagagc
cttgctgaggttcagattttttattttaataaaaaagatcgtgtctggaaacctgcacac
gtagagcacgtggatatggccaaaacgaacctggaggggagtgttccttccaataccaat
tattttgccggtttgattacagctccggaaatgccggaagccaaggcacatgtccccact
gccatgtccgatattaaggctgctaatccagctgccggtatgaacatcatacagcctcct
tccatcagcaataccggcgaggcaggtattcagtatccattggaaatcccggagggacgt
aatgggatggccccaaacctaaatctaacctatagcagcgatgccggcacaggatggatg
ggaatgggatggaatattagtattccgagtgtaagtatagactcgcgatggggagtgcct
acttttcccactaagcaagctgaagtttatatgttaaacggtaattcgctggtggaagag
ggaggatacaaaggaaaccggaaccctacaacccgtaccggtggcgatgtccgttttttt
gagcatgtacagagttcatataaggaaattgtgcgtaaggggggcagtacttccgattac
cggtggatagagacaaccgccaatcatactactttttactatggtacaacagacggatca
actgtagccgaagatgccgtgctgcgaaatagctcaaatgcttccggagatattgtccgc
tggtacttaaagaaagtaaaagacaaatgggggaattttatgacctattcctattctgat
atcagcgggtccggcggtataaaaaatggtgccaggggcaaggttttatctagcatacaa
tatacttcccatgagtctaccagtggaaggtatagtatagaatttgacctggcttcgggc
acgcgtagagatggaaaagtaaccatgaaccttggatttccggaactggatgaccgttta
ttggagcaaatccgcgtgatgtatgacagtgaagaggtcaagcggtttgagttcaattac
aagaatgatgatactacaatgtttaaaacccttttgacatcggtagaagagtatcgaaaa
gggagtttgttttatgaccacaattttaaatattatgaaggtaccctcgaatacagcggt
gcagaaacaattaacctatcgtattttaataatagtctgctgggggatattccttctgaa
gtgtcctcattgaccgcccccttaagcacgcaggcctatccttcgcccatcagtaccact
actacactgggatggggtaccaatggatctataggagttggtgtagcgccgttaacagat
gtgccgaataaagcgtttacattttccgggcgattgggatattcccaaacctttaataaa
gaccagtatacccttagtgatgttaatggggatgggttaccggaccttatatacaatcat
caggggaaaacccgctttcttcctttgcagcgaaatggttccgggggattgcagtttgga
aattataaaaccgtaaactatggagggcgtttgaaacgttcgggcggaagtagctttact
tatggtttcgatttcgctttgccgcttaatattttttatttcggaatgaactggaaccgg
acaaaatcgtctacctccacctatcttacagactataatgccgatggtatttcagatgtg
gtaagcggtcgaagcggggagaatggagttgtgcactttggtagagtagatgccaatgga
gatatcaaatattctgtcagtagcatttctactcccaatgtggttaagcaaggtgtggcc
gtggcccaaagcgaagatacagacgaggttctcaaagaccttgaaattgttagggtatgg
gaggctccctttgatggggaaattgaaatcaatggttgggcagaacttttacgggagtcc
gaagatgaggtatcagtaggggttcaacaaaacaattcctttctaataccgatgaggtca
ttatatccaacggtacccgaggaaataacagaagtaacacaggtagaccgtggcgatctt
ctgatgttccgggtaagggccaatgaaaatggctatgatgacctggtagaatggaacccg
gaagtagaatacattgacctggccgaaggggacctctcaaaaaccgatcccaatggcatc
gactatctcaattccacttacgaagatggatttttattatcggctggcgaaggggtatct
ttcagaggggatgaattagctagcgttaattggccacctttttctgcgggtccttttact
gatgatgtaatcctgcgggtctatgcgaggattagtgatcctaccaacaatagcctggtt
gatgagtatgtatacaaaatgaaaatagcggcgggcaatacccgaaatcctatcccgtca
caatttgtagattattttggtagtgaagagattttggatctatccaatattccgggtttt
gaaccacattacgtctgtgatctctcttttgaaatttttagccattccaacgtaaaatgg
aaggaaatttcctggaggccgcaaatcacaatcacttcgggtgactgcaatatggagaaa
catttctacccggtagtatactataaaaactggaataaggtagagaaaatggatgccccc
ttgctggttgaaggaccaaatacatatatgacctctccttcaatagatgagagtattata
gaaagcttatttgatgatgagaatgcaccggattcctataagctttacttcgtaaccaag
caaaaaggggtagcttcagtttctccacaagatgggctgggcaccaagatcatgatcctg
ttgacccctggcgacggcatccaatattttcacgttccggaatggggtgacgagccgggg
gaagaaataccccccggagaaataacagaaaacaacgattttaccgttggatcagaagat
aatgaggtctatgcggaattttataccgatagcaaggaagtagcacagctactgcgggaa
acagcaagtgtaaatttgtatagtagtggagggcctattgtcgaagaggcagaagagttc
aatatctattaccgtgaccataatgtccttcaagactactttctacattggggacaattt
tgttggagcgactctgtagctgatcccattctcacttccgagttatatatcccggcacag
gatgttgctgaaaataacgactacagtgatgaatcgactcccgatacctcgacgatgagt
agccttaaagatgacatgaaccctatggactggcagttttttcccttatcggcaaagcgc
ggggaaaatcaaggtcagttaagagattatattaaaagttattccctatcacctaacccg
gaatacctggatcgttggattgccttgggcactcacgtgggaacgtattcccatatggga
ataaccgcaccgggaaaacttggcgaagaagaacctcttggagatccggaatccccttcg
gtaccggaccccacttatggggcttctacagccttgcccctaagcaggggattatcttta
ggaatgagttggggaagcggcccggtagtggactccaagacatttacctcttccaattat
gggaattggagcttgagttctgccatggacatcaacggggatggatacccggacatattg
aggtcagaatctgctctacgagcacaggtaacagatgccctgggcggctacggatcagaa
tatagctatgacccggacaaaagccttggttattctctctccgataacctggggcggagc
atatcggggaaatttttaaatgaagacccccgttttcaggatgtgggaaatagtgcgtcc
ggaaattttgggcaggattataccaaggtggaatggcaggacatgaacggagatggattg
gcggaccggatcagtagtggaaacagcggaacagatgtagaactcaataccggaaaaggg
ttgaagtctcctgtcgatatcggaacatccaatcataaccaatcctctaacctggcattt
agcctgggggcctcttatagcaacatggataacgggtttgaaagtaccggcatgagtttt
agcggggggataggtttgagtagatccgggggaaagtcgaagagacttttaattgacctc
aatggggatggactgcctgaccaggtatctgtttcaggggggaatgtttccgtgtcctta
aatacgggtacagggtttgaaacctataccgaagcttctattgatgaactggataattta
aacagatcggatgccttgggtatttccgcaaatgttgcaggcacatactccttctatgta
atgttttttttactggccgtactgaaagtatcaatttcaggtggggtgcagggaaatttt
gcgatcaataaacttagttcttccctgcgtgatatgaacggggatggtgtcctggatttt
atcgaaaccgacaataagggaaatctcaaaatttacaagagtaagctgggcaagcaaaat
ctgctcaaggaagtgaccaatccgctcggtggtggctttgttatcgactatgggcaggaa
ggcaataaatacggagattacccaacacggatacagacccatgatactccagaacgggac
cgaatgatctgggatatgcccaatagtaaatgggtcatgcgccaagtggatgtatttgat
ggcctggatattcaaaatggaagtggtgaagatgtcgatggaaccgatacgcttcactac
tattttgcctatgacggaggagtgaaaagccgaagggaaaggtcgttcttgggatttacg
cgtacggaaacccgatatgaggccaatcgagaggaaccgatccaggatcaccccaagatt
tacataacggaagtaacggattatcctaaacctttaaaaaatgatccaggctatcgcaaa
cgttttgagtatatgcaaggcataaccgaagatcactacaccttatatcacaaagaagtt
ttggaacaagtagacatacagggcggtggttatcaatgggtgtataaccactatataaag
ctcatggagcaccgggagaaccgttatgtctataaggaagtagatcaaaatacaggactg
gccacttccaatgtcgtggactggaacgccattggggaaacccaaaccgtattcccggcc
ttaagtgtgatcaagaaaatatccgtgccccaggttgaagactccacgaccttctttacc
acaaaagataccataaactatgactcctattttaacgtgaagcggtatatgcaggaagcc
agtgaccccaccaccggtatgggtgatagcatagagctcgagccgatgatcgttacttct
tatgaatatgataccctggagttctttttctcagatatcactaatggcaacagtcctttt
gatgcaggctcgatagatccggaaacgggcatggtttgtcacacgatttccaattcgggc
tttgatcccatagattattgtgtcccgggtcatttcgattctaattttatctataatatt
aaaaacaatccgtgctatgatagcagtggtttatatacggaggccacgcaatttgaaatt
gtttttcgaaaggaagtttccgataccatacaccggaaaagggccaggtacaataccacc
tatcacggcgccctgattgccgttatggaatactataacccgactatggcgcgcaatcaa
accaatatgctgaaatggcacaaggtgtattttggcagtaccgatgatgatagccttcgc
aggtatgtaaaagtagaagcccttcaggatcaaaaggcaccgtcccttatatggaattat
ttaaacgacgaggattatgccgaaacggatgttacttatgatgataaaggaaatgttatc
gaggtaattgggccggttaatgacgatggtcaaagacttcgagttcaatatgactatgac
acggaagtggagcaatatgtaacacatatcaacaacctttcatatggagaagagcgctgt
atgatatatgattatgagaccggtaacctgatggaagaaaaggatgttaatgggcatagc
atagcctaccggtatgatgataaatcccgtctggtgtctgtattcggcccgagggagttt
gaagatccttcgtcggcccccacaatgtcctttgcttattttccggaaggcacggtcagt
ggaaatggagtcccggtggcctttacctaccacaatatggatgtagcggaagaaccttct
ggagaagggcaaggtgaccttgaggggggatgttctgaaccggcagatctggacgggcgt
ccagagattaccacggcaatgcaaacctcgacatttatggatggtatgcaacgggtcata
caagtgaaaaaagatgcctcccagtctggtaatataaaaagagaagtttcgggtatgatc
gcctatgattacctgggaagggaagctaaaaaaacaatatcccatttggagaaccatagt
gtgtcacccggggtgatggatttctcgccctcttccttcctgctttacaagaaacgttat
gactatgccggcaggataaaagaactggtggaatataatgaagactacgatagtgtaatg
acgggttttgcctatgattggagcacggggattattcaagcaaatgaaaaggacttttat
acggagtcaagtaaagaagggtttatttcgagaaaatataaagatgttcgcggaaatatt
atagggacctccctaagtagtgacggatatgctttggcaaagatgtattacgatccccta
aagcaattaaaaacagtaaaagaccctataggagaaataaccacctatgaatatgataat
tttggccgcaccacccaggaaagccaccctgaccgtggaatttcagaatttcaatatgat
ttggcggggaaccttatcgaggccattactgctgaaaacccggacggcatagtgatgaat
tatgattatcttcgtttaaaagagaaaattatgcctccaggcacaggttataccggcgat
gtgaataatgttgagtacacctacggttcccccggcgatgggaaaaacggtgcaggcagg
atcgtagaaataatacagggtaataacttcaaaacggaagaatataaatacgatgaactg
ggtaacctaatttgggaatacaccaatatcgggatacccaatgcagggtttagggaatat
gaaatgagttaccgatacgatagctggggacgtatgcgttggatcaagtacccggacaat
gaacaggtagaatatgtctataccgatgcgggtgaattggagagttttagtcgtatagcc
ggtccgggaggaacagtagatattgtaagcgaggttcaatatgacggttttgggaatata
gcagagattcaatacggaaacaatacccatacccaatttacctataatgggtttacccgc
aggttacaatattccgagctgcatgacgcagatggaatgccaatgttggacaaagaatat
gcctatagtgaccggggcaatgtggaaagtattgacaatagctccggggtatatcaaagc
ccattaacctccaatgaattggggggaggctacaatttttcttatacctatgatgcttta
agtagactctcaaatgcatccgggtcagctacttttactggcgatgccagtcatgaatat
aatgtgggtatggaatattacgccgatggaaggatccgtaaaaaactacagacccatacg
attgatgaggcccctactaagtatgattatgatatgacctacatatataacgacgagaac
aagcggcaccagatagattatatcagtcaggttgtagacgatccattctttggggaaacg
acttttgaaaatgtttattcctacaacgaagagggtagcgtaaccggggtcgaaataaat
tctgaatttgccctttttgaacctccctattataaatgggatgaaatgcagcaactcaat
gcttcgtttaatccattatatggtacgcaacactatttatatgaccaaaatagagaaagg
atactaaagggaaatatgcgagaggttgatggagaaacaaatggagaaggtggagatcct
gagtatgtgatggacagctatactttttatctcaatccatattatgtagtgacacattat
gatgaaaccacagagggaagcaagcactattatatgggcagccaaagagtcgccagctcc
atgataagctatattgtaacagaagctatttacgaaggtacccttgaaccatcattggaa
acgacttcgggttcaatcaagaacctggatgatattttatatgatgtgcaggagcaagga
ctgatggaagggtttaccgttgaatccatagactataatgaattcctggcgattcccatt
ctacaggaggccataccctttgccggtggacttgaagaagagatggacggatgtgaaggg
gatgaacaatgcttgtgtgaacaaagtatctttcatgcccgcgaacaatatggcatcgct
tgtgaacaaatacaggtaatgtactggtaccaccccgattatttgggaaataccgagtgg
gtaagcaaccgtcctggttacggacatcagtatttttggtacagtccatggggagaagct
ttgcacgaagatcatgaccgggggcaattcgaaagtcgttaccttttcaatgcgaaggaa
caggacatagagacggataattactattatgggatgcgctattacgacccccaaatcagt
atgtggctatcggtcgacaggctggcagccaaataccccgcctggaccccatataatttc
acaatgaataaccctgttaatttgattgatccgaatggggatagtgtaaagacttcgcaa
gaggggtatgatataataaatcaaggattaacatccactcttggggaatctcatcccttc
ggttacgatcaagataagggagctgttacatttgatcaaaattttgataggagtaaatat
aataaggatcagttggatgtaattgatagatattcctctttagttatttctgaaagtgac
atggtaaatgtctcagttgttaattttgaagagaatatttctgaaatcaaccagagttta
gccgatagaggagcaggtggtgttactgttccatattcaataaaaaattcgaaaacagga
gaaagaataggtacagagcaaaatgtttacatagccagaaaccctcagcgaaaaattgga
actgatccttttggtaatgcacgatatcaagcagaaaggccgtattatccagggttaaca
agtattcatgaaataggtggacatgcttacttgcatgttaagcaacccggtgtttctaat
cataatcaattggtggagagttttgaaaatagagtcagaaatttttatatgtataaaggt
gcgccaattaaggggtttgcgagaaagcattaa

DBGET integrated database retrieval system