Flavobacterium anhuiense: BB050_03588
Help
Entry
BB050_03588 CDS
T04718
Name
(GenBank) PKD domain protein
Organism
fjg
Flavobacterium anhuiense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
MBG_2
Por_Secre_tail
FlgD_ig
NAR2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOC96677
LinkDB
All DBs
Position
complement(4229022..4235390)
Genome browser
AA seq
2122 aa
AA seq
DB search
MKKKLLLLFTFFCVFSFHQNLKGQTLGPGDIAFIGFDTGGQDGFSFIALKNLPAGEIVYF
TEEGLFINGWIGSNEPHIRWTIPPNVTVGTIISVIETATNNVFTATASVIGDVTSSFVIN
PTGPVYSFNLSAGDQMLAYQSVGNVMRPTMTPVPDPIPDPEPVQPNITFIAGVHGDYNVS
NYDVVTHWNNPNTTGNLGGGESIKPWGLENGKNCVALFPGITEQGQFFAKYTGSLTGTAT
AIRTSINTYSNWIITTPTSTPAGSQGILPSNYTAPNITPMVAPTVTTNTPVTSFGAVSAV
LGGSNDNGGDTGTINRGVVWSLTTNPVISGPGVTNVFGTAGTGAFTINVLSLPPATTIYY
RAYAQNSIGTSYGNTVSFTTNSTLSATQSQTIACNGTNNATATVNVSGGKSPYTYAWTNG
STAATATGLEPNITYNVLITDSEQTTISKNFTIAENPAILGGLSVTNVACNGGNNGSIDL
TPSGGSGSYTYNWGGGVTTQDRTGLVAGTYSVTITDSNNCSTIINNIVVSQPTALSAAIG
GGKTDVSCNGGANGTATVAPTGGAGSYTYSWNTTPVQTTATATGLIAGTYTVTVTDANNC
QTTRTFTINQPPLLNIATGGGKTDVSCNGGANGTATVVPTGGAGGYTYSWNTTPVQTTAT
ATGLAAGNYTVTVTDANSCQATRSFTINQPATALNAASGGGKTDVSCNGGANGTATVAPT
GGAGGYTYSWNTTPVQTTATATGLAAGTYTVTVTDANNCQATRSFTIDQPATALSLLTGG
GKTDVSCNGGANGTATVAPTGGAGSYTYSWNTTPVQTTATATGLAAGTYTVTVTDANSCQ
ATRSFTINQPATALSLITGGGKTDVSCNGGANGTATVVPTGGTPGYTYSWNTTPVQTTAT
ATGLAAGTYTVTVTDANSCQATRSFTINQPPALNLSIGGGKTDASCNGGANGTATVVPTG
GAGGYTYSWNTTPVQTTATAMGLTAGTYTVTVTDSNSCQATRSFTISEPPALTASNGGQT
DVSCNGGSNGSATVNVTGGTGTYTYQWAPSGGTAATATGLSAGTYIVTVKDANNCQTSQS
FTINQPPILSATQTHTDVLCNGGATGTATVTASGGTGNYTYLWSPSGGTAATATGLTVGN
YSCLITDANGCSITKNFTINQPSVLGATTSQTNATCSVGGDASVTPFGGVGNYSYLWTPG
GATTQNITNLAAGNYSCLITDGNGCTVTKNFIINTTNTLVAATYQVNVLCNGSNTGSASV
IPSGAAGPFTYSWSPSGGSSDTANNLSAGNYSVTITASNGCSIVKNFTITEPSSIVITPN
PQTNVTCSGGNNGSASVSVTGGTGAYSYTWSPSGGNAATATGLSAGTYTVTVKDANSCTK
TQSFTITEPNALSATTSQTDVTCNGGSNGTATVNVTGGTGTYTYSWSPSGGTAATASGLP
AGTYTVTVKDANLCQTTASVTITEPPVLTATVAKTDVLCNQANNGTATVTPSGGTGTYTY
SWSPSGGTAATATGLSPNTYSVTVTDANGCSVTETVQITEPSALSLTDSHINVSCNGGNN
GTASVVATGGTGGTGAYTYSWSPSGGSAATATGLTAGVYTVTVTDENSCSATKAITITEP
DALTLTATPLAVSCHNGNNGSATVSVTGGTGAYSYSWAPSGGNAATATGLAAGTYTVTVT
DDNSCTATATVEVIQPANPVNLNTAVVSGITTTGASLSGTASSDGINTDSGSCLTEVGFV
YAQHANPTTADTKINVTAALGTFANSLSGLRGNRTYYVRTYAINSNGFINYGNEVSFTTQ
KYTLTITAATGHTKVYGTTDPVFNYTALGFANGDTNSILSGLLTRDAGENVGKYNINLGT
INAGADYVIAFTGAEFEITKANQTITWNQTLEFGCSDSKNVTLTATTDSGLPVSYSIANA
ALGTISGSTLNITGSGSSTITATQNGDQNHNPATVVVKPIEISQSGLVIQQWANVLFFDN
RSNNFVAWQWYKNGAAISGATKQYYSEIQPLNGIYYVIAKDKNGNSIKSCPIETTGTIFT
KKIKIYPNPVKPNAEFTLECDFSESQLNGSEVVIYDIAGKLVQTISNVKPKNQIIAPSQT
ALYIVVLKLADGQLKTINLLVK
NT seq
6369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaattacttttactttttacgttcttttgcgtctttagttttcatcaaaat
ttaaaaggacaaactttagggcctggagatattgcttttattggttttgatactggaggt
caagacggcttcagctttattgccttaaaaaatttaccagcgggagagattgtatatttc
accgaagaaggtttatttatcaatggctggataggaagcaatgaaccacacataagatgg
acaattcctcctaatgtgaccgtaggaacaatcatatctgtgatagaaactgcaacaaac
aatgtctttactgcaactgctagtgtaattggtgacgtgacaagtagttttgtaattaat
cctacagggcctgtttacagctttaatctatctgcaggagaccagatgctagcctatcaa
agcgttggaaatgtaatgaggcctacaatgacaccggtaccagacccgataccagaccca
gaaccggtacaaccaaatataacttttatagcaggtgttcatggcgattacaatgttagt
aattatgatgtagttacacattggaataatcctaacacaacaggaaatcttggtggtgga
gaaagtataaaaccatggggattagaaaatggaaaaaattgcgttgcattatttcctggg
attacagaacaaggacaatttttcgcaaaatacacaggttccttaacgggtacagctact
gctataagaacaagcattaacacgtacagtaactggattattacaacaccaacttctaca
cctgcaggcagtcaaggaatcttacctagcaactacactgctccaaatataactcctatg
gtagccccaacagtgaccacaaacacaccagtaacaagttttggagcagtctcggccgtg
ttaggaggttcaaacgataatggcggagacactgggactataaatagaggcgttgtttgg
tctttaacaaccaatccagtaataagcggtccaggagtaacaaacgtatttggaactgca
ggcactggtgcatttactataaatgtactttcactgcctccagcaacgacaatatattat
agagcctatgcgcaaaattcaattggtacatcttatggaaacacggtatcttttacaacc
aattccacattatctgcgacacaatcacagacaattgcttgtaatggcaccaataatgca
acggcaacagtaaacgtttcaggaggaaaatctccttacacttatgcttggactaatggt
agtacagcagcaacagcaacaggtttagagccaaatattacttacaatgttttaataaca
gacagtgaacaaactacgatatcaaaaaattttactatagcagaaaatccagcaatattg
ggtggacttagcgttaccaatgtggcgtgtaacggaggaaacaatgggtctatagacctt
accccttcaggaggcagcggatcttatacatacaattggggaggtggagtcacaacacaa
gatagaactggtctagtagcagggacatattctgtcactattactgactctaataattgt
agcacaataataaataatattgtagttagtcagcctacagctttaagcgcagcaattgga
ggcggaaaaacagacgtatcctgcaatggaggcgctaatggcacggcaacggtagctcca
actggaggtgctggaagctatacttattcctggaatacaacacccgtccaaacaactgct
acagcaacaggactcatagcagggacttatactgtgacggtaactgatgccaataactgc
cagacaactagaacttttactattaaccagcctccattattaaacatagcaactggagga
ggcaaaacagacgtatcctgcaatggaggcgctaatggcacggcaacagttgtgccgacc
ggaggtgctggaggttatacttattcttggaacacaacacctgttcaaaccactgctacc
gcaacaggtcttgctgcaggcaattatacggtaacggtaaccgatgccaatagctgtcag
gcaactaggagctttaccattaaccagccagcaacagctttaaacgctgcatctggagga
ggcaaaacagacgtatcatgtaatggaggcgctaatggtacggcaacagtagctccaact
ggaggtgctggaggttacacttattcttggaacacaactcctgtacaaacaaccgctacg
gcaacaggtcttgctgcaggcacttatacagtaacggtgaccgatgccaataactgccag
gcaacccgaagctttaccattgaccagccagcaactgctttaagcctactaactggagga
ggcaaaacagacgtatcctgcaatggaggtgctaatggtacggcaacagtagctccaact
ggaggtgctggaagctatacttattcttggaacacaactcctgtacaaacaactgctact
gcaacaggtcttgctgcaggcacttatacagtaacggtaaccgatgccaatagctgtcag
gcaactagaagctttaccattaaccagccagcaactgctttaagcttaataactggagga
ggcaaaacagacgtatcctgcaatggaggtgctaatggtactgcaacggttgtgccaact
ggaggaactccaggttatacttattcttggaatacaacacctgttcaaacaactgctacg
gcaacaggtcttgctgcaggcacttatactgtaacggtaactgatgccaatagctgtcag
gcaactaggagctttaccattaaccagccaccagctttaaacttatcaattggaggaggc
aaaacagacgcatcctgtaatgggggcgctaatggtacggcaacagttgtgccgaccgga
ggtgctggaggttatacctattcttggaatacaactcctgtacaaacaactgctaccgca
atgggtcttactgcaggcacttatacagtaacggtaaccgattctaatagctgccaagca
actagaagttttactatatctgaaccgcctgcacttacggcaagcaatggtggtcaaacc
gatgtttcttgcaatggaggatcaaatggttcagctactgtaaacgttactggaggaaca
ggcacttatacttaccaatgggctcctagcggaggaactgctgcaactgctacaggacta
tcagctggaacttatattgtaacagtaaaggatgctaataattgccagacttcacaaagt
ttcaccattaatcaaccacctattttaagtgcaacacaaacacataccgatgttttatgt
aatggcggagcaacaggaactgctacagttacagcatcaggtgggactggaaattatacc
tacttatggtctccatccgggggtacagctgctactgctactggcttaaccgtaggaaat
tatagctgcctaattacagatgctaatggatgttctattactaaaaattttacgatcaat
cagccttcagttttaggcgctactacttcgcagacaaatgcaacttgttctgtgggtgga
gatgcttctgtaacaccattcggcggtgttggtaattatagctatttatggacaccagga
ggtgctaccacgcaaaatattaccaacttagccgcgggcaattacagctgcctcattaca
gatggaaatggatgtacggtcactaaaaactttatcatcaatacaactaatacactagta
gctgctacttatcaagttaatgtgttatgcaacggatccaacactggttctgcttcagtt
attccttcaggagccgctggaccgtttacttatagttggtctccttctggaggatcttct
gatactgcaaacaaccttagtgcaggaaactattctgtaacaatcactgccagcaatgga
tgttcaattgtcaaaaactttacaatcactgagccatcgtccattgtaataacaccaaat
cctcaaacaaatgtgacttgcagtggaggaaacaatggttctgcaagtgtttcagtaaca
ggtggcacaggtgcatattcctacacttggtctccttctggcggaaatgcagcaacagca
accggactttctgctggaacttatactgtcacagtaaaagacgctaactcatgcaccaaa
acacaaagttttactataacagaacctaatgctcttagtgcaacaacatctcaaaccgat
gttacttgcaatggaggttctaacggaactgcaaccgtaaacgttactggaggaactgga
acttatacatactcttggtctccttctggcggaactgccgcaactgcttctggtttacca
gcaggaacatatacagttactgtcaaagatgccaacctatgtcaaactacggcaagcgta
actattactgaacctcctgttcttacagcaacggtagctaaaacagacgttttatgcaat
caggcaaataacggaacagctactgtaactccttctggaggaactggaacttatacctat
tcttggtcgccatctgggggaactgctgcaacagctacaggattaagtccaaatacttat
agtgttactgtgaccgatgcaaacggatgttctgtgacagaaaccgttcaaattacagag
ccttctgccctttcgctaacagattctcatatcaatgtttcttgtaatggaggcaataac
ggtactgcatctgtagtggcaactggaggaactggaggaactggagcttatacttactct
tggtctccgtctggcggaagtgcagcaacagcaactggtcttaccgcaggagtttatact
gtaaccgttacagatgaaaattcatgttctgcaacaaaagcgattaccattacagaacca
gatgccttaaccttaactgcaactcctttagcagtatcttgccataacggaaataacggg
tcggctacagtaagcgtaacaggcggtacaggtgcctattcttactcttgggctccatct
ggcggaaatgccgcaactgcaactggtcttgctgccggaacttacactgtaactgttaca
gatgataattcttgtacggctactgcaactgttgaagtaattcaacctgctaatccagtc
aatttaaatactgcagtggtttctggaataactacaactggcgcttcattatctggtaca
gcatcttctgacggaatcaatactgacagtggttcttgtttaacggaagttggttttgta
tatgctcagcatgctaaccctactacagctgatactaaaattaatgtcactgctgcatta
ggaacatttgcaaactctttatctggacttagaggaaatagaacgtattatgttagaact
tatgctataaacagtaacggttttattaattatggaaatgaagtaagttttacaacacaa
aaatatactcttactataaccgcagcaacaggacatactaaagtatatggcacaacagat
cccgtattcaattacactgctttaggttttgctaacggagatacaaactcaatacttagc
ggtctgcttacaagagatgctggagaaaatgttggaaaatacaacattaacctgggaaca
atcaatgctggggcagattacgtaattgcctttactggtgcagaatttgaaattactaaa
gcaaatcaaacaattacttggaatcaaacattagaatttggctgttcagattctaaaaat
gttaccttaacagcaacaactgatagtggcttaccagtttcttacagtattgcaaatgca
gcattgggaacaatttcaggatcaactttaaacattacaggttcaggaagctcaaccatt
actgcaacacaaaatggagatcagaatcataatcctgcaactgtcgttgtaaaaccaata
gaaataagccaatctggtcttgttatacagcaatgggcaaatgtcctattctttgataat
agatcaaataattttgtggcttggcaatggtataaaaacggagcagctatttctggagca
actaagcaatattatagtgaaatacagcctttaaatggcatttattacgtaattgcaaaa
gacaaaaacggaaactccattaaatcttgtccaattgaaacaactggaacaattttcacc
aagaaaatcaaaatttatccaaacccagttaaacctaatgccgagtttactttagaatgt
gattttagcgaatctcaattaaatggatctgaggtggttatttatgacattgcagggaaa
ttagttcagactatttcaaatgtaaaaccaaaaaatcaaattatcgctccatcacagaca
gccttatacattgttgttcttaaactggctgacggtcagttaaaaacaatcaacttattg
gttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system