Flammeovirga sp. MY04: MY04_5082
Help
Entry
MY04_5082 CDS
T04442
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
flm
Flammeovirga sp. MY04
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANQ52417
LinkDB
All DBs
Position
2:1450343..1457281
Genome browser
AA seq
2312 aa
AA seq
DB search
MKLNLLYITFLLILTTGLTNNTFSQRLMQGNPPSGTDISGGVVEACDFLLTSFYVDDQGL
GPITNYSWNFGNGNTSTLANPTEAFTDNSGSIKDFTVTVSFTQGGTTKTLSTTVRLKPIP
TIDFESDVETACDGARITFTKTTNIDLANYEFIIDGKSYQDGQQSHQLAPKADGYDVYLV
GETLDGCKVETFKQTYINITERIYTTIDPTIVSSCQSTLTQTFTAETFLVKDDSPAPDIT
YTWNFGDGTTSTDQNPTHTFDISNGKNYTVSVTATNGGCVDTQIANVYLGVSENMFDYTP
PATFCATYPVTFRPQLPADLDGEQITWNFGDGTIVTSNVPNNVVHDFSNTTGAPVNYTVT
ATLDNGCTWSEIVTVPSMVLSDISITADNTLFCSDNFSVNMSINNLHDVNNYFWRIRETN
STDFPNNPNPTFTFNAGGTYTIQLIANDNGECLIDEVEVTSTPIDTQIVGVGVGVNCAPY
STTLSYNLSQGGIAIPDNSVSRTWTVTGRTNGVNLTGTGTTFPVNNLTADDYDVTVVLDF
GGGCTSTDTRVINVGEQIDLDFTFFPGPAICNNTTVDFTNTSDRKGIPDADIQYYWDFNV
QGAPNWQAAGNVNGNSSHTFNELEAGFYTIGFYAVQNGCEAVPVFKQIEVITPRANFDME
MSLACDPTSITIDNLSTGAEAGGNYIWDISVSGTGGNRTTQIITTNINEDIPNHPDFLGL
NIDFGDQVTALLTVQNSASVPSVTPPNFCVDDYEVIITIPNKPPPMNPRWGLANNNYTNP
TEICSGTRLYFDPAVNNNTYPGSYFWRFTNLTTGTEYTRTNRRPNLEFNEGGDWEIEVTV
NYNNSGCTETITTGPFTVYEMDFRIDDDVDNVCIGEPITYFVEPGYKLEAPNITWVWEVN
GTDVSSGSGPVVDDLVWVYNDVLTPQSDRHRVRLKVYSDICDRNSNTERTRVTQPVLDFT
GPIEDYVSFAFRCDYIETYIDPNINTNTVYNPWNSDFIWELEYPDGTKTPITPDGIDNYI
FRFDNLTLGTYKAFLAVTDDNGCTTLDSLTFDVPEIPFSRAAFTPSEEELACPGFINFTD
LADGTDGNTIPRQDANGNEVSISDWVWSVTLSDGTVYTKNDDQGEFSYYFEPGDYKISMA
AQDTEGCILYADSMSINVGGVKGDIYIHKKIGYWPLNTNLEAIPADVSGEIQSIEYLWTL
GNGGAASGQIPNVDYEPDWSVIPNSSISYFPFLFFNSSIILVNGDTVECRYQAYEDPLNY
VTILKNPEVEIDDIFICTTEGDTTINAFDPNFQLTDIDTTHYSYKSEIFYQWYVDGQLIP
AMDGGIDSTITLTYCKDTTNCGYFDINPDDVDGRDYTLEIWLDAEYIDKVDPTHNHTDQR
VGYSTRTFNVKYDPTPVAVLPTLNPICLSDSIYIDASNSGFQPYTRGNITEYRWNITSAN
SYLKDTITTEPELGIIFPEEGDYDVQLTVVSDNICADSTVSQTLRVKPLPVVDFEAQEVC
IGDEMLFNNLTTFEGTEISTDPSIIQEVKWYFDVDNSPNDVGSTDINPLYAYPAPGTYNV
LLEVFTLEGCMESFSKEVIVRELPTITVSDSLYICFGDQVTLSVNGGTTYEWSTGETTQD
ITVAPIADSLFVVKAWNQYNCLTIDSVKVFVIPDFRERQTIFVACEGEEITFDARINDYD
GTVESFEWVDNESTDPTLTVSTPGDYTVINTITRPDGGSCTFTKTFTARFNPLPNEFAVD
TLVHCFSDGPITIDAPTGPSYAYVWDSGENTPSVIKNAPGTYTVTITDTSDTTNCSTITS
VVVFDPLTDAAFNFTQVCLGTETELTAQYENLDGLKIEYQWTLGTYESITTDTPNLTYEF
PDFGDHEVTLVVNPIGGCPSPAVTQTVTVYELPEPSFDVDEICIYGEAEFNNNTTYQGVR
ALEGGFDIALIEWDFNYDGSTPNFTSNEFSPRNAYNESGTFTILLQVTTTNGCTKQFMNT
LVVHPEPVITLTEDTYICEDDQITLEASGGSTYYWEGLGLTDNKITVDPKEDQTYVVQVT
SAAGCVSYDSVTVYVIPKIKLEDTYFEVCEGETVELNANIDDYDGVSQDFVWSNGETSDV
IYVDQPGTYTVSNTVTHESGKECVLTQSFEVVHRPLPAEFAVKERVICFDTESQIILEAP
QGNNFVYYWEDTGETSSTVSRTEEGEYTVYIIDESYDTDCETITSVVVDDICPPRLIVPT
AFTPNYDGTNDEFLIRSKYATDIKLNIYNRWGEIIFSRTYADSKEARTEGNGWDGMYRGN
LVMGGVYTVIVEYLSELDGENYRNSTPLTVIR
NT seq
6939 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactaaatttactatacataacgtttttactaattctaacaacaggacttaccaac
aacaccttttctcaaaggttaatgcaaggtaatcccccttctggtactgatatctctgga
ggagttgttgaagcctgcgactttttgctcacttcattttatgtagatgatcaaggttta
ggacctattactaattatagttggaatttcggtaatggaaatacatcgacactagcaaat
cctacagaggcatttacagacaatagtggttcgataaaagattttacggtaacggtatct
ttcacacaaggtggtactacaaaaactttaagtacaactgttcgacttaaacccatccca
acaatcgattttgaatcggatgtagaaactgcctgtgatggtgctagaatcacctttaca
aaaaccacaaatattgatttagcgaattatgaattcattattgatggtaaaagttaccaa
gatggtcaacaatcacatcaattggctccaaaagcagatggttatgatgtctatctagtt
ggtgaaacactcgatggatgtaaagtagaaacgtttaagcaaacttatatcaacattaca
gagagaatctacactactattgatccaacaattgtttcaagttgtcagagtacactcact
caaacctttactgcagaaacttttctagtaaaggacgattctcctgctcctgatattact
tatacttggaattttggtgatggcactacctcaacagatcaaaatccaacacatactttt
gatataagcaatggtaaaaattatacggtttctgtaacagcaacaaacggtggttgcgta
gatacacaaatagcaaatgtgtatttgggagtatcagaaaatatgtttgattacactcct
ccggcaactttttgtgctacctatccagtgacttttagacctcaattaccggctgattta
gatggagagcaaatcacatggaattttggtgatggaaccatcgttacttcaaacgtacct
aataatgttgttcatgatttttcgaatacaacaggtgctcctgtaaattataccgttacg
gctactttagataatggatgtacttggtctgaaattgtaacagtaccatcaatggtatta
tctgatatttcaattacagcagacaatacattgttctgttcggataatttctcggtaaat
atgagcatcaataatttacatgatgtaaacaattacttttggagaataagagagacaaat
agtacagatttccctaataacccgaatccaacattcacatttaatgcgggtggtacttat
accattcaattaattgctaacgataacggagagtgtttaatcgatgaggtagaagtaact
tctactcctatcgacacacaaattgtgggtgtaggcgttggtgttaactgtgcaccttat
tcaactacgctatcttataatttaagtcaaggtggtatagcaatacccgataattctgtg
tctagaacatggaccgtaactggtagaacaaatggggtcaacctaacaggaacggggacc
actttccctgtaaacaaccttacggcagacgattatgacgttacagttgtattagatttt
ggaggaggctgtacctctacagatacaagagtgatcaatgtaggagagcaaattgatctt
gattttactttcttccctggtccagcgatctgtaataatacaacagtagatttcacgaat
acatcagataggaaaggaattcctgatgctgacatacaatattactgggattttaatgta
caaggtgcccccaattggcaagcggcaggaaatgtaaacggtaattcttctcatacattc
aatgaattggaagcaggtttttataccattggtttctatgccgttcaaaatggctgtgaa
gccgttccagtattcaaacaaattgaggtgattactccaagagctaattttgatatggaa
atgtcattggcttgtgatccaacatcaattactatcgataatttatctactggtgcagaa
gcgggaggtaattatatatgggatatttctgtaagtggaacaggtggaaacagaactact
caaattatcactacaaacataaacgaagatatacctaatcaccctgactttttaggttta
aatattgattttggtgatcaagtaaccgcattattgacagttcaaaactcagcttcagta
ccttcagtaactccaccaaacttttgtgttgatgattacgaggtcatcatcactattcca
aacaagcctcctccaatgaatcctcgttggggattggccaataataattacactaatcct
actgaaatttgttcaggtacaagattatattttgatcctgctgtaaataataatacttac
cctggtagttacttttggagatttaccaatttaactacaggcacagagtacacaagaacc
aatcgtagaccaaatttagaatttaacgaaggaggcgattgggaaattgaagtcactgta
aattataataattctggctgtacagaaaccatcactactggaccgttcacagtatatgaa
atggatttcagaattgatgatgatgtagataatgtatgtataggcgagcctatcacttat
tttgtagaacccggctataaattagaagcaccaaacattacttgggtttgggaagtgaat
ggcactgatgtaagttcaggttcaggacctgtagtagatgatttagtatgggtatataat
gatgttttaacccctcaaagcgaccgtcatagagtaagattaaaagtatattctgatatt
tgtgatagaaattctaatacagaaagaacaagagtaacacaacctgtacttgatttcaca
ggacctattgaagattatgtctcttttgctttcagatgtgattatatcgaaacgtatatt
gatccaaacattaatacgaacacagtttataatccttggaactctgatttcatctgggaa
ttagagtatcctgatggcacaaaaacacctattactcctgacggaatcgacaattatatt
ttccgttttgataatcttacactcggaacatacaaagcatttttagcagttactgacgat
aatggttgtactactttagacagtctaacttttgatgtccctgaaattccattcagcaga
gccgctttcacgccttcagaagaagaattagcttgtccaggttttattaatttcaccgac
cttgctgatggcacagatggtaacacaattcctagacaagatgccaatggaaatgaagtg
agtatttctgattgggtatggagtgtaacgcttagcgatggtactgtatacactaaaaac
gatgatcaaggtgaatttagttattattttgagcctggtgattacaaaatcagcatggct
gctcaagatactgaaggatgtatcttgtatgccgatagtatgagcatcaatgtgggtggt
gtaaaaggagatatctacattcataaaaaaattggctattggcctttaaataccaattta
gaagctatacctgcagacgtttcaggggagattcaatctattgaatacttatggactcta
ggtaatggtggagcagcaagtggtcaaataccaaatgtagattatgaacctgattggtca
gttatacctaattcatcaattagttacttccctttcctattctttaattcatcaattata
ttggtgaatggtgacacagtagaatgtaggtatcaagcgtacgaagatcctttaaattat
gtcactattttaaagaatcctgaagtagaaatcgatgatattttcatttgtactactgaa
ggagatacaacgatcaatgcattcgatccgaatttccaactaactgatattgatacaact
cactacagttataaaagtgaaatattctaccaatggtatgtggatggtcagttaattcca
gcaatggatggtggaattgattccactatcactttaacttactgcaaagacactacaaac
tgtggatattttgatatcaatccagacgatgtagatggtagagactatacgttagaaata
tggttagatgcagaatatattgataaggtagatccaactcataatcatactgatcaaaga
gtgggttattccacaagaacatttaatgtaaaatacgatcctactcctgtagcagtactt
ccaacattaaatccaatttgtttatcagattctatttacattgatgctagtaactctggc
ttccaaccttatacaagaggtaatatcactgagtaccgttggaatattacatcagcaaat
tcttatttaaaagataccatcaccactgagcctgaattaggaatcattttcccagaagaa
ggtgattatgatgttcagttaaccgttgtatctgataatatttgtgcagactctacagtg
agtcaaacactcagagtaaaaccattgcctgtagtagactttgaagctcaagaggtttgt
attggagatgaaatgcttttcaataatctcactacatttgagggcactgaaatttctact
gatccaagtatcattcaagaagtaaaatggtattttgatgttgacaactcacctaatgat
gtgggttcaacagatattaacccattatatgcttatcctgcaccaggtacatataatgta
ctattggaagtcttcacattagaaggttgtatggaatccttctctaaggaagtgattgtg
agagagcttccaaccattacagtgagtgatagtttgtatatctgtttcggcgatcaggta
acattatccgtaaacggaggaactacttatgaatggtctactggtgaaactactcaagat
attaccgtagcgccaatagctgattctttatttgtagtcaaagcttggaatcaatacaat
tgtttgactatcgatagtgtaaaagtatttgttatacctgacttcagagagcgtcaaacg
atctttgtagcatgtgaaggtgaagagattacttttgatgcaagaatcaatgattatgat
ggcactgttgaatctttcgaatgggtggataatgaaagtacagatccaacgcttactgtt
tctactcctggagattatactgtaattaatacgattactagacctgatggcggatcttgt
acatttactaagacgtttacggctagatttaatcctcttcctaatgagtttgctgtagat
acattagtacactgtttctcggatggccctattacgattgatgccccaacaggtccttca
tatgcctatgtttgggattcaggagaaaatactccatctgtcattaaaaatgcaccaggc
acttatacggtgaccattacggatacatcggacaccacaaattgttcaacaataacaagt
gtagttgtatttgatccacttactgatgctgcatttaatttcacccaagtttgtttaggt
actgagactgaattaacagctcaatatgaaaacttggatggattgaaaatcgagtatcaa
tggacattaggtacatatgaatcaattacaacagacactcctaatttaacttatgaattc
ccagattttggtgatcatgaagttaccttagtggtcaatcctatcggtgggtgtccatct
cctgcagttacccaaactgtaactgtttatgaacttccggaaccttcttttgatgtggac
gaaatttgtatttatggtgaagcggaatttaataataacaccacctaccaaggagtaaga
gccctagaaggaggttttgatattgcgttaatcgaatgggattttaattatgatggttct
acgccaaacttcacttctaatgagttctctcctagaaatgcctataatgaatcaggaacg
tttaccattctattacaggtcactacaacaaatggttgtacaaaacaatttatgaataca
cttgtagtgcaccctgaaccagttattacacttacagaagacacttacatttgtgaggat
gatcaaattactttagaagcaagtggtggttcaacatattattgggaaggtttaggcctc
actgataataaaattactgtggatccaaaagaagatcagacctatgtagttcaagtaaca
tctgctgcaggatgtgtatcttatgatagtgttacagtctatgttattcctaaaataaaa
ttagaagacacctattttgaagtttgtgaaggagaaactgttgagttaaatgctaacatt
gatgattatgatggtgttagtcaagattttgtttggtcaaatggagaaacatcggatgtg
atttatgttgatcagccaggtacatatactgtaagtaatacagtgacgcatgaaagtggg
aaagaatgtgtacttacacaaagttttgaggttgtacaccgtcctttaccagcagaattt
gcggtaaaagaaagagttatttgtttcgatacagaaagtcaaatcattttagaagctcct
caaggaaataactttgtttactattgggaagatactggcgaaacaagttcaacagtgagt
agaactgaagaaggggaatacaccgtttatatcattgatgaaagttacgacacagattgt
gaaacaattacaagtgttgttgttgatgatatttgtcctcctagattaatagttccaaca
gcgttcactccaaactacgatggtaccaatgatgagttcttaattcgatctaaatatgcc
actgacattaaattaaatatctataaccgttggggagaaattattttcagtagaacatat
gcagattctaaagaagcgagaacggaaggaaatggttgggatggtatgtatagaggtaac
ttagtaatgggtggtgtctatactgttattgtggaatatttaagtgagttagatggagaa
aattatagaaattctactcctctaactgttatcagatag
DBGET
integrated database retrieval system