KEGG   Flammeovirga sp. MY04: MY04_5082
Entry
MY04_5082         CDS       T04442                                 
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
flm  Flammeovirga sp. MY04
SSDB
Motif
Pfam: PKD_4 PKD CHU_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ANQ52417
LinkDB
Position
2:1450343..1457281
AA seq 2312 aa
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DBGET integrated database retrieval system