Frischella perrara: FPB0191_00242
Help
Entry
FPB0191_00242 CDS
T03525
Name
(GenBank) DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
fpp
Frischella perrara
Pathway
fpp03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fpp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
FPB0191_00242
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
fpp03400
]
FPB0191_00242
Enzymes [BR:
fpp01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
FPB0191_00242
DNA repair and recombination proteins [BR:
fpp03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
FPB0191_00242
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
C_Hendra
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA44091
UniProt:
A0A0A7S484
LinkDB
All DBs
Position
244441..247758
Genome browser
AA seq
1105 aa
AA seq
DB search
MFTVYHSNQLDLLKELTSQVMTIQPLNSVFSPEIILVQSHGMGQWLQIQLAEKLDVAANI
HYPFPTQFVWDIYRIFYPDLPKSNIFDIDFMTWILLDILPDLIKQPQFTALQNYFDFIDD
KQKYYQLASMMAQLFDQYLVYRPDWLKAWENNQIIEGIDQTQLWQAALWRELVFASKKLT
PAYAHRSEIHMNVIKALNNKLSLSVIEQLPKRIFVFGIVSLPPMYLELFYSLSKYIDVHF
MFMNPCRQYWGDIIDHSFLTKYAHTDETLDNVIQTTNPLLASWGKLGRDHLALLQHYTDK
NDIEAFVDYDNRTLLSMVQQSILEMNNQSFLLKDHEPDASTLSIAMDDYSIEFHSCHSEQ
REVEVLYDNLLAIFDNHPDIDLNDCVVMVADIDHYAPYIQAVFDNAPKHRYLPYTIADQK
LKYIDPIVQGFFLLLDLPHSRLEIEYIFDLLEIPAIAKRFSFNEANLIQLRNWIVDSGIR
WGLESEIDKPHSWIMGLHRMLLGYTMESKLDSWQNIVPYDEVTGLNAELIGFLSEFIMMV
AKWRDTLTQSHSISDWQHLCLNLLTDFFFKNAESEPLLLMIENQWQDIILQAKNANYNGE
IDTIILKNFIQTKFNNNYLSHRFLIGKINFCTLMPMRSVPFKIVCLLGMNDGVYPRTTSP
LGFDLINRHGRLGDRSRRNDDRYLFLEALLSAEQKLYISYIGRDMQTNEPRYPSILVDEL
LNYIQQSYQLDDDNEISMELRVKNLTQHLIRQHTRMPFDIQNYQKITGSVLRPLSYADEW
LLAAKRCGKIDVFNQPLHNQAVTMITLTELKQFYLHPIKFLTKKRLGYFINIDAEQLPDA
ENFNLNNLQRFYINNQILNQFMLEKDKYHDLDDKLYNKMLHSNQLPYGAFGQLLYSEQKS
LMQTLMDRIYQERVGEYRTLDINLPIQSINLIGRITNLQSDGILQWCSSKLTIKNGLSLW
IDHLIICALQPYKDKFLNRLYGRDESKWSFENVSADEALKLLSVLMEGYLEGLNQPLFMP
LQSAWKWLDVAFDNEKQTISDDVVILSKAKASFREQWQNSIGSNAECDDYYYRLYPELND
ELIDCAINALKRYLLPIIQYRHKEN
NT seq
3318 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttactgtatatcattcaaatcaactcgatctattaaaagaattaacatctcaggtc
atgacaattcagcctttgaatagtgtattttcgccggagattattttagtgcagagtcat
ggaatggggcagtggttgcaaattcagttagctgaaaaattagatgtagcagcgaatatt
cattatcctttccctacccagtttgtttgggatatttatagaatattttatcccgattta
ccaaaaagtaatatttttgatatcgactttatgacgtggattttattagatatattaccc
gatttgattaaacaacctcaattcacggcattacagaattactttgattttatagatgat
aaacagaaatattatcaacttgccagtatgatggctcaattatttgatcagtatttagtt
taccgccctgactggttgaaagcatgggaaaataatcaaataattgaggggatagatcaa
acgcaactttggcaagctgcattgtggagagagttagttttcgcttctaaaaaattaact
ccagcttatgctcatcgttctgagatacatatgaatgttatcaaggcattaaataataaa
cttagcctatcagttattgagcaattaccaaaacgtatatttgtctttggtattgtttct
ctcccccctatgtatttggagcttttttatagtttgagtaaatatattgatgtccatttt
atgtttatgaatccttgtcgacaatattggggagatattattgaccattcttttctgacg
aaatatgctcatactgatgaaacacttgataatgtaattcaaacaactaatccattatta
gcatcttggggaaaactagggcgtgatcacttagctcttttacaacactatacagataaa
aatgatatagaagcatttgttgattacgataatcgaactctattatctatggtgcaacaa
tctattttagaaatgaacaaccagtcatttcttttgaaagatcatgaaccagatgcttca
acattaagtatagctatggatgattactctatagaatttcattcttgtcatagtgagcaa
cgagaagttgaagtgctttacgataatttattggcaatttttgataatcatcctgatatt
gacttgaatgattgcgttgttatggttgccgatattgatcattatgccccttatatacag
gcggtatttgataatgcgccaaaacatcgttatttaccctatactattgctgatcaaaaa
ttaaaatatattgatcctatcgtacagggattctttttattgcttgatctgccacacagc
cgtttagaaatagaatatatatttgatttgcttgaaatacctgctatagcaaaacgtttt
tcatttaatgaggcgaatttaattcaattacgaaattggattgttgattcgggtattcgc
tggggtcttgaatcggaaatagataaaccacatagctggatcatgggacttcatcgaatg
ctacttggttataccatggaaagtaagttagatagttggcaaaatatagtaccttatgat
gaagtaacaggattaaatgcggaattaattggttttttatctgaatttatcatgatggta
gctaaatggcgtgatacattaactcaatcccattcaattagtgattggcagcatttatgt
ttaaacttattaactgattttttctttaaaaatgctgaaagtgaacccttgctattaatg
attgagaaccaatggcaagatattattcttcaagctaaaaatgcgaattataatggtgaa
attgatactattattttgaagaattttattcagacaaaatttaataataactatttatca
caccgttttttaattggtaaaatcaatttttgtacacttatgccgatgcgttcggttccc
ttcaaaattgtatgtttattaggtatgaatgatggtgtttatccacgcactacttcacca
ttgggatttgatcttataaatcgacatggtcgacttggtgatagaagccgtcgtaatgat
gatcgataccttttcttagaagcgttgttatcggctgagcaaaaactgtatatcagttat
attggtcgagatatgcaaactaatgaaccacgttatccgtctattttagttgatgaacta
ttgaattatatacaacagagttatcaattagatgatgataatgagatttcaatggaatta
agagtaaagaatctaactcaacatttgataagacaacatacccgaatgccttttgatatt
caaaattatcaaaaaattacaggtagtgtattaagaccgcttagttatgcggatgaatgg
ttattggcggcaaaacgctgtgggaaaatagatgtatttaatcaaccgttacataaccaa
gctgtgacaatgattactttaacagaattaaaacagttttatctccatccaatcaaattc
ttaaccaaaaaaagattaggttatttcattaatatcgatgctgagcaattacctgatgca
gaaaatttcaatttaaataatctacagaggttttatattaataaccaaattttaaatcaa
tttatgttggaaaaggataaatatcatgacttagatgataaattgtacaataagatgtta
catagcaatcaattaccatatggtgcatttggtcaattgttatattctgaacaaaaatcc
ttgatgcagacattaatggatcgtatttaccaagaaagagtgggagagtatcgtacttta
gatattaacttacctattcaatctataaacttaattggcagaataacaaatttgcaatct
gatggtattttacaatggtgtagctccaagttaacgatcaaaaatggactatcattatgg
attgatcatttaattatttgtgcattacaaccctacaaggataaattcctaaatcgctta
tatggtcgcgatgaatcaaaatggtcttttgaaaatgtgtctgctgatgaggccttaaaa
ttattatcagtattaatggaaggttatttagaaggtcttaatcagccactatttatgcca
ttacaaagtgcatggaaatggttagatgtcgcttttgataatgaaaaacaaactattagc
gatgatgttgtaattttatcaaaagctaaagcttcttttagagaacaatggcaaaatagc
attggttctaacgctgaatgtgatgattattattatcgattatatcccgaattgaatgat
gaacttattgattgtgcgataaatgcattaaaacgttatttgttaccgattatacaatat
cgtcataaggaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system