KEGG   Frischella perrara: FPB0191_00242
Entry
FPB0191_00242     CDS       T03525                                 
Name
(GenBank) DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
fpp  Frischella perrara
Pathway
fpp03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:fpp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    FPB0191_00242
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:fpp03400]
    FPB0191_00242
Enzymes [BR:fpp01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     FPB0191_00242
DNA repair and recombination proteins [BR:fpp03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     FPB0191_00242
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C C_Hendra
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJA44091
UniProt: A0A0A7S484
LinkDB
Position
244441..247758
AA seq 1105 aa
MFTVYHSNQLDLLKELTSQVMTIQPLNSVFSPEIILVQSHGMGQWLQIQLAEKLDVAANI
HYPFPTQFVWDIYRIFYPDLPKSNIFDIDFMTWILLDILPDLIKQPQFTALQNYFDFIDD
KQKYYQLASMMAQLFDQYLVYRPDWLKAWENNQIIEGIDQTQLWQAALWRELVFASKKLT
PAYAHRSEIHMNVIKALNNKLSLSVIEQLPKRIFVFGIVSLPPMYLELFYSLSKYIDVHF
MFMNPCRQYWGDIIDHSFLTKYAHTDETLDNVIQTTNPLLASWGKLGRDHLALLQHYTDK
NDIEAFVDYDNRTLLSMVQQSILEMNNQSFLLKDHEPDASTLSIAMDDYSIEFHSCHSEQ
REVEVLYDNLLAIFDNHPDIDLNDCVVMVADIDHYAPYIQAVFDNAPKHRYLPYTIADQK
LKYIDPIVQGFFLLLDLPHSRLEIEYIFDLLEIPAIAKRFSFNEANLIQLRNWIVDSGIR
WGLESEIDKPHSWIMGLHRMLLGYTMESKLDSWQNIVPYDEVTGLNAELIGFLSEFIMMV
AKWRDTLTQSHSISDWQHLCLNLLTDFFFKNAESEPLLLMIENQWQDIILQAKNANYNGE
IDTIILKNFIQTKFNNNYLSHRFLIGKINFCTLMPMRSVPFKIVCLLGMNDGVYPRTTSP
LGFDLINRHGRLGDRSRRNDDRYLFLEALLSAEQKLYISYIGRDMQTNEPRYPSILVDEL
LNYIQQSYQLDDDNEISMELRVKNLTQHLIRQHTRMPFDIQNYQKITGSVLRPLSYADEW
LLAAKRCGKIDVFNQPLHNQAVTMITLTELKQFYLHPIKFLTKKRLGYFINIDAEQLPDA
ENFNLNNLQRFYINNQILNQFMLEKDKYHDLDDKLYNKMLHSNQLPYGAFGQLLYSEQKS
LMQTLMDRIYQERVGEYRTLDINLPIQSINLIGRITNLQSDGILQWCSSKLTIKNGLSLW
IDHLIICALQPYKDKFLNRLYGRDESKWSFENVSADEALKLLSVLMEGYLEGLNQPLFMP
LQSAWKWLDVAFDNEKQTISDDVVILSKAKASFREQWQNSIGSNAECDDYYYRLYPELND
ELIDCAINALKRYLLPIIQYRHKEN
NT seq 3318 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttactgtatatcattcaaatcaactcgatctattaaaagaattaacatctcaggtc
atgacaattcagcctttgaatagtgtattttcgccggagattattttagtgcagagtcat
ggaatggggcagtggttgcaaattcagttagctgaaaaattagatgtagcagcgaatatt
cattatcctttccctacccagtttgtttgggatatttatagaatattttatcccgattta
ccaaaaagtaatatttttgatatcgactttatgacgtggattttattagatatattaccc
gatttgattaaacaacctcaattcacggcattacagaattactttgattttatagatgat
aaacagaaatattatcaacttgccagtatgatggctcaattatttgatcagtatttagtt
taccgccctgactggttgaaagcatgggaaaataatcaaataattgaggggatagatcaa
acgcaactttggcaagctgcattgtggagagagttagttttcgcttctaaaaaattaact
ccagcttatgctcatcgttctgagatacatatgaatgttatcaaggcattaaataataaa
cttagcctatcagttattgagcaattaccaaaacgtatatttgtctttggtattgtttct
ctcccccctatgtatttggagcttttttatagtttgagtaaatatattgatgtccatttt
atgtttatgaatccttgtcgacaatattggggagatattattgaccattcttttctgacg
aaatatgctcatactgatgaaacacttgataatgtaattcaaacaactaatccattatta
gcatcttggggaaaactagggcgtgatcacttagctcttttacaacactatacagataaa
aatgatatagaagcatttgttgattacgataatcgaactctattatctatggtgcaacaa
tctattttagaaatgaacaaccagtcatttcttttgaaagatcatgaaccagatgcttca
acattaagtatagctatggatgattactctatagaatttcattcttgtcatagtgagcaa
cgagaagttgaagtgctttacgataatttattggcaatttttgataatcatcctgatatt
gacttgaatgattgcgttgttatggttgccgatattgatcattatgccccttatatacag
gcggtatttgataatgcgccaaaacatcgttatttaccctatactattgctgatcaaaaa
ttaaaatatattgatcctatcgtacagggattctttttattgcttgatctgccacacagc
cgtttagaaatagaatatatatttgatttgcttgaaatacctgctatagcaaaacgtttt
tcatttaatgaggcgaatttaattcaattacgaaattggattgttgattcgggtattcgc
tggggtcttgaatcggaaatagataaaccacatagctggatcatgggacttcatcgaatg
ctacttggttataccatggaaagtaagttagatagttggcaaaatatagtaccttatgat
gaagtaacaggattaaatgcggaattaattggttttttatctgaatttatcatgatggta
gctaaatggcgtgatacattaactcaatcccattcaattagtgattggcagcatttatgt
ttaaacttattaactgattttttctttaaaaatgctgaaagtgaacccttgctattaatg
attgagaaccaatggcaagatattattcttcaagctaaaaatgcgaattataatggtgaa
attgatactattattttgaagaattttattcagacaaaatttaataataactatttatca
caccgttttttaattggtaaaatcaatttttgtacacttatgccgatgcgttcggttccc
ttcaaaattgtatgtttattaggtatgaatgatggtgtttatccacgcactacttcacca
ttgggatttgatcttataaatcgacatggtcgacttggtgatagaagccgtcgtaatgat
gatcgataccttttcttagaagcgttgttatcggctgagcaaaaactgtatatcagttat
attggtcgagatatgcaaactaatgaaccacgttatccgtctattttagttgatgaacta
ttgaattatatacaacagagttatcaattagatgatgataatgagatttcaatggaatta
agagtaaagaatctaactcaacatttgataagacaacatacccgaatgccttttgatatt
caaaattatcaaaaaattacaggtagtgtattaagaccgcttagttatgcggatgaatgg
ttattggcggcaaaacgctgtgggaaaatagatgtatttaatcaaccgttacataaccaa
gctgtgacaatgattactttaacagaattaaaacagttttatctccatccaatcaaattc
ttaaccaaaaaaagattaggttatttcattaatatcgatgctgagcaattacctgatgca
gaaaatttcaatttaaataatctacagaggttttatattaataaccaaattttaaatcaa
tttatgttggaaaaggataaatatcatgacttagatgataaattgtacaataagatgtta
catagcaatcaattaccatatggtgcatttggtcaattgttatattctgaacaaaaatcc
ttgatgcagacattaatggatcgtatttaccaagaaagagtgggagagtatcgtacttta
gatattaacttacctattcaatctataaacttaattggcagaataacaaatttgcaatct
gatggtattttacaatggtgtagctccaagttaacgatcaaaaatggactatcattatgg
attgatcatttaattatttgtgcattacaaccctacaaggataaattcctaaatcgctta
tatggtcgcgatgaatcaaaatggtcttttgaaaatgtgtctgctgatgaggccttaaaa
ttattatcagtattaatggaaggttatttagaaggtcttaatcagccactatttatgcca
ttacaaagtgcatggaaatggttagatgtcgcttttgataatgaaaaacaaactattagc
gatgatgttgtaattttatcaaaagctaaagcttcttttagagaacaatggcaaaatagc
attggttctaacgctgaatgtgatgattattattatcgattatatcccgaattgaatgat
gaacttattgattgtgcgataaatgcattaaaacgttatttgttaccgattatacaatat
cgtcataaggaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system