Fusobacterium ulcerans: C4N20_12325
Help
Entry
C4N20_12325 CDS
T05433
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
ful
Fusobacterium ulcerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_11
TPR_8
TPR_12
TPR_17
TPR_16
TPR_9
TPR_14
ANAPC3
SHNi-TPR
TPR_19
DUF3856
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVQ28833
UniProt:
A0A2P1S681
LinkDB
All DBs
Position
complement(2656227..2657906)
Genome browser
AA seq
559 aa
AA seq
DB search
MDENNQDTLKEIEELNEKIRLNPNNANFYNSRGNCNYFLKKYEEAVIDYNKAIELDPNNA
VYYNLRGNCNHFLKKYKEAIIDYNKAIELDPNNATYYNNRGKTKYSLEDYENAIIDYNKA
IEVNPNEEIYYIYCGICNYNLKNYKEALKNFENAIQLNPNNATYYNNRGKIKYFLEDYKK
AIKDYDKALELNPYAAITYKNRAESKYMLENYKDALIDINKAIELNNADETFIEIKKKIE
KAITENSKPEIKKVNEIINEENNPTNLYNDGLSYYLKKEFDDAINNFSNFIFKANDLNNK
TNEIIKLLKITEEYIKLAQEKILKTEAYLTFADILGWKGIWQRENHIDGKKNNILKLIQI
KNKLIDIKDQYIEKKDISIDINLISDTFVIGCTNLEIHNKLCAELITTCLNKKLLIRGAT
AYGEYYYRDMVYIGQAVDEAASWHEKGEEIGIFYTPSARLKLENKIKEKLENKVKKDLKD
KNKKEFLEEIGLFEKPIITKIGEINSYVIPWFKEEENKNCFFQIMEKEIVYPEISKKYFN
TEKTIKNYENPPKKENDSK
NT seq
1680 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaaaataatcaagatactttaaaggaaatagaagagctaaatgaaaaaattaga
ctaaatcctaacaatgctaacttttataatagtcgtggtaattgtaactactttttaaaa
aaatatgaggaagctgttatagattataacaaagctattgaattagatcctaataatgct
gtttattacaatcttcgtggtaattgtaaccactttttaaaaaaatataaggaagctatt
atagattataacaaagctattgaattagatcctaataatgctacttattataataatcgt
ggaaaaacaaaatattccttagaagactatgaaaatgctattatagattataacaaagct
attgaagtaaatcctaatgaagaaatttattatatttattgtggaatatgtaattataat
ttaaaaaattataaagaagctcttaaaaactttgagaatgccatacaattaaatcctaac
aatgctacttattataataatcgtggaaaaataaaatattttttagaagactataaaaaa
gctattaaagattatgacaaggcattagaattaaatccatatgctgccattacttataaa
aatcgtgcagaaagtaaatatatgcttgaaaattataaagatgctttaatagatattaat
aaagcaatagaattaaataatgctgatgaaacatttatagaaattaaaaagaaaattgaa
aaagctataacagaaaattcaaaacctgaaattaaaaaagttaatgaaataattaatgaa
gaaaataatccaactaatttatacaatgatggactttcatattatttaaaaaaagaattt
gatgatgctattaataattttagtaattttatatttaaagctaatgacttaaataataaa
actaatgaaattataaaattattaaaaatcactgaagaatatataaaattagcacaagaa
aaaattttaaaaacagaggcttatcttacatttgcggatattttaggttggaagggaatt
tggcaaagagaaaatcatattgatggaaagaaaaataatattctaaagttaattcaaata
aaaaataaattaatagatatcaaagaccaatatattgaaaaaaaagatatatcaattgat
ataaatcttatatctgacacttttgttattggttgcactaatcttgaaatccataataaa
ttatgtgctgagctaataactacttgcttaaataaaaaattacttattagaggggctact
gcttatggtgaatactattatagagatatggtttatattggacaagctgttgatgaagct
gcttcatggcatgaaaaaggagaagaaattggtattttttatactccatctgcaagacta
aaattagaaaataaaattaaagaaaaactagaaaataaagttaaaaaagatttgaaagat
aaaaataaaaaagaatttttagaagaaattggactttttgaaaagccaataataacaaaa
ataggtgaaataaattcatatgttattccatggtttaaagaagaagaaaataaaaattgt
ttctttcaaattatggaaaaagaaattgtttatcctgaaataagtaaaaagtattttaat
actgaaaagacaataaaaaattatgaaaatcctcctaaaaaggaaaatgactcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
