Fragaria vesca (woodland strawberry): 101301607
Help
Entry
101301607 CDS
T02666
Name
(RefSeq) uncharacterized LOC101301607
Organism
fve
Fragaria vesca (woodland strawberry)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VIR_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101301607
NCBI-ProteinID:
XP_011468541
LinkDB
All DBs
Position
LG6:20188848..20206197
Genome browser
AA seq
2021 aa
AA seq
DB search
MGRPEPCVLFAQTFVHPHLDEYVDEVLFAEPIVITACEFLEHNTSSASQAVPLLGATLPP
SFALEVFVQCEGETRFRRLCQPFLYSPSSSNVLEVEAVVTNHLVVRGSYRSLSLVIYGNT
AEDLGQFNIEFDDSSITNLVSSAEGKLEDLPLALHSTNLTIEESLSALNTLSLPVTASDL
SIEVKQLLQLMLKICELPNLGDALQKVVSTVVSAATCYVTCSWGRSSDCEELHKVLIEAR
TELIQLYKSFKEESGNASAESLEDCDIFVSETDLVTSKQLADWLSRYFFFDRDFSSVGYH
QLPQDTNVMLGLSVALLLCSGRESCFHFVSGGGMQQLVHVFSRDKQNSTATTLLLLGVIE
KATQHSFGCEGFLGWWPREDENILSGVSDGYSRLLNLLLQKQRHDVASCATYVLHRLRFY
EVTARFECAALSVLGGLSTIGRVTSDTLEMLICAKSQLKKLLKLITSRDPIEDPSPVARA
TRKLILGQTEGLLSYKASSDLIASSNCCFSNRDIDLHLLDLLKVYLPLAVKILIEALHSA
KEPEPLAKNSGASPLNLAIFHSAAEIFEVIVSDSTASSLGSWIGHVTDLHRALHTSSPGS
NRKDAPTRMLEWIDAGVVYHKNGVTGLIRYAAVIVSGGDAHLTSTIPLVSDLTDAENVIG
DTCGGSDVNVMENLGKFISDKTFDGLTLRDSSVAQLTTAFRILAFISENSTVAATLYDEG
AIAIIYAVLVNCRFMLERSSNSYDYLVDEGTECNSTSDLLLERNREQSLVDLLVPTLVLL
INLLQKLKEVQEQHRNTKLLNALLRLHREVSPKLAACTADLSSPYPDSALGFGAICHLLV
SALACWPIFGWTPGLFHSLLASVQVTSLLALGPKETCSLLCLLNDLFPEEGVWLWKDGMP
LLSALRKLSVGTLLGPEKERQVNWYLRPANLEKLQSQFTPHLDKIAQIIQHYAISELVVI
QDMLRVFIIRVACQKSESCSVLLRPIFSWIRDHVYELPSPSDMDAYKVYRYLDFVASLLE
HPRAKALLLKEGAIRMLTRVLDRCLATADTDGTPILAGRSSAKSGFPVLSWCLPVFKSFS
LISISHASLHKDLHKFANVSTEDSIMILKYLLRFSQVLSAGKELLACLTAFKELGSCNEG
RSALAAAFYGLHYIAEDREAYKGHEQDGNGNSCLLNESEWRKCPPLLFCCKSLLRSADSK
DGLSSYVIEAVNALCMGSLWFCLDGERLKPDRVIAVKFLFGLPDDIGSTDGVAEENLNCI
HDLISVLTAVADEYVAKSDVQIPLHEVLESAKLLMLLLQKPSSLLKMDDIFVSDSVPVPP
NVALSSKIHLISDGGAEMTGDYLYQGALGDKFQWECPETLPDRLSQSNLSGKRKMSSLDG
PNRRARGESSVAEITTQNAFARGLASTTASSGPTRRDTFRQRKPNTSRPPSMHVDDYVAR
ERNDGGSNVIAVQRVGSSGGRPPSMHVDEYMARERERRNPLSTVVGDATIQVKSATPVND
SPMEKLNKPKQLKADLDDDLQIDIQFDGEECEPDDKLPFPQPDDILQLPAPVVAEQSSPH
SIVEETESDVHSTPLTSNMDDNTQSEFSSRMSVSRPEMPLTREPSVSSDKKYFEHSDESK
NPTFVKASSGFESTAAGNSPRFPVFGYNNSSGPSAQLPVDSRMNPQNFFPKNSSQHVGNV
PMATGSPGFYDPRFLSNQPPLPPMPPPSTVAALMSQTSDTVPSQSSPFVNSMNEGQQPST
TYQIRSDYPSAFNNGSSSRSSISSPSGAARAPPPLPLTPPPFSSSPYNVTPNRTSIAQST
VYNQTSGGTTELPQGSTAPSGARVNAYSSPALVPHMVFNRPGSNSMTIYGHVPTQLQGDN
PNMLQNLSVPQSPMQSIHTGGQLQPLQPPQLPRPPQPPQHLRPPIQASQHLEQGPLQSPV
PMHSLQMLQQPMVSPMQAYYQSQQEFAPIHQQVDYSQHQVLPQSGDTSSQQQQDPGMSLQ
EYFKSPEAIQSLLGDREKLCQVLEQHPKLMQMLQEKLGAQL
NT seq
6066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcggccggagccttgcgtcttgttcgcccagaccttcgtccacccccatctcgat
gaatacgtcgacgaggttttgtttgctgagccgattgtgatcactgcttgcgagtttctt
gaacacaacacctcgtcggcttcacaagcagtgccccttttaggggctactttacctcct
tcatttgctttggaggtatttgtacaatgcgagggagagacaagattcaggcgcctctgt
cagcctttcctgtattccccttcatcatcaaatgtgctagaagtagaggctgttgtaact
aatcatctggttgtaagggggagctaccgtagtctgagtttggttatatacggaaacacg
gccgaagatctggggcaattcaacattgaatttgatgatagctccataactaatcttgtt
agctcagctgagggaaagcttgaagacctccctctggctttacattcaactaatctgaca
attgaggaatcactatcagctctgaatactttatctttacctgttacagcatcagattta
tctattgaagttaagcaattattacagctgatgttgaagatttgtgagttgcccaatcta
ggggatgcattgcaaaaagtagttagcactgtagtgtcagctgccacttgttatgtgact
tgctcctggggcagatctagtgactgtgaagagctacacaaggttcttattgaggccaga
acagagcttattcagctatataaatcctttaaagaagaatcagggaatgcatcagctgaa
tcattggaagactgcgatatttttgtctctgagactgatttggtaacttccaaacagttg
gctgattggctaagtcggtactttttcttcgatagggacttttcaagtgttggatatcac
caacttccacaggatacaaatgtcatgctggggttgagtgtggctcttcttttgtgctct
ggaagagagagctgctttcactttgtcagcggtgggggaatgcagcagcttgtacatgtc
ttcagccgtgacaagcagaattctaccgcaacgacattacttctacttggagttattgag
aaagctactcagcattcttttggctgtgaaggatttttaggttggtggcctcgtgaagat
gaaaatattctatctggtgtcagtgatggttacagtagattgttgaatttgttgcttcaa
aaacagcgtcacgatgttgcttcatgtgcaacttatgtccttcatcgacttagattttat
gaggtcactgcaagatttgagtgtgcagctctgtctgtattgggaggtctctctactatt
ggtagggtgacgagtgatactttggaaatgcttatctgtgcaaaatcgcaactcaaaaaa
ctcttgaaattgataacttcacgtgatccaattgaagatccttccccagttgcccgtgca
accagaaaattgattcttggtcaaactgaaggtttgttgtcatataaagcatccagtgac
ttgattgcttcatcaaattgttgtttctcaaatcgggatatcgacttgcatttgctggat
cttctcaaggtatatctccctcttgctgttaaaattttgattgaagcattacattctgcc
aaggaaccggagccgcttgctaaaaatagtggagcctcaccgttaaatcttgcgatattt
cactcagctgccgagatttttgaagttattgtttcggattcaactgcctcttctcttgga
tcctggattggacatgttacggacctccatagggctttacatacctcttctccagggtcg
aataggaaggatgcccccacaaggatgttggaatggatagatgctggagtagtatatcat
aaaaatggagttacaggtcttatacgatatgctgctgtgattgtttccggaggagatgcg
cacttgacttcaaccatccctcttgtgtcggatctaacagatgcagagaatgttattgga
gatacttgtggtggttcagatgttaatgttatggagaatcttggaaagttcatctctgat
aagacttttgatggtttgactcttcgtgactcttctgtagcacagttgacaacagcattt
cgcattttggctttcatttcagagaactcgactgttgccgctactctatatgatgaagga
gcaatagcaataatctatgcagttttggtcaactgtaggtttatgctcgaaaggtcctca
aacagttatgattaccttgttgacgagggcacagaatgcaactctacatcagatttactg
ctggaacgtaatcgtgagcagagtttagttgatcttctggttccaactcttgtgttgttg
atcaatttattgcagaaattgaaggaggtacaagagcagcaccggaataccaaattgttg
aatgcgcttctacgattgcaccgagaagtaagtccgaaactagccgcatgtactgcagac
ctatcgtctccttatcctgattctgcccttgggtttggagctatctgccatcttcttgtc
tcagcgcttgcttgttggccaatctttggctggactcctgggctttttcactctctcctt
gctagtgttcaagttacttccttgctggccttgggtccaaaggaaacatgcagtttgcta
tgccttctgaatgatttatttccagaagaaggggtctggctctggaaagatgggatgcct
ttgctgagtgcccttagaaagttgtctgttgggacgcttttgggtcctgagaaggagaga
caggtcaactggtatctgcgtcctgcaaatcttgagaagttgcagagccaattcacacca
catctggacaaaatagcccagattatacaacattatgctatatctgaattggttgttatt
caagacatgcttcgagtttttattattcgcgttgcttgccaaaaaagtgaaagttgctct
gttcttctacggcccatattctcatggattcgtgatcatgtttatgagttgccttctcca
tcagatatggatgcttataaggtttatagatatcttgatttcgttgcgagcttattagag
catccacgtgccaaggcactattgttaaaggagggtgccattcgaatgctaactagagtg
ctcgataggtgtttagctactgctgatacagatggaaccccgatcctagctggtagaagt
tcagctaaatccgggtttcctgtgctcagttggtgcctccctgtattcaagtccttctca
ctgatttccatttctcacgcaagtctacacaaggatttgcacaagtttgcaaacgtgagt
actgaagattctataatgatattaaaatatctcctccggttttctcaggttctttcagct
ggaaaagaattacttgcatgccttactgctttcaaagaactaggttcttgtaatgaaggc
cgaagtgctttagcagccgctttttatggtcttcactatattgccgaggatcgtgaagca
tataaaggacatgaacaggatggaaatggtaacagttgtcttcttaacgaatcggaatgg
agaaagtgccctcctttgttattttgctgtaaatcgttgttaaggtcagctgattcaaaa
gacggtttatcaagttatgtgattgaagctgtcaatgcactgtgcatgggatctttatgg
ttctgccttgacggggaaagattgaaaccagacagggttattgcggtgaaattccttttt
ggtctacctgatgatataggctcaacagatggtgttgcagaagaaaacttgaactgcatt
catgatctaatctctgtgttgacggcagtagctgatgagtatgttgctaaatctgatgtt
cagatccccttgcatgaggttttagaatccgcaaagttattaatgctgttgttgcagaag
cctagttctttgttaaagatggatgatatctttgttagtgatagtgttcctgtaccacca
aatgttgcattatcttcaaagatccatctaatctcagatggtggtgctgaaatgactggt
gattatctttatcaaggagcacttggagataagtttcagtgggagtgtcctgaaacgttg
ccggatagattgtcacaatcaaatctttctggtaagaggaaaatgtcgtcacttgacggc
ccaaataggcgtgctaggggagaaagttccgtggctgagattacaacccaaaatgcattt
gctagaggtttggcctcgactactgcctcctctggtcctactcgcagggatacctttcgg
cagcggaaaccaaatactagtagacccccttccatgcatgttgatgactatgttgcaaga
gaaagaaatgatggtggttccaatgtaatagcagtccagcgggttggatcgtctggtggg
agacctccttcaatgcatgtggatgaatatatggccagggaaagggaacgccggaatccg
ttgtcaacggtagttggggatgcaacaatacaggtgaagagtgcaacacccgtgaatgac
tcacctatggagaagttgaacaagcctaaacaattgaaagctgatcttgatgatgatctt
caaattgacatacaatttgatggtgaggagtgtgaacctgatgacaaattgccctttcct
cagcctgatgatattctacagctgcctgctcctgtggttgctgagcaaagctctccacac
tctattgttgaagagacagagagcgatgttcactccacaccgctaacatctaatatggat
gacaacacacaaagtgaattttcttccaggatgtcagtttcacgtcctgaaatgcctttg
actcgagaaccaagtgtttcttcagacaagaagtattttgagcattctgatgagtcaaag
aatcctacatttgttaaggcttctagtggttttgaatctacagcagcaggaaatagtcct
agattccctgtctttggctataataattcatcgggaccttctgcacagttgccagttgat
tcaagaatgaatccacagaatttttttccaaagaacagttcacaacatgtaggtaatgtg
cctatggctacaggttctccaggattttatgacccgaggtttctttcaaatcaacctcct
ttacctccaatgccgcctccctcaacagttgcagctttgatgtctcagacttctgataca
gttccaagtcaatcatccccgtttgtgaactccatgaatgagggacagcagccctccaca
acctatcagattcgttcagattatccttctgcattcaataatggttcttcatccagaagt
tccatctcttctcctagtggggctgccagggcccctccaccgcttcctcttacaccacct
cctttttcatccagtccttataatgtaacacccaacagaacttctattgcccagtcaaca
gtatataaccagacaagtggtggaacaactgaactccctcagggctctactgcaccttcg
ggggccagagtaaatgcctattcatcacctgccctggtgcctcatatggttttcaatagg
ccaggttctaattctatgactatctatggacacgtcccaactcagctgcagggtgacaac
cctaatatgctgcagaatctttctgtcccccaatctccaatgcagtctattcatactggt
ggtcagttgcagccactacagcccccacagcttcctcgtcctccacaaccaccccaacat
cttaggccacctatacaagcttcacaacatctggaacagggtcctttgcagagcccagtt
ccgatgcattcactgcaaatgctgcaacagccaatggtttcacctatgcaggcctattat
caatcccaacaagagtttgctcctatacatcagcaagttgactattctcaacaccaggtt
ttgcctcaatcaggggatacttcatcccaacagcaacaagacccaggaatgtcattacag
gaatatttcaagtctccagaagctattcagtctctattgggtgaccgagaaaaactttgt
caagttttggagcagcatccaaagttaatgcagatgcttcaggagaagttgggcgctcag
ctatag
DBGET
integrated database retrieval system