Gossypium raimondii: 105776986
Help
Entry
105776986 CDS
T04129
Name
(RefSeq) beta-galactosidase 1
Organism
gra
Gossypium raimondii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_35
BetaGal_gal-bd
GHD
Gal_Lectin
Glyco_hydro_42
BetaGal_ABD2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105776986
NCBI-ProteinID:
XP_012455447
UniProt:
A0A0D2UPW7
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(5568414..5574612)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MAMVLNSKLPVVLNALLVVLLAISGVCLVSGSVSYDHKAITINGQRRILLSGSIHYPRSS
PEMWPDLIQKAKEGGLDVIQTYVFWNGHEPAPGKYYFQGNYDLVKFIKLVQQAGLYVHLR
IGPYVCAEWNFGGFPVWLKYIPGIVFRTNNGPFKAQMQRFTKKIVDMMKAERLYESQGGP
IILSQIENEYGPMEYELGAPGKAYSYWSAKMALGLATGVPWVMCKQDDAPDPIINTCNGF
YCDYFSPNKANKPKMWTEAWTGWYTEFGGAVPYRPAEDLAFSVARFIQKGGSFVNYYMYH
GGTNFGRTAGGPFIATSYDYDAPLDEYGLKRQPKWGHLKDLHRAIKLCEPALVYGDPTVI
RLGNYQEAHVFKYKAGGCAAFLANYNPRDYATVSFRNNHYNLPPWSISILPDCKNTVYNT
ARIGAQIARKKMVPVPMHGGLSWQAYNEETASVADSSFTMVGLLEQINTTRDATDYLWYT
TDVKIDPHEGFLRNGKSPVLTVLSAGHALHVFVNGQLSGSSYGSLEFPKLTFSQRVNLRA
GINKISLLSIAVGLPNVGPHFETWNAGVLGPVTLNGLNEGRRDLSWQKWSYKIGLKGEAL
NLLSLSGSSSVEWAQRSFVSQRQPLTWYKTTFNAPAGNSPLALDMGSMGKGQIWINGKSI
GRHWPAYKASGNCGVCSYAGTFNEKKCGTNCGEASQRWYHVPRSWLNPTGNLLVVFEEWG
GDPNGITLVRRETDSVCADIYEWQPNLMNYLMKASGKVNKPLRPKVHLECDAGQKISAVK
FASFGTPEGVCGSYREGSCHAHHSYDAFNRLCVGQNFCSVTVAPEMFGGDPCPNVMKKLS
VEVICS
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaatggtcttaaactccaagcttcctgtagtgttgaacgctttgttggttgttctg
ttagcaatatccggggtttgtttagtttctggttctgtttcctatgaccataaagctatc
accattaatgggcaaagaaggattctactttctggatccattcactacccaagaagctct
cctgagatgtggccagaccttatacagaaggctaaagaaggagggctggatgtgattcag
acatatgttttttggaatggacatgagcctgcacctggcaaatattacttccaaggaaac
tatgatttggtcaaatttattaagctggtgcagcaagcaggcctctatgttcatctcagg
attggtccttatgtctgtgctgaatggaactttgggggttttcctgtttggctgaagtac
attccaggtatcgttttcagaacaaacaatggacctttcaaggctcaaatgcaacgattt
acaaaaaagattgtggatatgatgaaagctgaaaggttgtatgagtctcaagggggtcct
attattctatctcagattgaaaacgaatacgggcccatggaatatgaactcggtgcacct
ggtaaagcttatagttactggtcagccaaaatggctttgggactagccactggtgttccc
tgggtcatgtgcaagcaagatgatgcgccggaccctattattaacacctgcaatgggttc
tactgtgactacttttctcctaacaaggccaacaaaccaaagatgtggactgaagcctgg
acaggctggtatactgagtttggaggggcagttccttacagacctgctgaagacttggca
ttttcagttgcgaggtttatacaaaaaggaggatcgtttgttaattattatatgtatcat
ggaggaacaaattttggccgaactgctgggggtcctttcattgctactagctatgattat
gatgctcctcttgatgaatacggactgaagaggcaacccaagtggggtcatttgaaagat
ttgcatagagcaataaagctttgtgaaccagctttagtatatggagacccaaccgtgatt
cgacttggaaattatcaggaggctcatgtattcaaatataaggctggaggttgtgctgcc
ttccttgcaaattacaacccgagagattatgcaacagtttccttcaggaacaatcactac
aacctacctccttggtctatcagcattcttcccgactgcaagaatactgtgtataacact
gcaaggattggagcccaaattgctcggaagaaaatggttcctgttcccatgcatggagga
ctctcttggcaggcatacaatgaagagactgcttcagttgctgacagttcattcacaatg
gttgggttgttggagcagataaatacaaccagagatgcaactgactatttgtggtacaca
acagacgttaagattgacccccatgaaggattcttgaggaatggaaaatctcctgttctt
actgtcttatcagctggccatgctttgcatgtttttgtcaatggtcaactatcaggaagt
tcctatggaagtctagaattccccaaactaacattcagccaacgtgttaatttgagagct
ggtatcaataaaatttcacttctgagcattgctgttggtctcccgaatgttggtccacac
tttgagacatggaatgctggtgttcttggtccagttacactgaatggtctcaatgaggga
aggagagatctctcatggcagaaatggtcttacaagattggccttaagggagaagccttg
aatcttctttcactaagtggtagttcatccgtggagtgggcacagaggtcttttgtctca
caaaggcaaccacttacatggtacaaaacaactttcaatgctccagctggaaattctcca
ttggctttagatatgggtagtatgggcaaaggccagatttggataaatggaaagagcatt
ggacgccactggcctgcatataaagcatctggaaattgtggtgtctgtagttatgccgga
acatttaacgagaagaaatgtggaactaattgtggagaggcctctcaaagatggtaccac
gttcctcgttcatggctcaacccaacagggaatttgttggttgtgtttgaggaatggggt
ggagatccgaatggaattactttggtacgccgagaaactgacagtgtctgtgctgatatc
tacgagtggcaaccgaacctaatgaattacctgatgaaagcctctggtaaagtcaacaaa
cccctaaggccaaaagtgcatttagagtgcgatgctgggcaaaaaatctcagcagttaag
tttgccagtttcggaacaccggaaggggtctgtggaagctaccgcgaaggaagctgtcat
gctcaccactcttatgatgcttttaataggctttgtgttggacagaacttctgctcagtg
actgtcgcaccagaaatgtttggaggagacccgtgtcctaatgtgatgaagaaactctct
gtggaggtcatttgcagctga
DBGET
integrated database retrieval system