Helianthus annuus (common sunflower): 110920285
Help
Entry
110920285 CDS
T05101
Name
(RefSeq) ATP-dependent DNA helicase PIF1-like
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PIF1
Pif1_2B_dom
Herpes_Helicase
RNA_helicase
AAA_16
AAA_30
Helicase_RecD
CbiA
AAA_5
AAA_25
ATPase_2
UvrD_C_2
TSC22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110920285
NCBI-ProteinID:
XP_035841591
LinkDB
All DBs
Position
16:complement(193424489..193428719)
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MGLLDDDNEYVEAIKEASFEAHCRYLRSLFATLLLTNTLSRPEFVWEKTWHLLGDDILFK
RRKETHIPDLIIPEHHLKNLILVEIENYLISNGSTLSKFSTMPYPDDDSLRQGTNRLINE
ELSHDPHELKSEFTILKESLTEEQLNVFNQIVNAVECQSGGLFFVYGYGGTGKTFLWKTL
AAAIRCKEDSMCFIKPNDDVANLLKESKLIIWDEAPMVHKHAFEALDRTMKDILSSSTNN
SSELPFGGKVIVFGGDFRQILPVIPNGTRQQIVNSSLSSSYLWSECKVLKLTKNMRLRTG
AESSNSDSIKKFAKWLLDIGEGNIGSENDGEAFIELPDDLVITDSDDPIQSLIDFVHPSI
LHQYKNPGFFSERAILAPKNEVVHEINDRLLSLFPGEEKEYLSCDSICQTEQVLDSFQQG
LYSPDNLNALKISGLPNHRLVLKVGVPVMLLRNIDQQNGLCNGTRLQVTFLGKRVIEAEV
ISGGNIGTRVFIPRISMVPSDKKIPFQFQRRQFPLTVCFAMTINKSQGQSLSRVGLYLKD
PVFTHGQLYVALSRVKSRQGVKILSFDCDGKPTSKTSNVVYKEIFHNL
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcttttagatgatgacaacgaatatgttgaagcaattaaggaagcaagttttgaa
gctcattgtcggtatttaagatcattatttgccacattgcttttaactaatacgctatca
agacctgaatttgtgtgggaaaaaacttggcacttactaggtgacgatattctattcaag
cgtcgtaaagaaacacatatccctgatctaattattcctgaacatcatttgaagaatcta
attttggtggaaattgagaattacttaatttccaatgggtctacattaagtaaattttct
acgatgccctatccagatgacgattcactacggcaaggtactaatcgtctaatcaatgag
gaattatcgcacgacccacatgagttgaaaagtgagtttactatattgaaagagtcttta
actgaagagcagttaaacgtttttaaccaaattgtgaatgctgtcgaatgccaaagtgga
gggttgttttttgtatatggttacggtgggacagggaagacttttttgtggaagactttg
gctgctgcaatcagatgtaaagaagattccatgtgcttcattaagccgaacgatgatgtt
gctaatcttttaaaagagtcaaagttgattatatgggatgaagcccctatggtgcacaaa
catgcgtttgaggcattagatcgaacaatgaaagacattctgtcgtcttctacgaataac
tcttctgagctaccatttggaggtaaagttattgtgtttggtggtgactttagacaaata
ctacccgttatcccaaatggtacgaggcagcagattgttaattcctctttgagttcttca
tatctatggtctgaatgcaaggttttaaagttaacaaaaaacatgaggttgagaactgga
gctgagtcatctaacagtgattctattaagaagtttgcaaaatggctacttgatattggt
gaaggaaacattggttcagaaaacgatggtgaagcgtttatagagttacccgatgattta
gtaattaccgactcagatgatccaattcaaagtttaattgactttgttcatccttcaatc
ttacatcagtataaaaatcctggattcttttcagagagagcaattttagcaccaaagaat
gaagtagttcatgagattaatgatcgattactttcattatttccaggtgaagaaaaagag
tatttgagctgtgacagtatatgtcaaacagaacaagttcttgattcttttcaacaaggt
ctatactctcctgacaatttgaatgctcttaaaatctccggtttacccaatcataggttg
gttcttaaagttggtgttcctgtgatgcttcttcgaaacattgatcaacagaacggacta
tgtaatggtaccagattacaagtaacctttcttggtaagcgagtaattgaagcggaagta
atatctggcggaaatatcggcacaagagtttttattccaagaattagtatggttccttca
gacaaaaagataccttttcaatttcaaagaaggcaatttccgttaacagtttgttttgct
atgacaattaacaagagtcaaggacagtcgctatctagagttggtttatacttaaaagat
cctgtatttactcacggtcaattgtatgtggcgttatccagagtcaagagcaggcaaggt
gttaaaattttatcatttgattgcgatggtaaacctacatcaaagacatctaatgtagtg
tacaaggagatttttcataacttataa
DBGET
integrated database retrieval system