Halanaerobium hydrogeniformans: Halsa_0535
Help
Entry
Halsa_0535 CDS
T01349
Name
(GenBank) conserved repeat domain protein
Organism
has
Halanaerobium hydrogeniformans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG_2
Big_13
Pur_ac_phosph_N
PhoD_N
Big_2
DUF5397
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ14003
UniProt:
E4RPI0
LinkDB
All DBs
Position
632725..635850
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MKIKAHKTNKLYYIFFFALMCLLFIGITNTTPAYARGGSGDFRVSNYASGFQLNNFLWRG
YAFTVSREVEVTHLWGGGGPTATGGFQGGIYETSWTGDTIGDGNPRLDKLLSGVVFDHTR
DVVVGGDSGQEEMVKLGKSVTLYPGQTYFIAQGRVSTGSGTHYAADSIDYENIEIGSPII
DQWWPQANMAYQPGGDGTAVDAVGRTALSETPIRVMMGFRYITDVNEPSLGPEAETGAMS
TGKYEAVLEGVLSDSGAANDEPTTLYFEYSTNSDLSNSTLVAASPHTIEGPATDVGFSRQ
ITGLNDGTTYYYRAVAINEAGRSNGDIVSFVHDSVNFARTLTAEVLGSGGTVIPETRAVP
IGESTTFELRPDSDYERSDNVVISSEHSFDSEGSWNGNVFTTGVIAEGSEENITLTFSFL
KEQAITFEAGDWQSKTYGDDNFVLEATASSGLDVFYESSNPDVASIDGNTVNIHNAGTTT
IIALQDGNVSYLPADNVERSLTVEKKAITIAADDISKYEGTDDPELSYQITEGNLESGDS
LAVELNREDGEEPGNYAIELNTLDNPNYDITCENANFTIKPAYSVSIDQEIINSNNEENI
SFKFADGDVGADYDYIIVDENENTVEGNGEITETVQTISGINVSSLSDGILTLTVTLTDS
AGNTGNEVTDQIDKETSIPTLDTVNIESDNDNNDHAKVGDKITLNFISSKDITELSITIA
DNQVSATDLEDNDATTWQAEYTMTDEDTEGEVVFVINYEDMAGNSGQEINQTTDNSSVFF
SKTAPENYYIDENSINFEKETGLYFDIKNAEIDSSYNSIIRDQNGREINENGVVSSETQQ
ITFAEDKLDRLDAGDWTIEIQLTDQAGNIGEKISHTIERPEIKAELTADYDGNTLSSGAE
ITYSLEIENIGAGLLKDIEVYAPIPAGSEYIAGSTIVNGKNIDDINNSLPLLDGLNIANL
ANEDGNLESGKNIEISYKVKTMDNLISGTEVINQAEVSGKDDLNYQLKDKLSDDPRTTGL
EDPLKLRIGDVIVQYLILKKK
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagataaaagcacataaaactaataaattatattacattttcttttttgctttgatg
tgtttattatttatcggtattactaatacaacccctgcttatgccaggggtggttcaggg
gattttcgagtttcaaattatgcaagtgggtttcaactcaataattttttatggcgtggt
tatgcatttacagtttctcgagaagttgaggttacacatttatggggtggtggtgggcca
actgcaactggtggatttcaaggtggtatatatgaaacctcctggactggggatacaatt
ggggatggaaatccaagacttgacaaacttttgagtggagttgtatttgaccatacacga
gatgttgtagttggtggtgactcaggtcaagaagagatggtaaaattaggcaaaagtgtt
actctatatcccgggcaaacatactttattgctcaagggagagtaagtacaggtagtgga
actcactacgcagctgacagcattgattatgaaaatattgaaatcggaagtccgattatt
gatcagtggtggccgcaggcaaacatggcttatcaaccaggaggtgatggaacagctgtg
gacgctgttgggagaacagcattgagtgagacacctatacgtgtcatgatgggatttaga
tatataacagatgtcaatgaaccaagtttaggacctgaagcagaaacaggtgctatgtct
acaggaaaatatgaggctgtcctggaaggtgtattaagtgattctggagctgctaatgat
gagcctacaaccttatattttgaatacagcactaactcagatctaagtaattcgacccta
gttgctgcttcccctcatactattgaaggtccagctacagatgtaggtttttctcgtcag
attactggccttaacgatggtactacatattattatagggcggttgcaattaatgaagca
ggcagatctaatggtgatattgttagttttgtccatgatagtgtgaattttgccaggaca
ttaacagcagaagtattaggttcgggaggaacggttattccagagaccagagctgttcct
attggtgagagtacaacttttgaacttagaccagatagtgattatgagcgatctgacaat
gttgtaatttcttcagaacactcttttgatagtgagggttcttggaatggaaatgttttt
acaacgggagtgattgctgaaggaagtgaagagaacattactttgacattttcttttctt
aaagaacaagctatcacctttgaagcaggtgattggcaaagcaagacatatggagacgat
aattttgttcttgaggcaactgcatcttcaggcttagatgttttctatgagagttcaaat
ccagatgtagcaagtattgatggtaatacagtaaacattcataatgctggaacaactaca
ataattgctttacaggatggtaatgtatcttatctaccagcagataatgtagagcgctca
cttacagttgagaaaaaagcaataacaattgcagcagatgatatatcaaaatatgagggt
acagatgatccagaactgagctatcagataacagaaggaaatctcgaaagtggagatagc
ttagctgtagaattaaaccgtgaagacggagaagaaccaggaaattatgctattgaacta
aatacattagataatcccaattacgatataacttgtgaaaatgcaaatttcactattaaa
ccagcttacagtgtgagtattgatcaagaaattattaactctaacaatgaagaaaatata
tcttttaaatttgcagatggagatgtaggtgcagattatgattacattatagttgatgaa
aatgagaacacagtagaaggaaatggagaaataactgaaactgttcaaacaatttctgga
ataaatgttagcagtttaagtgatggaattttaacattaactgtgaccttaacagattct
gccggtaatactggtaatgaggtaacagaccaaattgataaagagacttctattcctacc
ttagatactgtaaatatagaatcagataatgataataatgatcatgcaaaagtaggagat
aaaataacattaaactttatatcaagtaaagacataactgaactgagtataaccatagct
gataatcaagtctccgcaacagacttagaagataatgatgctaccacctggcaggccgaa
tataccatgacagatgaggatacagaaggcgaagttgtttttgtaatcaattatgaagat
atggcaggaaattcaggacaggaaataaatcaaacaacagataatagttcagttttcttt
agcaaaactgcacctgaaaactactatattgatgaaaatagtattaattttgaaaaagaa
accggcctttactttgatataaaaaatgcagaaatagatagttcctacaattcaattatt
agagatcaaaatggcagagaaattaatgaaaacggagtagtcagttcagaaactcagcaa
atcacttttgctgaagataagcttgatagattagatgcaggtgattggacaatagaaata
cagcttacagatcaggcaggtaatattggtgagaaaattagtcatactatagaacgccca
gaaattaaggctgaattaactgcagactatgatggaaacactttaagttctggtgcagaa
ataacttacagcctggaaatagaaaatatcggggcaggattactcaaagacatagaagtt
tatgctccaatacctgcaggtagtgagtatattgctggatcaacaatagttaatggcaaa
aatatagatgacattaataatagccttccacttttagatgggcttaatatagcaaatctg
gccaatgaagatggtaatttagaaagtggcaaaaatatagagataagctataaagtaaaa
accatggataatctaataagtggaactgaagtaataaatcaggctgaagtaagtggtaaa
gatgatcttaactatcagctgaaagataaattaagtgatgatccaagaacaacaggatta
gaggatccccttaaacttagaataggtgatgtgatagtgcagtacttgatattgaaaaag
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system