Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_04710
Help
Entry
HCW_04710 CDS
T02032
Name
(GenBank) soluble lytic murein transglycosylase (slt)
KO
K08309
peptidoglycan lytic transglycosylase [EC:
4.2.2.29
]
Organism
hce
Helicobacter cetorum MIT 00-7128
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hce00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
hce01011
]
HCW_04710
Enzymes [BR:
hce01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.29 peptidoglycan lytic transglycosylase
HCW_04710
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
hce01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
Lytic transglycosylase
HCW_04710
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLT
AvrM_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI04209
UniProt:
I0EMP0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1016789..1018486)
Genome browser
AA seq
565 aa
AA seq
DB search
MRIIKFYPFLFLFTISINLGLSKPRLSLKDLEKKPAGIARDYYLWRYISDKNTSLENAKK
AYELAQNKNSALQKAMHEKGLENLEKNPNVKMPEDIHCKQIALESLLEEIDTLQTSCIAI
ALKSKIRDFDKISLAILKPLQTKIKESYPILYQELNILQDKDISASMFKANAQVFSALFN
HLSYEQKLKIFEEPIPIKELNRLLDENYSAFNHLVYKIVLDPKLDNFKEALAKSNATHSN
AQTFFILGINEILRKKPQRASKYFERSEIVAKDDAFLRDRAIFWQYLVHKKRKILERLSK
SQALNLYSIYASHELKSSPNYRIISNIQNLSKKNPPFNTYDPFLWQKFKTYALSLQDENA
FKNTLKSLHYKKSAPELTYLLNERNKDKLYYYLSPYEGIIEWQNNDEKAMAYAIARQESF
LLPALISRSFALGLMQIMPFNVEPFAKSLGINNIDLDDMFNPNIAFKFGNYYLNHLKKEF
PHPLFVAYAYNAGPGFLRRWLESSKRFSEKNRFEPWLSMELVPYNETRLYGFKVIANYLI
YQEIFGNFIPVDAFLQQTLNLKDKK
NT seq
1698 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcattattaaattttatccatttttatttttatttactatctcaatcaatcttggg
ctttctaagcctcgtttaagtcttaaagatttagaaaaaaagcctgctggaattgctaga
gactactacttatggcgctatattagcgacaaaaatacaagtttagaaaacgccaaaaaa
gcctatgaattagcccaaaataagaatagtgccttacaaaaggctatgcatgaaaaaggc
ttagaaaatttagaaaaaaaccctaatgtcaaaatgccagaagatattcattgcaagcaa
attgctttagaaagtttattagaagagatagatacccttcaaacaagctgtattgctata
gccttaaaatcaaaaattagagattttgataaaatctctcttgcaatcctcaaacctttg
caaacaaaaatcaaagaatcctatcctattctttatcaagaattaaatattctacaagat
aaagatattagtgcctctatgtttaaggctaatgcacaagtttttagcgccctatttaac
cacctaagctatgagcaaaagcttaaaatttttgaagaacctatccccattaaagaatta
aatcgccttttagatgaaaattattcagcctttaatcatcttgtctataagattgtccta
gaccctaaattggataattttaaagaggctttagccaaaagtaatgccactcatagtaat
gcccaaacttttttcattctaggaatcaatgagattttaagaaaaaaacctcaaagagcc
tcaaaatattttgaacgctctgagattgtagctaaagatgatgctttcttaagagataga
gctattttttggcaatatttagtccataaaaaacgaaagattttagagcgcctctcaaaa
agtcaagcgcttaatctctatagtatttatgctagccatgaactcaaaagctcgcctaat
tatcgcattatttcaaatatccaaaatttaagcaagaaaaatcccccctttaatacctat
gacccttttttatggcaaaaatttaaaacttatgctttgagtttgcaagatgaaaatgct
tttaaaaatacgctcaaaagcttacattataaaaaaagcgcccccgagcttacttatctt
ttgaatgagcgcaataaagataagctctattactatctctctccttatgagggtattatt
gaatggcaaaataacgatgaaaaagcgatggcttatgcgattgctagacaagaaagtttc
ttacttccagcactcatttctcgctcttttgctttagggcttatgcagattatgcccttt
aatgtagagccttttgccaaaagtcttggaattaataatattgatttagatgatatgttt
aatcctaatattgcttttaaatttggtaattactatttaaaccacttaaaaaaagaattc
cctcaccccctttttgtggcttatgcttataatgcagggcctggttttttaagaagatgg
ttagaaagctctaaacgctttagtgaaaaaaatcgctttgagccatggcttagcatggag
cttgtgccttacaatgaaacacgcctttatggctttaaagtcatagctaattatttgatt
tatcaagaaatttttggcaattttattcctgttgatgcatttttacaacaaactcttaac
ttaaaggataaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system