Hydra vulgaris (swiftwater hydra): 100199001
Help
Entry
100199001 CDS
T01080
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 isoform X1
KO
K10590
E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12 [EC:
2.3.2.26
]
Organism
hmg
Hydra vulgaris (swiftwater hydra)
Pathway
hmg04120
Ubiquitin mediated proteolysis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hmg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04120 Ubiquitin mediated proteolysis
100199001
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
100199001
Enzymes [BR:
hmg01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.26 HECT-type E3 ubiquitin transferase
100199001
Ubiquitin system [BR:
hmg04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
HECT type E3
100199001
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HECT
WWE
Maestro_HEAT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100199001
NCBI-ProteinID:
XP_047130159
LinkDB
All DBs
Position
4:16107767..16167175
Genome browser
AA seq
1920 aa
AA seq
DB search
MADDVQSDQSGSQKILGKTRASRRNIIPEQGPSNQDSLQTQKFGTEDLRVKSKRKSRVSQ
SDTQLTCSDKSDIGGRKKKFNKQRKKLKESQSSSDILSESLSTNQESCKSEYNLTTSENF
SEPIKSLINLTTELGVALDSEAKENKLSKSKSAVILPAPFSEETQKITKSFSDQTSRKRK
QKLAPLFSPKKLRSSVKQRISKTGGWSSRNRSPPGRRTASVNLGSCASTRRNRRSRVANS
QPTVMENSRDLETTVGNTSSNEGTDDVVNAPLLGAMASLASVEGFSGGRDAGSNLGLEEA
DISRLQALLEARGLPAHLFGSLGPRMHLLLHKTFNSGASTKAQQLMTSMQSGDETLQLQG
VMEMCQMLVMGNEETLGGFPAKQVVPILITLLQMEHSFDIMNHACRALTYLMEALPRSSI
VVVDAIPSLLAKLQSIQCMDVAEQALTALEMLSKRHGKNILHAGGLNASLLFLDFFSIVA
QRSALAIAANCCQSVTVDEFSYIVDSIEIISNQLLNQDKRSIESVCLAFTRIVDNIQSDK
ALLLKLSEHGLLANIKKLLTNPPIISSSTFVMVIRMLAIMCANCPSLAVELLKLDISETV
QYLLIGSNDVTLVDSVELVARSPQELYELTCLISELMPSLPTSGIFSIDTQLSKGLQQST
QSGVWQWKDDLNVWHSYLWVDNRIIEAAYQSGEDEISLSTLGRNYIIDFPNMQQINEDTG
TMRLIQRKSDQGHATVNKSKISEEDERVYIFKNEPEKGKNLVQSLIRIVYVVYYSSVGPA
VKHKCLCSALKMLYHSPSELLRDVLQNIPISSYIAGMLSSSDLRIVTSAMQKIEILMTKL
SDIFHVYFRREGVMHKIKILADSDINNDWKCLAGSSEKDSDIILRKNQNNIELPCTMHGV
LAPPETSDIVPKPSKFSDALRSKKRGGSKLTRRQSSGKYGEDLPQSSSKKLSHETIRPKS
ASFSSSNNLASTNANSTKRSFFSNFAPRWGRSESYHNTDASNVTNVAENSFKEQFNKEHD
KNRECIKQWIKKTATEFYSKYFAGSLGSTHPALSVLQRLTQASEELAALRSDNIHPLLEL
CSVLINDNQQAGASPFEIVHSGTVTNLLRYLTNKDDKSSKRSARIKTFLTAFLDIKKNEM
KTNDTTKNLINSVHICEKPALIPLVQKLNLCVNQLEQFPVKCHDSGGGNGTRGGTSALRF
FNTHQIKCSLSRHPDCTSVKQWTGGAVKIDPLALVQAIERYLIVRGFGRVKDEFSNDVSD
NDDDDQSEDEIEESWASQLQGSLNGKHMLEFSMNGHILPYNMTIYQAVRQYGTTQTEDIS
DTEDYSPFGRASIWSGTHVLHFRPINQTEPVLSPKRIKSDSAHKASTSVSLENGDLDPAD
HFLCEKLPFEKFNEDPSLEVICLLRVLYYLNSNWGDYFGLQACSSVVPKTEFVNTKLTAK
ATRQLQDPLIIMTGNLPSWLSELAEACPFIFPFECRQMLFYVTTFDRDRAVMKLQETVPD
ITTNDSSDRVAPRLDKKKRTVNRNNIFKEGESLINDFTNSKSLLEIQYEGEVGTGLGPTL
EFYALVSKYFQRSDNDMWRGDKVSVVESDGDSKGQVEYCSTLHGLFPIALPKSIKNSQLN
KIKAKFRYLGKFIAKACMDSRMIDIPLSRTFYKWLLKQDNTIDITDLKYVDSILYQSISQ
LYDVCLEKKRLENDTSYSKESLSLALNSLTLDGVSIEDLGLDFILPGTNIELKKNGKDTL
VTVENLEEYLNLIVKYSLRDGVARQLNAFKEGFEQFFPLKNLRMFYPEEMELLLCGCKSE
QWVAKDLFECCRPDHGYTSSSRAVCYLFDILSKYNTEEQRLFLQFITGSPKLPVGGFKSL
NPPLTIVRKTVDNNANPDDYLPSVMTCVNYLKLPDYSSLEIMYDKLKSAYNEGKNAFHLS
NT seq
5763 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatgatgtacaatctgaccagagtgggtcacaaaagattttaggaaaaactcgt
gcttcaagaagaaatattatacctgaacagggaccgtcaaatcaagattcattacaaaca
cagaaatttggaacggaagatttaagggtaaagagcaaaagaaaatcaagagtatcacaa
tcagatacacaacttacctgcagtgataaatctgatattggaggtagaaagaaaaaattt
aacaaacaaagaaaaaagttaaaagaatctcaatcatcttcagatatattgagtgaatct
ctatcaacaaaccaggagagctgtaaatctgagtataatctgacaacttctgaaaatttt
tcagagcctattaagtcacttattaatttaactactgagcttggtgttgcattagattct
gaagcgaaagaaaataaattatctaaaagcaaaagtgcagttatattacctgctccattt
tcagaggaaactcaaaaaataaccaaaagtttctctgatcagacatctcgtaagcgtaaa
caaaaattagcacctctattttcacccaaaaagttacgtagttctgtaaagcaaagaatt
tccaagacgggtggctggtcttctcgaaacaggagtcctcctggtcggaggacagctagt
gtaaacctggggtcttgtgctagtactaggagaaatagaagatctcgagtagccaattct
cagccaacagtaatggagaattccagagatttagaaaccacagttggaaacacatcatct
aatgaaggcactgatgatgttgtcaatgcacctcttcttggagcaatggcttcgttagct
tcagttgaagggttttcaggaggaagagatgccggttctaaccttgggcttgaagaagca
gatatatctagattacaagctttactggaagcaagaggattgccagcacatctttttggc
agtcttggtcccagaatgcaccttcttctccataaaacatttaatagtggcgcaagtaca
aaagctcaacaattaatgacttcaatgcaaagtggtgacgagactctccaactgcaaggt
gtcatggaaatgtgccagatgttagtgatgggaaatgaagaaacattaggaggatttcca
gccaaacaagttgtaccaatattgatcacacttctgcaaatggagcatagctttgatata
atgaatcatgcatgccgtgcattaacctatttaatggaagctcttccacgatcctctatt
gtagtagtagatgcaataccttcccttttagcaaaattgcagtctattcagtgtatggat
gttgcagaacaagcgcttactgcactagaaatgctatctaaaagacatgggaaaaatatt
cttcatgctggtggtttaaatgcaagtttattatttttggatttcttctctattgttgct
caaagatcagctcttgccattgcggctaactgctgccaatcagttactgttgatgagttt
agttacattgttgattcaatcgaaataatttccaatcagctgttaaatcaggataaaaga
tctattgaaagtgtttgtttagcatttactagaatagttgacaacatccagtctgataag
gctttactgttaaagctttctgaacatgggctacttgctaatattaaaaaactgcttaca
aatccacctattataagcagtagtactttcgtgatggtcattcgtatgttagccattatg
tgtgcaaattgtccctctcttgctgtagaattactgaagcttgatatttcagaaactgtg
caatatttattgattggtagcaatgatgttactttggttgatagtgtagaattagttgct
cgtagtccacaagaactctatgaattaacttgcttaataagtgaacttatgcctagctta
cctacatctgggatattttctattgatacacagttaagcaaagggttacaacaaagtact
cagtcaggtgtttggcaatggaaagatgatctcaatgtgtggcattcctatttatgggta
gataaccgaataatagaagcagcatatcaaagtggagaggatgaaataagtttgtcaaca
cttggacgaaattatataattgactttccaaatatgcagcaaataaatgaagacacggga
acaatgcgcttaattcaaaggaaatcagatcaggggcatgctactgtgaacaaatctaaa
atatctgaagaagatgagcgagtttatatttttaaaaatgaaccagaaaaaggaaaaaat
cttgttcagtctttaattaggatagtctacgttgtatattattcttcagttggtcctgct
gtaaagcataaatgtttgtgttcagctttaaagatgttgtatcattctcctagtgaactt
ttacgagatgttcttcaaaatattcctatatccagttatatagcaggaatgctctcttct
agtgacttaagaatagttacttcagcaatgcaaaaaattgaaattttaatgacaaaactt
tctgatatatttcatgtttattttcgtcgtgaaggtgttatgcataagataaaaatctta
gctgattcagatataaataatgactggaaatgtttggcaggctccagtgaaaaggatagt
gatataattttaagaaaaaaccaaaacaacattgagcttccttgtacaatgcatggtgtt
ttagcgcctcctgaaacttcagatattgtaccaaaaccatcaaagttctctgatgcctta
agaagtaaaaaaagaggaggttcaaagttgactcgcagacaaagtagtggaaagtatgga
gaagacctgcctcaatcttcttccaaaaagctatctcatgaaaccattagacctaagtca
gcatctttttcttcatccaataatttggcatcaaccaacgcaaactcaaccaaacgatct
tttttttctaactttgcacctagatggggtcgttcagaatcgtatcacaatacagatgct
tctaatgtaactaatgttgcagaaaattcatttaaggagcaatttaacaaagaacatgac
aaaaacagagagtgcataaaacaatggataaaaaaaacagctactgaattttacagcaaa
tactttgcaggaagtttgggttcaactcatcctgctctaagtgttttacaaagattaaca
caagcatctgaagaacttgcagcattaagaagcgacaatatccatccattattagaactg
tgcagtgtgttaataaatgataaccaacaggcaggtgcatcaccttttgaaattgtacac
agtggcacagttactaatttattaagatatttaactaacaaggatgacaaatcttcaaaa
agaagtgctcgaattaaaacatttctcactgcttttcttgatataaagaaaaatgagatg
aaaacaaatgatacaacaaagaatttaattaattctgtgcatatctgtgaaaaaccagca
ttaataccattagtccagaaactcaatctttgtgttaaccaattagaacagtttcctgtg
aaatgtcatgattctggtggtggtaatggaacaagaggtggaacatcagctcttcggttt
tttaacactcatcaaataaagtgctctctcagtcgacacccagactgtacatcagtaaaa
caatggacaggaggagctgtcaaaattgatccattagcacttgtgcaggcaatagaaaga
tatttaatagtcagaggatttggtagagtaaaagatgagttttcaaatgatgttagtgac
aatgatgatgatgatcaatctgaagatgaaatcgaagaatcctgggcttcccaattgcaa
ggctctctcaatggaaaacacatgttagagttttctatgaatggacacattttgccatat
aatatgacaatatatcaagctgttagacaatatggaactacacagacagaagatataagt
gatacagaggattacagcccatttggtagagctagtatatggtctggaacacatgtttta
catttcagacctattaatcaaacggagcctgttttatctccaaaaagaatcaaatcagat
tcagcacataaagcaagcacctcagtttcactagaaaatggagatttagatccagctgat
cattttctttgtgaaaaactaccttttgaaaaatttaatgaagatccctcacttgaagta
atatgtttgctacgtgttctatactatcttaatagcaattggggagattattttggtctt
caagcctgtagttctgtagtacctaaaactgagtttgttaatactaaactaacagcaaaa
gcaacacgacaacttcaagaccctctcattattatgactggtaatttaccatcatggctt
tcagaattggcagaagcatgcccttttatatttccttttgaatgtcgtcaaatgcttttc
tatgtcacaacatttgaccgagatcgagctgttatgaaattgcaagaaactgttcctgat
attactactaatgacagcagcgatcgagtagctccaagactagataaaaaaaaacgcact
gttaaccgtaataacattttcaaagaaggtgaatcattaattaatgatttcacaaattca
aaatctctattagaaatacaatatgaaggcgaggttgggactggtcttggacctacatta
gaattttatgctttagtttcaaaatattttcaacgaagtgataatgatatgtggagagga
gacaaagtatcagttgttgagagtgatggtgattcaaaaggacaggttgaatactgtagt
actctccatgggttgtttccaattgcactacctaaaagtataaagaattcacaattaaac
aagattaaagcgaaatttcgttatctcggaaagtttattgcaaaagcatgtatggactct
cgtatgattgacattcccttaagtaggacgttttataaatggttgcttaaacaagataat
acaatagatataacagacttgaaatatgttgactctatcttatatcaatcaataagtcaa
ttatatgatgtttgtcttgaaaagaaacgccttgaaaatgatacttcttattctaaagaa
tctttaagtttagccttgaacagtttaactttagatggtgtttctattgaagatttaggt
cttgattttatattacctggtactaatattgaattaaaaaaaaatggtaaagatacatta
gtaacagttgaaaacctagaagaatatttaaatttgattgtaaaatacagcttacgcgat
ggagtagcaagacagttaaatgcttttaaagaaggttttgaacaattttttccgttgaaa
aatctccgaatgttttatccagaagaaatggaactgcttttatgtggctgcaaaagtgaa
caatgggttgcaaaagatttatttgaatgttgccgacctgaccatggttatacttcaagc
agccgagcggtttgttacttgtttgacatattaagcaaatacaatactgaagagcaaagg
ttgttcttacagtttattaccggaagtccaaaactacccgttggtgggttcaaaagttta
aacccgcctcttacaatcgtccggaagactgttgacaacaacgcaaaccctgatgattat
ttgccctctgtaatgacttgtgttaattacctaaagttgcccgattattcaagcctagaa
attatgtatgataagcttaaaagtgcatataacgaagggaagaacgcctttcatttatct
tag
DBGET
integrated database retrieval system