Helicobacter pylori 908: hp908_1550
Help
Entry
hp908_1550 CDS
T01893
Name
(GenBank) putative ATP-dependent helicase
Organism
hpi
Helicobacter pylori 908
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
AAA_19
UvrD_C
UvrD_C_2
PDDEXK_1
Cas_Cas4
DEAD
ResIII
Terminase_6N
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADN80670
LinkDB
All DBs
Position
1499455..1502295
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MDTKRQCMALKASAGSGKTFALSVRFLALLFKGANPSEILTLTFTKKATAEMKERILDYL
KILQKENLESGKEKSQNILKELEEKYHLDPSLVRNSAQKIYQRFLNAEIRISTIDAFFQS
ILRKFCWFVGLSANFEVNEDTEAHQRQLNEGFLSALNSEQLEELSVFIVQCLSYESYTSD
SILERLRFLKNKLYLFDPNKKEPTFDEEGFLEKLRSLNNQIQSIETASNEAKKAIKCDSF
RGFLNSSLTWLEKKSEYRYFKKLKSEIPTLESECEEIENDLKRYYEAKETAIFKKFPKFI
QLYDNATSKIQALDFDAIKDKVHVLLNGYEEMPAEFFYFRLDSKIVHILIDEFQDTSLND
YKILVPFIDEIKAGIGQAKWHRSVFFVGDVKQSIYAFRGSFSSLFESVSKDFYHDNLEFN
HRSAPLIINYVNTIFKKAYQNSPTAYLEQKYPEASNNKHVTEGYVKVSLVADEKELLLEQ
ILQEAKNLLDHRIDPKDITILCATNKDALEIKNYLQERLSAIRPSTESSARLSQLVESKI
IKNALEYALAEEPYKPFYKHSVLKLAGYLHDDAIALPGFNPKKESVAGFVWKIMEQFKLY
GEPAQSCLELAIGCEDANEFLEKLEAKEIASFNPKGAQIMTIHGSKGMQFPYVIVCERLG
NPNSSHANQFLEEYNGAELACLYYRMKNREVVDKDYARALNKEEAAKDHEEINVYYVAFT
RAELGLIVVAKDKKESKKESKNKTMCEKLDLLPLEEGEIMPVISPQKEPLMTSVVIKPHA
YGEQVQEIEEEPDSDYEKNNDQEAINFGIALHKGLEYQYAYNIPKKSVLEYLNYHHGFYG
LDYQALEESLELFENDAEIQALFKNHALRGEAAFLFQGVVSRIDVLLWDRGQNLYVLDYK
SSQNYQQSHKAQVSHYAEFLRTQAPHFKIQAGIIYAHKRLLEKLWV
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatacaaaaagacaatgcatggctttaaaggcttcagcagggagcgggaagactttc
gctttgagcgtgcggtttttggccttattgtttaaaggggctaatcctagcgagatttta
acgctcactttcactaaaaaagccaccgccgaaatgaaggagcgcattttagactattta
aaaatcttgcaaaaagaaaaccttgagagcggaaaagagaaatcccaaaatatcttgaaa
gaattagaagaaaaataccatttagaccctagcttggtgcgaaatagcgctcaaaaaatc
taccaacgctttttaaacgctgaaatcagaatcagcaccattgacgcgtttttccaaagc
attttaaggaaattttgctggtttgtggggttgagcgcgaattttgaagtcaatgaagac
acagaagcgcaccaacgacagcttaatgagggttttttgagcgctttaaacagcgaacag
cttgaagaattgagcgtttttatcgtccaatgcttaagttatgagagttacacaagcgat
tctattttagagcggctgcgttttttaaagaacaagctctatttatttgatcctaataag
aaagagcccacatttgatgaagagggttttttagaaaaactaaggagcttaaacaaccaa
attcaaagcatagaaacagcgtcaaatgaggctaaaaaagccattaaatgcgatagtttt
aggggatttttaaacagctctttaacatggcttgaaaaaaagagtgaatatcgctatttc
aaaaaactcaaaagtgaaatccctaccttagagagcgaatgcgaagagattgaaaacgat
ttaaaacgctattatgaagccaaagaaaccgcaatatttaaaaaattccctaaattcatc
caactttatgataacgccacttctaaaatccaagccctagattttgatgcgattaaagat
aaggttcatgtcttattgaatggttatgaagaaatgccggcggagtttttttatttcaga
ttggatagcaagatcgtgcacattttgattgatgaatttcaagacacgagcttgaacgat
tataagattttagtcccttttattgatgagattaaagccgggatagggcaagcgaaatgg
cacaggagcgtgttttttgtgggcgatgtcaagcagagcatttatgcctttagggggagt
tttagctccttatttgaaagcgtttctaaggatttttaccacgataatttggaattcaac
caccgcagtgcgcctttaatcattaattacgtgaacaccatttttaaaaaagcttatcaa
aattcccccaccgcttatttggagcaaaaataccctgaagcttccaacaataaacatgtt
acagagggctatgttaaagtctctttagtggctgatgaaaaagaattgttattagaacaa
atcttacaagaagctaaaaaccttttagatcatcgtattgatcctaaagacattaccatt
ttatgcgccaccaataaggacgctttagaaatcaaaaattatttgcaagagcgtttgagt
gcgattcgcccaagcacggaatctagcgcgagattgtctcaattggtagaatctaagatc
attaagaacgctttagaatacgctttagcggaagaaccttacaaacccttttataagcac
agcgttttaaaactcgccggatacttgcatgatgatgcgatcgctttacctggttttaac
cctaaaaaagagagcgtggcaggctttgtgtggaaaattatggagcagtttaaactttat
ggagagcctgcgcaaagctgcttggaattggccattgggtgcgaagacgccaatgaattt
ttagaaaaattagaggctaaagagatcgcttctttcaatccaaaaggcgcacagatcatg
accattcatggatctaaaggcatgcaattcccttatgtgatcgtgtgcgaacgcttgggc
aatcctaattcaagccatgctaatcaattccttgaagaatataacggtgcagagcttgcg
tgcctttattacagaatgaaaaatcgtgaagtagtggataaagattacgctagggcttta
aataaagaagaagcggccaaagatcacgaagaaattaatgtgtattatgtcgcattcact
agggctgagttagggctgattgtcgtggccaaagacaaaaaagaaagcaaaaaagaaagc
aaaaacaaaacaatgtgcgaaaaattggatcttttgcctttagaagagggagaaattatg
ccggttatttctcctcaaaaagagcctttaatgacaagcgttgtcatcaagccccatgcc
tatggcgagcaagtccaagaaatagaagaagagccagatagcgattatgaaaagaataac
gaccaggaagcgattaatttcggtatcgctttgcacaaggggttagaataccaatacgct
tataacattcctaaaaaaagcgttttagaatatttaaactaccatcatggtttttatggt
ttggattatcaagcgttagaagagagtttagagctttttgaaaacgatgcagagatacaa
gccctttttaaaaatcatgccttaaggggtgaagcggcttttttattccaaggggttgtg
tctaggattgatgttttattgtgggatagagggcaaaatttgtatgttttagattataaa
agctctcaaaattaccagcaaagccataaagcgcaagtgtctcattacgctgagtttttg
cgaactcaagccccccattttaagatacaagcgggcattatttacgctcataaaagactg
cttgaaaaattatgggtttga
DBGET
integrated database retrieval system
