Helicobacter pylori 83: HMPREF0462_1090
Help
Entry
HMPREF0462_1090 CDS
T01915
Name
(GenBank) putative cytochrome c-type biogenesis protein CcsB
Organism
hpx
Helicobacter pylori 83
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE70694
UniProt:
F4D260
LinkDB
All DBs
Position
complement(1092945..1095755)
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search
MKSLKSLLSFLLASFWVAIPLIALYALACAIATFIENDYGTSASKAIVYNTPWFNFLHAY
LLVVLIGTFINSKALERKRYASLFFHSSLILIILGAAITRFFGTEGLMHVRENSAQSSFE
SADTYLNITLNDTTKLSLKTPFTFYYSKRLKPIHATLDRKPLILEPLEIYKQNAIKKDDA
AILVLKATYNGVSRKFNLIKTNRNEGIEESEMFKDDKLSLSFGSAYIELPFQIKLKRFEL
ERYAGSMSPSSYASEVEVLKLDNTLIKPYRIFMNHVLDYEGYRFFQSSYDTDEKGTILSV
NKDPGKIPTYLGYAMLILGALWLLLDKNGRFLKLSRFLKSQQAASFLLALILISPFTPSF
ASEAPIDMHGGKSAQIERQNVENSANKEDSKSAILERLKHLRGYSKDHLKAFQRLQVQDF
DGRIKPLDTISIEYIHKILKKDDFQGLNAMQVLLGIMFFPNDWRSIKMIYTSNKALRKLI
GTPLDESRIAFRDVFDSRGYKLKNLVEEVNQKSPNARNELDKDVLKVDERINLVYTLFSA
QFLRIFPSDKTTAWLSPIEAINSPNKEISSVATEFLKNIFSGFDDALKTNQWDKVEKTLQ
DLSIYQQEHAKNLYLPSSKVDSEIFLNHTNFFNSLTLPYIFLGLLLFIVVISSLVKNTIP
NIWLTKTLYMAILLCALAHSMGLVLRWYVSGHSPWSNAYESMLYIAWASVIAGFVLRSKL
ALSASSFLAGIALFVAHLGFMDPQIGHLVPVLKSYWLNIHVSVITASYGFLGLCFVLGIL
SLVLFILRKQGRFNLDKTILSISAINEMSMILGLFMLTAGNFLGGVWANESWGRYWGWDP
KETWALISICVYALILHLRFLGSQNWPFILASSSVLGFYSVLMTYFGVNYYLSGLHSYAA
GDPLPIPTFLYFLVAIPFALVILAYFKRHLSLPKLV
NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagccttaagagcttgctttcttttttgctggcttctttttgggtcgctatccct
ttaatagcactctatgccttagcgtgcgcgatagccacttttatagaaaacgattatggc
acgagcgcgagtaaggcgattgtgtataacaccccttggtttaatttcttgcatgcgtat
ttattggtggttttaataggcacattcatcaattctaaagccttagagcgcaaaagatac
gcaagcctttttttccacagctccttgattttaatcattttaggggcagccatcacacga
ttttttggcacagaagggcttatgcatgtgcgagaaaatagcgcgcaaagctcttttgaa
agcgcggacacttaccttaatatcactcttaatgacaccactaaactttctttaaaaacg
ccttttaccttttattattccaaacgattaaaacccattcatgcgactttagatcgcaag
cctttaattttagaacccttagaaatttacaagcaaaacgccattaaaaaagatgacgct
gctattttagtgttaaaagcgacttataacggcgtgagccgcaaattcaacctcatcaaa
accaacaggaatgaaggcatagaagaaagcgagatgtttaaagacgacaagctctcttta
agttttggatccgcttacattgaattgccctttcaaatcaaactgaagcgttttgaatta
gagcgctacgccggctctatgagcccttcatcttatgcttcagaagtggaagttttgaaa
ttggataacaccttgatcaagccttataggatttttatgaaccatgttttagattatgaa
ggctatcgctttttccaatcttcctatgatacggatgaaaaaggcacgatcctttctgtc
aataaagacccgggtaaaatccccacttatttagggtatgcgatgcttattttgggggct
ttgtggttgcttttggataagaacgggcgttttttaaagctttcacgctttttaaaatcc
caacaagccgctagtttcttgctcgctttaattttaatcagcccttttactccctcgttc
gctagtgaggctccaattgacatgcatgggggcaaaagcgctcaaatagaacgacaaaat
gtagaaaattccgctaataaagaggattctaaaagcgcaattttagagcgtttgaagcat
ttaagagggtattccaaagaccacttaaaagcctttcaaaggcttcaagtccaggatttt
gacgggcgtatcaaaccccttgacaccattagcattgaatatatccataagattttaaaa
aaagatgattttcaagggctaaacgccatgcaggtgcttttagggatcatgtttttcccc
aatgattggcgcagtattaagatgatttacacttctaataaagccttaagaaagcttatc
ggcacgcctttagatgagagtcgtatcgcttttagagatgtgtttgatagccgtgggtat
aaattaaaaaatcttgttgaagaagtcaatcaaaaatcccccaatgcgcgcaacgagttg
gataaagatgtcttaaaagtagatgaacgaatcaacttagtctatacgctttttagcgct
caatttttacgcattttccctagcgataaaaccaccgcttggctttcgcccattgaagcg
atcaacagccccaataaagaaatttcaagcgtggcaacggagtttttaaaaaatattttt
agcgggtttgatgacgctttaaaaaccaatcaatgggataaagtagaaaaaaccctacaa
gatttaagcatttaccagcaagagcatgccaaaaacctctatttaccctcttctaaagtg
gattctgaaatttttttaaaccacaccaatttttttaacagcctgactttgccttatatc
tttctagggctattgctttttatcgttgtgatcagctctcttgttaaaaacacgattcca
aatatttggctcactaaaaccctttatatggctatcttgctttgcgcgctcgctcattct
atggggctagttttgcgctggtatgtgagcgggcattcgccttggagcaacgcttatgag
tccatgctttatatcgcatgggcttctgttatcgcagggtttgttttacgctccaaactc
gcgctatcggcttctagctttttagccggtatcgcgctctttgtggcccatttaggcttt
atggaccctcaaattggccatttagtgccggtgttaaaatcctattggctcaatatccat
gtttctgtcatcaccgccagttatggctttttgggcttgtgttttgtgctagggattttg
agtttagttctgtttattttgcgcaaacaagggcgtttcaatttggacaaaaccattctt
tccattagcgctatcaatgaaatgagcatgattttaggcctgttcatgctcacagccggg
aatttcttaggcggggtgtgggcgaatgaatcttgggggcgctattgggggtgggaccct
aaagaaacttgggcgttgatttctatttgcgtctatgctttaatcttgcatttgcgtttt
ctaggctctcaaaattggccctttattttagcgagcagcagcgttctagggttttattcg
gttttaatgacttattttggcgtgaattactacctttctggcttgcacagctatgccgca
ggcgatcccttgcccatccccactttcttatactttttggtagcgataccttttgctctc
gtgatcttggcgtatttcaaacgccatttgagtttgcctaaattggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system