KEGG   ORTHOLOGY: K03048
Entry
K03048                      KO                                     

Name
rpoE
Definition
DNA-directed RNA polymerase subunit delta
Pathway
ko03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03048  rpoE; DNA-directed RNA polymerase subunit delta
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03048  rpoE; DNA-directed RNA polymerase subunit delta
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03048  rpoE; DNA-directed RNA polymerase subunit delta
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03048  rpoE; DNA-directed RNA polymerase subunit delta
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      K03048  rpoE; DNA-directed RNA polymerase subunit delta
Other DBs
COG: COG3343
Genes
HMAR: HVMH_1344
ACHR: C2U31_20110
SDL: Sdel_1171
SBA: Sulba_1095
SMUL: SMUL_1354
MCI: Mesci_5069
MAMO: A6B35_11625
MESP: C1M53_01715
MHUA: MCHK_0932
MJR: EB229_28940
STAX: MC45_12275
SPHI: TS85_17780
BSU: BSU37160(rpoE)
BSR: I33_3861
BSL: A7A1_2726
BSH: BSU6051_37160(rpoE)
BSUT: BSUB_03951(rpoE)
BSUL: BSUA_03951(rpoE)
BSUS: Q433_20430
BSS: BSUW23_18355(rpoE)
BST: GYO_4095(rpoE)
BSQ: B657_37160(rpoE)
BSX: C663_3616(rpoE)
BLI: BL05358(rpoE)
BLD: BLi03964(rpoE)
BLH: BaLi_c39800(rpoE)
BAQ: BACAU_3466(rpoE)
BYA: BANAU_3621(rpoE)
BAMP: B938_17610
BAML: BAM5036_3362(rpoE)
BAMA: RBAU_3568(rpoE)
BAMN: BASU_3344(rpoE)
BAMB: BAPNAU_3633(rpoE)
BAMT: AJ82_19375
BAMY: V529_37010(rpoE)
BMP: NG74_03609(rpoE)
BAO: BAMF_3553(rpoE)
BAZ: BAMTA208_18830(rpoE)
BQL: LL3_03864(rpoE)
BXH: BAXH7_03854(rpoE)
BQY: MUS_4091(rpoE)
BAMI: KSO_001865
BAMC: U471_35770
BAMF: U722_18420
BAN: BA_5584(rpoE)
BAR: GBAA_5584(rpoE)
BAT: BAS5188
BAH: BAMEG_5628(rpoE)
BAI: BAA_5609(rpoE)
BANT: A16_55930
BANR: A16R_56610
BANS: BAPAT_5353
BANV: DJ46_4233(rpoE)
BCE: BC5339
BCA: BCE_5470(rpoE)
BCZ: BCE33L5039(rpoE)
BCR: BCAH187_A5517(rpoE)
BCB: BCB4264_A5462(rpoE)
BCU: BCAH820_5432(rpoE)
BCG: BCG9842_B5490(rpoE)
BCQ: BCQ_5180(rpoE)
BCX: BCA_5489(rpoE)
BNC: BCN_5269
BCF: bcf_26805
BCER: BCK_08655
BTK: BT9727_5023(rpoE)
BTL: BALH_4837(rpoE)
BTB: BMB171_C4935(rpoE)
BTT: HD73_5746
BTHI: BTK_28270
BTC: CT43_CH5379(rpoE)
BTM: MC28_4575(rpoE)
BTG: BTB_c55410(rpoE)
BTI: BTG_21685
BTW: BF38_1066(rpoE)
BWW: bwei_4438(rpoE)
BMYO: BG05_663(rpoE)
BMYC: DJ92_2433(rpoE)
BTRO: FJR70_20845(rpoE)
BPU: BPUM_3361
BPUM: BW16_17850
BPUS: UP12_17345
BMQ: BMQ_5179(rpoE)
BMD: BMD_5165(rpoE)
BMH: BMWSH_0102(rpoE)
BMEG: BG04_2173(rpoE)
BAG: Bcoa_1427
BCOA: BF29_2088(rpoE)
BJS: MY9_3799
BACW: QR42_16860
BACP: SB24_11540
BACB: OY17_00835
BACO: OXB_1407
BACY: QF06_16990
BACL: BS34A_40310(rpoE)
BALM: BsLM_3744
BEO: BEH_23555
BGY: BGLY_4369(rpoE)
BBEV: BBEV_0156(rpoE)
BTHV: CQJ30_18255(rpoE)
BFD: NCTC4823_00425(rpoE_1)
BHA: BH3793(rpoE)
BCL: ABC3887(rpoE)
BPF: BpOF4_07030(rpoE)
OIH: OB3008(rpoE)
OCN: CUC15_17655(rpoE)
GKA: GK3390
GTN: GTNG_3335
GGH: GHH_c34860(rpoE)
GEA: GARCT_03374(rpoE_2)
AFL: Aflv_2733(rpoE)
AAMY: GFC30_337
AXL: AXY_20680(rpoE)
LSP: Bsph_0978
LYS: LBYS11_02710(rpoE)
LYB: C3943_03385(rpoE)
LYZ: DCE79_02255(rpoE)
LYG: C1N55_04155(rpoE)
LPAK: GDS87_02775(rpoE)
HHD: HBHAL_4634(rpoE)
HLI: HLI_14320(rpoE)
VIL: CFK37_07740(rpoE)
VNE: CFK40_03005(rpoE)
VPN: A21D_00963(rpoE)
VIM: GWK91_11745(rpoE)
PBUT: DTO10_10890(rpoE)
PASA: BAOM_4894(rpoE)
AQT: FN924_16805(rpoE)
PSYH: D0S48_09075(rpoE)
PSYO: PB01_03280(rpoE)
PRD: F7984_18165(rpoE)
GRC: GI584_21035(rpoE)
RUE: DT065_10490(rpoE)
SALE: EPH95_11620(rpoE)
NMK: CHR53_27195(rpoE)
STEA: C0679_14325(rpoE)
BSE: Bsel_3185
SAU: SA1930(rpoE)
SAV: SAV2128(rpoE)
SAW: SAHV_2112(rpoE)
SAM: MW2052(rpoE)
SAS: SAS2031
SAR: SAR2216(rpoE)
SAC: SACOL2120(rpoE)
SAX: USA300HOU_2116(rpoE2)
SAA: SAUSA300_2082(rpoE)
SAE: NWMN_2032(rpoE)
SAD: SAAV_2183(rpoE)
SUE: SAOV_2169c(rpoE)
SUJ: SAA6159_02042(rpoE)
SUK: SAA6008_02166(rpoE)
SUQ: HMPREF0772_11062(rpoE)
SUZ: MS7_2146
SUX: SAEMRSA15_20360(rpoE)
SUW: SATW20_22660(rpoE)
SUG: SAPIG2170(rpoE)
SUF: SARLGA251_19290(rpoE)
SAUA: SAAG_02342
SAUE: RSAU_001966(rpoE)
SAUS: SA40_1887(rpoE)
SAUU: SA957_1971(rpoE)
SAUG: SA268_2041(rpoE)
SAUZ: SAZ172_2232(rpoE)
SAUT: SAI1T1_2015680(rpoE)
SAUJ: SAI2T2_1015690(rpoE)
SAUK: SAI3T3_1015680(rpoE)
SAUQ: SAI4T8_1015690(rpoE)
SAUV: SAI7S6_1015690(rpoE)
SAUW: SAI5S5_1015630(rpoE)
SAUX: SAI6T6_1015640(rpoE)
SAUY: SAI8T7_1015670(rpoE)
SAUF: X998_2107
SAB: SAB2012c(rpoE)
SUY: SA2981_2068(rpoE)
SAUB: C248_2142(rpoE)
SAUC: CA347_2208
SAUR: SABB_02453(rpoE)
SAUI: AZ30_11235
SAUD: CH52_08320
SAMS: NI36_10445
SER: SERP1735(rpoE)
SEP: SE1726
SEPP: SEB_01737
SEPS: DP17_671
SHA: SH0907(rpoE)
SHH: ShL2_00798(rpoE)
SSP: SSP0757
SCA: SCA_1631
SLN: SLUG_09390(rpoE)
SDT: SPSE_0695(rpoE)
SPAS: STP1_0562
SHU: SHYC_03640(rpoE)
SCAP: AYP1020_1315(rpoE)
SSCH: LH95_03465
SSCZ: RN70_03735
SAGQ: EP23_06430
SDP: NCTC12225_00765(rpoE)
SARL: SAP2_08220
MCL: MCCL_1783(rpoE)
MCAK: MCCS_22980(rpoE_2)
LMO: lmo2560
LMOC: LMOSLCC5850_2564(rpoE)
LMOE: BN418_3028
LMOB: BN419_3042
LMOD: LMON_2575
LMOW: AX10_06870
LMOQ: LM6179_1640(rpoE)
LMR: LMR479A_2688(rpoE)
LMOM: IJ09_12000
LMF: LMOf2365_2532(rpoE)
LMOG: BN389_25210(rpoE)
LMP: MUO_12780
LMOL: LMOL312_2519(rpoE)
LMOX: AX24_10755
LMH: LMHCC_0036(rpoE)
LMQ: LMM7_2603(rpoE)
LML: lmo4a_2561(rpoE)
LMS: LMLG_2532
LMW: LMOSLCC2755_2566(rpoE)
LMX: LMOSLCC2372_2624(rpoE)
LMZ: LMOSLCC2482_2565(rpoE)
LMON: LMOSLCC2376_2453(rpoE)
LMOS: LMOSLCC7179_2472(rpoE)
LMOO: LMOSLCC2378_2563(rpoE)
LMOY: LMOSLCC2479_2623(rpoE)
LMOT: LMOSLCC2540_2594(rpoE)
LMOA: LMOATCC19117_2569(rpoE)
LMOK: CQ02_12990
LIN: lin2705
LWE: lwe2510(rpoE)
LSG: lse_2467(rpoE)
LIV: LIV_2473
LGZ: NCTC10812_02563(rpoE)
BTHS: CNY62_06820(rpoE)
ESI: Exig_2735
EAN: Eab7_2544(rpoE)
GMO: NCTC11323_01451(rpoE)
GEQ: CG018_03780(rpoE)
GSA: FOC50_02640(rpoE)
GHA: NCTC10459_01475(rpoE)
BBE: BBR47_54930(rpoE)
PPY: PPE_00134
PPM: PPSC2_00680(rpoE1)
PPO: PPM_0128(rpoE1)
PPQ: PPSQR21_001330(rpoE)
PPOY: RE92_11025
PMW: B2K_36235
PLV: ERIC2_c39020(rpoE)
PSAB: PSAB_00515
PRI: PRIO_0116
PSWU: SY83_05890
ASOC: CB4_00560(rpoE_1)
AAC: Aaci_2786
AAD: TC41_3126(rpoE)
BTS: Btus_3272
KYR: CVV65_16200(rpoE)
SIV: SSIL_3401
SOB: CSE16_02325(rpoE)
PLX: CW734_14365(rpoE)
JEO: JMA_30520
SPOS: DV702_16140(rpoE)
SPAE: E2C16_11645(rpoE)
PAEK: D3873_02560(rpoE)
PANC: E2636_13580(rpoE)
PLAY: DNR44_007575(rpoE)
LFB: C1X05_16335(rpoE)
TVU: AB849_005210(rpoE)
KPUL: GXN76_15685(rpoE)
KEB: GXN75_17020(rpoE)
LLA: L0141(rpoE)
LLK: LLKF_0628(rpoE)
LLT: CVCAS_0544(rpoE)
LLS: lilo_0520(rpoE)
LLX: NCDO2118_0631(rpoE)
LLM: llmg_0608(rpoE)
LLC: LACR_0658
LLR: llh_9815
LLI: uc509_0642(rpoE)
LLW: kw2_0593(rpoE)
LLJ: LG36_0598(rpoE)
LGR: LCGT_0349
LGV: LCGL_0349
LPK: LACPI_1745(rpoE)
LRN: CMV25_02770(rpoE)
SPY: SPy_1895(rpoE)
SPZ: M5005_Spy1611(rpoE)
SPYM: M1GAS476_1690(rpoE)
SPYA: A20_1657c(rpoE)
SPM: spyM18_1960(rpoE)
SPG: SpyM3_1633(rpoE)
SPS: SPs0233
SPH: MGAS10270_Spy1679(rpoE)
SPI: MGAS10750_Spy1666(rpoE)
SPJ: MGAS2096_Spy1634(rpoE)
SPK: MGAS9429_Spy1614(rpoE)
SPF: SpyM50243(rpoE)
SPB: M28_Spy1600(rpoE)
STG: MGAS15252_1455(rpoE)
STX: MGAS1882_1516(rpoE)
SOZ: Spy49_1562c(rpoE)
STZ: SPYALAB49_001600(rpoE)
SPYH: L897_08055
SPN: SP_0493
SPD: SPD_0441
SPR: spr0437(rpoE)
SPW: SPCG_0472(rpoE)
SJJ: SPJ_0462(rpoE)
SNV: SPNINV200_04370(rpoE)
SPX: SPG_0446(rpoE)
SNT: SPT_0532(rpoE)
SND: MYY_0561
SPNN: T308_02375
SNE: SPN23F04480(rpoE)
SPV: SPH_0603(rpoE)
SNC: HMPREF0837_10789(rpoE)
SNM: SP70585_0554(rpoE)
SPP: SPP_0516(rpoE)
SNI: INV104_04210(rpoE)
SNB: SP670_0570(rpoE)
SNP: SPAP_0496
SNX: SPNOXC04590(rpoE)
SNU: SPNA45_01583(rpoE)
SPNE: SPN034156_15160(rpoE)
SPNU: SPN034183_04620(rpoE)
SPNM: SPN994038_04500(rpoE)
SPNO: SPN994039_04510(rpoE)
SAG: SAG0106
SAN: gbs0105
SAK: SAK_0156(rpoE)
SGC: A964_0109(rpoE)
SAGS: SaSA20_0104(rpoE)
SAGL: GBS222_0257(rpoE)
SAGM: BSA_1580
SAGI: MSA_1690
SAGR: SAIL_1660
SAGP: V193_01590
SAGC: DN94_01590
SAGE: EN72_00800
SAGG: EN73_00775
SAGN: W903_0164
SMU: SMU_96(rpoE)
SMC: SmuNN2025_0088(rpoE)
SMJ: SMULJ23_0077(rpoE)
SMUA: SMUFR_0078(rpoE)
STC: str0133(rpoE)
STL: stu0133(rpoE)
STE: STER_0192
STN: STND_0137
STU: STH8232_0223(rpoE)
STW: Y1U_C0123
STHE: T303_01940
SSA: SSA_1996(rpoE)
SSB: SSUBM407_0300(rpoE)
SSI: SSU0310(rpoE)
SSS: SSUSC84_0298(rpoE)
SUP: YYK_01460
SSUY: YB51_1680
SSUT: TL13_0370(rpoE)
SSUI: T15_0340(rpoE)
SGO: SGO_0413
SEQ: SZO_02520
SEZO: SeseC_02322(rpoE)
SEU: SEQ_1946
SUB: SUB0325(rpoE)
SDS: SDEG_0328
SDA: GGS_0316(rpoE)
SDC: SDSE_0340(rpoE)
SGA: GALLO_0252(rpoE)
SGG: SGGBAA2069_c02850(rpoE)
SGT: SGGB_0325(rpoE)
SMB: smi_0400(rpoE)
SOR: SOR_0396(rpoE)
STK: STP_1432
STB: SGPB_0245(rpoE)
SCP: HMPREF0833_11890(rpoE)
SCF: Spaf_0478(rpoE)
SSR: SALIVB_0171(rpoE)
STF: Ssal_02039(rpoE)
STJ: SALIVA_0153(rpoE)
SSAH: HSISS4_00106(rpoE)
SMN: SMA_0291(rpoE)
SIF: Sinf_0280(rpoE)
SIE: SCIM_1329(rpoE)
SIB: SIR_1515(rpoE)
SIU: SII_1501(rpoE)
SANG: SAIN_1460(rpoE)
SANC: SANR_1686(rpoE)
SANS: DK43_02175
SCG: SCI_1610(rpoE)
SCON: SCRE_1566(rpoE)
SCOS: SCR2_1566(rpoE)
SIK: K710_0403
SLU: KE3_0241
STRN: SNAG_0420(rpoE)
LJO: LJ_0223
LJF: FI9785_298(rpoE)
LJH: LJP_0227
LAC: LBA0232
LAD: LA14_0228
LAF: SD55_0225
LDB: Ldb0353(rpoE)
LBU: LBUL_0308
LDE: LDBND_0301(rpoE)
LDL: LBU_0283
LGA: LGAS_0225
LHE: lhv_0246
LHL: LBHH_0226
LHV: lhe_1842
LHH: LBH_0195
LHD: HUO_02145
LCR: LCRIS_00231(rpoE)
LAM: LA2_01300
LKE: WANG_1853
LAE: LBAT_0296
LPW: LpgJCM5343_02260(rpoE)
LCA: LSEI_2573
LCS: LCBD_2751
LCE: LC2W_2726
LPAP: LBPC_2524
LCB: LCABL_27400(rpoE)
LRH: LGG_02551
LRG: LRHM_2449
LRA: LRHK_2663(rpoE)
LPL: lp_0480(rpoE)
LPJ: JDM1_0404(rpoE)
LPT: zj316_0645(rpoE)
LPS: LPST_C0405(rpoE)
LPZ: Lp16_0432
LRE: Lreu_0229
LRF: LAR_0220
LRU: HMPREF0538_21409(rpoE)
LRT: LRI_1728
LFE: LAF_0201
LFF: LBFF_0217
LSN: LSA_04090(rpoE)
LBH: Lbuc_1588
LBN: LBUCD034_1646(rpoC)
LBR: LVIS_0486
LJI: ELX58_07220(rpoE)
LSL: LSL_0341(rpoE)
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GAU: GAU_2143
GBA: J421_3740
MBAS: ALGA_4365
FLN: FLA_5213
SGN: SGRA_2751
CHU: CHU_0356
DFE: Dfer_2433
FAE: FAES_2460
GFO: GFO_2610
FIN: KQS_06765
IAL: IALB_3194
ASAC: ATHSA_1877
MMET: MCMEM_0197
NMG: Nmag_0704
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Reference
  Authors
Borukhov S, Nudler E
  Title
RNA polymerase holoenzyme: structure, function and biological implications.
  Journal
Curr Opin Microbiol 6:93-100 (2003)
DOI:10.1016/S1369-5274(03)00036-5
LinkDB

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