KEGG   ORTHOLOGY: K03088Help
Entry
K03088                      KO                                     

Name
rpoE
Definition
RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily
Brite
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     K03088  rpoE; RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG1595
GO: 0016987
Genes
ECO: b2573(rpoE) b4293(fecI)
ECJ: JW2557(rpoE) JW4253(fecI)
ECD: ECDH10B_2741(rpoE) ECDH10B_4491(fecI)
EBW: BWG_2337(rpoE) BWG_3990(fecI)
ECOK: ECMDS42_2118(rpoE)
ECE: Z3855(rpoE)
ECS: ECs3439
ECF: ECH74115_3810(rpoE)
ETW: ECSP_3519(rpoE)
ELX: CDCO157_3207
EOI: ECO111_3299(rpoE)
EOH: ECO103_3151(rpoE)
ECG: E2348C_2850(rpoE)
EOK: G2583_3155(rpoE)
ECC: c3097(rpoE)
ECP: ECP_2575
ECI: UTI89_C2895(rpoE)
ECV: APECO1_3958(rpoE)
ECX: EcHS_A2728(rpoE)
ECW: EcE24377A_2859(rpoE) EcE24377A_4870(fecI)
ECM: EcSMS35_2726(rpoE)
ECY: ECSE_2861
ECR: ECIAI1_2686(rpoE)
ECQ: ECED1_3003(rpoE) ECED1_5158(fecI)
ECK: EC55989_2862(rpoE) EC55989_4966(fecI)
ECT: ECIAI39_2778(rpoE) ECIAI39_4771(fecI)
EOC: CE10_3006(rpoE) CE10_5019(fecI)
EUM: ECUMN_2895(rpoE) ECUMN_4862(fecI)
ECZ: ECS88_2747(rpoE) ECS88_4866(fecI)
ELO: EC042_2777(rpoE) EC042_4782(fecI)
ESE: ECSF_2412
EBR: ECB_02467(rpoE) ECB_04159(fecI)
EKF: KO11_09955(rpoE)
EAB: ECABU_c28750(rpoE) ECABU_c49050(fecI)
EIH: ECOK1_2917(rpoE)
ELW: ECW_m2802(rpoE)
ELL: WFL_13710(rpoE)
ELC: i14_2892(rpoE)
ELD: i02_2892(rpoE)
ELP: P12B_c2674(rpoE) P12B_c4398(fecI)
EBL: ECD_02467(rpoE) ECD_04159(fecI)
EBE: B21_02431(rpoE) B21_04122(fecI)
ELF: LF82_1962(rpoE)
ECOI: ECOPMV1_02755(rpoE)
ECOO: ECRM13514_3400(rpoE) ECRM13514_3858(fecI)
ECOS: EC958_2879(rpoE) EC958_4790
EFE: EFER_0501(rpoE)
EAL: EAKF1_ch3429(rpoE)
EMA: C1192_22645(rpoE)
STY: STY2833(rpoE)
STT: t0270(rpoE)
STM: STM2640(rpoE)
SEO: STM14_3234(rpoE)
SEY: SL1344_2604(rpoE)
SEJ: STMUK_2676(rpoE)
SEB: STM474_2753(rpoE)
SEF: UMN798_2846(rpoE)
SENR: STMDT2_25921(rpoE)
SEND: DT104_26941(rpoE)
SENI: CY43_14065
SPT: SPA0278(rpoE)
SEK: SSPA0263
SEI: SPC_2751(rpoE)
SEC: SCH_2645(rpoE)
SEH: SeHA_C2854(rpoE)
SHB: SU5_03183
SEE: SNSL254_A2850(rpoE)
SEW: SeSA_A2832(rpoE)
SEA: SeAg_B2750(rpoE)
SENS: Q786_12805
SED: SeD_A2966(rpoE)
SEG: SG2624(rpoE)
SEL: SPUL_0286(rpoE)
SEGA: SPUCDC_0286(rpoE)
SET: SEN2567(rpoE)
SENA: AU38_13000
SENO: AU37_13010
SENV: AU39_13010
SENQ: AU40_14620
SENL: IY59_13355
SEEP: I137_01310
SENB: BN855_27360(rpoE)
SENE: IA1_12930
SBG: SBG_2358(rpoE)
SBZ: A464_2697
SFL: SF2635(rpoE)
SFX: S2808(rpoE)
SFV: SFV_2636(rpoE)
SFE: SFxv_2892(rpoE)
SFN: SFy_3743
SFS: SFyv_3820
SFT: NCTC1_02896(rpoE)
SSN: SSON_2697(rpoE) SSON_4465(fecI)
SBO: SBO_2601(rpoE)
SBC: SbBS512_E2938(rpoE)
SDY: SDY_2814(rpoE) SDY_4299(fecI)
ENC: ECL_03911(rpoE) ECL_A104
EEC: EcWSU1_03387(rpoE) EcWSU1_03453(rpoE)
ECLX: LI66_16455
ESA: ESA_00686
CSK: ES15_0959(rpoE)
CTU: CTU_15420 CTU_31640(rpoE)
KPU: KP1_4155(rpoE) KP1_p036(fecI)
KPP: A79E_1204
KPT: VK055_4603(rpoE)
KPE: KPK_1224(rpoE) KPK_A0060
KPR: KPR_1375(rpoE) KPR_1688
KPX: PMK1_00395(rpoE) PMK1_a00042(fecI) PMK1_a00092(sigM)
KPNK: BN49_4107(rpoE) BN49_pII0049
KVA: Kvar_1165
CRO: ROD_25201(rpoE) ROD_34391(fecI)
HDE: HDEF_0527(rpoE)
EBT: EBL_c09900(rpoE)
LEI: C2U54_22340(rpoE)
EBF: D782_1101
YPE: YPO2711(rpoE)
YPK: y1290(rpoE)
YPA: YPA_2445
YPN: YPN_1199
YPM: YP_2515(rpoE)
YPG: YpAngola_A3604(rpoE)
YPZ: YPZ3_2392(rpoE)
YPD: YPD4_2320(rpoE)
YPX: YPD8_2371(rpoE)
YPH: YPC_3139(rpoE)
YPW: CH59_3596(rpoE)
YPJ: CH55_1455(rpoE)
YPV: BZ15_817(rpoE)
YPL: CH46_2393(rpoE)
YPS: YPTB2897(rpoE)
YPO: BZ17_3734(rpoE)
YPI: YpsIP31758_1129(rpoE)
YPY: YPK_1182
YPB: YPTS_3008
YPQ: DJ40_3595(rpoE)
YPU: BZ21_2198(rpoE)
YPR: BZ20_3278(rpoE)
YPC: BZ23_2480(rpoE)
YPF: BZ19_2265(rpoE)
YEN: YE0316 YE1010(rpoE) YE2840
YAL: AT01_3484(rpoE)
YFR: AW19_157(rpoE) AW19_614
YIN: CH53_687(rpoE)
YKR: CH54_1048 CH54_1506(rpoE)
YRO: CH64_1518(rpoE)
YRU: BD65_1088(rpoE)
SPLY: Q5A_019390(rpoE) Q5A_023240(sigR)
SMAR: SM39_0339(hasI) SM39_1753(fecI) SM39_2512 SM39_3274(rpoE)
SGL: SG1793
SOD: Sant_1092(rpoE)
DDQ: DDI_3050
ETA: ETA_09840(rpoE) ETA_28360 ETA_30330(fecI)
EPY: EpC_09970(rpoE) EpC_29870
EPR: EPYR_01055(rpoE) EPYR_03226(sigD)
EAM: EAMY_0593(sigD) EAMY_2631(rpoE)
EAY: EAM_2522(rpoE) EAM_2836
PAM: PANA_1604(rpoE) PANA_1945 PANA_2589(fecI) PANA_2899(rpoE)
PAJ: PAJ_0958(rpoE) PAJ_1278 PAJ_1882(fecI) PAJ_2190(rpoE)
PVA: Pvag_2321(rpoE) Pvag_pPag30030(rpoE) Pvag_pPag30274(nccH)
PGZ: C2E15_16115(rpoE)
PAY: PAU_01299(rpoE) PAU_03224 PAU_03939(fecI)
PMR: PMI1894(rpoE) PMI3708
XBV: XBW1_1675(rpoE) XBW1_3667(fecI)
XNE: XNC1_3267(rpoE) XNC1_3739(fecI)
XNM: XNC2_3143(rpoE) XNC2_3594(fecI)
XDO: XDD1_1179 XDD1_2816(rpoE)
XPO: XPG1_0982(rpoE) XPG1_2510
PRG: RB151_006430(fecI) RB151_028580(rpoE)
ETR: ETAE_2728(rpoE)
ETD: ETAF_2462(rpoE)
ETE: ETEE_0881(rpoE)
PSHI: SAMEA2665130_2365(rpoE)
HIN: HI0628(rpoE) HI1459
HIT: NTHI0719(rpoE) NTHI1673
HIA: H733_0513(rpoE) H733_0982
HIW: NTHI477_00180(rpoE_1) NTHI477_01720(rpoE_2)
HIC: NTHIC486_00377(rpoE_1) NTHIC486_01252(rpoE_2)
HIX: NTHI723_00099(rpoE_1) NTHI723_01107(rpoE_2)
HDU: HD_1172(rpoE) HD_1917
HAP: HAPS_0532(rpoE) HAPS_0720(rpoE)
HSO: HS_1016 HS_1605(rpoE)
PMU: PM0209 PM1789(rpoE)
PMP: Pmu_11020 Pmu_15470(rpoE)
PMUL: DR93_148(rpoE) DR93_1856
MSU: MS2228(rpoE)
MHT: D648_1110 D648_8430(rpoE)
APL: APL_0394(rpoE) APL_1831
APJ: APJL_0415(rpoE) APJL_1869
APA: APP7_0418(rpoE) APP7_1918
XFA: XF_2239
XFT: PD_1284(algU)
XCC: XCC0847 XCC1267(algU) XCC1306(algU) XCC1334(rpoE) XCC1665(rpoE) XCC2643(rfaY) XCC2916 XCC3593(fecI)
XCV: XCV0954(rpoE1) XCV1370(rpoE2) XCV1436(rpoE3) XCV1718(rpoE4) XCV2975(rpoE5) XCV3224(rpoE6) XCV4082(rpoE7) XCV4222(rpoE9)
XAX: XACM_0900(rpoE1) XACM_1302(rpoE2) XACM_1365(rpoE) XACM_1701(rpoE4) XACM_2758(rpoE5) XACM_3012 XACM_3858(rpoE7) XACM_3998(rpoE9)
XAC: XAC0922 XAC1319(algU) XAC1380(rpoE) XAC1682(rpoE) XAC2191 XAC2814(rfaY) XAC3989(prtI) XAC4129(rpoE)
XOO: XOO0448(prtI) XOO1548(rfaY) XOO1849(algU) XOO1919(rpoE) XOO2343(RpoE) XOO3003(rpoE) XOO3631(RpoE)
XOM: XOO0411(XOO0411) XOO1437(XOO1437) XOO1745(XOO1745) XOO1817(XOO1817) XOO2225(XOO2225) XOO2854(XOO2854) XOO3432(XOO3432)
XAL: XALC_0471 XALC_1465(rpoE3) XALC_2493(rpoE2) XALC_2547(rpoE1)
XPH: XppCFBP6546_04510(XppCFBP6546P_04510) XppCFBP6546_04840(XppCFBP6546P_04840) XppCFBP6546_06900(XppCFBP6546P_06900) XppCFBP6546_13795(XppCFBP6546P_13795) XppCFBP6546_14585(XppCFBP6546P_14585) XppCFBP6546_18685(XppCFBP6546P_18685) XppCFBP6546_21795(XppCFBP6546P_21795)
VTA: A0068(rpoE) A1920(sigZ) A2183 B1194(fecI)
VFI: VF_0972(rpoE2) VF_2093(rpoE) VF_A0766(rpoE4) VF_A0820(rpoE3)
VFM: VFMJ11_1026(sigZ_1) VFMJ11_2198(rpoE) VFMJ11_A0891 VFMJ11_A0947(sigZ_2)
VSA: VSAL_I2531(rpoE)
PPR: PBPRA0960(SO3096) PBPRA3095(Y1290) PBPRB0251
PMAI: CF386_01780(rpoE)
PPSE: BN5_2128(sigX) BN5_2362 BN5_2415(rpoE1) BN5_2857(rpoE3) BN5_2907(algU)
PCQ: PcP3B5_00450(fecI_1) PcP3B5_06200(fecI_2) PcP3B5_08160(fecI_3) PcP3B5_12880 PcP3B5_15040(rpoE_1) PcP3B5_19920(sigW_1) PcP3B5_21530(fecI_4) PcP3B5_21580(fecI_5) PcP3B5_27620(fecI_6) PcP3B5_29550(sigR) PcP3B5_30900(fecI_7) PcP3B5_31150(fecI_8) PcP3B5_31440(fecI_9) PcP3B5_31630 PcP3B5_32210(fecI_10) PcP3B5_32650(fecI_11) PcP3B5_33470(fecI_12) PcP3B5_36640(fecI_13) PcP3B5_39260(sigW_2) PcP3B5_49090(rpoE_2) PcP3B5_55130(fecI_14)
ACB: A1S_2598
ABY: ABAYE0897
ABX: ABK1_2894
ABAD: ABD1_25510
ABAA: IX88_16020
ILO: IL0054 IL0816(rpoE) IL1391 IL1594(fecI) IL1936
PTN: PTRA_a0823(rpoE) PTRA_a1102(rpoE) PTRA_a2260(rpoE) PTRA_a2428(rpoE) PTRA_a2931(rpoE) PTRA_b0498(rpoE) PTRA_b0650(rpoE)
PEA: PESP_a0717(rpoE) PESP_a0775(rpoE) PESP_a1085(rpoE) PESP_a1238(rpoE) PESP_a1352(rpoE) PESP_a1368(rpoE) PESP_a1563(rpoE) PESP_a2529 PESP_a2951(rpoE) PESP_b0583(rpoE) PESP_b0732(rpoE)
PSPO: PSPO_a0189(rpoE) PSPO_a0268(rpoE) PSPO_a0835(rpoE) PSPO_a0928(rpoE) PSPO_a2569(rpoE) PSPO_a2617(rpoE) PSPO_b0463(rpoE) PSPO_b1273(rpoE) PSPO_b1376 PSPO_b1475(rpoE) PSPO_b1478(rpoE) PSPO_b1557(rpoE) PSPO_b1583(rpoE)
PART: PARC_a0206(rpoE) PARC_a0993(rpoE) PARC_a2154 PARC_a2455(rpoE) PARC_a2796(rpoE) PARC_a3263(rpoE) PARC_a3321(rpoE) PARC_b0500(rpoE) PARC_b0700(rpoE)
PNG: PNIG_a0881(rpoE) PNIG_a1159(rpoE) PNIG_a3116(rpoE) PNIG_b0460(rpoE) PNIG_b0610(rpoE)
PTD: PTET_a0685(rpoE) PTET_a1165(rpoE) PTET_a1423(rpoE) PTET_a2646(rpoE) PTET_a2871(rpoE) PTET_b0652(rpoE)
MBS: MRBBS_0168(rpoE) MRBBS_0519(sigK) MRBBS_2659(algU)
GNI: GNIT_0704(rpoE) GNIT_1081(rpoE) GNIT_1123(rpoE) GNIT_1195(rpoE) GNIT_2985(rpoE) GNIT_3025(rpoE) GNIT_3168(rpoE)
MVS: MVIS_0420(rpoE)
MICC: AUP74_00127(fecI) AUP74_01055(sigW) AUP74_02058 AUP74_02771(rpoE_1) AUP74_02791(rpoE_2) AUP74_03106(rpoE_3) AUP74_03203(sigG)
LPN: lpg1577(rpoE)
LPH: LPV_1713(rpoE)
LPO: LPO_1596(rpoE)
LPM: LP6_1556(rpoE)
LPF: lpl1448(rpoE)
LPP: lpp1535(rpoE)
LPC: LPC_1001(rpoE)
LPA: lpa_02291(rpoE)
LPE: lp12_1515
LLO: LLO_1504(rpoE)
LFA: LFA_1632(algU)
LHA: LHA_1565(rpoE)
MCA: MCA1471(rpoE)
NWA: Nwat_0668
TNI: TVNIR_0148(rpoE_[H]) TVNIR_0372 TVNIR_0819(algU_[H])
HCO: LOKO_01535 LOKO_01813(sigR) LOKO_02085(rpoE_1) LOKO_02332(rpoE_2)
ABO: ABO_1639(algU) ABO_2179(rpoE)
ASA: ASA_0204(sigY) ASA_2154 ASA_3492(rpoE) ASA_4375(fecI)
ACAV: VI35_00930 VI35_03265(rpoE)
EBH: BSEPE_0475(rpoE)
NME: NMB2144
NMP: NMBB_2441
NMA: NMA0230
NMW: NMAA_1926
NMX: NMA510612_0249(ecf)
NMC: NMC2123
NMN: NMCC_2103(ecf)
NMT: NMV_2359
NMI: NMO_0031
NGO: NGO1944
NGK: NGK_2307
NLA: NLA_20380
ECOR: SAMEA4412678_0530(rpoE)
LHK: LHK_01458(rpoE)
PSE: NH8B_1571(rpoE) NH8B_2028(rpoE) NH8B_3073(rpoE)
REH: H16_A1034(rpoE2) H16_A1096(rpoE3) H16_A2563(rpoE1) H16_A2923(rpoE4) H16_A3447(rpoE5) H16_B1727(prtI) H16_B2413(rpoE6)
RME: Rmet_0597(rpoO) Rmet_0910(rpoR) Rmet_1120(rpoI) Rmet_1648(rpoP) Rmet_2425(rpoE) Rmet_3280(rpoL) Rmet_3844(rpoT) Rmet_4001(rpoK) Rmet_4499(rpoJ) Rmet_4686(rpoQ) Rmet_5400(rpoM) Rmet_6207(cnrH)
CGD: CR3_0331(rpoE) CR3_0844(rpoE) CR3_1248(rpoE) CR3_1856(rpoE) CR3_3319(rpoE) CR3_3747(rpoE) CR3_3848(rpoE) CR3_3951(rpoE) CR3_4485(rpoE)
PNE: Pnec_0809
BPE: BP0349(hurI) BP1136(fecI) BP1191 BP1225 BP2007 BP2437(sigE) BP2914
BAV: BAV0636(fecI) BAV0806 BAV1125(rpoE) BAV1207(fecI) BAV1842 BAV3136(hurI)
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