KEGG   ORTHOLOGY: K05522
Entry
K05522                      KO                                     

Name
nei
Definition
endonuclease VIII [EC:3.2.2.- 4.2.99.18]
Pathway
ko03410  Base excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03410 Base excision repair
    K05522  nei; endonuclease VIII
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K05522  nei; endonuclease VIII
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.2  Glycosylases
   3.2.2  Hydrolysing N-glycosyl compounds
    3.2.2.-  
     K05522  nei; endonuclease VIII
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.99  Other carbon-oxygen lyases
    4.2.99.18  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
     K05522  nei; endonuclease VIII
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA glycosylases
     K05522  nei; endonuclease VIII
Other DBs
COG: COG0266
GO: 0000703
Genes
ECO: b0714(nei)
ECJ: JW0704(nei)
ECD: ECDH10B_0781(nei)
EBW: BWG_0573(nei)
ECOK: ECMDS42_0564(nei)
ECE: Z0865(nei)
ECS: ECs0739
ETW: ECSP_0756(nei)
ELX: CDCO157_0719
EOI: ECO111_0731(nei)
EOJ: ECO26_0775(nei)
EOH: ECO103_0707(nei)
ECOO: ECRM13514_0725(nei)
ECOH: ECRM13516_0672(nei)
ESL: O3K_18080
ESO: O3O_07215
ESM: O3M_18060
ECK: EC55989_0697(nei)
ECG: E2348C_0597(nei)
EOK: G2583_0869(nei)
ELH: ETEC_0726
ECW: EcE24377A_0740(nei)
ECP: ECP_0727
ENA: ECNA114_0645(nei)
ECOS: EC958_0823
ECV: APECO1_1361(nei)
ECX: EcHS_A0762(nei)
ECM: EcSMS35_0730(nei)
ECY: ECSE_0773
ECR: ECIAI1_0688(nei)
ECQ: ECED1_0686(nei)
EUM: ECUMN_0792(nei)
ECT: ECIAI39_0666(nei)
EOC: CE10_0696(nei)
EBR: ECB_00674(nei)
EBL: ECD_00674(nei)
EBE: B21_00663(nei)
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ECI: UTI89_C0712(nei)
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ELO: EC042_0731(nei)
ESE: ECSF_0642
EKF: KO11_20180(nei)
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EDJ: ECDH1ME8569_0673(nei)
ELW: ECW_m0768(nei)
ELL: WFL_03750(nei)
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SEY: SL1344_0710(nei)
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SPT: SPA2015(nei)
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SEI: SPC_0725(nei)
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SED: SeD_A0823
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SENA: AU38_03500
SENO: AU37_03495
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SENQ: AU40_03880
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SENB: BN855_7030
SENE: IA1_03710
SBG: SBG_0622(nei)
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SFE: SFxv_0643(nei)
SFN: SFy_0780
SFS: SFyv_0821
SFT: NCTC1_00619(nei)
SSN: SSON_0665(nei)
SBO: SBO_0573(nei)
SBC: SbBS512_E0632(nei)
SDY: SDY_0649(nei)
ENC: ECL_03013
ECLX: LI66_06225
ECLY: LI62_07125
ECLZ: LI64_06710
ECLO: ENC_20190
EEC: EcWSU1_01267(nei)
ESA: ESA_02628
CSK: ES15_2710(nei)
CTU: CTU_13260(nei)
KPN: KPN_00726(nei)
KPU: KP1_1681(nei)
KPP: A79E_3510
KPR: KPR_3852(end8)
KPJ: N559_3599
KPX: PMK1_03062(nei)
KPNU: LI86_18445
KPNK: BN49_1782(end8)
KVA: Kvar_3645
KPE: KPK_3844(nei)
KOX: KOX_14560
KOE: A225_1737
EAE: EAE_14140
EAR: CCG31142
CKO: CKO_02451
CAMA: F384_03150
EBT: EBL_c26740(nei)
RTG: NCTC13098_05294(nei)
REE: electrica_03602(nei)
CLAP: NCTC11466_03255(nei)
KIE: NCTC12125_02271(nei)
METY: MRY16398_40420(nei)
AHN: NCTC12129_03495(nei)
YRE: HEC60_00720(nei)
PDZ: HHA33_20180(nei)
EBF: D782_3140
PSTS: E05_08130
SMAR: SM39_0676(nei)
SMAC: SMDB11_0504(nei)
SMW: SMWW4_v1c12250(nei)
SPE: Spro_1261
SRL: SOD_c11310(nei)
SPLY: Q5A_006335(nei)
SMAF: D781_1183
SERF: L085_22320
SOF: NCTC11214_05653(nei)
RAA: Q7S_15920
EAME: GXP68_14940(nei)
ECA: ECA1355(nei)
PATR: EV46_06850
PATO: GZ59_13870(nei)
PCT: PC1_1230
PEC: W5S_3097
SOD: Sant_3818(nei)
PES: SOPEG_2129(nei)
DDD: Dda3937_01541(nei)
DAQ: DAQ1742_02990(nei)
EAM: EAMY_1162(nei)
EAY: EAM_1166(nei)
ETA: ETA_23100(nei)
EPY: EpC_24440(nei)
EPR: EPYR_02646(nei)
EBI: EbC_12930(nei)
ERJ: EJP617_22850(nei)
EGE: EM595_1108(nei)
PAM: PANA_1168(nei)
PLF: PANA5342_3121(nei)
PAJ: PAJ_0488(nei)
PVA: Pvag_0542(nei)
PSTW: DSJ_08285
MINT: C7M51_00563(nei)
MTHI: C7M52_02182(nei)
ETR: ETAE_2590(nei)
ETD: ETAF_2331
ETE: ETEE_0687(nei)
LRI: NCTC12151_02198(nei)
XCC: XCC3527
XCB: XC_0633
XCA: xcc-b100_0669(mutM1)
XCP: XCR_3868
XCV: XCV0662
XAX: XACM_0609
XAC: XAC0606
XCI: XCAW_03975(nei)
XOO: XOO4027
XOP: PXO_04161
XOR: XOC_0662
XPH: XppCFBP6546_08635(XppCFBP6546P_08635)
SML: Smlt2533
SMZ: SMD_2202
PSUW: WQ53_10045
LEZ: GLE_3693(mutM)
LEM: LEN_2445(nei)
PSA: PST_0858
PSTT: CH92_04005
MAD: HP15_4107(nei)
MBS: MRBBS_2866(nei)
AMAC: MASE_13750
GNI: GNIT_0281(nei)
GPS: C427_4688(nei)
TGR: Tgr7_3176
TKM: TK90_2263
TVR: TVD_01330
HAM: HALO2525
HCO: LOKO_01594(nei)
TBN: TBH_C2751
GPB: HDN1F_20490(nei)
ENM: EBS_1293(nei)
AAV: Aave_1848
AAA: Acav_1787
RTA: Rta_10440
ADE: Adeh_2091
CCX: COCOR_01590(nei)
HOH: Hoch_4683
BBAR: RHAL1_00459(nei)
BMQ: BMQ_0878
BMD: BMD_0877
BMH: BMWSH_4363(nei)
BMEG: BG04_3172
BEO: BEH_02180
BBEV: BBEV_2713(nei)
HHD: HBHAL_5164(nei)
BSE: Bsel_0626
JEO: JMA_06990
MTU: Rv2464c Rv3297(nei)
MTC: MT2539(fpg-1) MT3396(nei)
MRA: MRA_2490 MRA_3338(nei)
MTUR: CFBS_2610 CFBS_3488(nei)
MTD: UDA_2464c UDA_3297(nei)
MBB: BCG_2484c BCG_3326(nei_1) BCG_3362(nei_2)
MBT: JTY_2478 JTY_3322(nei_1)
MAF: MAF_24810 MAF_33080(nei)
MPA: MAP_2284c MAP_3416(nei)
MAV: MAV_1708
MUL: MUL_2650(nei)
MMC: Mmcs_1265
MKM: Mkms_1282
MJL: Mjls_1291
MMI: MMAR_1237(nei) MMAR_3812
MHAD: B586_08810
MSHG: MSG_01143(nei2) MSG_03468(nei1)
MFJ: MFLOJ_22480(nei2) MFLOJ_52170(nei1)
MXE: MYXE_18020(nei1) MYXE_37680(nei2)
MNV: MNVI_01790(nei1) MNVI_27650(nei2)
MPHL: MPHLCCUG_01540(nei) MPHLCCUG_03625(nei1)
MTHN: 4412656_01143(mutM_1) 4412656_02879(nei)
MHAS: MHAS_00463(nei1_1) MHAS_01141(nei1_2)
MAUU: NCTC10437_00335(mutM_1) NCTC10437_01338(nei) NCTC10437_03798(mutM_3)
MSAL: DSM43276_01437(nei1) DSM43276_04549(nei)
MTER: 4434518_01341(nei_1) 4434518_03105(nei_2)
MMIN: MMIN_08040(nei2) MMIN_30460(nei1)
MHIB: MHIB_09010(nei1) MHIB_25380
CGL: NCgl0813(Cgl0847)
CGB: cg0969(nei)
CGU: WA5_0813(Nei)
CGT: cgR_0962
CGM: cgp_0969(nei)
CGJ: AR0_04795
CEF: CE0922
CDI: DIP0829
CDIP: ERS451417_00736(nei)
CJK: jk0446(nei)
CUR: cu1517
CUA: CU7111_1466(nei)
CAR: cauri_0796(nei)
CPL: Cp3995_0647(nei)
CPP: CpP54B96_0648(nei)
CPZ: CpPAT10_0637(nei)
COR: Cp267_0666(nei)
COD: Cp106_0621(nei)
COS: Cp4202_0630(nei)
CPSE: CPTA_01188
CPSU: CPTB_00344
CPSF: CPTC_01179
CRD: CRES_0362(nei)
CUN: Cul210932_0716(nei)
CUS: CulFRC11_0685(nei)
CUQ: Cul210931_0684(nei)
CUZ: Cul05146_0736(nei)
CUJ: CUL131002_0693(nei)
CVA: CVAR_0676
CTER: A606_02960
CGY: CGLY_12655(nei)
CSX: CSING_04470(nei)
CDX: CDES_04270(nei)
CSP: WM42_0568
CPHO: CPHO_08925
CGV: CGLAU_03640(nei1)
CMIN: NCTC10288_01735(nei)
CPEG: CPELA_07730(nei1)
CEE: CENDO_03580(nei1)
CGK: CGERO_03380(nei1)
NFR: ERS450000_02781(mutM_1) ERS450000_03139(nei)
NAD: NCTC11293_01829(nei_1) NCTC11293_02308(nei_2)
RFA: A3L23_00103(nei1_1) A3L23_00923(nei1_2) A3L23_03703(nei1_3)
RHS: A3Q41_02428(nei1_1) A3Q41_03311(nei1_2) A3Q41_04537(nei1_3)
RHU: A3Q40_00976(nei1_1) A3Q40_02073(nei1_2) A3Q40_03922(nei1_3)
RRT: 4535765_01811(mutM_2) 4535765_03398(nei)
RCR: NCTC10994_01079(mutM_2) NCTC10994_03866(nei)
GRU: GCWB2_08835(nei1) GCWB2_15135(nei2)
GOM: D7316_00552(nei1) D7316_01464(nei)
SRT: Srot_2428
SCO: SCO2626(SCC80.11c) SCO5760(SC7C7.15c)
SMA: SAVERM_2501(nei1) SAVERM_5427(nei2)
SBH: SBI_03347(nei1) SBI_07095(nei2)
SALS: SLNWT_1526
SLV: SLIV_09815(nei) SLIV_24535(nei1)
SGU: SGLAU_11985(nei1) SGLAU_24815(nei)
SAMB: SAM23877_2676(nei) SAM23877_5464(nei)
SRW: TUE45_03234(nei1) TUE45_06256(nei)
SLE: sle_19090(sle_19090) sle_46120(sle_46120)
SRN: A4G23_01706(nei1) A4G23_04275(nei)
SNR: SNOUR_12990(nei) SNOUR_27195(nei1)
SALF: SMD44_02924(nei) SMD44_06378(nei)
SALJ: SMD11_1841(nei) SMD11_4506(nei)
SLX: SLAV_11150(nei1) SLAV_24420(nei2)
SGE: DWG14_02296(nei) DWG14_05516(nei1)
KSK: KSE_04300(nei1) KSE_14070(nei2)
MOO: BWL13_00384(nei1_1) BWL13_01468(nei1_2) BWL13_02855(nei1_3)
MLV: CVS47_00391(nei1_1) CVS47_01583(nei1_2) CVS47_02691(nei1_3)
MOY: CVS54_01953(nei1_1) CVS54_03100(nei1_2)
AMIN: AUMI_17560
AUW: AURUGA1_00619(nei1)
ART: Arth_0622
ARX: ARZXY2_1581(nei) ARZXY2_3218(nei)
KRH: KRH_03070
BCV: Bcav_2454
IDO: I598_1017(mutM) I598_1152(nei1)
ACIJ: JS278_01195(nei1_1) JS278_01646(nei1_2)
NDK: I601_0892(mutM) I601_2378(nei1) I601_2906(nei)
NBE: Back2_09570(nei)
MGG: MPLG2_3300(nei)
TFU: Tfu_0694
NDA: Ndas_3660
NAL: B005_0831
TCU: Tcur_3301
FAL: FRAAL5723(end8)
NML: Namu_0817
SEN: SACE_1351(fpg-1) SACE_5875(end8)
SACC: EYD13_06580(nei1) EYD13_13980(nei2)
AMD: AMED_6274(nei) AMED_6810(nei)
AMM: AMES_6183(nei) AMES_6708(nei)
AMZ: B737_6183(nei) B737_6708(nei)
AOI: AORI_1929(nei) AORI_2276(nei)
AJA: AJAP_27480(nei) AJAP_29890(nei1)
AMQ: AMETH_1700(nei) AMETH_2505(nei)
AMYY: YIM_35715(nei1) YIM_39015(nei2)
PAUT: Pdca_19950(nei_1) Pdca_52490(nei_2)
ACTI: UA75_07965
ACAD: UA74_07985
AHG: AHOG_07480(nei1)
SAQ: Sare_1363
ASE: ACPL_7182(nei1) ACPL_7528
PFLA: Pflav_081680(nei_1) Pflav_087690(nei_2)
PSUU: Psuf_044490(nei_1) Psuf_050670(nei_2)
SNA: Snas_6173
TBW: NCTC13354_01277(nei)
AHW: NCTC11636_00863(mutM_2)
AIR: NCTC12972_01224(mutM_2)
ASLA: NCTC11923_01432(nei)
AVC: NCTC10951_01261(mutM_2)
CWO: Cwoe_5804
LET: O77CONTIG1_04602(nei)
PME: NATL1_13271(nei)
AMR: AM1_0649
THEU: HPC62_18640(nei)
PNL: PNK_1832
RBA: RB12746(mutM)
MFF: MFFC18_00530(nei1)
PLS: VT03_16955(mutM_2)
FMR: Fuma_01885(mutM_1) Fuma_02550(nei)
ACA: ACP_0800 ACP_1716(mutM1)
ABAS: ACPOL_5415
SUS: Acid_2844
ABAC: LuPra_05622(nei1)
CPI: Cpin_6307
FLN: FLA_5247
PHE: Phep_2614
STHA: NCTC11429_04232(mutM_1)
DFE: Dfer_0134
FJO: Fjoh_3364
FJG: BB050_04196(mutM)
FBA: FIC_00988
CTAK: 4412677_00749(mutM)
CPRV: CYPRO_0194
TAA: NMY3_00083(nei)
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Reference
PMID:9171429
  Authors
Jiang D, Hatahet Z, Blaisdell JO, Melamede RJ, Wallace SS
  Title
Escherichia coli endonuclease VIII: cloning, sequencing, and overexpression of the nei structural gene and characterization of nei and nei nth mutants.
  Journal
J Bacteriol 179:3773-82 (1997)
DOI:10.1128/JB.179.11.3773-3782.1997
  Sequence
[eco:b0714]
Reference
  Authors
Guo Y, Bandaru V, Jaruga P, Zhao X, Burrows CJ, Iwai S, Dizdaroglu M, Bond JP, Wallace SS
  Title
The oxidative DNA glycosylases of Mycobacterium tuberculosis exhibit different substrate preferences from their Escherichia coli counterparts.
  Journal
DNA Repair (Amst) 9:177-90 (2010)
DOI:10.1016/j.dnarep.2009.11.008
  Sequence
[eco:b0714] [mtu:Rv2464c Rv3297]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system