KEGG   ORTHOLOGY: K10848Help
Entry
K10848                      KO                                     

Name
ERCC4, XPF
Definition
DNA excision repair protein ERCC-4 [EC:3.1.-.-]
Pathway
ko03420  Nucleotide excision repair
ko03460  Fanconi anemia pathway
Disease
H00238  Fanconi anemia
H00403  Disorders of nucleotide excision repair
H01428  Xeroderma pigmentosum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
   03460 Fanconi anemia pathway
    K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins
    K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.-  Acting on ester bonds
    3.1.-.-  
     K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic Type
  DNA Replication Termination Factors
   Other telomere regulation proteins
    Others
     K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic Type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    Other NER factors
     K10848  ERCC4, XPF; DNA excision repair protein ERCC-4
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 2072(ERCC4)
PTR: 453935(ERCC4)
PPS: 100987667(ERCC4)
GGO: 101147575(ERCC4)
PON: 100454987(ERCC4)
NLE: 100580520(ERCC4) 100581477
MCC: 712641(ERCC4)
MCF: 101926259(ERCC4)
CSAB: 103228615(ERCC4)
RRO: 104664877(ERCC4)
RBB: 108541251(ERCC4)
CJC: 100395516(ERCC4)
SBQ: 101030525(ERCC4)
MMU: 50505(Ercc4)
MCAL: 110311477(Ercc4)
MPAH: 110329994(Ercc4)
RNO: 103693257 304719(Ercc4) 360465(Ercc4l1)
MUN: 110558894(Ercc4)
CGE: 100689044(Ercc4)
NGI: 103731563(Ercc4)
HGL: 101717694(Ercc4)
CCAN: 109700031(Ercc4)
OCU: 100350642(ERCC4)
TUP: 102468411(ERCC4)
CFA: 479842(ERCC4)
VVP: 112923338(ERCC4)
AML: 100470341(ERCC4)
UMR: 103668836(ERCC4)
UAH: 113270777(ERCC4)
ORO: 101369453(ERCC4)
FCA: 101100531(ERCC4)
PTG: 102963066(ERCC4)
AJU: 106970569(ERCC4)
BTA: 516371(ERCC4)
BOM: 102264330(ERCC4)
BIU: 109578663(ERCC4)
BBUB: 102395614(ERCC4)
PHD: 102315345(ERCC4)
CHX: 102175824(ERCC4)
OAS: 101109669(ERCC4)
SSC: 100516427(ERCC4)
CFR: 102514345(ERCC4)
CDK: 105089061(ERCC4)
BACU: 103019168(ERCC4)
LVE: 103084902(ERCC4)
OOR: 101285937(ERCC4)
DLE: 111163499(ERCC4)
ECB: 100050812(ERCC4)
EPZ: 103541164(ERCC4)
EAI: 106847172(ERCC4)
MYB: 102241758(ERCC4)
MYD: 102752166(ERCC4)
MNA: 107524346(ERCC4)
HAI: 109387183(ERCC4)
RSS: 109457635(ERCC4)
DRO: 112314948(ERCC4)
PALE: 102881542(ERCC4)
LAV: 100655576(ERCC4)
TMU: 101359440
MDO: 100024202(ERCC4)
SHR: 100913843(ERCC4)
PCW: 110198319(ERCC4)
OAA: 114809030(ERCC4)
GGA: 416420(ERCC4)
MGP: 100542086(ERCC4)
CJO: 107320532(ERCC4)
TGU: 100231158(ERCC4)
LSR: 110478891(ERCC4)
SCAN: 103817904(ERCC4)
GFR: 102040202(ERCC4)
FAB: 101805993(ERCC4)
PHI: 102100909(ERCC4)
PMAJ: 107211352(ERCC4)
CCAE: 111945836(ERCC4)
CCW: 104684976(ERCC4)
ETL: 114058275(ERCC4)
FPG: 101910318(ERCC4)
CLV: 102089377(ERCC4)
EGZ: 104126979(ERCC4)
NNI: 104009304(ERCC4)
ACUN: 113485742(ERCC4)
AAM: 106482627(ERCC4)
ASN: 102384321(ERCC4)
AMJ: 102563394(ERCC4)
PSS: 102457695(ERCC4)
CMY: 102934996(ERCC4)
CPIC: 101944600(ERCC4)
ACS: 100567423(ercc4)
PVT: 110086697(ERCC4)
PBI: 103062375(ERCC4)
PMUR: 107293802(ERCC4)
GJA: 107105453(ERCC4)
XLA: 446411(ercc4.L)
XTR: 100145552(ercc4)
NPR: 108788648(ERCC4)
DRE: 327322(ercc4)
SRX: 107731380(ercc4) 107734247
SGH: 107554035(ercc4)
IPU: 108273887(ercc4)
PHYP: 113527069(ercc4)
EEE: 113574893(ercc4)
TRU: 101067597(ercc4)
NCC: 104958521(ercc4) 104958545
MZE: 101464731(ercc4)
OLA: 101167401(ercc4)
XMA: 102235274(ercc4)
XCO: 114154710(ercc4)
PRET: 103481019(ercc4)
NFU: 107388249(ercc4)
KMR: 108235849(ercc4)
CSEM: 103382099(ercc4)
LCF: 108889141(ercc4)
SDU: 111220144(ercc4)
HCQ: 109512072(ercc4)
BPEC: 110159680(ercc4)
MALB: 109971864(ercc4)
SASA: 106589551(ercc4)
OTW: 112224420(ercc4)
SALP: 111967912(ercc4)
ELS: 105031067(ercc4)
SFM: 108926581(ercc4)
PKI: 111836202(ercc4)
LCM: 102346482(ERCC4)
CMK: 103178771(ercc4)
CIN: 100176727
SPU: 588601
APLC: 110984376
SKO: 100371245
DME: Dmel_CG3697(mei-9)
DER: 6550992
DPE: 6596827
DSI: Dsimw501_GD16302(Dsim_mei-9)
DWI: 6652944
DAZ: 108619928
DNV: 108655608
DHE: 111599954
MDE: 101898931
AAG: 5573608
AME: 725405
BIM: 100741106
BTER: 100642690
SOC: 105200728
MPHA: 105828531
AEC: 105147837
ACEP: 105625745
PBAR: 105429686
HST: 105188485
DQU: 106750726
CFO: 105247963
LHU: 105670061
PGC: 109853824
OBO: 105278492
PCF: 106784496
NVI: 100115669
MDL: 103575037
TCA: 100142060(mei-9)
DPA: 109538580
NVL: 108559737
BMOR: 101742198
PMAC: 106714043
PRAP: 111001100
HAW: 110384442
TNL: 113497252
PXY: 105391721
API: 100159509
DNX: 107163138
AGS: 114129523
CLEC: 106673733
ZNE: 110833523
FCD: 110846254
TUT: 107362792
DPTE: 113791351
CEL: CELE_C47D12.8(xpf-1)
CBR: CBG03141
BMY: Bm1_46945
TSP: Tsp_10891
PCAN: 112573070
CRG: 105328848
MYI: 110440561
OBI: 106870199
SHX: MS3_10247
EGL: EGR_03712
EPA: 110246210
ADF: 107335174
PDAM: 113670423
SPIS: 111326805
ATH: AT5G41150(UVH1)
CRB: 17878037
BRP: 103864059
BOE: 106341794
THJ: 104807928
CIT: 102624221
TCC: 18606146
GRA: 105791997
GAB: 108470307
DZI: 111289403
EGR: 104443617
GMX: 100812359
VRA: 106778081
VAR: 108334579
CCAJ: 109800600
CAM: 101490549
LJA: Lj2g3v1988980.1(Lj2g3v1988980.1) Lj2g3v1988980.2(Lj2g3v1988980.2)
ADU: 107487517
AIP: 107642605
LANG: 109331271
FVE: 101307891
PPER: 18776101
PMUM: 103342609
PAVI: 110756441
MDM: 103428186
PXB: 103937904
ZJU: 107430354
CSV: 101210951
CMO: 103503479
MCHA: 111025148
CMAX: 111491052
CMOS: 111459549
RCU: 8269025
JCU: 105632362
HBR: 110659510
MESC: 110629813
POP: 18094546
JRE: 109003372
VVI: 100247853
SLY: 101249845
SPEN: 107026862
SOT: 102590040
CANN: 107868563
NTA: 107810733
NTO: 104119566
NAU: 109231299
INI: 109152943
SIND: 105155989
OEU: 111408404
HAN: 110872370
LSV: 111907385
CCAV: 112527124
DCR: 108204919
BVG: 104892834
SOE: 110781770
NNU: 104609822
PSOM: 113321928
OSA: 4331279
DOSA: Os03t0100400-01(Os03g0100400)
OBR: 102721342
BDI: 100820951
ATS: 109742948(LOC109742948)
SBI: 8059542
ZMA: 100192883
SITA: 101771882
PDA: 103710777
EGU: 105043789
MUS: 103976861
PEQ: 110028642
AOF: 109839311
PPP: 112295634
MNG: MNEG_3211
APRO: F751_6591
SCE: YPL022W(RAD1)
KMX: KLMA_60377(RAD1)
NCS: NCAS_0C02540(NCAS0C02540)
NDI: NDAI_0E03240(NDAI0E03240)
TPF: TPHA_0C01850(TPHA0C01850)
TBL: TBLA_0D02790(TBLA0D02790)
TDL: TDEL_0B01630(TDEL0B01630)
KAF: KAFR_0H01600(KAFR0H01600)
CAL: CAALFM_C210440CA(RAD1)
SLB: AWJ20_4643(RAD1)
NCR: NCU07440(mus-38)
NTE: NEUTE1DRAFT125187(NEUTE1DRAFT_125187)
SMP: SMAC_05209(putative mei9)
MGR: MGG_02804
SSCK: SPSK_08455
TRE: TRIREDRAFT_72108(mus38)
MAW: MAC_00910
MAJ: MAA_03851
CMT: CCM_06540
BFU: BCIN_09g06220(Bcrad1)
MBE: MBM_07311
ANI: AN8713.2
ANG: ANI_1_962104(An12g07910)
ABE: ARB_02030
TVE: TRV_05859
PTE: PTT_19608
SPO: SPCC970.01(rad16)
CNE: CNH01820
CNB: CNBL1810
ABP: AGABI1DRAFT109572(AGABI1DRAFT_109572) AGABI1DRAFT122321(AGABI1DRAFT_122321)
ABV: AGABI2DRAFT212972(AGABI2DRAFT_212972)
MGL: MGL_1317
MLR: MELLADRAFT_32538(MellpRad16)
DDI: DDB_G0284419(ercc4)
DFA: DFA_01831(ercc4)
EHI: EHI_148310(1.t00124)
PYO: PY17X_1146000(PY04288)
PCB: PCHAS_114420(PC000902.01.0)
TAN: TA04325
TPV: TP03_0395
BBO: BBOV_IV002550(21.m02955)
SMIN: v1.2.008218.t1(symbB.v1.2.008218.t1)
PTI: PHATRDRAFT_30908(XPF)
SPAR: SPRG_05237
AFU: AF_2418
FPL: Ferp_0097
ACJ: ACAM_0900
IHO: Igni_1062
IIS: EYM_04945
IAG: Igag_1512
HBU: Hbut_0841
STO: STK_04390(xpf)
SSO: SSO0729(eiF4A)
SOL: Ssol_1786
SSOA: SULA_1812
SSOL: SULB_1813
SSOF: SULC_1811
SAI: Saci_0604
SID: M164_1406
SII: LD85_1617
SIH: SiH_1358
SIR: SiRe_1280
SIC: SiL_1270
MSE: Msed_0083
MCN: Mcup_1975
AHO: Ahos_0836
PAI: PAE1735
PIS: Pisl_1707
PCL: Pcal_0629
PAS: Pars_0772
PYR: P186_0065
POG: Pogu_1566
TNE: Tneu_0726
CMA: Cmaq_1706
TUZ: TUZN_2006
TTN: TTX_1531
VDI: Vdis_1852
VMO: VMUT_0289
TPE: Tpen_0877
ASC: ASAC_0386
ACIA: SE86_02775
NMR: Nmar_0437
NCT: NMSP_1290
NVN: NVIE_000300(xpf)
NEV: NTE_01348
NCV: NCAV_0354(xpf)
NBV: T478_0411
NDV: NDEV_0392
KCR: Kcr_1284
BARC: AOA65_1433
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Niedernhofer LJ, Odijk H, Budzowska M, van Drunen E, Maas A, Theil AF, de Wit J, Jaspers NG, Beverloo HB, Hoeijmakers JH, Kanaar R
  Title
The structure-specific endonuclease Ercc1-Xpf is required to resolve DNA interstrand cross-link-induced double-strand breaks.
  Journal
Mol Cell Biol 24:5776-87 (2004)
DOI:10.1128/MCB.24.13.5776-5787.2004
  Sequence
[mmu:50505]
Reference
PMID:8479526
  Authors
Tomkinson AE, Bardwell AJ, Bardwell L, Tappe NJ, Friedberg EC
  Title
Yeast DNA repair and recombination proteins Rad1 and Rad10 constitute a single-stranded-DNA endonuclease.
  Journal
Nature 362:860-2 (1993)
DOI:10.1038/362860a0
  Sequence
[sce:YPL022W]
LinkDB All DBs

DBGET integrated database retrieval system