KEGG   ORTHOLOGY: K10979
Entry
K10979                      KO                                     

Name
ku
Definition
DNA end-binding protein Ku
Pathway
ko03450  Non-homologous end-joining
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03450 Non-homologous end-joining
    K10979  ku; DNA end-binding protein Ku
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10979  ku; DNA end-binding protein Ku
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    Two-component NHEJ DNA repair complex
     K10979  ku; DNA end-binding protein Ku
Other DBs
COG: COG1273
Genes
CHX: 108634985
AALB: 115261782
XCC: XCC0104
XCB: XC_0108
XCA: xcc-b100_0114
XCP: XCR_0121
XCV: XCV0109
XAX: XACM_0108
XAC: XAC0132
XCI: XCAW_00522
XPH: XppCFBP6546_11265(XppCFBP6546P_11265)
SML: Smlt0052
SMT: Smal_0025
SMZ: SMD_0022(ku)
PSUW: WQ53_07795
PSD: DSC_15035
LEZ: GLE_3697
DKO: I596_2241
RBD: ALSL_1250
PAE: PA2150
PAEV: N297_2220
PAEI: N296_2220
PAEP: PA1S_14945
PAEM: U769_14540
PAEL: T223_16225
PAEG: AI22_18825
PAEC: M802_2217
PAEO: M801_2219
PMY: Pmen_3216
PMK: MDS_2412
PCQ: PcP3B5_27310(ykoV)
PPU: PP_3255
PPF: Pput_2506
PPT: PPS_2720
PPI: YSA_10736
PPX: T1E_5620
PPUH: B479_13265
PPUN: PP4_30680(ku)
PPUD: DW66_2979
PMON: X969_12940
PMOT: X970_12585
PSB: Psyr_3246
PSYR: N018_16285
PVD: CFBP1590__3349(ku)
PFS: PFLU_2912
PFB: VO64_0157
PMAN: OU5_0287
PEN: PSEEN2761
PSA: PST_2162
PSTT: CH92_11450
PSES: PSCI_3758
PSEM: TO66_14820
PANR: A7J50_2742
PSIL: PMA3_13335
PALL: UYA_12530
CBU: CBU_1933
CBD: CBUD_0189
CBG: CbuG_0043
CBC: CbuK_0041
LHA: LHA_3069
LOK: Loa_02542
LCD: clem_01135(ykoV)
TMC: LMI_1627
NHL: Nhal_2484
HCO: LOKO_00653(ykoV_1) LOKO_00654(ykoV_2)
SVA: SVA_1769
RPI: Rpic_0502
REH: H16_B2355(h16_B2355)
BPS: BPSS2212
BPSE: BDL_5684
BPSM: BBQ_3896
BPSU: BBN_5704
BPSD: BBX_4851
BPK: BBK_4988
BPSH: DR55_5521
BPSA: BBU_3780
BPSO: X996_5292
BUT: X994_4841
BVE: AK36_5226
BCN: Bcen_1347
BCEN: DM39_7046
BCEW: DM40_5176
BCEO: I35_7582
BAM: Bamb_5611
BMU: Bmul_5475
BMK: DM80_5694
BMUL: NP80_5543
BCED: DM42_7099
BDL: AK34_5178
BCON: NL30_32855
BLAT: WK25_16555
BTEI: WS51_27060
BSEM: WJ12_16955
BPSL: WS57_15610
BMEC: WJ16_17050
BSTG: WT74_19355
BGU: KS03_2022
BGO: BM43_2576
BUK: MYA_5304
BXE: Bxe_A2329
BXB: DR64_33
BFN: OI25_3428
PPNO: DA70_13180
PPNM: LV28_17520
PSPU: NA29_07550
PAPI: SG18_11955
CABA: SBC2_20580(ku_1) SBC2_78780(ku_2) SBC2_84750(ku_3)
BPA: BPP2665
BBR: BB2844
BPT: Bpet3442
BHO: D560_3421
BHM: D558_3394
BHZ: ACR54_02551(ykoV)
AMIM: MIM_c30330
ODI: ODI_R4158
POL: Bpro_3002
PNA: Pnap_1894
AAV: Aave_2520
AJS: Ajs_2524
AAA: Acav_2692
DAC: Daci_4340
RTA: Rta_10200(kulA)
HYB: Q5W_13760
CFU: CFU_1973(ligD)
RGE: RGE_37590
PBH: AAW51_3124(ku)
TBD: Tbd_2246
EBA: ebA6657
AZO: azo1740
AOA: dqs_1890
AZA: AZKH_2967
GBM: Gbem_0141
GEO: Geob_0337
GEM: GM21_0124
GEB: GM18_0120
ADE: Adeh_0963
SCL: sce2664
HOH: Hoch_3329
AMIH: CO731_01531(ykoV)
PLA: Plav_2978
NWI: Nwi_0355
OCA: OCAR_6719
VGO: GJW-30_1_00118(ykoV_1) GJW-30_1_00122(ykoV_2) GJW-30_1_03740(ykoV_3)
MOR: MOC_5431
BBAR: RHAL1_02336(ku)
HDN: Hden_1068
RVA: Rvan_0632
PHL: KKY_1734
MMED: Mame_02199(ykoV)
MCG: GL4_0155
RBM: TEF_06745
CAK: Caul_1773
CSE: Cseg_3111
PZU: PHZ_c3262
TSV: DSM104635_00282(ykoV)
CID: P73_3678
MALG: MALG_00292
ROH: FIU89_09570(ykoV)
NAR: Saro_1694
SPHP: LH20_16995
SGI: SGRAN_4136(ku)
SPHU: SPPYR_0044
SWI: Swit_3981
SPHD: HY78_04320
SPHM: G432_04405
STAX: MC45_16325
SPHI: TS85_18235
SECH: B18_22680
SSY: SLG_04310
SPMI: K663_11065
SINB: SIDU_07845
SPHT: K426_07780
BLAS: BSY18_2879
SMIC: SmB9_21340(ku)
ELI: ELI_04130
AAY: WYH_02745(ykoV)
ADO: A6F68_01382(ykoV)
ALB: AEB_P1913
KSC: CD178_02503(ykoV_1) CD178_02506(ykoV_2)
SHUM: STHU_33180(ku_1) STHU_33200(ku_2)
SVC: STVA_11450(ku_1) STVA_11470(ku_2)
TMO: TMO_a0312
HTQ: FRZ44_20870(ku)
HADH: FRZ61_26190(ku)
BBA: Bd2254
BBAT: Bdt_2207
BBW: BDW_07905
BBAC: EP01_07525
BSU: BSU13410(ykoV)
BSR: I33_1509(ykoV)
BSL: A7A1_1485
BSH: BSU6051_13410(ykoV)
BSUT: BSUB_01459(ykoV)
BSUL: BSUA_01459(ykoV)
BSUS: Q433_07665
BSS: BSUW23_06880(ykoV)
BST: GYO_1665(ykoV)
BSO: BSNT_07828(ykoV)
BSQ: B657_13410(ykoV)
BSX: C663_1380(ykoV)
BLI: BL03627(ykoV)
BLD: BLi01495(ykoV)
BLH: BaLi_c15740(ykoV)
BAQ: BACAU_1296(ykoV)
BYA: BANAU_1255(ykoV)
BAMP: B938_06850
BAML: BAM5036_1254(ykoV)
BAMA: RBAU_1297(ykoV)
BAMN: BASU_1276(ykoV)
BAMB: BAPNAU_2445(ykoV)
BAMT: AJ82_07565
BAMY: V529_12690(ykoV)
BMP: NG74_01371(ykoV)
BAO: BAMF_1422(ykoV)
BAZ: BAMTA208_10440(ykoV)
BQL: LL3_01441(ykoV)
BXH: BAXH7_02134(ykoV)
BQY: MUS_1418(ykoV)
BAMI: KSO_012780
BAMC: U471_13380
BAMF: U722_07045
BAN: BA_0808
BAR: GBAA_0808
BAT: BAS0771
BAI: BAA_0918
BANT: A16_08940
BANR: A16R_09040
BANS: BAPAT_0779
BANV: DJ46_5286
BCE: BC0826
BCA: BCE_0900
BCQ: BCQ_0897
BCX: BCA_0871
BAL: BACI_c08460(ykoV)
BNC: BCN_0794
BCF: bcf_04230
BCER: BCK_04130
BTL: BALH_0737
BTT: HD73_0942
BTHI: BTK_04690
BTI: BTG_17140
BTW: BF38_2065
BPU: BPUM_1667
BPUM: BW16_09195
BPUS: UP12_08585
BMQ: BMQ_2561
BMD: BMD_2550
BMH: BMWSH_2644(ykoV)
BMEG: BG04_5012
BAG: Bcoa_3264
BCOA: BF29_290
BJS: MY9_1469
BMET: BMMGA3_09830(ykoV)
BACW: QR42_08525
BACP: SB24_03115
BACB: OY17_09690
BACO: OXB_3304
BACY: QF06_05720
BACL: BS34A_14870(ykoV)
BALM: BsLM_1419
BEO: BEH_15970
BGY: BGLY_1427(ykoV)
BHA: BH2208
BCL: ABC1602
BKW: BkAM31D_15785(ykoV)
OIH: OB3033
LSP: Bsph_3076
HHD: HBHAL_4933(ykoV)
HLI: HLI_13270
VPN: A21D_01872(ykoV)
PASA: BAOM_3393(ku)
BBE: BBR47_36410(ykoV)
BLR: BRLA_c033570(ykoV)
PPY: PPE_01169
PPM: PPSC2_06030(ykoV)
PPO: PPM_1140(ykoV)
PPOL: X809_06050
PPOY: RE92_05855
PLV: ERIC2_c03290(ykoV)
PSAB: PSAB_04975
PRI: PRIO_1238(ykoV)
PBK: Back11_58640(ku)
COHN: KCTCHS21_12160(ku)
AAC: Aaci_1650
AAD: TC41_1546
BTS: Btus_1214
SIV: SSIL_2189
CCE: Ccel_0364
CSD: Clst_1551
CCEL: CCDG5_0621
CPY: Cphy_1728
STH: STH1798
SWO: Swol_1122
SLP: Slip_1508
SALQ: SYNTR_0295
DSY: DSY2556
DHD: Dhaf_3719
DRM: Dred_2003
PTH: PTH_1242
DAU: Daud_0594
SGY: Sgly_2286
HMO: HM1_3135
TMR: Tmar_1129
SAY: TPY_1570
CTHM: CFE_1796
THX: Thet_1964
TIT: Thit_1867
TKI: TKV_c19030(ku)
CHY: CHY_0027
MTA: Moth_1489
TTM: Tthe_0705
TSH: Tsac_1307
TOC: Toce_0248
PUF: UFO1_2619
MANA: MAMMFC1_03305(ykoV)
STED: SPTER_25080(ku)
LPIL: LIP_2514
MTU: Rv0937c(mku)
MTC: MT0964
MRA: MRA_0945
MTUR: CFBS_0985
MTD: UDA_0937c
MTUB: MT7199_0956(mku)
MTUC: J113_06565
MTUE: J114_05020
MTUL: TBHG_00922
MTUT: HKBT1_0985
MTUU: HKBT2_0986
MBO: BQ2027_MB0962C(mku)
MBB: BCG_0991c
MBT: JTY_0961
MBX: BCGT_0750
MAF: MAF_09460
MMIC: RN08_1045
MPA: MAP_0875c
MAO: MAP4_2985
MAVI: RC58_14820
MAVU: RE97_14845
MAV: MAV_1050
MIT: OCO_09230
MIA: OCU_09270
MID: MIP_01541
MYO: OEM_09400
MIR: OCQ_09360
MUL: MUL_4436
MMC: Mmcs_4361
MKM: Mkms_4447
MJL: Mjls_4741
MMI: MMAR_4575
MMM: W7S_04560
MHAD: B586_06185
MSHG: MSG_04111(ku)
MFJ: MFLOJ_45150(mku)
MXE: MYXE_12300(ku)
MNV: MNVI_08210(ku)
MVA: Mvan_4917
MGI: Mflv_1826
MPHL: MPHLCCUG_00882(ykoV)
MVQ: MYVA_4737
MHAS: MHAS_03411(ku)
MDU: MDUV_52550(ku)
MCHT: MCHIJ_23230(ku)
MDR: MDOR_30760(ku)
MAB: MAB_1032c
MABB: MASS_1027
MCHE: BB28_05140
MSTE: MSTE_01003(ku)
MSAL: DSM43276_00904(ykoV)
MMIN: MMIN_25040(mku)
MHIB: MHIB_03690(mku)
ASD: AS9A_4181
MKR: MKOR_38750(ku)
CGV: CGLAU_04770(ykoV)
NFA: NFA_34910
RER: RER_30620
REY: O5Y_14030
ROP: ROP_69900
REQ: REQ_22340
RHB: NY08_1079
GBR: Gbro_4531
GOR: KTR9_4497
GRU: GCWB2_22525(ykoV)
GOM: D7316_03012(ku)
TPR: Tpau_0202
SCO: SCO0601(SCF55.25c) SCO5309(SC6G9.24c) SCP1.285c SCP1.68
SALB: XNR_1492
SMA: SAVERM_2945(ku1)
SCT: SCAT_5458
SBH: SBI_06359
SVE: SVEN_5002
SFI: SFUL_5135
SRW: TUE45_00050(ykoV_1) TUE45_00512(ykoV_2) TUE45_05821(ykoV_3) TUE45_pSRb_0023(ykoV)
SLE: sle1_073 sle_24310(sle_24310) sle_66420(sle_66420)
SRN: A4G23_03929(ykoV)
SMAL: SMALA_4605
SLAU: SLA_5155
SALF: SMD44_05891(ku)
SALJ: SMD11_5750(ku)
SLX: SLAV_13060(ykoV1) SLAV_38105(ykoV2)
SFK: KY5_5448
SGE: DWG14_02829(ku)
LXX: Lxx15680
CMI: CMM_2073
CMS: CMS1158
CMC: CMN_02035
MTS: MTES_3164
MOO: BWL13_01653(ku)
MLV: CVS47_01782(ku)
MOY: CVS54_01274(ku)
ART: Arth_0295
ARM: ART_3549
ARX: ARZXY2_3627(ku)
AAU: AAur_0284
ACH: Achl_0521
BCV: Bcav_0652
LMOI: VV02_22855
XCE: Xcel_2229
IDO: I598_0193(ykoV)
CFL: Cfla_1902
CFI: Celf_1918
SERJ: SGUI_1448
BLIN: BLSMQ_3104
MPH: MLP_32350
NCA: Noca_1234
NDK: I601_2207(ykoV)
NBE: Back2_09920(ku)
PSIM: KR76_09210
MGG: MPLG2_1247(ku)
NDA: Ndas_2246
STRR: EKD16_11790(ykoV)
TCU: Tcur_1209
SRO: Sros_8388
FAL: FRAAL6052
NML: Namu_0127
GOB: Gobs_2119
MMAR: MODMU_2074
KRA: Krad_4108
SACC: EYD13_01015(ykoV)
AMYY: YIM_01440(ykoV1) YIM_11305(ykoV2) YIM_28210(ykoV3)
PSEA: WY02_17945
PSEE: FRP1_24835
PSEH: XF36_23630
PAUT: Pdca_03570
AMI: Amir_3417
ACTI: UA75_26695
ACAD: UA74_26110
AHG: AHOG_23985(ykoV)
ALO: CRK58313
SAQ: Sare_4353
MIL: ML5_0457
ASE: ACPL_521
AMS: AMIS_3560
ACTS: ACWT_0406
PFLA: Pflav_042200(ku_1) Pflav_075290(ku_2)
PSUU: Psuf_037710(ku)
SNA: Snas_2813
TBI: Tbis_2990
CWO: Cwoe_1814
ELE: Elen_1599
GPA: GPA_04010
PNL: PNK_2193
PUV: PUV_10680
OTE: Oter_0045
MKC: kam1_745
PLS: VT03_16945(ykoV_1) VT03_22115(ykoV_2)
ACA: ACP_3505
ABAS: ACPOL_1797
ABAC: LuPra_01423(ykoV)
CPI: Cpin_0997
FLN: FLA_2074
PHE: Phep_1712
MUC: MuYL_1041
CHU: CHU_2838
DFE: Dfer_3084
GFO: GFO_0299
GFL: GRFL_2086
FJO: Fjoh_3304
FJG: BB050_02760(ykoV)
ZPR: ZPR_3655
MARM: YQ22_16385
CBAL: M667_13180
FBA: FIC_01170
METH: MBMB1_0647
MFC: BRM9_1589
AFU: AF_1726
GAH: GAH_01513
MCJ: MCON_3252
MPD: MCP_0581
TAA: NMY3_00136(ykoV)
VG: 1259566(Corndogp087) 1260006(Omega_gp206) 16546097(87) 16547283(196) 16836311(87) 18559480(207) 18562289(91) 18566146(181) 19813978(200) 23678902(202) 26631973(210) 26639879(213)
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Reference
  Authors
Doherty AJ, Jackson SP, Weller GR
  Title
Identification of bacterial homologues of the Ku DNA repair proteins.
  Journal
FEBS Lett 500:186-8 (2001)
DOI:10.1016/S0014-5793(01)02589-3
  Sequence
[bsu:BSU13410]
Reference
  Authors
Wang ST, Setlow B, Conlon EM, Lyon JL, Imamura D, Sato T, Setlow P, Losick R, Eichenberger P
  Title
The forespore line of gene expression in Bacillus subtilis.
  Journal
J Mol Biol 358:16-37 (2006)
DOI:10.1016/j.jmb.2006.01.059
  Sequence
[bsu:BSU13410]
LinkDB

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