KEGG   ORTHOLOGY: K11098Help
Entry
K11098                      KO                                     

Name
SNRPF, SMF
Definition
small nuclear ribonucleoprotein F
Pathway
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
   03032 DNA replication proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 Complex B
  U1 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
 Complex C
  U2 snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   Sm proteins
    K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
DNA replication proteins [BR:ko03032]
 Eukaryotic Type
  DNA Replication Termination Factors
   Telomerase complex (fungi)
    Sm core complex
     K11098  SNRPF, SMF; small nuclear ribonucleoprotein F
BRITE hierarchy
Other DBs
GO: 0030532
Genes
HSA: 6636(SNRPF)
PTR: 452143(SNRPF)
PPS: 100993647(SNRPF)
GGO: 101124905(SNRPF)
PON: 100451758(SNRPF)
NLE: 100594777(SNRPF)
MCC: 716917(SNRPF)
MCF: 102141572 102146659(SNRPF)
CSAB: 103238901(SNRPF)
RRO: 104657389 104678576(SNRPF)
RBB: 108521797(SNRPF) 108530794
CJC: 100399108(SNRPF)
SBQ: 101031875 101045055(SNRPF)
MMU: 102638183(Gm13092) 69878(Snrpf)
MPAH: 110326773(Snrpf)
RNO: 680737(Snrpf)
MUN: 110545533 110559842(Snrpf)
NGI: 103728999 103733264(Snrpf)
HGL: 101701100(Snrpf) 101725717
CCAN: 109686605(Snrpf)
OCU: 100348389(SNRPF)
CFA: 100687510 482609(SNRPF)
VVP: 112910823 112930713(SNRPF)
AML: 100469419(SNRPF)
UMR: 103660122(SNRPF) 103671444
ORO: 101367652(SNRPF) 101376578
PTG: 102950891 102961212(SNRPF)
AJU: 106973428(SNRPF)
BTA: 107131530 615240(SNRPF)
BOM: 102273911(SNRPF) 106701434
BIU: 109559404(SNRPF) 109574461
BBUB: 102404764 102405810(SNRPF)
PHD: 102333418(SNRPF)
CHX: 102185068(SNRPF)
OAS: 101121249(SNRPF) 105612015
SSC: 100155855(SNRPF)
CFR: 102510005(SNRPF)
CDK: 105097429(SNRPF)
BACU: 103011092(SNRPF)
LVE: 103072935(SNRPF)
OOR: 101285259(SNRPF)
DLE: 111168731(SNRPF)
ECB: 100630068(SNRPF)
EPZ: 103561940(SNRPF)
EAI: 106837254(SNRPF)
MNA: 107544070(SNRPF)
HAI: 109382293(SNRPF) 109385754
DRO: 112307410 112321855(SNRPF)
PALE: 102882064(SNRPF)
LAV: 100662636(SNRPF)
TMU: 101345555
MDO: 100017542(SNRPF)
PCW: 110221811(SNRPF)
OAA: 114816634(SNRPF)
GGA: 417916(SNRPF)
MGP: 100547816(SNRPF)
CJO: 107311805(SNRPF)
APLA: 101795975(SNRPF)
LSR: 110469385(SNRPF)
SCAN: 103813641(SNRPF)
FAB: 101817387(SNRPF)
PHI: 102100469(SNRPF)
PMAJ: 107205011(SNRPF)
CCAE: 111931087(SNRPF)
ETL: 114059235(SNRPF)
FCH: 114017840(SNRPF)
EGZ: 104132357(SNRPF)
NNI: 104011707(SNRPF)
AAM: 106488188(SNRPF)
ASN: 102384542(SNRPF)
AMJ: 102576464(SNRPF)
PSS: 102455127(SNRPF)
ACS: 100566616(snrpf)
PVT: 110091449(SNRPF)
PBI: 103067306(SNRPF)
PMUR: 107284560(SNRPF)
XLA: 108711072 380595(snrpf.S)
XTR: 448659(snrpf)
NPR: 108792586(SNRPF) 108800426
DRE: 445404(snrpf)
SANH: 107679260(snrpf)
IPU: 100528977(snrpf)
PHYP: 113540432(snrpf)
AMEX: 103043442(snrpf)
EEE: 113584706(snrpf)
TRU: 101074074(snrpf)
LCO: 104937391(snrpf)
NCC: 104945680(snrpf)
MZE: 101483952(snrpf)
OLA: 101170138(snrpf)
XMA: 102234736(snrpf)
XCO: 114141338(snrpf)
PRET: 103459148(snrpf)
NFU: 107387488(snrpf)
KMR: 108233316(snrpf)
CSEM: 103382608(snrpf)
LCF: 108897575(snrpf)
SDU: 111224863(snrpf)
HCQ: 109508638 109530060(snrpf)
BPEC: 110161828(snrpf)
MALB: 109967806(snrpf)
SASA: 106561682(RUXF) 106573056(RUXF) 106576293(RUXF) 106609479
ELS: 105020274(snrpf) 105021811
SFM: 108920875(snrpf)
PKI: 111844299(snrpf)
CMK: 103188899(snrpf)
CIN: 100181243
SPU: 592177
APLC: 110989179
SKO: 100370688
DME: Dmel_CG16792(SmF)
DER: 6546889
DPE: 6590199
DSI: Dsimw501_GD15243(Dsim_GD15243)
DWI: 6643331
DNV: 108654445
DHE: 111597934
MDE: 101899525
AAG: 110681523
AME: 725880
BIM: 100748964
BTER: 100651890
SOC: 105196810
MPHA: 105834179
AEC: 105152287
ACEP: 105620997
PBAR: 105427665
HST: 105191504
DQU: 106744486
CFO: 105247918
LHU: 105676495
PGC: 109852727
OBO: 105287395
PCF: 106785820
NVI: 100117043(Snrpf)
MDL: 103578122
TCA: 658284
DPA: 109543616
NVL: 108559386
BMOR: 100101178
PMAC: 106713769
PRAP: 111002121
HAW: 110371987
TNL: 113497627
PXY: 105393302
API: 100162422
DNX: 107172609
AGS: 114127201
CLEC: 106667413
DPTE: 113797520
CEL: CELE_ZK652.1(snr-5)
CBR: CBG12250(Cbr-snr-5)
BMY: Bm1_22805
TSP: Tsp_11073
PCAN: 112571431
CRG: 105328191
MYI: 110466285
OBI: 106883615
EGL: EGR_03805
EPA: 110250094
PDAM: 113682973
SPIS: 111324851
HMG: 100198581
AQU: 100640351
ATH: AT2G14285 AT4G30220(RUXF)
CRB: 17878899
CIT: 102609283
TCC: 18589305
GRA: 105770622
GAB: 108484487
EGR: 104435957
CAM: 101496464
LJA: Lj0g3v0298839.1(Lj0g3v0298839.1) Lj5g3v0292810.1(Lj5g3v0292810.1) Lj5g3v0292810.2(Lj5g3v0292810.2)
ZJU: 107418828
CSV: 101204969
CMO: 103501840
MCHA: 111013917
VVI: 100263985
SLY: 101260491
SPEN: 107032133
SOT: 102600295
CANN: 107854579
SIND: 105179597
CCAV: 112518054
DOSA: Os02t0177500-01(Os02g0177500) Os11t0657300-01(Os11g0657300)
OBR: 102709142
ATS: 109734301(LOC109734301) 109769192(LOC109769192)
DCT: 110111480
PEQ: 110021762
ATR: 18437879
CRE: CHLREDRAFT_131463(SMPF)
APRO: F751_0718
SCE: YPR182W(SMX3)
ERC: Ecym_2813
NCS: NCAS_0A15220(NCAS0A15220)
NDI: NDAI_0J00380(NDAI0J00380)
TPF: TPHA_0I03270(TPHA0I03270)
TBL: TBLA_0B04935(TBLA0B04935)
TDL: TDEL_0H00320(TDEL0H00320)
KAF: KAFR_0B00320(KAFR0B00320)
NCR: NCU01614
NTE: NEUTE1DRAFT83630(NEUTE1DRAFT_83630)
MGR: MGG_03895
SSCK: SPSK_10102
MAW: MAC_02612
MAJ: MAA_03025
CMT: CCM_02006
BFU: BCIN_13g02370(Bcsmx3)
MBE: MBM_07409
ANG: ANI_1_764134(An15g05680)
PTE: PTT_15691
SPO: SPBC3E7.14(smf1)
CNE: CND03220
CNB: CNBD3130
MGL: MGL_2967
DDI: DDB_G0278821(snrpF)
EHI: EHI_188130(75.t00014)
PYO: PY17X_0923500(PY02122)
PCB: PCHAS_092290(PC000324.03.0)
TAN: TA21000
TPV: TP01_0376
BBO: BBOV_IV005760(23.m05936)
SPAR: SPRG_05695
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Kambach C, Walke S, Young R, Avis JM, de la Fortelle E, Raker VA, Luhrmann R, Li J, Nagai K
  Title
Crystal structures of two Sm protein complexes and their implications for the assembly of the spliceosomal snRNPs.
  Journal
Cell 96:375-87 (1999)
DOI:10.1016/S0092-8674(00)80550-4
  Sequence
[hsa:6636]
Reference
  Authors
Chari A, Golas MM, Klingenhager M, Neuenkirchen N, Sander B, Englbrecht C, Sickmann A, Stark H, Fischer U
  Title
An assembly chaperone collaborates with the SMN complex to generate spliceosomal SnRNPs.
  Journal
Cell 135:497-509 (2008)
DOI:10.1016/j.cell.2008.09.020
  Sequence
[hsa:6636]
LinkDB All DBs

DBGET integrated database retrieval system