KEGG   ORTHOLOGY: K11927
Entry
K11927                      KO                                     

Name
rhlE
Definition
ATP-dependent RNA helicase RhlE [EC:3.6.4.13]
Pathway
ko03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Helicases
     K11927  rhlE; ATP-dependent RNA helicase RhlE
Other DBs
COG: COG0513
Genes
ECO: b0797(rhlE)
ECJ: JW0781(rhlE)
ECD: ECDH10B_0865(rhlE)
EBW: BWG_0650(rhlE)
ECOK: ECMDS42_0647(rhlE)
ECE: Z1017(rhlE)
ECS: ECs0875
ECF: ECH74115_0945
ETW: ECSP_0893(rhlE)
ELX: CDCO157_0853
EOI: ECO111_0858(rhlE)
EOJ: ECO26_0923(rhlE)
EOH: ECO103_0833(rhlE)
ECOO: ECRM13514_0872(rhlE)
ECOH: ECRM13516_0827(rhlE)
ESL: O3K_17365
ESO: O3O_07920
ESM: O3M_17340
ECK: EC55989_0841(rhlE)
ECG: E2348C_0749(rhlE)
EOK: G2583_1025(rhlE)
ELH: ETEC_0864
ECP: ECP_0811
ENA: ECNA114_0729(rhlE)
ECOS: EC958_0909(rhlE)
ECV: APECO1_1293(rhlE)
ECY: ECSE_0852
ECR: ECIAI1_0833(rhlE)
ECQ: ECED1_0762(rhlE)
EUM: ECUMN_0941(rhlE)
ECT: ECIAI39_0773(rhlE)
EOC: CE10_0817(rhlE)
EBR: ECB_00764(rhlE)
EBL: ECD_00764(rhlE)
EBE: B21_00781(rhlE)
EBD: ECBD_2826
ECI: UTI89_C0798(rhlE)
ECZ: ECS88_0815(rhlE)
ECC: c0880(rhlE)
ELO: EC042_0887(rhlE)
ESE: ECSF_0723
EKF: KO11_19795(rhlE)
EAB: ECABU_c08390(rhlE)
EDJ: ECDH1ME8569_0750(rhlE)
ELW: ECW_m0853(rhlE)
ELL: WFL_04140(rhlE)
ELC: i14_0846(rhlE)
ELD: i02_0846(rhlE)
ELF: LF82_1872(rhlE)
ECOI: ECOPMV1_00800(rhlE)
ECOJ: P423_03950
EFE: EFER_2311(rhlE)
ESZ: FEM44_18490(rhlE)
STY: STY0855(rhlE)
STT: t2068(rhlE)
STM: STM0820(rhlE)
SEO: STM14_951(rhlE)
SEY: SL1344_0796(rhlE)
SEJ: STMUK_0825(rhlE)
SEB: STM474_0846(rhlE)
SEF: UMN798_0889(rhlE)
SENR: STMDT2_07971(rhlE)
SEND: DT104_08361(rhlE)
SENI: CY43_04395
SPT: SPA1933(rhlE)
SEK: SSPA1802
SEI: SPC_0817
SEC: SCH_0817(rhlE)
SHB: SU5_01491
SENS: Q786_03980
SED: SeD_A0915
SEG: SG0799(rhlE)
SEL: SPUL_2156(rhlE)
SEGA: SPUCDC_2142(rhlE)
SET: SEN0766(rhlE)
SENA: AU38_03970
SENO: AU37_03955
SENV: AU39_03960
SENQ: AU40_04405
SENL: IY59_04025
SEEP: I137_09795
SENB: BN855_7900
SENE: IA1_04165
SBG: SBG_0705(rhlE)
SBZ: A464_784
SALZ: EOS98_15040(rhlE)
SFL: SF0747(rhlE)
SFX: S0788(rhlE)
SFV: SFV_0780(rhlE)
SFE: SFxv_0813(rhlE)
SFN: SFy_1014
SFS: SFyv_1056
SFT: NCTC1_00754(rhlE)
SSN: SSON_0776(rhlE)
SBO: SBO_0685(rhlE)
SDY: SDY_0806(rhlE)
ENC: ECL_02938
ECLX: LI66_06610
ECLY: LI62_07510
ECLZ: LI64_07115
EEC: EcWSU1_01341(rhlE)
ECHG: FY206_08025(rhlE)
EBG: FAI37_22730(rhlE)
ESA: ESA_02548
CSK: ES15_2642(rhlE)
CTU: CTU_13960(rhlE)
KPN: KPN_00830(rhlE)
KPU: KP1_1785(rhlE)
KPP: A79E_3412
KPR: KPR_3758(rhlE)
KPJ: N559_3505
KPX: PMK1_03162(rhlE)
KPNU: LI86_17935
KPNK: BN49_1879(rhlE)
KVA: Kvar_3551
KPE: KPK_3740
KOX: KOX_15070
KOE: A225_1842
EAE: EAE_14570
EAR: CCG31054
KLW: DA718_19165(rhlE)
CRO: ROD_08031(rhlE)
CKO: CKO_02330
CPOT: FOB25_03670(rhlE)
CAMA: F384_03655
HDE: HDEF_0292(rhlE)
SECT: A359_00900
EBT: EBL_c26040(rhlE)
RTG: NCTC13098_05202(rhlE)
REE: electrica_03517(rhlE)
CLAP: NCTC11466_03181(rhlE)
KOT: EH164_15315(rhlE)
KPSE: IP581_07075(rhlE)
KIE: NCTC12125_02187(rhlE)
KAS: KATP_31120(rhlE)
LER: GNG29_06960(rhlE)
LEA: GNG26_06600(rhlE)
LNI: CWR52_05475(rhlE)
BUF: D8682_08195(rhlE)
BAGE: BADSM9389_28550(rhlE)
METY: MRY16398_39700(rhlE)
AHN: NCTC12129_03404(rhlE)
YRE: HEC60_01090(rhlE)
SGOE: A8O29_015640(rhlE)
PDZ: HHA33_19785(rhlE)
EBF: D782_3047
PSTS: E05_08850(rhlE)
YPM: YP_0973(srmB1)
YPZ: YPZ3_1076 YPZ3_1080(rhlE)
YPD: YPD4_1035 YPD4_1041(rhlE)
YPS: YPTB1214(rhlE)
YPO: BZ17_1313
YPB: YPTS_1294
YPQ: DJ40_1027(rhlE)
YPU: BZ21_477
YPR: BZ20_778
YPC: BZ23_808
YPF: BZ19_612
YEN: YE2889(rhlE)
YEY: Y11_17991
YEW: CH47_2243(rhlE)
YET: CH48_2983
YEE: YE5303_33161(rhlE)
YAL: AT01_3868
YFR: AW19_573(rhlE)
YIN: CH53_3203
YKR: CH54_1089
YRO: CH64_3844
YRU: BD65_3093
YHI: D5F51_12380(rhlE)
YCA: F0T03_15035(rhlE)
YMO: HRD69_12425(rhlE)
SMAR: SM39_0751(rhlE)
SMAC: SMDB11_0577(rhlE)
SMW: SMWW4_v1c13000(rhlE)
SPE: Spro_1331
SRL: SOD_c12000(rhlE)
SPLY: Q5A_006690(rhlE)
SMAF: D781_1258
SERF: L085_21940
SQU: E4343_09575(rhlE)
SFJ: SAMEA4384070_1391(rhlE)
SOF: NCTC11214_05570(rhlE)
RAA: Q7S_15535
EAME: GXP68_14565(rhlE)
RBAD: H2866_13850(rhlE)
ECA: ECA2805(rhlE)
PATR: EV46_13735
PATO: GZ59_17530(rhlE)
PCT: PC1_1528
PEC: W5S_2921
PPUJ: E2566_08445(rhlE)
SGL: SG0913
SOD: Sant_2721(rhlE)
PES: SOPEG_0511(rhlE)
DDD: Dda3937_04013(rhlE)
DDQ: DDI_1517
DAQ: DAQ1742_01644(rhlE)
DIC: Dpoa569_002245(rhlE)
BRB: EH207_10765(rhlE)
BNG: EH206_07825(rhlE)
LPOP: I6N93_09755(rhlE)
IZH: FEM41_13895(rhlE)
EAM: EAMY_1224(rhlE)
EAY: EAM_1226(rhlE)
ETA: ETA_22510(rhlE)
EPY: EpC_23830(rhlE)
EPR: EPYR_02578(rhlE)
EBI: EbC_13610(rhlE)
ERJ: EJP617_23450(rhlE)
EGE: EM595_1176(rhlE)
ERWI: GN242_14235(rhlE)
PAM: PANA_1232(rhlE)
PLF: PANA5342_3056(rhlE)
PAJ: PAJ_0553(rhlE)
PVA: Pvag_0609(rhlE)
PSTW: DSJ_08635
PANS: FCN45_06150(rhlE)
PEY: EE896_13495(rhlE)
PDIS: D8B20_05645(rhlE)
MINT: C7M51_00633(rhlE)
MTHI: C7M52_02111(rhlE)
TPTY: NCTC11468_01272(rhlE)
PLU: plu1511(rhlE)
PAY: PAU_02922(rhlE)
PMR: PMI0620(rhlE)
PMIB: BB2000_0696(rhlE)
PHAU: PH4a_12555
PCIB: F9282_05295(rhlE)
PCOL: F1325_05530(rhlE)
XBO: XBJ1_0969(rhlE)
XBV: XBW1_3446(rhlE)
XNE: XNC1_1460(rhlE)
XNM: XNC2_1423(rhlE)
XDO: XDD1_1414(rhlE)
XPO: XPG1_2306(rhlE)
PSI: S70_16005
PSX: DR96_2261(rhlE)
PRG: RB151_011810(rhlE)
PHEI: NCTC12003_02878(rhlE)
PRQ: CYG50_10030(rhlE)
PRJ: NCTC6933_01177(rhlE)
PVC: G3341_14720(rhlE)
MMK: MU9_1441
ANS: ArsFIN_15720(rhlE)
ETR: ETAE_2327(rhlE)
ETD: ETAF_2099(rhlE)
ETE: ETEE_0349(rhlE)
PRAG: EKN56_10150(rhlE)
LRI: NCTC12151_02140(rhlE)
PSHI: SAMEA2665130_0921(rhlE_2)
XFA: XF_0192
XFT: PD_0157(rhlE)
XCC: XCC0590(rhlE)
XCA: xcc-b100_0458(rhlE1) xcc-b100_3760(rhlE2)
XCV: XCV0470(rhlE) XCV3733(rhlE)
XAX: XACM_0434(rhlE) XACM_3510(rhlE)
XAC: XAC3610(rhlE)
XCI: XCAW_04313(srmB)
XFU: XFF4834R_chr35040(rhlE2)
XOM: XOO0700(XOO0700)
XOO: XOO0133(rhlE) XOO0770(rhlE)
XAL: XALC_2720(rhlE)
XPH: XppCFBP6546_16265(XppCFBP6546P_16265)
SML: Smlt0605(rhlE1)
SMT: Smal_0480
SMZ: SMD_0517(rhlE)
SACZ: AOT14_05990(rhlE_1) AOT14_07560(rhlE_2)
PSUW: WQ53_11095
PSD: DSC_14335
LAQ: GLA29479_3183(rhlE)
LEZ: GLE_3468
LEM: LEN_1666
DKO: I596_2268
VCO: VC0395_0709 VC0395_1024(rhlE-2) VC0395_A1018(rhlE-1)
VCR: VC395_1526(rhlE-1) VC395_A0242(rhlE-2) VC395_A0546
VCM: VCM66_1362(rhlE-1) VCM66_A0200(rhlE-2) VCM66_A0727
VNI: VIBNI_A1518(rhlE) VIBNI_B0517(rhlE) VIBNI_B0910(rhlE) VIBNI_B0937(rhlE)
VTA: A0510(rhlE) A2496(rhlE) B0858(rhlE) B1158(rhlE) B1165(rhlE)
VAQ: FIV01_09740(rhlE1) FIV01_16100(rhlE2) FIV01_16705(rhlE3)
VFI: VF_A0151(rhlE) VF_A0374
PPR: PBPRA1748(RHLE) PBPRB0199(SF0747) PBPRB1008(S0788) PBPRB1232(RHLE) PBPRB1761(SO3783)
PAE: PA0428
PPSE: BN5_0322(rhlE) BN5_0801
PCQ: PcP3B5_53550(rhlE_2) PcP3B5_58270(rhlE_3)
PPU: PP_4980(rhlE-II)
PPX: T1E_1128(rhlE) T1E_4911
PPUN: PP4_47490(rhlE) PP4_50460(rhlE)
PSB: Psyr_0458
PSYR: N018_02195
PFL: PFL_5407(rhlE_1) PFL_5801(rhlE_2)
PPRC: PFLCHA0_c53770(rhlE2) PFLCHA0_c57560(rhlE3)
PPRO: PPC_5376(rhlE_1) PPC_5748(rhlE_2)
PFS: PFLU_5378(rhlE2) PFLU_5724(rhlE1)
PFC: PflA506_4664(rhlE_1) PflA506_5023(rhlE_2)
PMAN: OU5_3894(rhlE1) OU5_4263
PSTT: CH92_18400
PKC: PKB_0820(rhlE) PKB_5377
PSOS: POS17_5363(rhlE_1) POS17_5737(rhlE_2)
PADE: C3B55_00096(rhlE)
SON: SO_3783(rhlE)
SBK: SHEWBE_1216(rhlE) SHEWBE_1537(rhlE) SHEWBE_1737(rhlE) SHEWBE_2884(rhlE) SHEWBE_3446(rhlE) SHEWBE_3882(rhlE)
SKH: STH12_00336(rhlE_1) STH12_02178(rhlE_2) STH12_02227(rhlE_3) STH12_02579(rhlE_4) STH12_04083(rhlE_5)
ILO: IL1491 IL1546(rhlE)
PHA: PSHAa0641 PSHAa1930(rhlE) PSHAa2983(rhlE) PSHAb0411(rhlE)
PSM: PSM_A1118(rhlE) PSM_A2422 PSM_A3091(rhlE) PSM_B0485(rhlE)
PSEN: PNC201_04625(rhlE1) PNC201_10185(rhlE2) PNC201_18795(rhlE3)
MAQ: Maqu_3825
MHC: MARHY3753(rhlE)
MAD: HP15_3607
MBS: MRBBS_3719(rhlE)
MARJ: MARI_28570(rhlE)
AMAL: I607_15800
AMAE: I876_16100
AMAO: I634_16045
AMAD: I636_15945
AMAI: I635_16585
AMAG: I533_15640
MYA: MORIYA_0686(rhlE) MORIYA_0697(rhlE) MORIYA_0703(rhlE) MORIYA_1006(rhlE) MORIYA_1251(rhlE) MORIYA_4175(rhlE)
SAGA: M5M_18910
MICC: AUP74_00426(rhlE)
MICT: FIU95_18665(rhlE)
CBU: CBU_0670(rhlE)
CBD: CBUD_0681(rhlE)
CBG: CbuG_1335(rhlE)
CBC: CbuK_1587(rhlE)
RVI: RVIR1_09140(rhlE-2)
ASIP: AQUSIP_24960(rhlE_2)
LPN: lpg0250
LPH: LPV_0333(rhlE)
LPO: LPO_0290(rhlE)
LPM: LP6_0251(rhlE)
LPF: lpl0304(rhlE)
LPP: lpp0320(rhlE)
LPC: LPC_0327(rhlE)
LPA: lpa_00441
LPE: lp12_0254
LLO: LLO_1328(rhlE)
LFA: LFA_1489(rhlE)
LHA: LHA_2138(rhlE)
LOK: Loa_01382
LCD: clem_04015(rhlE)
LLG: 44548918_02190(rhlE_1)
LJR: NCTC11533_01391(rhlE)
LCJ: NCTC11976_02500(rhlE)
LWA: SAMEA4504053_2779(rhlE)
LSS: NCTC12082_01348(rhlE_1)
TMC: LMI_0697(rhlE)
MCA: MCA1011
MAH: MEALZ_0370(rhlE) MEALZ_0542(rhlE)
MMAI: sS8_0805
FTU: FTT_0952(rhlE)
FTQ: RO31_1095
FTF: FTF0952(rhlE)
FTW: FTW_0850
FTT: FTV_0907(rhlE)
FTG: FTU_0991(rhlE)
FTL: FTL_1252
FTH: FTH_1229(rhlE)
FTA: FTA_1324
FTS: F92_06945
FTI: FTS_1226(rhlE)
FTC: DA46_1523
FTV: CH67_1624
FTZ: CH68_1355
FTM: FTM_0997
FTN: FTN_0831
FTX: AW25_1187
FTD: AS84_1708
FTY: CH70_1190
FPH: Fphi_1783
FPT: BZ13_206
FPI: BF30_39
FPM: LA56_391
FPX: KU46_1513
FPZ: LA55_1002
FPJ: LA02_1478
FRC: KX01_1163
HMAR: HVMH_1368 HVMH_1369(rhlE)
CYQ: Q91_0599(rhlE)
TEE: Tel_10145
AEH: Mlg_1613
HHA: Hhal_0924
HHK: HH1059_23370(rhlE1)
TGR: Tgr7_1678
TKM: TK90_1028
TNI: TVNIR_2396(rhlE_[H])
TVR: TVD_05305
GAI: IMCC3135_12530(rhlE_1) IMCC3135_12720(rhlE_2)
HCH: HCH_04705
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CBF: CLI_0719(rhlE)
CBM: CBF_0687(rhlE)
CPAS: Clopa_4743
CLD: CLSPO_c06580(rhlE)
CTYK: CTK_C13630
AMT: Amet_2952
FPR: FP2_12470
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Reference
  Authors
Bizebard T, Ferlenghi I, Iost I, Dreyfus M
  Title
Studies on three E. coli DEAD-box helicases point to an unwinding mechanism different from that of model DNA helicases.
  Journal
Biochemistry 43:7857-66 (2004)
DOI:10.1021/bi049852s
  Sequence
[eco:b0797]
LinkDB

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