KEGG   ORTHOLOGY: K19117
Entry
K19117                      KO                                     
Symbol
csd1, cas8c
Name
CRISPR-associated protein Csd1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19117  csd1, cas8c; CRISPR-associated protein Csd1
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-C factors
    K19117  csd1, cas8c; CRISPR-associated protein Csd1
Genes
DDD: Dda3937_02859
DDQ: DDI_1268
HAY: C3V42_05450(cas8c)
HSEM: L3077_03265(cas8c)
GLE: CJD39_01180(cas8c)
MSU: MS0987
BSUN: A4G13_02685
MHT: D648_15270(cas8c)
MHQ: D650_13800(cas8c)
MHAT: B824_16030(cas8c)
MHX: MHH_c16450(cas8c)
MHAE: F382_02565
MHAM: J450_02060
MHAO: J451_02860
MHAL: N220_05435
MHAQ: WC39_05215
MHAY: VK67_05220
MVI: X808_14110
MVG: X874_13080
MVE: X875_6940
MGRA: A4G16_04910
MPEG: HV560_08255(cas8c)
ASU: Asuc_1286
APOR: DDU33_05740(cas8c)
AART: NYR89_02865(cas8c)
AGK: NYR60_02585(cas8c)
AAP: NT05HA_0331
AAZ: ADJ80_06255
AAN: D7S_00187 D7S_03610
AACN: AANUM_1924 AANUM_2200
AACT: ACT75_00745 ACT75_09815
BTO: WQG_14100
BTRE: F542_7940
BTRH: F543_9190
BTRA: F544_14430 F544_8210
RHAE: IHV77_01095(cas8c)
FCL: A4G17_00090
XTW: AB672_10725
XAC: XAC3839
XCI: XCAW_04600
XCT: J151_04017 J151_04018
XCJ: J158_03993 J158_03994
XCU: J159_03989 J159_03990
XCN: J169_04014 J169_04015
XCW: J162_03994 J162_03995
XCR: J163_03989 J163_03990
XCM: J164_03990 J164_03991
XCF: J172_04007 J172_04008
XOM: XOO0796(XOO0796)
XOO: XOO0870
XOP: PXO_02699(csd)
XOY: AZ54_20460
XAL: XALC_2888
XVA: C7V42_19730(cas8c)
XHY: FZ025_06740(cas8c)
XCZ: EBN15_17100(cas8c)
XTH: G4Q83_19905(cas8c)
PSD: DSC_15245
DKO: I596_2483
LANH: KR767_04540(cas8c)
TAMN: N4264_21585(cas8c)
VAQ: FIV01_05810
VNV: IF132_10380(cas8c)
PSA: PST_3747
AVN: Avin_31610(csd1)
AVL: AvCA_31610(csd1)
AVD: AvCA6_31610(csd1)
MLQ: ASQ50_16210
PSYA: AOT82_971
MOI: MOVS_04295
MBL: AAX09_03715
PRR: AT705_23545
PMAZ: R5H13_23420(cas8c)
FES: HER31_02030(cas8c)
CJA: CJA_2455(csd1)
TTU: TERTU_3117(csd1)
MBRG: PVT68_07400(cas8c)
MCA: MCA0655
METU: GNH96_05915(cas8c)
MMT: Metme_3034
MRP: NM686_011845(cas8c)
MAH: MEALZ_1348 MEALZ_2160(csd)
MBUR: EQU24_10880(cas8c)
MMAI: sS8_2091
MSZE: MSZNOR_4859
MMOB: F6R98_05435(cas8c)
TMH: JX580_01345(cas8c)
TLO: J9253_05010(cas8c)
TANI: J8380_12740(cas8c)
TWN: L2Y54_13410(cas8c)
TDU: QJT80_01075(cas8c)
NHL: Nhal_1943
NWR: E3U44_12645(cas8c)
MPUR: MARPU_12875
TSY: THSYN_19250 THSYN_19260
THIP: N838_13095(cas8c)
CJAP: GWK36_08000
TFRI: Thiofri_02331
TWG: Thiowin_01400
HNA: Hneap_0824
EPS: L0Y14_10005(cas8c)
HCH: HCH_02815
HAHH: O5O45_12660(cas8c)
CCAG: SR908_06965(cas8c)
HHH: CLM76_12630(cas8c)
HASO: B2G49_20235
HALW: B6N23_11095(cas8c)
HSR: HSBAA_42120
HTT: HZS52_13750(cas8c)
HAA: A5892_01370
TOL: TOL_2235
MGEO: CFI10_16465(cas8c)
EEI: NX720_18735(cas8c)
EMP: EZMO1_0347
CHJ: NCTC10426_00642
SDF: ACG33_00115
NGO: NGO_1005
NGK: NGK_0784
NLA: NLA_7350
NWE: SAMEA3174300_0843
NSI: A6J88_08880(cas8c)
NMJ: NM96_03470(cas8c)
NEI: BG910_09490(cas8c)
NEK: CGZ77_00800(cas8c)
NFV: FAH67_02760(cas8c)
NSF: FAH66_02875(cas8c)
NBL: GJV52_08260(cas8c)
NZO: SAMEA4504057_0194
NCI: NCTC10296_02310
NANI: NCTC12227_01769
NWD: H3L96_00060(cas8c)
NSG: H3L94_07180(cas8c)
NSC: J7445_05175(cas8c)
NWX: CGZ65_10465(cas8c)
NDU: LVJ88_11480(cas8c)
NAW: LVJ86_10830(cas8c)
NMB: MON40_08855(cas8c)
NLS: PJU73_04160(cas8c)
KOA: H3L93_01470(cas8c)
VFF: VITFI_CDS2373
AFF: H3L97_07265(cas8c)
CKH: LVJ77_05240(cas8c)
MCER: MON37_04235(cas8c)
USU: LVJ78_08900(cas8c)
CVI: CV_1226
CHRB: DK843_01200(cas8c)
CKS: H9L41_09035(cas8c)
BUM: AXG89_06305
CABA: SBC2_01080
ACHR: C2U31_01390(cas8c)
TEA: KUI_0228
OUE: I6G29_04965(cas8c)
RFR: Rfer_3903
RAC: RA876_01745
ACRA: BSY15_1471(cas8c)
AAA: Acav_3871
DTS: BI380_12690
DLA: I6G47_12645(cas8c)
RTA: Rta_34710
OTD: J1M35_02185(cas8c)
MELA: C6568_09070(cas8c)
MJE: LVC68_16795(cas8c)
CBAA: SRAA_1389
RBN: RBXJA2T_07728
ATER: MW290_08730(cas8c)
LCH: Lcho_1159
JAJ: EKL02_13555(cas8c)
NET: Neut_1016
NIT: NAL212_1463
NCO: AAW31_15505
NUR: ATY38_13435
RBU: PG1C_12175
NPV: OHM77_01610(cas8c)
MFA: Mfla_0603
NIM: W01_03120(Csd1)
NARC: NTG6680_1335(cas8c)
SPLB: SFPGR_27010
EBA: ebA3288
AZR: CJ010_02265(cas8c)
THAU: C4PIVTH_1057
TCL: Tchl_1457
THK: CCZ27_11470(cas8c)
TAK: Tharo_3020
RPX: Rpdx1_3113
NWI: Nwi_1939
MET: M446_1725
MAQU: Maq22A_c15120
MICO: GDR74_04895(cas8c)
RHJ: HZY79_10875(cas8c)
CHEL: AL346_02905
CDQ: BOQ54_11160
HNI: W911_06970
RVA: Rvan_1217
RLAC: QMO75_02315(cas8c)
BVR: BVIR_2217
MPAR: F7D14_11815(cas8c)
MAAD: AZF01_10705
THD: BHV28_05920(cas8c)
PPHR: APZ00_15345
SIW: GH266_09200(cas8c)
KVL: KVU_1369
KVU: EIO_1912
CEH: CEW89_10210(cas8c)
YAN: AYJ57_21375
HAT: RC74_12255
RSK: RSKD131_1959
RCP: RCAP_rcc01302
RBL: B6K69_12250
PCON: B0A89_09020
PAMN: JCM7685_2866(cas8)
PFEO: E3U26_06325(cas8c)
DAA: AKL17_0114
GFU: KM031_15445(cas8c)
MON: G8E03_12570(cas8c)
HDH: G5B40_15210(cas8c)
ZMN: Za10_1900
ZMP: Zymop_1715
SSY: SLG_17400
SAMI: SAMIE_1022810
SPZR: G5C33_10935(cas8c)
GDI: GDI0062
GDJ: Gdia_1630
ASV: WG31_04615
APOM: CPF11_03350(cas8c)
ACET: DS739_04325(cas8c)
ROS: CTJ15_13955(cas8c)
RMUC: FOB66_05240(cas8c)
RCV: PFY06_10150(cas8c)
ABQ: ABAZ39_18645
ABF: AMK58_11240
AZM: DM194_12290(cas8c)
AOZ: HUE56_15135
AARE: D3093_11940(cas8c)
NCB: C0V82_20450(cas8c)
SKT: IGS68_19120(cas8c)
RRU: Rru_A0830
RRF: F11_04280
MAGQ: MGMAQ_2142
TMO: TMO_c0387
PBR: PB2503_07694
MGM: Mmc1_3521
GME: Gmet_1066(csd1)
GPI: GPICK_10895
GEF: FO488_05640(cas8c)
GEO: Geob_3414(csd1)
TAMM: GEAMG1_0911(csd)
GSB: GSUB_06170
GHC: L9S41_08370(cas8c)
DEU: DBW_1331
DEP: AOP6_0771 AOP6_1732
DSB: LN040_05235(cas8c)
DMA: DMR_14370
DCB: C3Y92_07095(cas8c)
DMS: E8L03_15650(cas8c)
DEJ: AWY79_16065
PSEL: GM415_02405(cas8c)
DDN: DND132_3120
PTHE: LF599_04025(cas8c)
DVU: DVUA0131
DVL: Dvul_2976
DVM: DvMF_1973
DVG: Deval_3232
DOA: AXF15_10435
DESU: NLA06_07205(cas8c)
DSF: UWK_03530
DLM: DPPLL_29210
DPR: Despr_1488
DEO: CAY53_07405
DOG: HP555_09965(cas8c)
DBK: DGMP_27570
DDU: GF1_28760
ECOM: QTN59_04560(cas8c)
DOV: DSCO28_05270
DALK: DSCA_16070
DMM: dnm_098890(cas8c-1) dnm_098940(cas8c-2)
SAT: SYN_02476
DTI: Desti_0796
DBR: Deba_1659
MXA: MXAN_7018(csd1)
MSD: MYSTI_07615
MYM: A176_007525
MFB: MFUL124B02_40500
MYX: QEG98_28125(cas8c) QEG98_39275(cas8c)
MFU: LILAB_11295
CCRO: CMC5_057270
DHR: LGS26_03060(cas8c)
BTHR: YBT1520_32046
BTHI: BTK_32096
BTC: CT43_P281184
BTM: MC28_F266
BTHT: H175_285p190
BTHY: AQ980_29675
BXI: BK049_15365
BFD: NCTC4823_03487
GST: HW35_14005
BACA: FAY30_02675(cas8c)
BHA: BH0338
BCL: ABC3595
CSPG: LS684_10670(cas8c)
GTM: GT3921_06855
GEA: GARCT_02508
GEL: IB49_04425
LSP: Bsph_p118
LAGR: FJQ98_11680(cas8c)
LMAC: I6G82_06565(cas8c)
LLB: R6U77_15295(cas8c)
HAMY: MUO15_09010(cas8c)
VIG: BKP57_09665
VNT: OLD84_04835(cas8c)
SJE: AAV35_008355
APAK: AP3564_01185
SCIA: HUG15_03850(cas8c)
BCK: BCO26_0392
BAG: Bcoa_0804
BCOA: BF29_1599(cas8c) BF29_2898(cas8c)
BVJ: I5776_17720(cas8c)
SLMS: MM221_10575(cas8c)
PUK: PU629_19875(cas8c)
MEQU: KFV11_04610(cas8c)
ESI: Exig_0149
EAUR: NMQ00_13495(cas8c)
BAGR: BA6348_25010(cas8c)
BCOP: JD108_08755(cas8c)
BRUM: NDK47_09075(cas8c)
PPOL: X809_10795
PPQ: PPSQR21_020860
PTA: HPL003_18750
PDU: PDUR_07000
PBD: PBOR_06695
PSTE: PSTEL_06575
PBJ: VN24_14600
PRI: PRIO_1408
PNP: IJ22_06920
POW: IJ21_15410
PXL: BS614_09170
PYG: AWM70_14730
PCX: LPB68_05960
PKB: B4V02_14780
PAIH: ASL14_00835
PLEN: EIM92_11625(cas8c)
PPRT: ET464_02045(cas8c)
PBAC: HUB98_22215(cas8c)
PLYC: GXP70_26870(cas8c)
PTRI: KDC22_05835(cas8c)
PALR: HGI30_20245(cas8c)
PTHI: NDS46_08805(cas8c)
PDY: QJQ58_13365(cas8c)
PMAE: LMZ02_07005(cas8c) LMZ02_07190(cas8c)
PWN: QNH46_17100(cas8c)
PKP: SK3146_04736 SK3146_04778
TCO: Theco_3237
SACA: FFV09_01700(cas8c)
EFF: skT53_20790
KZO: NCTC404_01979
SPOS: DV702_10855(cas8c)
UTH: DKZ56_07910(cas8c)
SPY: SPy_1565
SPZ: M5005_Spy1289
SPYM: M1GAS476_1942
SPYA: A20_1322c(csd2)
SPH: MGAS10270_Spy1370
SPI: MGAS10750_Spy1396
SPJ: MGAS2096_Spy1308
SPK: MGAS9429_Spy1283
SPB: M28_Spy1293(cas8c)
SOZ: Spy49_1211c
SAGI: MSA_5460
SAGG: EN73_02675
SMU: SMU_1761c
SMJ: SMULJ23_0381(csd1)
SEZ: Sez_0550(csd1)
SEQ: SZO_14410
SEZO: SeseC_00668
SEQU: Q426_06530
SDG: SDE12394_08130
SDA: GGS_1427
SDC: SDSE_1669(csd1)
SCP: HMPREF0833_10397(csd1)
SPEI: EHW89_02020(cas8c)
SMEN: SAMEA4412692_1256
SCAI: NCTC12191_01185
SPSU: NCTC13786_00754
SRUN: LPB404_05135(cas8c)
LHE: lhv_1621
LHL: LBHH_0546
LHR: R0052_03305
LGL: AO203_09760
LCHI: KG086_05240(cas8c)
LZE: KG087_05885(cas8c)
LFE: LAF_1212
LFR: LC40_0787
ESS: ATZ33_10905
MPS: MPTP_1686
MPX: MPD5_0372
TKR: C7K43_11790(cas8c)
ALOY: CJ190_005480(cas8c)
IRU: M0R79_00680(cas8c)
FCT: NRE15_07520(cas8c)
MARR: BKP56_00060
CLB: Clo1100_1252
CRW: CROST_016950
CTHD: CDO33_11185(cas8c)
ASF: SFBM_0690
ASM: MOUSESFB_0650(csd1)
ASO: SFBmNL_00731
ASB: RATSFB_0577(csd1)
RBP: B6259_05955
RPAY: P0092_07025(cas8c)
ESR: ES1_15640
CCEL: CCDG5_2003
FPLA: A4U99_08335
EHA: Ethha_0650
RAL: Rumal_1131
RCH: RUM_17640
RUM: CK1_18650
RUS: RBI_II00217(cas_csd1)
RUJ: E5Z56_03345(cas8c)
FPR: FP2_21280
OBJ: EIO64_01315(cas8c)
CAML: H6X83_09565(cas8c)
CLF: GJQ69_04590(cas8c)
CARL: PXC00_03385(cas8c) PXC00_08750(cas8c)
SMAN: C12CBH8_16580
VFA: MM35RIKEN_06300
VCOP: MM50RIKEN_23840
TMEL: NOG13_07530(cas8c)
CFEM: HCR03_13440(cas8c)
AGAT: RWV98_07870(cas8c)
STH: STH311
CMIC: caldi_03910
SWO: Swol_0477
SLP: Slip_1546
SGY: Sgly_0903
DOR: Desor_1806
DAI: Desaci_1474
DCA: Desca_0536
PTH: PTH_1992
DRM: Dred_1004
DRU: Desru_1405
DAE: Dtox_3649
TJR: TherJR_1888
DGI: Desgi_4166
THEF: E1B22_11315(cas8c)
CTHM: CFE_0059
IBU: IB211_03092c
RHO: RHOM_12720
CEV: LK421_12405(cas8c)
BYL: A4V09_17190
BLIQ: INP51_02795(cas8c)
BLAR: LC508_15815(cas8c)
BCOC: BLCOC_05120
LACY: A4V08_13965
CSCI: HDCHBGLK_01983
CHYL: CE91St63_25240
CSO: CLS_03910
HSD: SD1D_0533
EHL: EHLA_1640 EHLA_1974
ACEL: acsn021_19160
RGN: RGna_16745(cas8c)
CBOL: CGC65_02900(cas8c)
SSUN: H9Q77_13315(cas8c)
WHJ: H9Q79_00970(cas8c) H9Q79_06620(cas8c)
MFOR: NQ534_09045(cas8c)
ERE: EUBREC_2493
ERT: EUR_26450
ERA: ERE_07660
AMIJ: EQM06_09475(cas8c)
ETM: CE91St48_08920
AMT: Amet_1664
FAA: HMPREF0389_01169(csd1)
GEK: kuro4_10040
MTA: Moth_0496
MTHO: MOTHE_c04330
MTHZ: MOTHA_c05230
PHAR: NCTC13077_01527
PIV: NCTC13079_01546
PEQU: O6R05_07960(cas8c)
MED: MELS_1993
MEG: DKB62_06420(cas8c)
MMAX: LCQ47_00715(cas8c)
SSG: Selsp_1979
SELE: ADJ74_09165
SELT: BCS37_04600
STED: SPTER_37220
AFN: Acfer_0758
LCG: L3BBH23_20960
ERB: A4V01_00020
CIU: G4D55_19230(cas8c)
OLO: ADJ70_01550
ELE: Elen_1977
EYY: EGYY_19480
CBAC: JI75_00365
RTS: CE91St31_30770
MCX: BN42_40529
MMAM: K3U93_09855(cas8c)
NHU: H0264_18455
NSPU: IFM12276_40400
SGB: WQO_34345
SANL: KZO11_34000(cas8c)
SSOI: I1A49_15590(cas8c)
SLE: sle_60900(sle_60900)
SALU: DC74_6137
SLX: SLAV_00340 SLAV_39050
SLK: SLUN_01415(cas8c)
SCAL: I6J39_34555
SPRA: CP972_03490(cas8c)
SJN: RI060_42110
YIA: LO772_16220(cas8c)
SAIU: J4H86_06450(cas8c)
AGRA: AGRA3207_002431(cas8c)
FRA: Francci3_3343
SESP: BN6_20160
AHM: TL08_12975
ACTI: UA75_13865
ACAD: UA74_13780
AHG: AHOG_12985
ACTA: C1701_23040(cas8c)
UME: RM788_43225(cas8c)
SNA: Snas_3580
GLY: K3N28_15400(cas8c)
BAD: BAD_1183 BAD_1184
BDE: BDP_1641(cds1)
BDN: BBDE_1557
BBV: HMPREF9228_1448(csd1)
BBRU: Bbr_1409
BBRJ: B7017_1613
BBRC: B7019_1596
BBRN: B2258_1388
BBRS: BS27_1432
BTP: D805_0638
BKA: AH68_07815
BPSC: BBPC_1361
BEU: BE0216_10620(cas8c)
BSUE: BS3272_02825
PDO: PSDT_1098
BAPK: KIMH_13400
RRD: RradSPS_1079
CMP: Cha6605_2040 Cha6605_6337
PSEU: Pse7367_1744
PAGH: NIES204_10020
PPSU: NO713_05266
AFLO: HEQ12_10745
STOQ: K2F26_01670
STAN: STA3757_26830
GLT: GlitD10_1360
DMD: dcmb_97
RRS: RoseRS_4333
ATM: ANT_12260
PSUB: Pelsub_P2274
DGE: Dgeo_0237
DRD: LMT64_13265
DMB: E5F05_03500(cas8c)
TRA: Trad_1661
TTH: TT_P0134
TTS: Ththe16_2155
TBC: A0O31_02382
MRB: Mrub_1487
MRE: K649_15125
MTAI: Mtai_v1c14890
MSV: Mesil_3383
MHD: Marky_0276
SLOM: PXH66_20595(cas8c)
AGL: PYTT_2357
AMAK: J5W79_10450(cas8c)
LUO: HHL09_07990(cas8c)
VBS: EGM51_01805(cas8c)
MFF: MFFC18_51580
RUV: EC9_25750
RLC: K227x_25310
SNEP: Enr13x_35780
AMUC: Pan181_32310
PND: Pla175_17860
PBS: Plabr_3870 Plabr_4114
GIM: F1728_25080(cas8c)
ACAF: CA12_25150
PBOR: BSF38_04790
AGV: OJF2_05450
BPIT: BPIT_07840
JET: L3J17_09410(cas8c)
PHM: PSMK_06920
MCAD: Pan265_24970
PBP: STSP1_01048
ALUS: STSP2_01885
TAER: GT409_09540(cas8c)
TBE: Trebr_2177
TSK: HRI97_12515(cas8c)
SSM: Spirs_1071
SLR: L21SP2_0570
ECUL: PVA46_02745(cas8c)
SGP: SpiGrapes_3220
SCD: Spica_1927
LIL: LA_0687
LIE: LIF_A0558
LIC: LIC_12913
LIS: LIL_13006
LNO: MAL08_14670(cas8c)
LKR: FH602_02810(cas8c)
ACA: ACP_0780(csd1)
EDA: GWR55_16840(cas8c)
EPO: Epro_1085(csd1)
ETI: RSTT_195(csd1)
RSD: TGRD_217
CPOR: BED41_02075
PPIO: CE91St28_23810
PYY: RAH42_00165(cas8c) RAH42_11425(cas8c)
BHL: Bache_3085
BZG: C4H11_01365(cas8c)
BDH: GV66_02015
PCOP: I6J50_00195(cas8c)
PAH: Poras_0915
PCAG: NCTC12856_01269
PEND: LA319_01640(cas8c)
PDI: BDI_1180
PARC: CI960_09620(cas8c)
PII: NF347_01665(cas8c)
PDT: Prede_1519
CTE: CT1133
CLZ: BIU88_06020
CCH: Cag_1008
CPH: Cpha266_1434
PVI: Cvib_1302
PLT: Plut_1297
PPH: Ppha_1659
PRS: B9H02_06825
RLO: GQ464_014990(cas8c)
RBAR: AWN76_010065
NIO: NITINOP_2580
BIH: BIP78_0921
SCHV: BRCON_2348
MVC: MSVAZ_2243
MEK: MSKOL_2243
MEF: MSWH1_1806
MLA: Mlab_0848
MRC: R6Y96_04340(cas8c)
MEFW: F1737_08150(cas8c)
MFO: Metfor_2735
 » show all
Reference
PMID:24371266
  Authors
Punetha A, Sivathanu R, Anand B
  Title
Active site plasticity enables metal-dependent tuning of Cas5d nuclease activity in CRISPR-Cas type I-C system.
  Journal
Nucleic Acids Res 42:3846-56 (2014)
DOI:10.1093/nar/gkt1335
  Sequence
[bha:BH0338]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system