KEGG   ORTHOLOGY: K23113Help
Entry
K23113                      KO                                     

Name
SMCHD1
Definition
structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1
Disease
H00591  Facioscapulohumeral muscular dystrophy
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K23113  SMCHD1; structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K23113  SMCHD1; structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Heterochromatin formation proteins
   Other heterochromatin formation proteins
    K23113  SMCHD1; structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    Other NHEJ factors
     K23113  SMCHD1; structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 23347(SMCHD1)
PTR: 455319(SMCHD1)
PPS: 100976685(SMCHD1)
GGO: 101123980(SMCHD1)
PON: 100454023(SMCHD1)
NLE: 100583915(SMCHD1)
MCC: 695870(SMCHD1)
MCF: 101866667(SMCHD1)
CSAB: 103222694(SMCHD1)
RRO: 104654118(SMCHD1)
RBB: 108516707(SMCHD1)
SBQ: 101031954(SMCHD1)
MMU: 74355(Smchd1)
MCAL: 110312298(Smchd1)
RNO: 316732(Smchd1)
CGE: 100770189(Smchd1)
NGI: 103735397(Smchd1)
HGL: 101725927(Smchd1)
CCAN: 109682063
OCU: 100348571(SMCHD1)
TUP: 102481782(SMCHD1)
CFA: 490535(SMCHD1)
VVP: 112925259(SMCHD1)
AML: 100466431(SMCHD1)
UMR: 103662690(SMCHD1)
UAH: 113253255(SMCHD1)
ORO: 101373019(SMCHD1)
FCA: 101087430(SMCHD1)
PTG: 102948565(SMCHD1)
PPAD: 109248577(SMCHD1)
AJU: 106986068(SMCHD1)
BTA: 537894(SMCHD1)
BOM: 102271989(SMCHD1)
BIU: 109577842(SMCHD1)
BBUB: 102402007(SMCHD1)
CHX: 102168787(SMCHD1)
OAS: 101122749(SMCHD1)
SSC: 100627122(SMCHD1)
CFR: 102513149(SMCHD1)
CDK: 105086114(SMCHD1)
BACU: 103007523(SMCHD1)
LVE: 103087089(SMCHD1)
OOR: 101287991(SMCHD1)
DLE: 111163067(SMCHD1)
PCAD: 102990901(SMCHD1)
ECB: 100062029(SMCHD1)
EPZ: 103562361(SMCHD1)
EAI: 106825861(SMCHD1)
MYB: 102262183(SMCHD1)
MYD: 102751418(SMCHD1)
MNA: 107535893(SMCHD1)
HAI: 109394735(SMCHD1)
DRO: 112322563(SMCHD1)
PALE: 102883943(SMCHD1)
RAY: 107516781(SMCHD1)
MJV: 108392793(SMCHD1) 108406735
LAV: 100671161(SMCHD1)
TMU: 101352494
MDO: 100012023(SMCHD1)
SHR: 100921922(SMCHD1)
PCW: 110197058(SMCHD1)
OAA: 100077368(SMCHD1)
GGA: 421057(SMCHD1)
MGP: 100551356(SMCHD1)
CJO: 107310038(SMCHD1)
NMEL: 110393566(SMCHD1)
ACYG: 106034915(SMCHD1)
TGU: 100220166(SMCHD1)
LSR: 110482373(SMCHD1)
SCAN: 103826891(SMCHD1)
GFR: 102039397(SMCHD1)
FAB: 101821313(SMCHD1)
PHI: 102102664(SMCHD1)
PMAJ: 107200514(SMCHD1)
CCAE: 111923998(SMCHD1)
CCW: 104687302(SMCHD1)
ETL: 114058733(SMCHD1)
FPG: 101922712(SMCHD1)
FCH: 102050400(SMCHD1)
CLV: 102084331(SMCHD1)
EGZ: 104125220(SMCHD1)
ACUN: 113476112(SMCHD1)
PADL: 103917796(SMCHD1)
AAM: 106482205(SMCHD1)
ASN: 102377199(SMCHD1)
AMJ: 102569707(SMCHD1)
PSS: 102446910(SMCHD1)
CMY: 102940396(SMCHD1)
CPIC: 101941440(SMCHD1)
ACS: 100565669 100567132(smchd1)
PVT: 110079441(SMCHD1)
PMUR: 107294000(SMCHD1)
PMUA: 114585875 114601359(SMCHD1)
GJA: 107112740(SMCHD1)
XLA: 108719212
XTR: 100380032(smchd1)
NPR: 108784510(SMCHD1)
DRE: 497282(smchd1)
IPU: 108267874(smchd1)
PHYP: 113540252(smchd1)
AMEX: 103045413(smchd1)
EEE: 113579288(smchd1)
LCO: 104925298(smchd1)
NCC: 104949662(smchd1)
MZE: 101482681(smchd1)
ONL: 102077272 102078558(smchd1)
OLA: 101162718(smchd1)
NFU: 107382515(smchd1)
KMR: 108230468(smchd1)
ALIM: 106520959(smchd1)
AOCE: 111569341(smchd1)
CSEM: 103377452(smchd1)
POV: 109629560(smchd1)
LCF: 108895001(smchd1)
SDU: 111237830(smchd1)
SLAL: 111656609(smchd1)
BPEC: 110170049(smchd1)
MALB: 109953779
SASA: 106590141(smchd1)
OTW: 112227966
SALP: 111953281(smchd1)
ELS: 105019337(smchd1)
SFM: 108937082(smchd1)
PKI: 111857741(smchd1)
LCM: 102347541(SMCHD1)
CMK: 103183455(smchd1)
RTP: 109929510(smchd1)
CIN: 100185596
SPU: 583320
APLC: 110978240
CSCU: 111619035
PCAN: 112561972
MYI: 110450933
OBI: 106869626
LAK: 106153881
EPA: 110236167
AMIL: 114963880
PDAM: 113669395
SPIS: 111333631
DGT: 114527022
HMG: 100212735
ATH: AT5G24280(GMI1)
BOE: 106306185
RSZ: 108853959
THJ: 104798901
CIT: 102628315
GMX: 100815144
GSJ: 114392992
CAM: 101490815
LJA: Lj4g3v1316180.1(Lj4g3v1316180.1)
LANG: 109354273
RCN: 112183112
PPER: 18785803
PMUM: 103333768
PAVI: 110767159
MDM: 103440149
HBR: 110633695
MESC: 110601658
POP: 7464275
JRE: 109007579
VVI: 100252197
SLY: 101253262
SPEN: 107013465
SOT: 102601834
NTO: 104101890
NAU: 109231428
OEU: 111405633
LSV: 111876764
CCAV: 112524836
CQI: 110696132
NNU: 104604778
BDI: 100829204
ATS: 109743344
SBI: 8081647
SITA: 111257871
PDA: 103702510
EGU: 105040910
MUS: 103968942
DCT: 110110900
AOF: 109836607
ATR: 18442334
APRO: F751_6302
DFA: DFA_03409
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Tang M, Li Y, Zhang X, Deng T, Zhou Z, Ma W, Songyang Z
  Title
Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain containing 1 (SMCHD1) promotes non-homologous end joining and inhibits homologous recombination repair  upon DNA damage.
  Journal
J Biol Chem 289:34024-32 (2014)
DOI:10.1074/jbc.M114.601179
  Sequence
[hsa:23347]
Reference
  Authors
Nozawa RS, Nagao K, Igami KT, Shibata S, Shirai N, Nozaki N, Sado T, Kimura H, Obuse C
  Title
Human inactive X chromosome is compacted through a PRC2-independent SMCHD1-HBiX1 pathway.
  Journal
Nat Struct Mol Biol 20:566-73 (2013)
DOI:10.1038/nsmb.2532
  Sequence
[hsa:23347]
LinkDB All DBs

DBGET integrated database retrieval system