KEGG   ORTHOLOGY: K03009
Entry
K03009                      KO                                     
Symbol
RPABC4, RPB12, POLR2K
Name
DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
Pathway
map03020  RNA polymerase
map03420  Nucleotide excision repair
map04623  Cytosolic DNA-sensing pathway
map05016  Huntington disease
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
 09150 Organismal Systems
  09151 Immune system
   04623 Cytosolic DNA-sensing pathway
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol I, II, III common subunits
     K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
  RNA polymerase III system
   RNA polymerase III
    Pol I, II, III common subunits
     K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Pol I, II, III common subunits
     K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03009  RPABC4, RPB12, POLR2K; DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03009
Other DBs
COG: COG1996
Genes
HSA: 5440(POLR2K)
PTR: 741257(POLR2K)
PPS: 100968278(POLR2K) 112436904
GGO: 101147508(POLR2K)
PON: 100455413(POLR2K)
NLE: 100592590(POLR2K)
HMH: 116462054 116467257 116813469(POLR2K)
MCC: 100426798 114671810 708464(POLR2K)
MCF: 102118042 102139564(POLR2K)
MTHB: 126949371 126961152
MNI: 105476059(POLR2K) 105477515
CSAB: 103237210(POLR2K)
CATY: 105586535(POLR2K)
PANU: 108585500(POLR2K)
TGE: 112604599 112630449(POLR2K)
MLEU: 105529559(POLR2K)
RRO: 104670820(POLR2K)
RBB: 108520201(POLR2K)
TFN: 117062911 117079270(POLR2K)
CANG: 105504285(POLR2K)
CSYR: 103268112(POLR2K)
MMUR: 105869910(POLR2K)
OGA: 100962412(POLR2K)
MMU: 17749(Polr2k)
MPAH: 110335171(Polr2k)
RNO: 100361574(Polr2k)
MCOC: 116081810(Polr2k)
ANU: 117718861(Polr2k) 117723443
CGE: 100762645(Polr2k)
MAUA: 101844290(Polr2k)
MFOT: 126514276
AAMP: 119823082(Polr2k) 121677360
NGI: 103730304 103732829(Polr2k)
HGL: 101718217(Polr2k)
CPOC: 100731078(Polr2k)
CCAN: 109701926(Polr2k)
DORD: 105982760(Polr2k)
DSP: 122102379(Polr2k)
TUP: 102492638(POLR2K)
CFA: 100688583(POLR2K) 119870926
VVP: 112916960(POLR2K)
VLG: 121492472 121498741(POLR2K)
AML: 100480977(POLR2K)
UMR: 103661503(POLR2K)
UAH: 113252878(POLR2K)
UAR: 123793553 123797841(POLR2K)
ELK: 111146668
LLV: 125099185
MNP: 132013212(POLR2K)
MLK: 131823510 131826551(POLR2K)
NVS: 122905541(POLR2K)
ORO: 101386875(POLR2K)
EJU: 114206025 114215052(POLR2K)
NSU: 110574035 110578869(POLR2K)
LWW: 102736611 102744232(POLR2K)
FCA: 101097129(POLR2K)
PYU: 121042772(POLR2K)
PCOO: 112859547(POLR2K)
PBG: 122495662(POLR2K)
LRUF: 124519014
PTG: 102964749(POLR2K)
PPAD: 109278018(POLR2K)
PUC: 125924497
AJU: 106980060
HHV: 120232860(POLR2K)
BTA: 614776(POLR2K)
BOM: 102282672(POLR2K)
BIU: 109568608(POLR2K)
BBUB: 102404410(POLR2K)
BBIS: 105005498(POLR2K)
CHX: 102177074(POLR2K)
OAS: 101104250(POLR2K) 114117498
ODA: 120858765 120878432(POLR2K)
CCAD: 122451265(POLR2K)
SSC: 100524560(POLR2K)
CFR: 116659907(POLR2K)
CDK: 116148901(POLR2K)
VPC: 107034357(POLR2K)
OOR: 101276855(POLR2K) 117196045
DLE: 111180384(POLR2K)
PCAD: 102990421(POLR2K) 112065026
PSIU: 116742367(POLR2K) 116753439
NASI: 112407301(POLR2K)
ECB: 100630612(POLR2K)
EPZ: 103567253(POLR2K)
EAI: 106847847(POLR2K)
MYB: 102259159(POLR2K)
MYD: 102755915 102768431(POLR2K)
MLF: 102422407(POLR2K) 102428798
MNA: 107526135(POLR2K)
HAI: 109382786(POLR2K)
DRO: 112315576(POLR2K) 112319104
SHON: 118988556(POLR2K)
AJM: 119038582(POLR2K)
PDIC: 114514708(POLR2K) 114515265
PHAS: 123826576 123833189(POLR2K)
PPAM: 129084041(POLR2K)
PALE: 102894671(POLR2K)
PVP: 105302901(POLR2K)
RAY: 107502500(POLR2K)
TOD: 119238011(POLR2K)
LAV: 100673571(POLR2K)
TMU: 101353977
DNM: 111759165 111763816(POLR2K)
MDO: 100023403(POLR2K)
GAS: 123231908(POLR2K)
SHR: 100935194(POLR2K)
PCW: 110196162(POLR2K)
OAA: 100074090(POLR2K)
GGA: 112529926(POLR2K)
PCOC: 116227647(POLR2K)
MGP: 100545147(POLR2K)
CJO: 107310410(POLR2K)
TPAI: 128091150(POLR2K)
LMUT: 125691247(POLR2K)
NMEL: 110393629(POLR2K)
APLA: 101791485(POLR2K)
ACYG: 106035324(POLR2K)
CATA: 118247937(POLR2K)
AFUL: 116486021(POLR2K)
TGU: 100190183(POLR2K)
LSR: 110470083(POLR2K)
SCAN: 103813837(POLR2K)
PMOA: 120500874(POLR2K)
OTC: 121340205(POLR2K)
PRUF: 121355464(POLR2K)
GFR: 102034954(POLR2K)
FAB: 101815709(POLR2K)
OMA: 130249631(POLR2K)
PHI: 102107396(POLR2K)
PMAJ: 107199895(POLR2K)
CCAE: 111924503(POLR2K)
CCW: 104692719(POLR2K)
CBRC: 103612962(POLR2K)
ETL: 114067557(POLR2K)
ZAB: 102068670(POLR2K)
ACHL: 103799653(POLR2K)
SVG: 106855301(POLR2K)
MMEA: 130573680(POLR2K)
HRT: 120755496(POLR2K)
FPG: 101911255(POLR2K)
FCH: 102059545(POLR2K)
CLV: 102091300(POLR2K)
EGZ: 104125876(POLR2K)
NNI: 104016438(POLR2K)
PCRI: 104026198(POLR2K)
PLET: 104615641(POLR2K)
EHS: 104504875(POLR2K)
PCAO: 104040530(POLR2K)
ACUN: 113477345(POLR2K)
TALA: 104356555(POLR2K)
PADL: 103916124(POLR2K)
AFOR: 103895786(POLR2K)
ACHC: 115340736(POLR2K)
HALD: 104321454(POLR2K)
HLE: 104837725(POLR2K)
AGEN: 126050022
GCL: 127013222
CCRI: 104156503(POLR2K)
CSTI: 104563385(POLR2K)
CMAC: 104480559(POLR2K)
MUI: 104544202(POLR2K)
BREG: 104631130(POLR2K)
FGA: 104071607(POLR2K)
GSTE: 104252489(POLR2K)
LDI: 104345740(POLR2K)
MNB: 103770387(POLR2K)
OHA: 104332109(POLR2K)
NNT: 104400898(POLR2K)
SHAB: 115615783(POLR2K)
DPUB: 104298126(POLR2K)
PGUU: 104469870(POLR2K)
ACAR: 104519598(POLR2K)
CPEA: 104396595(POLR2K)
AVIT: 104269247(POLR2K)
CVF: 104292437(POLR2K)
RTD: 128905347(POLR2K)
CUCA: 104056724(POLR2K)
TEO: 104384087(POLR2K)
BRHI: 104488604(POLR2K)
AAM: 106483911(POLR2K)
AROW: 112974144(POLR2K)
NPD: 112956537(POLR2K)
TGT: 104566987(POLR2K)
DNE: 112994942(POLR2K)
SCAM: 104144790(POLR2K)
ASN: 102378877(POLR2K)
AMJ: 102569944(POLR2K)
CPOO: 109320954(POLR2K)
GGN: 109305093(POLR2K)
PSS: 102461642(POLR2K)
CMY: 102944774(POLR2K)
CCAY: 125632721(POLR2K)
DCC: 119851119(POLR2K)
CPIC: 101935900(POLR2K)
TST: 117873708(POLR2K)
CABI: 116837262(POLR2K)
MRV: 120396500(POLR2K)
ACS: 100559488(polr2k)
ASAO: 132775019(POLR2K)
SUND: 121930027(POLR2K)
PBI: 103051493(POLR2K)
PMUR: 107285231(POLR2K)
CTIG: 120301513(POLR2K)
TSR: 106544543(POLR2K)
PGUT: 117668548(POLR2K)
PTEX: 113438221(POLR2K)
NSS: 113427853(POLR2K)
VKO: 123019134(POLR2K)
PMUA: 114600375(POLR2K)
PRAF: 128417195(POLR2K)
ZVI: 118090060(POLR2K)
HCG: 128324329(POLR2K)
GJA: 107105830(POLR2K)
STOW: 125438728(POLR2K)
EMC: 129333605(POLR2K)
XLA: 443871(polr2k.L) 447189(polr2k.S)
XTR: 549263(polr2k)
NPR: 108789298(POLR2K)
RTEM: 120941422(POLR2K)
BBUF: 121001462(POLR2K)
BGAR: 122939127(POLR2K)
MUO: 115479397(POLR2K)
GSH: 117355095 117355100(POLR2K)
DRE: 796803(polr2k)
SANH: 107672846(polr2k) 107698637
CCAR: 109055776 109055782(polr2k)
PTET: 122323707(polr2k)
LROH: 127181526(polr2k)
OMC: 131526071(polr2k)
PPRM: 120485358(polr2k)
RKG: 130087766(polr2k)
MAMB: 125275181(polr2k)
CIDE: 127500902
TROS: 130566692(polr2k)
MANU: 129454975(polr2k)
IPU: 108257309
IFU: 128600109(polr2k)
PHYP: 113546296(polr2k)
SMEO: 124376090(polr2k)
TFD: 113649565(polr2k)
TVC: 132863868(polr2k)
AMEX: 103021424(polr2k)
CMAO: 118805224(polr2k)
EEE: 113573587(polr2k)
CHAR: 105907729(polr2k)
TRU: 101074353(polr2k)
TFS: 130518693(polr2k)
LCO: 104918641(polr2k)
NCC: 104942851(polr2k)
TBEN: 117478431(polr2k)
CGOB: 115015639(polr2k)
PGEO: 117454656(polr2k)
GACU: 117536166(polr2k)
ELY: 117263972(polr2k)
EFO: 125904741(polr2k)
SLUC: 116047418(polr2k)
ECRA: 117956562(polr2k)
ESP: 116701370(polr2k)
PFLV: 114567695(polr2k)
GAT: 120826528(polr2k)
PPUG: 119219158(polr2k)
AFB: 129097171(polr2k)
CLUM: 117738687(polr2k)
MSAM: 119907173(polr2k)
SCHU: 122864130(polr2k)
CUD: 121523368(polr2k)
ALAT: 119017124(polr2k)
MZE: 101476521(polr2k)
ONL: 100711464(polr2k)
OAU: 116322437(polr2k)
OLA: 101167378(polr2k)
OML: 112137101(polr2k)
XMA: 102233387(polr2k)
XCO: 114155409(polr2k)
XHE: 116731117(polr2k)
PRET: 103472438(polr2k)
PFOR: 103135173(polr2k)
PLAI: 106938040(polr2k)
PMEI: 106904807(polr2k)
GAF: 122844204(polr2k)
PPRL: 129374963(polr2k)
CTUL: 119784839(polr2k)
GMU: 124878988(polr2k)
NFU: 107394675(polr2k)
KMR: 108239717(polr2k) 108248915
ALIM: 106518167(polr2k)
NWH: 119425777(polr2k)
AOCE: 111582359(polr2k)
CSEM: 103394380(polr2k)
POV: 109638815(polr2k)
SSEN: 122786509(polr2k)
HHIP: 117770172(polr2k)
HSP: 118124886(polr2k)
LCF: 108898192
SDU: 111223379(polr2k)
SLAL: 111659256(polr2k)
XGL: 120786767(polr2k)
HCQ: 109512022(polr2k)
SSCV: 125986758
SBIA: 133498034(polr2k)
PEE: 133395392(polr2k)
PTAO: 133470755(polr2k)
BPEC: 110167498(polr2k)
MALB: 109958753(polr2k)
BSPL: 114865457(polr2k)
SJO: 128374231(polr2k)
SASA: 106570789(RPAB4) 106589136(RPAB4)
OTW: 112236595(polr2k)
OKI: 109880491(polr2k)
SALP: 112073746(polr2k)
ELS: 105027711(polr2k)
SFM: 108919279(polr2k)
PKI: 111848282(polr2k)
AANG: 118234176(polr2k)
LOC: 102687034(polr2k)
PSEX: 120515993(polr2k)
LCM: 102367228(POLR2K)
CMK: 103180741(polr2k)
RTP: 109928920(polr2k)
CPLA: 122549147(polr2k) 122557520
HOC: 132815390(polr2k)
LERI: 129696729(polr2k)
LRJ: 133347685
CIN: 101242260
DME: Dmel_CG34186(Polr2K)
DER: 6548996
DSE: 6609247
DSI: Dsimw501_GD25636(Dsim_GD25636)
DAN: 6495477
DSR: 110177773
DPO: 6898494
DPE: 6592956
DGR: 6559526
DAZ: 108615836
DNV: 115564617
DHE: 111602582
DVI: 6626489
CCAT: 101457024
BOD: 106626531
BDR: 105226303
RZE: 108364771
AOQ: 129246380
MDE: 101889125
SCAC: 106082351
LCQ: 111680038
LSQ: 119611532
GFS: 119644674
ECOE: 129941175
CLON: 129606267
HIS: 119655370
ACOZ: 120959541
AARA: 120902260
AMER: 121598240
ASTE: 118507341
AFUN: 125767513
AMOU: 128309451
AALI: 118464716
AAG: 23687737
AALB: 109412048
CPII: 120415148
BCOO: 119071345
AME: 727025
ACER: 107996972
ADR: 102673268
AFLR: 100872013
BIM: 100741160
BBIF: 117213502
BVK: 117233576
BVAN: 117154748
BTER: 100644189
BAFF: 126922858
BPYO: 122574168
BPAS: 132911115
FVI: 122531181
CCAL: 108622492
OBB: 114874493
OLG: 117608513
MGEN: 117227056
NMEA: 116430469
CGIG: 122403339
SOC: 105207386
MPHA: 105828368
AEC: 105153019
PBAR: 105434219
VEM: 105564997
HST: 105182879
DQU: 106752322
CFO: 109609836
FEX: 115244124
LHU: 105678155
PGC: 109858254
OBO: 105277355
PCF: 106791965
PFUC: 122514813
VPS: 122636722
VCRB: 124429707
VVE: 124956014
NVI: 100118293
CSOL: 105368164
TPRE: 106654919
LHT: 122507758
LBD: 127281467
MDL: 103569324
CGLO: 123260823
FAS: 105271510
AGIF: 122854811
CINS: 118064602
CCIN: 107270805
DSM: 124411657
NPT: 124220628
NFB: 124183915
NLO: 107227040
NVG: 124306414
AROA: 105683923
TCA: 103313918
DPA: 109543238
AGRG: 126748452
ATD: 109600054
AGB: 108913541
LDC: 111508947
NVL: 108569110
APLN: 108742338
BMOR: 101736490
BMAN: 114250927
MSEX: 115445459
BANY: 112043031
MJU: 123876077
NIQ: 126769133
VCD: 124534555
MCIX: 123657161
PMAC: 106717598
PRAP: 110994351
PBX: 123716269
PNAP: 125054277
ZCE: 119829716
CCRC: 123705942
LSIN: 126976846
HAW: 110378920
HZE: 124634397
TNL: 113501782
SLIU: 111353565
OFU: 114365778
PXY: 105389295
PGW: 126376166
CFEL: 113378178
CCRN: 123298443
API: 100573983
DNX: 107163839
AGS: 114119742
RMD: 113557432
ACOO: 126838124
DVT: 126910283
BTAB: 109041343
DCI: 108253883
HHAL: 106687978
NLU: 111060170
HVI: 124361985
MQU: 128988624
FOC: 113210662
TPAL: 117652674
IEL: 124153538
DMK: 116929832
CEL: CELE_F23B2.13(rpb-12)
CBR: CBG_21781(Cbr-rpb-12)
BMY: BM_BM3534(Bma-rpb-12)
TSP: Tsp_06400
PMAX: 117316175
DPOL: 127857738
EGL: EGR_09900
ATH: AT1G53690 AT5G41010(NRPB12)
CPAP: 110818360
CIT: 102608086
PVY: 116109844
TCC: 18595592
EGR: 104425878
VRA: 106767094
VAR: 108345089
VUN: 114181371
VUM: 124848092
CCAJ: 109797120
APRC: 113867998
PSAT: 127127567
LJA: Lj0g3v0326669.2(Lj0g3v0326669.2) Lj2g3v0608570.1(Lj2g3v0608570.1) Lj2g3v0608570.2(Lj2g3v0608570.2)
RCN: 112179485
ZJU: 107419711
MNT: 21407405
CSAV: 115695979
BHJ: 120083390
MCHA: 111008568
RCU: 8272277
HBR: 110648693
MESC: 110624024
POP: 7454993
PALZ: 118040720
CILL: 122299128
VRI: 117912086
SPEN: 107002287
SSTN: 125864961
SDUL: 129877430
CANN: 107845622
LBB: 132629446
NTO: 104120059
NAU: 109207814
APAN: 127252220
ECAD: 122600295
BVG: 104893387
SOE: 110799009
ATRI: 130797246
MOF: 131149839
DOSA: Os01t0530366-01(Os01g0530366) Os07t0105100-00(Os07g0105100)
OGL: 127772606
LPER: 127316691
EGU: 105042794
MUS: 103970171
DCT: 110096352
PEQ: 110033895
AOF: 109822285
NCOL: 116247841
ATR: 110007581
PPP: 112276606
MNG: MNEG_2692
APRO: F751_2750
OLU: OSTLU_119610(rpc10)
MPP: MICPUCDRAFT_55164(JGI:MicpuC2_55164)
SCE: YHR143W-A(RPC10)
SEUB: DI49_2546
ERC: Ecym_6409
KMX: KLMA_20755(RPC10)
NCS: NCAS_0D00470(NCAS0D00470)
NDI: NDAI_0H03680(NDAI0H03680)
TPF: TPHA_0F02250(TPHA0F02250)
TBL: TBLA_0B00880(TBLA0B00880)
TDL: TDEL_0F00750(TDEL0F00750)
KAF: KAFR_0F00450(KAFR0F00450)
KNG: KNAG_0H03800(KNAG0H03800)
PIC: PICST_37319(RPC10)
CAL: CAALFM_C114390WA(RPC10)
NCR: NCU04508
NTE: NEUTE1DRAFT99462(NEUTE1DRAFT_99462)
PBEL: QC761_607080(RPC10)
PPSD: QC762_607080(RPC10)
PPSP: QC763_607080(RPC10)
PPSA: QC764_607080(RPC10)
MGR: MGG_11667
PGRI: PgNI_11599
SSCK: SPSK_10938
MAW: MAC_05433
MAJ: MAA_09479
CMT: CCM_08361
MBE: MBM_05787
ALUC: AKAW2_20803S(RPC10)
ACHE: ACHE_10248S(RPC10)
APUU: APUU_60240A(RPC10)
PTE: PTT_18070
SPO: SPBC19C2.03(rpc10)
SOM: SOMG_00843(rpc10)
CDEU: CNBG_9686
TASA: A1Q1_01569
CCAC: CcaHIS019_0109880(RPC10)
ABV: AGABI2DRAFT191935(AGABI2DRAFT_191935)
SCM: SCHCO_02623624(SCHCODRAFT_02623624)
MRT: MRET_3644
PTRC: PtA15_7A71
DDI: DDB_G0283365(rpb12)
DFA: DFA_02110(rpb12)
TPV: TP03_0016
CPV: cgd7_3240
TGO: TGME49_254140(POLR2K)
NGD: NGA_0434201(RPB12)
SPAR: SPRG_01449
 » show all
Reference
PMID:7651387
  Authors
Shpakovski GV, Acker J, Wintzerith M, Lacroix JF, Thuriaux P, Vigneron M
  Title
Four subunits that are shared by the three classes of RNA polymerase are functionally interchangeable between Homo sapiens and Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Mol Cell Biol 15:4702-10 (1995)
DOI:10.1128/mcb.15.9.4702
  Sequence
[hsa:5440]
Reference
  Authors
Kuhn CD, Geiger SR, Baumli S, Gartmann M, Gerber J, Jennebach S, Mielke T, Tschochner H, Beckmann R, Cramer P
  Title
Functional architecture of RNA polymerase I.
  Journal
Cell 131:1260-72 (2007)
DOI:10.1016/j.cell.2007.10.051
  Sequence
[sce:YHR143W-A]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system