KEGG   ORTHOLOGY: K03090
Entry
K03090                      KO                                     

Symbol
sigB
Name
RNA polymerase sigma-B factor
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03090  sigB; RNA polymerase sigma-B factor
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     K03090  sigB; RNA polymerase sigma-B factor
Other DBs
COG: COG1191
GO: 0016987
Genes
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BSL: A7A1_1406
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BANR: A16R_10740
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BTT: HD73_1149
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BWW: bwei_4002(sigB)
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BPUM: BW16_02625
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SAU: SA1869(sigB)
SAV: SAV2064(sigB)
SAW: SAHV_2049(sigB)
SAM: MW1988(sigB)
SAS: SAS1969
SAR: SAR2152(sigB)
SAC: SACOL2054(rpoF)
SAX: USA300HOU_2059(fliA)
SAA: SAUSA300_2022(rpoF)
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SUU: M013TW_2023(sigB)
SUE: SAOV_2106c(sigB)
SUJ: SAA6159_01979(sigB)
SUK: SAA6008_02103(sigB)
SUC: ECTR2_1920(sigB)
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SUZ: MS7_2081(sigB)
SUX: SAEMRSA15_19740(sigB)
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SUG: SAPIG2105(sigB)
SUF: SARLGA251_18670(sigB)
SAUA: SAAG_02276
SAUE: RSAU_001904(sigB)
SAUS: SA40_1822(sigB)
SAUU: SA957_1906(sigB)
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SAUJ: SAI2T2_1015220(sigB)
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SAUV: SAI7S6_1015210(sigB)
SAUW: SAI5S5_1015150(sigB)
SAUX: SAI6T6_1015170(sigB)
SAUY: SAI8T7_1015190(sigB)
SAUF: X998_2044(sigB)
SAB: SAB1949c(sigB)
SUY: SA2981_2005(sigB)
SAUB: C248_2075(sigB)
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SAUR: SABB_02394(sigB)
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SAUD: CH52_08640
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SEPS: DP17_613(sigB)
SHA: SH0967(sigB)
SHH: ShL2_00857(sigB)
SCA: SCA_1570(sigB)
SLN: SLUG_09950(sigB)
SDT: SPSE_0759(sigB)
SDP: NCTC12225_00826(sigB)
SPAS: STP1_0507
SXO: SXYL_00862(sigB)
SHU: SHYC_03940(sigB)
SCAP: AYP1020_1257(sigB)
SSCH: LH95_03780
SSCZ: RN70_04040
SAGQ: EP23_06135(sigB)
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SCAR: DWB96_04320(sigB)
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SPIC: SAMEA4384060_0972(sigB)
SSH: NCTC13712_02006(sigB)
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LMOQ: LM6179_1209(sigB)
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CST: CLOST_0012(sigB)
PHX: KGNDJEFE_00169(sigB)
DAE: Dtox_3254
PTH: PTH_1148(FliA)
ELM: ELI_0811
CSC: Csac_0460
ATE: Athe_0437
TOC: Toce_1747
FMA: FMG_0009
APR: Apre_0009
PMIC: NW74_00130
PED: ING2D1G_0009(sigB)
PHAR: NCTC13077_00009(sigB)
PIV: NCTC13079_00009(sigB)
CAD: Curi_c00100(rpoD1)
PLUF: LFWB_0250(rpoD) LFWB_0530(rpoD) LFWB_1620(rpoD) LFWB_2910(rpoD) LFWB_3440(rpoD) LFWB_3660(rpoD) LFWB_3990(rpoD) LFWB_4210(rpoD) LFWB_4760(rpoD) LFWB_4930(rpoD) LFWB_5380(rpoD) LFWB_5970(rpoD) LFWB_7100(rpoD)
MTU: Rv3286c(sigF)
MTC: MT3385(sigF)
MRA: MRA_3327(sigF)
MTUR: CFBS_3477(sigF)
MTO: MTCTRI2_3353(sigF)
MTN: ERDMAN_3602(sigF)
MTUC: J113_22940
MTUE: J114_17620
MTUL: TBHG_03222
MTUT: HKBT1_3464(sigF)
MTUU: HKBT2_3471(sigF)
MTQ: HKBS1_3474(sigF)
MBO: BQ2027_MB3314C(sigF)
MBB: BCG_3315c(sigF)
MBT: JTY_3311(sigF)
MBM: BCGMEX_3313c(sigF)
MBX: BCGT_3150
MAF: MAF_32970(sigF)
MCE: MCAN_33091(sigF)
MCQ: BN44_70077(sigF)
MCV: BN43_60301(sigF)
MCX: BN42_41344(sigF)
MCZ: BN45_60324(sigF)
MPA: MAP_1474c(sigF) MAP_3406c(sigF)
MLP: MLM_2389
MUL: MUL_2640(sigF)
MMI: MMAR_1248(sigF)
MMAE: MMARE11_12160(sigF)
MLI: MULP_01407(sigF)
MHAD: B586_17670
MSHG: MSG_01148(sigF) MSG_02521
MSTO: MSTO_08630 MSTO_26160(sigF)
MSIM: MSIM_13660(sigF) MSIM_52600
MSAK: MSAS_06120 MSAS_47730(sigF)
MXE: MYXE_37410(sigF)
MNV: MNVI_27860(sigF)
MNM: MNVM_29610(sigF)
MCOO: MCOO_44280(sigF)
MBAI: MB901379_01144(sigF)
MSEO: MSEO_13390 MSEO_50830(sigF)
MPSE: MPSD_14240(sigF)
MSHO: MSHO_60680
MHEK: JMUB5695_03693(sigF)
MLJ: MLAC_32490(sigF)
MBRD: MBRA_03990(sigF)
MSHJ: MSHI_25320(sigF)
MKR: MKOR_20770(sigF)
MSG: MSMEI_1759(sigF)
MPHL: MPHLCCUG_00640(sigF_1) MPHLCCUG_01578(sigF_2)
MTHN: 4412656_01164(sigB)
MHAS: MHAS_00480(sigF_1) MHAS_00696(sigF_2)
MAUU: NCTC10437_01362(sigB_1) NCTC10437_01650(sigB_2) NCTC10437_02355(sigB_3) NCTC10437_02432(sigB_4)
MAIC: MAIC_12800 MAIC_47770(sigF)
MALV: MALV_20010
MTY: MTOK_34830(sigF)
MSAR: MSAR_03000(sigF_1) MSAR_04510(sigF_2) MSAR_38210(sigF_3)
MANY: MANY_52370
MBOK: MBOE_56340
MFLV: NCTC10271_00592(sigB_1) NCTC10271_03670(sigB_2) NCTC10271_03887(sigB_3) NCTC10271_04336(sigB_4)
MAB: MAB_2511
MABB: MASS_2432
MCHE: BB28_12605
MSAL: DSM43276_02230(sigF)
MJD: JDM601_3105(sigF)
MTER: 4434518_03095(sigF)
MMIN: MMIN_07970(sigF)
MHIB: MHIB_25290(sigF)
ASD: AS9A_1391(sigF) AS9A_4336
NFR: ERS450000_00097(sigB_1) ERS450000_00451(sigB_2) ERS450000_01387(sigB_3) ERS450000_02225(sigB_4) ERS450000_04082(sigB_5)
NAD: NCTC11293_03229(sigB_1) NCTC11293_04175(sigB_2) NCTC11293_04938(sigB_3)
RER: RER_12750 RER_15780(sigF)
RHB: NY08_402
RFA: A3L23_03727(sigF)
RHS: A3Q41_04513(sigF)
RHU: A3Q40_00207(sigF)
RRT: 4535765_03762(sigB)
RCR: NCTC10994_03499(sigB)
GBR: Gbro_4292
GOR: KTR9_4128
GRU: GCWB2_20840(sigF)
GOM: D7316_04202(sigF)
SCO: SCO0600(SCF55.24) SCO4034(2SC10A7.38c) SCO4035(2SCD60.01c) SCO5243(2SC7G11.05c) SCO6520(SC5C7.05) SCO7278(SC5H1.14) SCO7314(SC5F8.24) SCO7341(SC4G10.20c)
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Reference
PMID:10077659 (Synechocystis)
  Authors
Bhaya D, Watanabe N, Ogawa T, Grossman AR
  Title
The role of an alternative sigma factor in motility and pilus formation in the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC6803.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 96:3188-93 (1999)
DOI:10.1073/pnas.96.6.3188
Reference
PMID:11065366 (Synechocystis)
  Authors
Huckauf J, Nomura C, Forchhammer K, Hagemann M
  Title
Stress responses of Synechocystis sp. strain PCC 6803 mutants impaired in genes encoding putative alternative sigma factors.
  Journal
Microbiology 146 ( Pt 11):2877-89 (2000)
DOI:10.1099/00221287-146-11-2877
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  Authors
Hartkoorn RC, Sala C, Magnet SJ, Chen JM, Pojer F, Cole ST
  Title
Sigma factor F does not prevent rifampin inhibition of RNA polymerase or cause rifampin tolerance in Mycobacterium tuberculosis.
  Journal
J Bacteriol 192:5472-9 (2010)
DOI:10.1128/JB.00687-10
  Sequence
[mtu:Rv3286c]
LinkDB

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