KEGG   ORTHOLOGY: K07259Help
Entry
K07259                      KO                                     

Name
dacB
Definition
serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4) [EC:3.4.16.4 3.4.21.-]
Pathway
ko00550  Peptidoglycan biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09107 Glycan biosynthesis and metabolism
   00550 Peptidoglycan biosynthesis
    K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01002 Peptidases
    K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
   01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins
    K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.4  Acting on peptide bonds (peptidases)
   3.4.16  Serine-type carboxypeptidases
    3.4.16.4  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase
     K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
   3.4.21  Serine endopeptidases
    3.4.21.-  
     K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
Peptidases [BR:ko01002]
 Serine Peptidases
  Family S13: D-Ala-D-Ala peptidase C family
   K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:ko01011]
 Peptidoglycan biosynthesis and degradation
  DD-Carboxypeptidase/DD-Endopeptidase (Low molecular weight PBP)
   K07259  dacB; serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase/endopeptidase (penicillin-binding protein 4)
BRITE hierarchy
Other DBs
COG: COG2027
GO: 0008658 0009002
Genes
ECO: b3182(dacB)
ECJ: JW3149(dacB)
ECD: ECDH10B_3356(dacB)
EBW: BWG_2884(dacB)
ECOK: ECMDS42_2650(dacB)
ECE: Z4544(dacB)
ECS: ECs4061
ECF: ECH74115_4504(dacB)
ETW: ECSP_4157(dacB)
ELX: CDCO157_3802
EOJ: ECO26_4286(dacB)
EOI: ECO111_4007(dacB)
EOH: ECO103_3929(dacB)
ECOO: ECRM13514_4141(dacB)
ECOH: ECRM13516_3945(dacB)
ECG: E2348C_3461(dacB)
EOK: G2583_3907(dacB)
ESO: O3O_22615
ESM: O3M_03075
ESL: O3K_03030
ECW: EcE24377A_3667(dacB)
ELH: ETEC_3447
EUN: UMNK88_3943(dacB)
ECC: c3939(dacB)
ECP: ECP_3269
ECI: UTI89_C3615(dacB)
ECV: APECO1_3250(dacB)
ECX: EcHS_A3374(dacB)
ECM: EcSMS35_3478(dacB)
ECY: ECSE_3466
ECR: ECIAI1_3330(dacB)
ECQ: ECED1_3840(dacB)
ECK: EC55989_3600(dacB)
ECT: ECIAI39_3677(dacB)
EOC: CE10_3712(dacB)
EUM: ECUMN_3662(dacB)
ECZ: ECS88_3564(dacB)
ELO: EC042_3473(dacB)
ESE: ECSF_3014
EBR: ECB_03047(dacB)
EBD: ECBD_0560
EKF: KO11_06760(dacB)
EAB: ECABU_c35940(dacB)
EDJ: ECDH1ME8569_3071(dacB)
EIH: ECOK1_3603(dacB)
ENA: ECNA114_3261(dacB)
ELW: ECW_m3454(dacB)
ELL: WFL_16895(dacB)
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ELP: P12B_c3298(dacB)
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EBE: B21_02998(dacB)
ELF: LF82_0430(dacB)
ECOI: ECOPMV1_03492(dacB_1) ECOPMV1_03493(dacB_2)
ECOJ: P423_17875
ECOS: EC958_3582(dacB)
EFE: EFER_3159(dacB)
EAL: EAKF1_ch2757c(dacB)
STY: STY3479
STT: t3217
STM: STM3300(dacB)
SEO: STM14_3986(dacB)
SEY: SL1344_3272(dacB)
SEJ: STMUK_3286(dacB)
SEB: STM474_3459(dacB)
SENI: CY43_17185
SPT: SPA3167(dacB)
SEK: SSPA2955
SEI: SPC_3369(dacB)
SEC: SCH_3238(dacB)
SEH: SeHA_C3596(dacB)
SHB: SU5_03784
SEE: SNSL254_A3560(dacB)
SEW: SeSA_A3491(dacB)
SEA: SeAg_B3490(dacB)
SENS: Q786_16085
SED: SeD_A3658(dacB)
SEG: SG3190(dacB)
SEL: SPUL_3309(dacB)
SEGA: SPUCDC_3295(dacB)
SET: SEN3133(dacB)
SENA: AU38_15965
SENO: AU37_16165
SENV: AU39_16160
SENQ: AU40_17985
SENL: IY59_16565
SEEP: I137_15785
SENB: BN855_33770(dacB)
SENE: IA1_15975
SBG: SBG_2928
SBZ: A464_3381
SFL: SF3222(dacB)
SFX: S3440(dacB)
SFV: SFV_3212(dacB)
SFE: SFxv_3535(dacB)
SFN: SFy_4604
SFS: SFyv_4678
SFT: NCTC1_03498(dacB)
SSN: SSON_3330(dacB)
SBO: SBO_3200(dacB)
SBC: SbBS512_E3588(dacB)
SDY: SDY_3363(dacB)
ENC: ECL_04561
ECLO: ENC_34170
ECLX: LI66_19965
ECLY: LI62_21945
ECLZ: LI64_19065
EEC: EcWSU1_03983(dacB)
ESA: ESA_03573
CSK: ES15_3524(dacB)
CTU: CTU_03990(dacB)
KPN: KPN_03592(dacB)
KPU: KP1_4901(dacB)
KPP: A79E_0519
KPT: VK055_3885(dacB)
KPE: KPK_0529(dacB)
KPR: KPR_4785(dacB)
KPJ: N559_0575
KPX: PMK1_01100(dacB)
KPNU: LI86_02760
KPNK: BN49_0527(dacB)
KVA: Kvar_0507
KOX: KOX_03715
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EAR: CCG33121
CKO: CKO_04583
CRO: ROD_46391(dacB)
CAMA: F384_17535
EBT: EBL_c03970(dacB)
METY: MRY16398_05910(dacB)
AHN: NCTC12129_04353(dacB_2)
IZH: FEM41_02755(dacB)
EBF: D782_0513
YPE: YPO3506(dacB)
YPK: y0678(dacB)
YPH: YPC_0572(dacB)
YPA: YPA_0056
YPN: YPN_3250
YPM: YP_0577(dacB)
YPG: YpAngola_A3981(dacB)
YPZ: YPZ3_3254(dacB)
YPD: YPD4_3245(dacB)
YPX: YPD8_3082(dacB)
YPW: CH59_2539(dacB)
YPJ: CH55_3342(dacB)
YPV: BZ15_14(dacB)
YPL: CH46_1582(dacB)
YPS: YPTB0470(dacB)
YPO: BZ17_2095(dacB)
YPI: YpsIP31758_3606(dacB)
YPY: YPK_3740
YPB: YPTS_0500
YPQ: DJ40_1920(dacB)
YPU: BZ21_3844(dacB)
YPR: BZ20_1638(dacB)
YPC: BZ23_4114(dacB)
YPF: BZ19_3945(dacB)
YEN: YE0424(dacB)
YEY: Y11_36611
YEW: CH47_3051(dacB)
YET: CH48_1166(dacB)
YEE: YE5303_29121(dacB)
YAL: AT01_2959(dacB)
YFR: AW19_3800(dacB)
YIN: CH53_1291(dacB)
YKR: CH54_1990(dacB)
YRO: CH64_3052(dacB)
YRU: BD65_2343(dacB)
SPE: Spro_0479
SRL: SOD_c03530(dacB)
SPLY: Q5A_001950(dacB)
SMAF: D781_0382
SMAR: SM39_0477 SM39_4763(dacB)
SQU: E4343_14265(dacB)
RAA: Q7S_02370
ECA: ECA0694(dacD)
PATR: EV46_02995
PATO: GZ59_05970(dacD)
PCT: PC1_0562
PEC: W5S_0698
SOD: Sant_3465(dacB)
DDD: Dda3937_02351(dacB)
DDQ: DDI_0443
ETA: ETA_03370
EPY: EpC_03510
EPR: EPYR_00364(dacB)
EAM: EAMY_0337(dacB)
EAY: EAM_3082(dacB)
EBI: EbC_40130
EGE: EM595_0494(dacB)
PAM: PANA_0447(dacB)
PLF: PANA5342_3853(dacB)
PAJ: PAJ_3594(dacB)
PVA: Pvag_3667(dacB)
PSTW: DSJ_04010
TPTY: NCTC11468_00313(dacB)
PLU: plu4539(dacB)
PAY: PAU_04040(dacB)
PMR: PMI3408(dacB)
PMIB: BB2000_3448(dacB)
PHAU: PH4a_08490
XBO: XBJ1_0358(dacB)
XBV: XBW1_4425(dacB)
XNE: XNC1_0494(dacB)
XNM: XNC2_0482(dacB)
XDO: XDD1_0467(dacB)
XPO: XPG1_3399(dacB)
PSI: S70_12120
PSX: DR96_751(dacB)
PRG: RB151_041170(dacB)
PHEI: NCTC12003_03633(dacB)
MMK: MU9_184
ETR: ETAE_0395(dacD1)
ETD: ETAF_0350
ETE: ETEE_2154(dacB)
LRI: NCTC12151_03060(dacB)
PSHI: SAMEA2665130_2576(dacB)
HIN: HI1330(dacB)
HIT: NTHI1655(dacB)
HIU: HIB_14940
HIE: R2846_0946(dacB)
HIZ: R2866_0920(dacB)
HIK: HifGL_001173(dacB)
HIA: H733_0970
HIW: NTHI477_00169(dacB)
HIC: NTHIC486_01242(dacB)
HIX: NTHI723_00088(dacB)
HAP: HAPS_1112(dacB)
HPAZ: K756_01205
PMU: PM0716(dacB)
PMV: PMCN06_0776(dacB)
PMP: Pmu_07830(dacB)
PMUL: DR93_1546(dacB)
PDAG: 4362423_00688(dacB)
PAET: NCTC13378_00910(dacB)
MSU: MS0960(dacB)
MHT: D648_7780
MHAT: B824_8440
MHX: MHH_c13800(dacB)
MHAE: F382_11980
MHAM: J450_10945
MHAO: J451_12100
MHAL: N220_04110
MHAQ: WC39_09780
MHAY: VK67_09780
MVR: X781_8620
MVI: X808_7420
MVG: X874_7550
APL: APL_0945(dacB)
APJ: APJL_0955(dacB)
APA: APP7_1003(dacB)
ASU: Asuc_1456
AIO: EXH44_00685(dacB)
AAT: D11S_1020
AAN: D7S_02221
AACN: AANUM_2095(dacB2)
RPNE: NCTC8284_02201(dacB_1) NCTC8284_02202(dacB_2) NCTC8284_02203(dacB_3)
XFA: XF_1614
DYE: EO087_03020(dacB)
DKO: I596_1831
VCH: VC0632
VCS: MS6_0450
VCE: Vch1786_I0040(dacB)
VCI: O3Y_02945
VCO: VC0395_A0161(dacB)
VCR: VC395_0649(dacB)
VCM: VCM66_0590(dacB)
VCX: VAA049_3062(dacB)
VCZ: VAB027_3217(dacB)
VVU: VV1_1685(dacB)
VVY: VV2721
VPA: VP2468
VPB: VPBB_2293
VAG: N646_1563
VSP: VS_2495
VAN: VAA_00793
VAU: VANGNB10_cI0531c(dacB)
VSC: VSVS12_00721(dacB)
VTA: A1599
VFI: VF_0474(dacB)
VFM: VFMJ11_0474(dacB)
VSA: VSAL_I0587(dacB)
AWD: AWOD_I_0468(dacB)
PPR: PBPRA0599(S3440)
PMAI: CF386_04775(dacB)
SALY: E8E00_02055(dacB)
SKS: FCN78_10765(dacB)
PAE: PA3047
PAEV: N297_3154(dacB)
PAEI: N296_3154(dacB)
PAU: PA14_24690(dacB)
PAP: PSPA7_2091(dacB)
PNC: NCGM2_4167(dacB)
PAEB: NCGM1900_3254(dacB)
PAEP: PA1S_10150
PAEM: U769_09690
PAEL: T223_10165
PAEG: AI22_23720
PAEC: M802_3151(dacB)
PAEO: M801_3019(dacB)
PMY: Pmen_3008
PMK: MDS_3286
PRE: PCA10_20690(dacB)
PPSE: BN5_1419(dacB)
PCQ: PcP3B5_18780(dacB)
PPU: PP_2098(dacB)
PPF: Pput_3641
PPT: PPS_1662
PPI: YSA_01582
PPX: T1E_3241(dacC)
PPUH: B479_08110
PPUT: L483_07735
PPUN: PP4_37500(dacB)
PPUD: DW66_1953
PMON: X969_06365
PMOT: X970_06340
PST: PSPTO_2314(dacB)
PSB: Psyr_2111
PSYR: N018_09875
PSP: PSPPH_2081(dacB)
PAMG: BKM19_013205(dacB)
PAVL: BKM03_17715(dacB)
PFL: PFL_1880(dacB)
PPRC: PFLCHA0_c19210(dac)
PPRO: PPC_1933
PFC: PflA506_1002(dacB_2) PflA506_3899(dacB_1)
PMAN: OU5_5414(dacB)
PEN: PSEEN3770(dacB)
PSA: PST_2387(dacB)
PSZ: PSTAB_2285(dacB)
PSR: PSTAA_2496(dacB)
PSTT: CH92_13030
PPUU: PputUW4_03606(dacB)
PKC: PKB_3823
PSES: PSCI_3884
PSOS: POS17_1897
PSET: THL1_2076
PSIL: PMA3_20360
PSED: DM292_06900(dacB)
AVN: Avin_18940(dacB)
AVL: AvCA_18940(dacB)
AVD: AvCA6_18940(dacB)
ACX: Achr_14700(dacB)
PALI: A3K91_0497
PSYA: AOT82_1302
MBOI: DQF64_05580(dacB)
SON: SO_2394(dacB)
SDN: Sden_1778
SFR: Sfri_1920
SAZ: Sama_1744
SBL: Sbal_2078
SLO: Shew_1962
SSE: Ssed_2291
SPL: Spea_2082
SHL: Shal_2055
SWD: Swoo_2324
SWP: swp_2504
SVO: SVI_2082(dacB)
SHF: CEQ32_04825(dacB)
SPSW: Sps_00825
SBJ: CF168_10760(dacB)
SMAV: CFF01_09525(dacB)
SHEW: CKQ84_20265(dacB)
SLJ: EGC82_11975(dacB)
MAQ: Maqu_2196
MHC: MARHY1030(dacB)
MAD: HP15_829
MBS: MRBBS_2618(dacB)
MARA: D0851_17890(dacB)
PIN: Ping_3293
FBL: Fbal_1929
MVS: MVIS_1632(dacB)
CBU: CBU_0009(dacB)
CBS: COXBURSA331_A2192(dacB)
CBD: CBUD_0134(dacB)
CBC: CbuK_0198(dacB)
RVI: RVIR1_04520(dacB) RVIR1_12360(dacB)
LPN: lpg2589(dacB)
LPM: LP6_1451 LP6_2620(dacB)
LPF: lpl2512
LPP: lpp2642
LPC: LPC_0554(dacB)
LPA: lpa_03787(dacB)
LHA: LHA_2880
LOK: Loa_00594
LCD: clem_02045(dacB)
LLG: 44548918_01153(dacB_1) 44548918_01878(dacC) 44548918_02388(dacB_2)
LIB: E4T55_04780(dacB)
FTU: FTT_1039(dacB1)
FTF: FTF1039(dacB1)
FTW: FTW_0948(dacB1) FTW_1514(dacB2)
FTT: FTV_0995(dacB1)
FTG: FTU_1079(dacB1)
FTL: FTL_1046
FTH: FTH_1025(dacB) FTH_1461
FTA: FTA_1106(dacB)
FTI: FTS_1024(dacB)
FTC: DA46_1242(dacB) DA46_1751(dacB)
FTV: CH67_1392(dacB) CH67_1906(dacB)
FTZ: CH68_1124(dacB) CH68_1635(dacB)
FTM: FTM_0911
FTX: AW25_1101(dacB) AW25_1391(dacB)
FTD: AS84_1617(dacB) AS84_37(dacB)
FTY: CH70_1092(dacB) CH70_1417(dacB)
FPH: Fphi_1700
FPT: BZ13_294(dacB)
FPI: BF30_1978(dacB)
FPM: LA56_113(dacB) LA56_471(dacB)
FPX: KU46_1597(dacB)
FPZ: LA55_1090(dacB)
FPJ: LA02_1399(dacB)
FNA: OOM_0970
FHA: CDV26_05365(dacB) CDV26_06185(dacB)
FRC: KX01_1674(dacB)
TCX: Tcr_0793
MEJ: Q7A_1765(dacB)
MEC: Q7C_2559
TIG: THII_0903
AEH: Mlg_1692
TGR: Tgr7_1575
TKM: TK90_0467
TNI: TVNIR_3208(dacB_[H])
TVR: TVD_11600
CSA: Csal_2931
HEL: HELO_3978
HAM: HALO1018
HCO: LOKO_02350(dacC_2)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:2046551
  Authors
Korat B, Mottl H, Keck W
  Title
Penicillin-binding protein 4 of Escherichia coli: molecular cloning of the dacB gene, controlled overexpression, and alterations in murein composition.
  Journal
Mol Microbiol 5:675-84 (1991)
DOI:10.1111/j.1365-2958.1991.tb00739.x
Reference
PMID:2040429
  Authors
Mottl H, Terpstra P, Keck W
  Title
Penicillin-binding protein 4 of Escherichia coli shows a novel type of primary structure among penicillin-interacting proteins.
  Journal
FEMS Microbiol Lett 62:213-20 (1991)
DOI:10.1111/j.1574-6968.1991.tb04445.x
  Sequence
[eco:b3182]
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