KEGG   ORTHOLOGY: K10610
Entry
K10610                      KO                                     

Name
DDB1
Definition
DNA damage-binding protein 1
Pathway
ko03420  Nucleotide excision repair
ko04120  Ubiquitin mediated proteolysis
ko05161  Hepatitis B
ko05170  Human immunodeficiency virus 1 infection
ko05203  Viral carcinogenesis
Disease
H00403  Disorders of nucleotide excision repair
H01428  Xeroderma pigmentosum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   04120 Ubiquitin mediated proteolysis
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
 09160 Human Diseases
  09161 Cancer: overview
   05203 Viral carcinogenesis
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
  09172 Infectious disease: viral
   05170 Human immunodeficiency virus 1 infection
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
   05161 Hepatitis B
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
Ubiquitin system [BR:ko04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Multi subunit Ring-finger type E3
   Cul4 complex
    Adoptor protein
     K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     Cul4-DDB2 complex
      K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
    TCR (transcription coupled repair) factors
     Cul4-CSA complex
      K10610  DDB1; DNA damage-binding protein 1
Genes
HSA: 1642(DDB1)
PTR: 451234(DDB1)
PPS: 100974073(DDB1)
GGO: 101128174(DDB1)
PON: 100173610(DDB1)
NLE: 100591012(DDB1)
MCC: 694253(DDB1)
MCF: 102139788(DDB1)
CSAB: 103234463(DDB1)
RRO: 104679393(DDB1)
RBB: 108533616(DDB1)
CJC: 100386689(DDB1)
SBQ: 101047177(DDB1)
MMU: 13194(Ddb1)
MCAL: 110285966(Ddb1)
MPAH: 110332039(Ddb1)
RNO: 64470(Ddb1)
MUN: 110548072(Ddb1)
CGE: 100764133(Ddb1)
NGI: 103725009(Ddb1)
HGL: 101712635(Ddb1)
CCAN: 109687309(Ddb1)
OCU: 100354475(DDB1)
TUP: 102491328(DDB1)
CFA: 476067(DDB1)
VVP: 112911054(DDB1)
AML: 100468274(DDB1)
UMR: 103678159(DDB1)
UAH: 113246913(DDB1)
ORO: 101369653(DDB1)
ELK: 111150052
FCA: 101081079(DDB1)
PTG: 102969790(DDB1)
PPAD: 109246537(DDB1)
AJU: 106977885(DDB1)
BTA: 511951(DDB1)
BOM: 102281595(DDB1)
BIU: 109554274(DDB1)
BBUB: 102415003(DDB1)
CHX: 102173071(DDB1)
OAS: 101106122(DDB1)
SSC: 100522239(DDB1)
CFR: 102524200(DDB1)
CDK: 105094885(DDB1)
BACU: 103014994(DDB1)
LVE: 103088040(DDB1)
OOR: 101271405(DDB1)
DLE: 111183892(DDB1)
PCAD: 102994780(DDB1)
ECB: 100059606(DDB1)
EPZ: 103563968(DDB1)
EAI: 106847575(DDB1)
MYB: 102259825(DDB1)
MYD: 102759807(DDB1)
MNA: 107527694(DDB1)
HAI: 109390039(DDB1)
DRO: 112317083(DDB1)
PALE: 102897514(DDB1)
RAY: 107504749(DDB1)
MJV: 108392382(DDB1)
LAV: 100659188(DDB1)
TMU: 101350156
MDO: 100027158(DDB1)
SHR: 100932655(DDB1)
PCW: 110195387(DDB1)
OAA: 100073517(DDB1)
GGA: 374050(DDB1)
MGP: 100538577(DDB1)
CJO: 107314196(DDB1)
NMEL: 110400820(DDB1)
APLA: 101793052(DDB1)
ACYG: 106048274(DDB1)
TGU: 100221900(DDB1)
LSR: 110484947(DDB1)
SCAN: 103822147(DDB1)
GFR: 102037903(DDB1)
FAB: 101813893(DDB1)
PHI: 102102702(DDB1)
PMAJ: 107206332(DDB1)
CCAE: 111930604(DDB1)
CCW: 104684126(DDB1)
ETL: 114063335(DDB1)
FPG: 101916555(DDB1)
FCH: 102056097(DDB1)
CLV: 102083939(DDB1)
EGZ: 104125248(DDB1)
NNI: 104009175(DDB1)
ACUN: 113480931(DDB1)
PADL: 103922975(DDB1)
AAM: 106494907(DDB1)
ASN: 102368702(DDB1)
AMJ: 102562398(DDB1)
PSS: 102445355(DDB1)
CMY: 102933282(DDB1)
CPIC: 101935621(DDB1)
ACS: 100567601(ddb1)
PVT: 110078318(DDB1)
PBI: 103056431(DDB1)
PMUR: 107292639(DDB1)
TSR: 106550282(DDB1)
PMUA: 114600733(DDB1)
GJA: 107120363(DDB1)
XLA: 399026(ddb1.S)
XTR: 100485735(ddb1)
NPR: 108794182(DDB1)
DRE: 393599(ddb1)
SRX: 107711352(ddb1) 107728187
SANH: 107681355 107681436
SGH: 107567482(ddb1) 107599771
CCAR: 109113043 109113065
IPU: 108264636(ddb1)
PHYP: 113526738(ddb1)
EEE: 113570846(ddb1)
TRU: 101073611(ddb1)
TNG: GSTEN00018133G001
LCO: 109142342(ddb1)
NCC: 104948593(ddb1)
MZE: 101485195(ddb1)
ONL: 100701659(ddb1)
OLA: 101162350(ddb1)
XMA: 102222957(ddb1)
XCO: 114142998(ddb1)
PRET: 103462703(ddb1)
CVG: 107095505(ddb1)
NFU: 107381780(ddb1)
KMR: 108234789(ddb1)
ALIM: 106524774(ddb1)
AOCE: 111581444(ddb1)
CSEM: 103398637(ddb1)
POV: 109637274(ddb1)
LCF: 108887821(ddb1)
SDU: 111225433(ddb1)
SLAL: 111659426(ddb1)
HCQ: 109525959(ddb1)
BPEC: 110170514 110174494
MALB: 109965091(ddb1)
SASA: 100306841(ddb1) 106561926(DDB1)
OTW: 112232282 112248982 112263480
SALP: 111969195 111974035
ELS: 105025975(ddb1)
SFM: 108941286(ddb1)
PKI: 111848012(ddb1)
LCM: 102353166(DDB1)
CMK: 103174841(ddb1)
RTP: 109936417
BFO: 118414478
CIN: 100187356
SPU: 588842
APLC: 110987715
SKO: 100370988
DME: Dmel_CG7769(pic)
DER: 6553634
DSE: 6606575
DSI: Dsimw501_GD18880(Dsim_GD18880)
DYA: Dyak_GE26244
DAN: 6500363
DSR: 110187909
DPO: Dpse_GA20574
DPE: 6587576
DMN: 108155996
DWI: 6649634
DGR: Dgri_GH18378
DMO: Dmoj_GI23368
DAZ: 108616778
DNV: 115562279
DHE: 111594632
DVI: 6632537
MDE: 101891356
LCQ: 111690457
AGA: AgaP_AGAP002472
AAG: 5574598
AALB: 109423494
CQU: CpipJ_CPIJ013742
AME: 412593
BIM: 100741904
BTER: 100650523
CCAL: 108631887
OBB: 114872966
SOC: 105201249
MPHA: 105832113
AEC: 105153002
ACEP: 105620686
PBAR: 105430709
VEM: 105562523
HST: 105183657
DQU: 106741416
CFO: 105248215
LHU: 105679961
PGC: 109856304
OBO: 105281228
PCF: 106784387
NVI: 100114761
CSOL: 105362886
MDL: 103576659
TCA: 664450
DPA: 109536975
ATD: 109602565
NVL: 108568627
BMOR: 101741287
BMAN: 114243827
DPL: KGM_214746
PMAC: 106707906
PRAP: 111000869
HAW: 110372494
TNL: 113492460
PXY: 105392169
API: 100165978
DNX: 107168436 107173063
AGS: 114120326 114131095
RMD: 113558016 113558989
BTAB: 109044154
CLEC: 106671251
PHU: Phum_PHUM237350
ZNE: 110837897
FCD: 110844766
DPX: DAPPUDRAFT_303245
PVM: 113810662
ISC: IscW_ISCW004025
TUT: 107363579
DPTE: 113790455
CSCU: 111641781
PTEP: 107437144
CEL: CELE_M18.5(ddb-1)
CBR: CBG06232(Cbr-ddb-1)
BMY: Bm1_39925 Bm1_39930
LOA: LOAG_18703
TSP: Tsp_02888
HRO: HELRODRAFT_187538
LGI: LOTGIDRAFT_209160
PCAN: 112558685
CRG: 105339796
MYI: 110461953
OBI: 106882477
LAK: 106164639
SMM: Smp_175430
SHX: MS3_06649
OVI: T265_01934
EGL: EGR_05525
NVE: 5514579
EPA: 110244633
ADF: 107347188
AMIL: 114966482
PDAM: 113684911
SPIS: 111321431
DGT: 114521436
HMG: 100203542
TAD: TRIADDRAFT_18324
AQU: 100635409
ATH: AT4G05420(DDB1A) AT4G21100(DDB1B)
ALY: 9305980 9310909 9313598
CRB: 17877916 17883780 17884531
CSAT: 104707706 104715741 104718227 104727878 104731438 104737397
EUS: EUTSA_v10024273mg EUTSA_v10028374mg
BRP: 103834207 103839745
BNA: 106360998 106389894 106448242 111204575
BOE: 106318142 106336355
RSZ: 108818670 108827795 108846370
THJ: 104812376
CPAP: 110819767
CIT: 102623596
CIC: CICLE_v10014106mg
TCC: 18607075
GRA: 105795519
GHI: 107908539 107938502
GAB: 108475900
DZI: 111283148 111308545 111308546
EGR: 104415814 104417802
GMX: 100777459
GSJ: 114413051 114421812
PVU: PHAVU_002G252300g
VRA: 106768321
VAR: 108321890
VUN: 114177336
CCAJ: 109799399
MTR: MTR_8g089380
CAM: 101506983
LJA: Lj0g3v0282539.1(Lj0g3v0282539.1)
ADU: 107472232
AIP: 107630562
LANG: 109338928
FVE: 101298151
RCN: 112166138
PPER: 18778981
PMUM: 103325185
PAVI: 110755479
MDM: 103435600 103446131
PXB: 103952395 103966062
ZJU: 107416869
CSV: 101208613
CMO: 103488135
MCHA: 111010936
CMAX: 111490364 111495534
CMOS: 111434104 111456937
CPEP: 111783375 111801684
RCU: 8266532
JCU: 105636880
HBR: 110637865 110646641 110646646
MESC: 110618138
POP: 7470811
PEU: 105116256 105141261
JRE: 108986907
QSU: 111995470 112007104 112033231
VVI: 100256664
SLY: 778355(DDB1)
SPEN: 107011170
SOT: 102579151
CANN: 107856556 107867065 107869427
NTA: 107763306 107797933
NSY: 104249289
NTO: 104084911
NAU: 109218520 109225064
INI: 109174939 109185088
SIND: 105167273 105175777
OEU: 111370491 111397877
HAN: 110911784 110936969
LSV: 111880704
CCAV: 112503889
DCR: 108199412
BVG: 104901181
SOE: 110799010
CQI: 110685431 110692623
NNU: 104590707 104607867
PSOM: 113279444 113290118
OSA: 4339794
DOSA: Os05t0592400-01(Os05g0592400)
OBR: 102699310
BDI: 100826348 100841631
ATS: 109764431(LOC109764431)
SBI: 8066563
ZMA: 100279448 103635427
SITA: 101762805
PDA: 103696820
EGU: 105033280 105059787
MUS: 103993621
DCT: 110104920
PEQ: 110039296
AOF: 109825984
ATR: 18423529
SMO: SELMODRAFT_145521(DDB1-1) SELMODRAFT_151061(DDB1-2)
PPP: 112286784 112292408
CRE: CHLREDRAFT_133572(DDB1)
VCN: VOLCADRAFT_40179(ddb1)
MNG: MNEG_2408
CSL: COCSUDRAFT_28729
CVR: CHLNCDRAFT_29381
APRO: F751_3719
OLU: OSTLU_26305
OTA: OT_ostta10g03360
BPG: Bathy11g03760
MIS: MICPUN_97627
MPP: MICPUCDRAFT_50560
CME: CYME_CMR264C
GSL: Gasu_15950
CCP: CHC_T00002851001
YLI: YALI0E00506g
SLB: AWJ20_637
NCR: NCU06605(dim-8)
NTE: NEUTE1DRAFT145059(NEUTE1DRAFT_145059)
SMP: SMAC_04731
PAN: PODANSg7535
TTT: THITE_2114471
MTM: MYCTH_2310607
CTHR: CTHT_0036510
MGR: MGG_16867
TMN: UCRPA7_3405
SSCK: SPSK_08361
FGR: FGSG_05252
FPU: FPSE_07241
FVR: FVEG_06222
FOX: FOXG_08454
NHE: NECHADRAFT_33709
TRE: TRIREDRAFT_56582
TRR: M419DRAFT_33415
MAW: MAC_01259
MAJ: MAA_06283
CMT: CCM_07224
PLJ: VFPFJ_06385
VAL: VDBG_01185
VDA: VDAG_00787
CFJ: CFIO01_07795
SAPO: SAPIO_CDS7528
ELA: UCREL1_11438
PFY: PFICI_04895
SSL: SS1G_08368
BFU: BCIN_12g03580
MBE: MBM_03262
PSCO: LY89DRAFT_646785
GLZ: GLAREA_01872
ANI: AN0596.2
AFM: AFUA_6G10980
ACT: ACLA_084670
NFI: NFIA_056720
AOR: AO090023000521
ANG: ANI_1_2152074(An08g07830)
AFV: AFLA_109360
PCS: Pc21g20880
PDP: PDIP_39260
TMF: PMAA_052550
TRG: TRUGW13939_00126
CIM: CIMG_00036
CPW: CPC735_060770
PBL: PAAG_03979
PBN: PADG_03467
URE: UREG_00164
ABE: ARB_07875
TVE: TRV_06556
AJE: HCAG_01094
BGH: BDBG_06545
PNO: SNOG_08717
PTE: PTT_17772
BZE: COCCADRAFT_8611
BSC: COCSADRAFT_32431
BOR: COCMIDRAFT_81195
AALT: CC77DRAFT_1050348
ZTR: MYCGRDRAFT_87400
PFJ: MYCFIDRAFT_43692
BCOM: BAUCODRAFT_116696
NPA: UCRNP2_5027
TML: GSTUM_00004371001
SPO: SPAC17H9.10c(ddb1)
CNE: CNG03940
CNB: CNBG0790
CGI: CGB_G1120W
TMS: TREMEDRAFT_71141
TASA: A1Q1_04103
TVS: TRAVEDRAFT_167065
DSQ: DICSQDRAFT_153890
PCO: PHACADRAFT_181065
SHS: STEHIDRAFT_121882
HIR: HETIRDRAFT_317594
PSQ: PUNSTDRAFT_97523
ADL: AURDEDRAFT_112250
FME: FOMMEDRAFT_162310
GTR: GLOTRDRAFT_116530
LBC: LACBIDRAFT_309027
MPR: MPER_03361
MRR: Moror_15743
CCI: CC1G_02971
ABP: AGABI1DRAFT39860(AGABI1DRAFT_39860)
ABV: AGABI2DRAFT72896(AGABI2DRAFT_72896)
CPUT: CONPUDRAFT_56293
SLA: SERLADRAFT_449959
WSE: WALSEDRAFT_33953
WIC: J056_001934
UMA: UMAG_10604
PFP: PFL1_04001
MGL: MGL_2753
MRT: MRET_1757
MSYM: MSY001_0110
PGR: PGTG_22575
MLR: MELLADRAFT_105631
MBR: MONBRDRAFT_31124
SRE: PTSG_00286
DDI: DDB_G0286013(repE)
DPP: DICPUDRAFT_86223
DFA: DFA_05237(repE)
EHI: EHI_194860(70.t00005)
EDI: EDI_287870
EIV: EIN_176300 EIN_369480
TAN: TA19595
TPV: TP01_0243
TOT: TOT_010000226
BEQ: BEWA_032110
BBO: BBOV_IV005010(23.m06420)
BMIC: BMR1_02g00665
CPV: cgd1_2840
CHO: Chro.10318
TET: TTHERM_00197810
PTI: PHATRDRAFT_29502(DDB1)
FCY: FRACYDRAFT_135945(DDB1_1)
TPS: THAPSDRAFT_2182
AAF: AURANDRAFT_72671
PIF: PITG_01737
PSOJ: PHYSODRAFT_259403
SPAR: SPRG_04038
EHX: EMIHUDRAFT_427214 EMIHUDRAFT_429357
GTT: GUITHDRAFT_143370 GUITHDRAFT_158867
NGR: NAEGRDRAFT_82942
TVA: TVAG_094790 TVAG_130320 TVAG_198760 TVAG_353390
 » show all
Reference
  Authors
Wang H, Zhai L, Xu J, Joo HY, Jackson S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Xiong Y, Zhang Y
  Title
Histone H3 and H4 ubiquitylation by the CUL4-DDB-ROC1 ubiquitin ligase facilitates cellular response to DNA damage.
  Journal
Mol Cell 22:383-94 (2006)
DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.035
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
  Authors
Lovejoy CA, Lock K, Yenamandra A, Cortez D
  Title
DDB1 maintains genome integrity through regulation of Cdt1.
  Journal
Mol Cell Biol 26:7977-90 (2006)
DOI:10.1128/MCB.00819-06
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
  Authors
Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H
  Title
CUL4-DDB1 ubiquitin ligase interacts with multiple WD40-repeat proteins and regulates histone methylation.
  Journal
Nat Cell Biol 8:1277-83 (2006)
DOI:10.1038/ncb1490
  Sequence
[hsa:1642]
Reference
PMID:8530102
  Authors
Dualan R, Brody T, Keeney S, Nichols AF, Admon A, Linn S
  Title
Chromosomal localization and cDNA cloning of the genes (DDB1 and DDB2) for the p127 and p48 subunits of a human damage-specific DNA binding protein.
  Journal
Genomics 29:62-9 (1995)
DOI:10.1006/geno.1995.1215
  Sequence
[hsa:1642]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system