KEGG   ORTHOLOGY: K12812
Entry
K12812                      KO                                     
Symbol
DDX39B, UAP56, SUB2
Name
ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2 [EC:3.6.4.13]
Pathway
map03013  Nucleocytoplasmic transport
map03015  mRNA surveillance pathway
map03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
  09122 Translation
   03013 Nucleocytoplasmic transport
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
   03041 Spliceosome
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.6  Acting on acid anhydrides
   3.6.4  Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
    3.6.4.13  RNA helicase
     K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
 Other splicing related proteins
  Spliceosome associated proteins (SAPs)
   TREX complex
    K12812  DDX39B, UAP56, SUB2; ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
Other DBs
COG: COG0513
GO: 0003724
TC: 3.A.18.1 3.A.22.1
Genes
HSA: 7919(DDX39B)
PTR: 463180(DDX39B)
PPS: 100978005(DDX39B)
GGO: 101147472(DDX39B)
PON: 100174561(DDX39B)
NLE: 100583305(DDX39B)
MCC: 715233(DDX39B)
MCF: 101865332(DDX39B)
CSAB: 103221767(DDX39B)
CATY: 105573466(DDX39B)
TGE: 112623648(DDX39B)
RRO: 104661907(DDX39B)
RBB: 108520224(DDX39B)
TFN: 117086922(DDX39B)
PTEH: 111523937(DDX39B)
CJC: 100395064(DDX39B)
SBQ: 101036182 101038331(DDX39B)
CSYR: 103270145(DDX39B)
MMUR: 105858134(DDX39B)
OGA: 100941553 100960360(DDX39B)
MMU: 53817(Ddx39b)
MCAL: 110284033(Ddx39b)
MPAH: 110335531(Ddx39b)
RNO: 114612(Ddx39b)
MCOC: 116074610(Ddx39b)
MUN: 110560125(Ddx39b)
CGE: 100752504 100773161(Ddx39b)
PLEU: 114705798(Ddx39b)
NGI: 103724455(Ddx39b)
HGL: 101719937(Ddx39b)
CPOC: 100723839(Ddx39b)
CCAN: 109690379(Ddx39b)
DORD: 105996855 105996861(Ddx39b)
DSP: 122111063(Ddx39b)
NCAR: 124988113
OCU: 100349333(DDX39B)
OPI: 101526853(DDX39B)
TUP: 102495885(DDX39B)
CFA: 474839(DDX39B)
VVP: 112913587(DDX39B)
VLG: 121495108(DDX39B)
AML: 100466125(DDX39B)
UMR: 103682342(DDX39B)
UAH: 113243707(DDX39B)
UAR: 123791021(DDX39B)
ELK: 111152256
LLV: 125102161
MPUF: 101689626(DDX39B)
ORO: 101366446(DDX39B)
EJU: 114222240(DDX39B)
ZCA: 113927732(DDX39B)
MLX: 118027348(DDX39B)
FCA: 101083847(DDX39B)
PYU: 121022355(DDX39B) 121029245
PBG: 122478280(DDX39B) 122489600
PTG: 102960336(DDX39B)
PPAD: 109260530(DDX39B)
AJU: 106975939(DDX39B)
HHV: 120221910(DDX39B)
BTA: 540191(DDX39B)
BOM: 102276014(DDX39B)
BIU: 109577017(DDX39B)
BBUB: 102392707(DDX39B)
CHX: 102188099(DDX39B)
OAS: 101101929(DDX39B)
ODA: 120870530(DDX39B)
CCAD: 122429506(DDX39B)
SSC: 448813(DDX39B)
CFR: 102505253(DDX39B)
CBAI: 105074079(DDX39B)
CDK: 105087521(DDX39B)
VPC: 102540600(DDX39B)
BACU: 103007450(DDX39B)
LVE: 103084702(DDX39B)
OOR: 101271173(DDX39B)
DLE: 111170655(DDX39B)
PCAD: 102984110(DDX39B)
PSIU: 116761821(DDX39B)
ECB: 100146384(DDX39B)
EPZ: 103562464(DDX39B)
EAI: 106825031(DDX39B)
MYB: 102249384(DDX39B)
MYD: 102757850(DDX39B)
MMYO: 118679556(DDX39B)
MLF: 102438883(DDX39B)
MNA: 107538986(DDX39B)
PKL: 118716975(DDX39B)
HAI: 109373086(DDX39B)
DRO: 112302071(DDX39B)
SHON: 118987588(DDX39B)
AJM: 119053712(DDX39B)
PDIC: 114493793(DDX39B)
PHAS: 123810399(DDX39B)
MMF: 118620915(DDX39B)
RFQ: 117020872(DDX39B)
PALE: 102888540(DDX39B)
PGIG: 120618945(DDX39B)
PVP: 105305330(DDX39B)
RAY: 107498472(DDX39B)
MJV: 108397854(DDX39B)
TOD: 119252196(DDX39B)
SARA: 101557310(DDX39B)
LAV: 100663194(DDX39B)
TMU: 101341139
DNM: 101421761(DDX39B)
GAS: 123245094(DDX39B)
SHR: 100921090(DDX39B)
PCW: 110199293(DDX39B)
OAA: 100086055(DDX39B)
LSR: 110483887
PHI: 102100396
CLV: 102097797
NPD: 112956989(DDX39B)
ASN: 102378570(DDX39B)
AMJ: 102570178(DDX39A)
CMY: 102935352
CPIC: 101937703(DDX39B)
CABI: 116829895
MRV: 120392340(DDX39B)
ACS: 100553235(ddx39b)
PVT: 110088695(DDX39B)
SUND: 121922300(DDX39B)
PBI: 103060002(DDX39B)
PMUR: 107298255(DDX39B)
TSR: 106544275
PGUT: 117667862(DDX39B)
VKO: 123018000(DDX39B)
PMUA: 114592065(DDX39B)
ZVI: 118081041(DDX39B)
GJA: 107119902(DDX39B)
XLA: 447706(ddx39b.L)
XTR: 394669(ddx39b)
NPR: 108793752(DDX39B)
RTEM: 120913263(DDX39B)
BBUF: 121009219(DDX39B)
BGAR: 122946245(DDX39B)
DRE: 393917(ddx39b)
CCAR: 109098418
CAUA: 113090831
PPRM: 120485165(ddx39b)
IPU: 108272881(ddx39b)
PHYP: 113543696
SMEO: 124381969(ddx39b)
TFD: 113634769(ddx39b)
AMEX: 103042292
EEE: 113590327
LCO: 104931065
PLEP: 121957540(ddx39b)
MZE: 101463626
ONL: 100711348
OAU: 116324361(ddx39b)
LCF: 108896383
SDU: 111220864
XGL: 120786540(ddx39b) 120787279
SASA: 100194897(uap56)
OTW: 112264312(ddx39b)
OGO: 124012549(ddx39b)
ONE: 115128831
SALP: 112068840
SNH: 120022275(ddx39b)
ELS: 105012335
SFM: 108935641
PKI: 111842831
AANG: 118233383(ddx39b)
PSPA: 121304397(ddx39b)
ARUT: 117433968(ddx39b)
LCM: 102360471(DDX39B)
CMK: 103189099
RTP: 109919153
BFO: 118420743
BBEL: 109484662
CIN: 100182155
SCLV: 120344944
SPU: 580001
APLC: 110984794
SKO: 100376228(BAT1)
DME: Dmel_CG7269(Hel25E)
DER: 6542263
DSE: 6613492
DSI: Dsimw501_GD11981(Dsim_GD11981)
DYA: Dyak_GE18993(Dyak_Hel25E)
DAN: 6497567
DSR: 110187406
DPE: 6593703
DMN: 108161830
DGR: 6562731
DAZ: 108611823
DNV: 108657674
DHE: 111599200
DVI: 6628034
MDE: 101896679
SCAC: 106083074
LCQ: 111686976
ACOZ: 120957484
AARA: 120900567
AAG: 5569076
AALB: 109421659
CPII: 120413862
AME: 552515
ACER: 107992644
ALAB: 122716322
BIM: 100748363
BBIF: 117204768
BVK: 117230183
BVAN: 117163683
BTER: 100651252
BPYO: 122571132
CCAL: 108630676
OBB: 114878364
MGEN: 117224195
NMEA: 116432630
CGIG: 122397045
SOC: 105199620
MPHA: 105829649
AEC: 105151634
ACEP: 105617456
PBAR: 105428547
VEM: 105559299
HST: 105189449
DQU: 106743497
CFO: 105252347
FEX: 115233425
LHU: 105677870
PGC: 109854415
PCF: 106789801
PFUC: 122519610
VPS: 122637637
CSOL: 105365779
MDL: 103569806
CGLO: 123259232
FAS: 105266953
DAM: 107041565
AGIF: 122851505
CCIN: 107271915
TCA: 662877
DPA: 109542510
SOY: 115884526
ATD: 109596377
CSET: 123310767
AGB: 108914772
NVL: 108566004
APLN: 108736601
PPYR: 116172737
OTU: 111414668
BMOR: 101741115
BMAN: 114243661
BANY: 112050704
PMAC: 106721752
PPOT: 106107214
PXU: 106117591
PRAP: 111002950
ZCE: 119833546
HAW: 110373640
TNL: 113494550
SLIU: 111360259
OFU: 114360791
PXY: 105392786
API: 100161938
DNX: 107172068
AGS: 114128333
RMD: 113559380
BTAB: 109042156
DCI: 103514355
CLEC: 106668351
HHAL: 106680240
FOC: 113213124
ZNE: 110834555
CSEC: 111869466
FCD: 110854389
DMK: 116916451
PJA: 122259369
PCHN: 125036852
HAME: 121857079
PCLA: 123759021
PTRU: 123509212
HAZT: 108676291
VDE: 111243436
VJA: 111263559
TUT: 107366055
DFR: 124496944
CSCU: 111628615
PTEP: 107436222
SDM: 118202471
CEL: CELE_C26D10.2(hel-1)
CBR: CBG_00694(Cbr-hel-1)
BMY: BM_BM13698(Bma-hel-1)
PCAN: 112574665
BGT: 106066765
GAE: 121384637
HRF: 124144772
HRJ: 124278826
MYI: 110460800
MMER: 123555802
OBI: 106879226
EGL: EGR_06510
NVE: 5515330
EPA: 110246420
ATEN: 116303995
ADF: 107337901
AMIL: 114953048
PDAM: 113671657
SPIS: 111345222
DGT: 114530375
XEN: 124439553
HMG: 100198798
AQU: 100633956
ATH: AT5G11170(UAP56a) AT5G11200(UAP56b)
CPAP: 110826217
CIT: 102618350
PVY: 116132318
LJA: Lj0g3v0209329.1(Lj0g3v0209329.1) Lj1g3v1911750.1(Lj1g3v1911750.1)
CSV: 101217346
CMO: 103488306
BHJ: 120075711
MCHA: 111004723
PEU: 105136165
BVG: 104908615
DOSA: Os01t0549700-01(Os01g0549700) Os01t0550000-01(Os01g0550000)
ATR: 18443738
MNG: MNEG_0605
APRO: F751_4937
SCE: YDL084W(SUB2)
SEUB: DI49_0984
ERC: Ecym_6049
KMX: KLMA_10698(SUB2)
NDI: NDAI_0E01750(NDAI0E01750)
TPF: TPHA_0G02050(TPHA0G02050) TPHA_0G02585(TPHA0G02585)
TBL: TBLA_0B08880(TBLA0B08880) TBLA_0B09205(TBLA0B09205)
TDL: TDEL_0G03140(TDEL0G03140)
KAF: KAFR_0F02940(KAFR0F02940)
KNG: KNAG_0A05850(KNAG0A05850)
PIC: PICST_83587(SUB2)
CAL: CAALFM_C400220CA(SUB2)
SLB: AWJ20_755(SUB2)
BNN: FOA43_003653(SUB2)
BBRX: BRETT_004513(SUB2)
NCR: NCU09076
NTE: NEUTE1DRAFT118432(NEUTE1DRAFT_118432)
MGR: MGG_02806
SSCK: SPSK_09125
MAW: MAC_00905
MAJ: MAA_03855
CMT: CCM_03173
BFU: BCIN_09g03410(Bcsub2)
MBE: MBM_07342
ANI: AN8722.2
ANG: ANI_1_978104(An12g08030)
ALUC: AKAW2_61162A(SUB2)
ACHE: ACHE_50852A(SUB2)
APUU: APUU_10461A(SUB2)
ABE: ARB_01808
TVE: TRV_03502
PTE: PTT_01995
SPO: SPAC17G6.14c(uap56)
CNE: CNA07200
CNB: CNBA7000
MORE: E1B28_009871(SUB2)
ABP: AGABI1DRAFT110279(AGABI1DRAFT_110279)
ABV: AGABI2DRAFT189825(AGABI2DRAFT_189825)
MGL: MGL_3192
MRT: MRET_2163
DDI: DDB_G0269932(uap56)
DFA: DFA_04265(uap56)
EHI: EHI_036900(283.t00009) EHI_150160 EHI_151600(22.t00040)
PCB: PCHAS_030900(PC000062.03.0)
TAN: TA04190
TPV: TP03_0373
BBO: BBOV_IV002750(21.m02887)
CPV: cgd8_3900
TGO: TGME49_216860(DDX39)
SMIN: v1.2.018841.t1(symbB.v1.2.018841.t1) v1.2.018842.t1(symbB.v1.2.018842.t1) v1.2.029637.t1(symbB.v1.2.029637.t1) v1.2.029637.t3(symbB.v1.2.029637.t3)
PTI: PHATRDRAFT_51301(helicase_5)
SPAR: SPRG_06983
 » show all
Reference
  Authors
Luo ML, Zhou Z, Magni K, Christoforides C, Rappsilber J, Mann M, Reed R
  Title
Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly.
  Journal
Nature 413:644-7 (2001)
DOI:10.1038/35098106
  Sequence
[hsa:7919]
Reference
  Authors
Boyne JR, Colgan KJ, Whitehouse A
  Title
Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication.
  Journal
PLoS Pathog 4:e1000194 (2008)
DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
  Sequence
[hsa:7919]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system