KEGG   ORTHOLOGY: K12828
Entry
K12828                      KO                                     

Name
SF3B1, SAP155
Definition
splicing factor 3B subunit 1
Pathway
ko03040  Spliceosome
Disease
H01481  Myelodysplastic syndrome
H02410  Myelodysplastic/myeloproliferative neoplasms
H02411  Chronic myelomonocytic leukemia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
   03036 Chromosome and associated proteins
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U2 snRNP components
   U2 snRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 Complex B
  U2 snRNP components
   U2 snRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 Complex C
  U2 snRNP components
   U2 SnRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Chromatin remodeling factors
   B-WICH complex
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Genes
HSA: 23451(SF3B1)
PTR: 459850(SF3B1)
PPS: 100981355(SF3B1)
GGO: 101147191(SF3B1)
PON: 100454388(SF3B1)
NLE: 100604147(SF3B1)
MCC: 697773(SF3B1)
CSAB: 103217582(SF3B1)
RRO: 104676745(SF3B1)
RBB: 108527831(SF3B1)
CJC: 100413687(SF3B1)
SBQ: 101042346(SF3B1)
MMU: 81898(Sf3b1)
MCAL: 110295228(Sf3b1)
RNO: 84486(Sf3b1)
MUN: 110551637(Sf3b1)
CGE: 100772265(Sf3b1)
NGI: 103746171(Sf3b1)
HGL: 101707227(Sf3b1)
CCAN: 109681925(Sf3b1)
OCU: 100348734(SF3B1)
TUP: 102502823(SF3B1)
CFA: 488456(SF3B1)
VVP: 112922903(SF3B1)
AML: 100477819(SF3B1)
UMR: 103659709(SF3B1)
UAH: 113250629(SF3B1)
ORO: 101376277(SF3B1)
ELK: 111145177
FCA: 101088016(SF3B1)
PTG: 102960594(SF3B1)
PPAD: 109254431(SF3B1)
AJU: 106979985(SF3B1)
BTA: 510177(SF3B1)
BOM: 102281418(SF3B1)
BIU: 109568995(SF3B1)
BBUB: 102404293(SF3B1)
CHX: 102171199(SF3B1)
OAS: 101121573(SF3B1)
SSC: 100157887(SF3B1)
CFR: 102507112(SF3B1)
CDK: 105088803(SF3B1)
BACU: 103015163(SF3B1)
LVE: 103074457(SF3B1)
OOR: 101290341(SF3B1)
DLE: 111171690(SF3B1)
PCAD: 102974416(SF3B1)
ECB: 100070506(SF3B1)
EPZ: 103549675(SF3B1)
EAI: 106834365(SF3B1)
MYB: 102259725(SF3B1)
MYD: 102770688(SF3B1)
MNA: 107542376(SF3B1)
HAI: 109379214(SF3B1)
DRO: 112307661(SF3B1)
PALE: 102890521(SF3B1)
RAY: 107503139(SF3B1)
MJV: 108398696(SF3B1)
LAV: 100665858(SF3B1)
TMU: 101357717
MDO: 100022236(SF3B1)
SHR: 100916978(SF3B1)
PCW: 110213243(SF3B1)
OAA: 100087263(SF3B1)
GGA: 424056(SF3B1)
MGP: 100547422(SF3B1)
CJO: 107316344(SF3B1)
NMEL: 110399413(SF3B1)
APLA: 101804459(SF3B1)
ACYG: 106039958(SF3B1)
TGU: 100230975(SF3B1)
LSR: 110484613(SF3B1)
SCAN: 103814733(SF3B1)
GFR: 102035041(SF3B1)
FAB: 101806296(SF3B1)
PHI: 102108134(SF3B1)
PMAJ: 107207637(SF3B1)
CCAE: 111931712(SF3B1)
CCW: 104694136(SF3B1)
FPG: 101917144(SF3B1)
FCH: 102046437(SF3B1)
CLV: 102090349(SF3B1)
EGZ: 104130485(SF3B1)
NNI: 104010250(SF3B1)
ACUN: 113482067(SF3B1)
PADL: 103924323(SF3B1)
AAM: 106492421(SF3B1)
ASN: 102374184(SF3B1)
AMJ: 102562721(SF3B1)
PSS: 102457188(SF3B1)
CMY: 102934076(SF3B1)
CPIC: 101948208(SF3B1)
ACS: 100559157(sf3b1)
PVT: 110079902(SF3B1)
PBI: 103058019(SF3B1)
PMUR: 107284912(SF3B1)
TSR: 106538305(SF3B1)
PMUA: 114608017(SF3B1)
GJA: 107124750(SF3B1)
XLA: 108701497(sf3b1.L) 399336(sf3b1.S)
XTR: 100127558(sf3b1)
NPR: 108804426(SF3B1)
DRE: 446117(sf3b1)
IPU: 108266286(sf3b1)
PHYP: 113526243(sf3b1)
AMEX: 103043813(sf3b1)
EEE: 113587562(sf3b1)
TRU: 101077688(sf3b1)
LCO: 104932521(sf3b1)
NCC: 104953348
MZE: 101471054(sf3b1)
ONL: 100696218(sf3b1)
OLA: 101159486(sf3b1)
XMA: 102230809(sf3b1)
XCO: 114148909(sf3b1)
PRET: 103481892(sf3b1)
CVG: 107095705(sf3b1)
NFU: 107389572(sf3b1)
KMR: 108238829(sf3b1)
ALIM: 106530753(sf3b1)
AOCE: 111583816(sf3b1)
CSEM: 103391643(sf3b1)
POV: 109640918(sf3b1)
SDU: 111218216(sf3b1)
SLAL: 111659580(sf3b1)
HCQ: 109519970(sf3b1)
BPEC: 110170663(sf3b1)
MALB: 109972678(sf3b1)
SASA: 100380860(sf3b1) 106586372
SALP: 111959884
ELS: 105016281(sf3b1)
SFM: 108926501(sf3b1)
PKI: 111840701(sf3b1)
LCM: 102350600(SF3B1)
CMK: 103182886(sf3b1)
RTP: 109920971(sf3b1)
BFO: 118424524
CIN: 100176532
SPU: 590531
APLC: 110983771
SKO: 100377153
DME: Dmel_CG2807(Sf3b1)
DER: 6541409
DSE: 6617274
DSI: Dsimw501_GD28712(Dsim_GD28712)
DAN: 6497839
DSR: 110178165
DPE: 6589591
DMN: 108162763
DWI: 6644173
DAZ: 108611528
DNV: 115561978
DHE: 111599212
DVI: 6628195
MDE: 101891132
LCQ: 111680531
AAG: 5578620
AME: 551331
BIM: 100748439
BTER: 100650395
CCAL: 108625374
OBB: 114871708
SOC: 105200232
MPHA: 105829750
AEC: 105149471
ACEP: 105626699
PBAR: 105432908
VEM: 105557974
CFO: 105250265
PGC: 109854754
OBO: 105286713
PCF: 106786132
CSOL: 105359668
MDL: 103579785
TCA: 660131
DPA: 109541999
ATD: 109600820
NVL: 108565710
BMOR: 101738436
BMAN: 114251214
PMAC: 106709061
PRAP: 110992683
HAW: 110369983
PXY: 105384929
API: 100161993
DNX: 107162505
AGS: 114131452
RMD: 113560301
BTAB: 109044141
CLEC: 106667738
ZNE: 110840729
FCD: 110845481
PVM: 113805753
TUT: 107368253
CSCU: 111612957
PTEP: 107451307
CEL: CELE_T08A11.2(sftb-1)
CBR: CBG21228
BMY: Bm1_54945
TSP: Tsp_00780
PCAN: 112565270
CRG: 105333111
MYI: 110459526
OBI: 106875096
LAK: 106176064
SHX: MS3_10303
EGL: EGR_07151
NVE: 5514800
EPA: 110254764
ADF: 107356364
AMIL: 114965239
PDAM: 113665426
SPIS: 111326198
DGT: 114525998
HMG: 100205901 100209738(sf3b1)
AQU: 100636997
ATH: AT5G64270
ALY: 9300968
THJ: 104799861
CIT: 102613662
TCC: 18608254
GRA: 105762726
GAB: 108479188
DZI: 111295361
EGR: 104419891
GMX: 100810599
VRA: 106775636
VAR: 108342822
VUN: 114187929
CCAJ: 109812694
CAM: 101490836
LJA: Lj6g3v2204780.1(Lj6g3v2204780.1) Lj6g3v2204790.1(Lj6g3v2204790.1) Lj6g3v2204790.2(Lj6g3v2204790.2)
AIP: 107621579
LANG: 109345663
PPER: 18767238
PMUM: 103336029
PAVI: 110747420
PXB: 103927772
ZJU: 107404103
CSV: 101213260
CMO: 103501154
MCHA: 111011453
RCU: 8282974
JCU: 105631598
HBR: 110649464
MESC: 110625049
VVI: 100243186
SLY: 101252641
SPEN: 107002044
SOT: 102582680
CANN: 107843751
NTA: 107769132
NSY: 104224074
NTO: 104101026
NAU: 109233095
INI: 109181539
OEU: 111388623
LSV: 111912055
CCAV: 112520695
BVG: 104905458
NNU: 104598042
DOSA: Os02t0478900-00(Os02g0478900)
ATS: 109753399(LOC109753399) 109781233(LOC109781233)
SBI: 8069963
ZMA: 100277544
SITA: 101780167
PDA: 103719620
MUS: 103999839
DCT: 110108123
PEQ: 110031120
PPP: 112289069
APRO: F751_1586
SCE: YMR288W(HSH155)
KMX: KLMA_10479(HSH155)
NCS: NCAS_0F02230(NCAS0F02230)
NDI: NDAI_0C03570(NDAI0C03570)
TPF: TPHA_0A05400(TPHA0A05400)
TBL: TBLA_0C06730(TBLA0C06730)
TDL: TDEL_0G00700(TDEL0G00700)
KAF: KAFR_0B01550(KAFR0B01550)
CAL: CAALFM_C403150WA(CaO19.2675)
SLB: AWJ20_1633(HSH155)
NCR: NCU03042
NTE: NEUTE1DRAFT74055(NEUTE1DRAFT_74055)
MGR: MGG_00356
SSCK: SPSK_00668
MAW: MAC_08147
MAJ: MAA_04343
CMT: CCM_02233
MBE: MBM_01423
ANI: AN2420.2
ANG: ANI_1_746024(An02g05400)
ABE: ARB_04422
TVE: TRV_05356
PTE: PTT_09497
SPO: SPAC27F1.09c(prp10)
CNE: CNI01130
CNB: CNBH1080
TASA: A1Q1_06503
ABP: AGABI1DRAFT54902(AGABI1DRAFT_54902)
ABV: AGABI2DRAFT223074(AGABI2DRAFT_223074)
MGL: MGL_1549
MRT: MRET_3806
DDI: DDB_G0275957(sf3b1)
DFA: DFA_02244(sf3b1)
EHI: EHI_049170(902.t00001)
PCB: PCHAS_040800(PC000448.01.0)
TAN: TA03380
TPV: TP03_0212
BBO: BBOV_IV006950(23.m06336)
CPV: cgd6_4750
SMIN: v1.2.036956.t1(symbB.v1.2.036956.t1)
SPAR: SPRG_06763
 » show all
Reference
  Authors
Wang Q, He J, Lynn B, Rymond BC
  Title
Interactions of the yeast SF3b splicing factor.
  Journal
Mol Cell Biol 25:10745-54 (2005)
DOI:10.1128/MCB.25.24.10745-10754.2005
  Sequence
[sce:YMR288W]
Reference
  Authors
Visconte V, Makishima H, Jankowska A, Szpurka H, Traina F, Jerez A, O'Keefe C, Rogers HJ, Sekeres MA, Maciejewski JP, Tiu RV
  Title
SF3B1, a splicing factor is frequently mutated in refractory anemia with ring sideroblasts.
  Journal
Leukemia 26:542-5 (2012)
DOI:10.1038/leu.2011.232
  Sequence
[hsa:23451]
Reference
PMID:9837997
  Authors
Habara Y, Urushiyama S, Tani T, Ohshima Y
  Title
The fission yeast prp10(+) gene involved in pre-mRNA splicing encodes a homologue of highly conserved splicing factor, SAP155.
  Journal
Nucleic Acids Res 26:5662-9 (1998)
DOI:10.1093/nar/26.24.5662
  Sequence
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system