KEGG   ORTHOLOGY: K12828
Entry
K12828                      KO                                     

Name
SF3B1, SAP155
Definition
splicing factor 3B subunit 1
Pathway
ko03040  Spliceosome
Disease
H01481  Myelodysplastic syndrome
H02410  Myelodysplastic/myeloproliferative neoplasms
H02411  Chronic myelomonocytic leukemia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
   03036 Chromosome and associated proteins
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex A
  U2 snRNP components
   U2 snRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 Complex B
  U2 snRNP components
   U2 snRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
 Complex C
  U2 snRNP components
   U2 SnRNP specific factors
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Chromatin remodeling factors
   B-WICH complex
    K12828  SF3B1, SAP155; splicing factor 3B subunit 1
Genes
HSA: 23451(SF3B1)
PTR: 459850(SF3B1)
PPS: 100981355(SF3B1)
GGO: 101147191(SF3B1)
PON: 100454388(SF3B1)
NLE: 100604147(SF3B1)
MCC: 697773(SF3B1)
CSAB: 103217582(SF3B1)
RRO: 104676745(SF3B1)
RBB: 108527831(SF3B1)
CJC: 100413687(SF3B1)
SBQ: 101042346(SF3B1)
MMU: 81898(Sf3b1)
MCAL: 110295228(Sf3b1)
RNO: 84486(Sf3b1)
MUN: 110551637(Sf3b1)
CGE: 100772265(Sf3b1)
NGI: 103746171(Sf3b1)
HGL: 101707227(Sf3b1)
CCAN: 109681925(Sf3b1)
OCU: 100348734(SF3B1)
TUP: 102502823(SF3B1)
CFA: 488456(SF3B1)
VVP: 112922903(SF3B1)
AML: 100477819(SF3B1)
UMR: 103659709(SF3B1)
UAH: 113250629(SF3B1)
ORO: 101376277(SF3B1)
ELK: 111145177
FCA: 101088016(SF3B1)
PTG: 102960594(SF3B1)
PPAD: 109254431(SF3B1)
AJU: 106979985(SF3B1)
BTA: 510177(SF3B1)
BOM: 102281418(SF3B1)
BIU: 109568995(SF3B1)
BBUB: 102404293(SF3B1)
CHX: 102171199(SF3B1)
OAS: 101121573(SF3B1)
SSC: 100157887(SF3B1)
CFR: 102507112(SF3B1)
CDK: 105088803(SF3B1)
BACU: 103015163(SF3B1)
LVE: 103074457(SF3B1)
OOR: 101290341(SF3B1)
DLE: 111171690(SF3B1)
PCAD: 102974416(SF3B1)
ECB: 100070506(SF3B1)
EPZ: 103549675(SF3B1)
EAI: 106834365(SF3B1)
MYB: 102259725(SF3B1)
MYD: 102770688(SF3B1)
MNA: 107542376(SF3B1)
HAI: 109379214(SF3B1)
DRO: 112307661(SF3B1)
PALE: 102890521(SF3B1)
RAY: 107503139(SF3B1)
MJV: 108398696(SF3B1)
LAV: 100665858(SF3B1)
TMU: 101357717
MDO: 100022236(SF3B1)
SHR: 100916978(SF3B1)
PCW: 110213243(SF3B1)
OAA: 100087263(SF3B1)
GGA: 424056(SF3B1)
MGP: 100547422(SF3B1)
CJO: 107316344(SF3B1)
NMEL: 110399413(SF3B1)
APLA: 101804459(SF3B1)
ACYG: 106039958(SF3B1)
TGU: 100230975(SF3B1)
LSR: 110484613(SF3B1)
SCAN: 103814733(SF3B1)
GFR: 102035041(SF3B1)
FAB: 101806296(SF3B1)
PHI: 102108134(SF3B1)
PMAJ: 107207637(SF3B1)
CCAE: 111931712(SF3B1)
CCW: 104694136(SF3B1)
ETL: 114064964 114067097
FPG: 101917144(SF3B1)
FCH: 102046437(SF3B1)
CLV: 102090349(SF3B1)
EGZ: 104130485(SF3B1)
NNI: 104010250(SF3B1)
ACUN: 113482067(SF3B1)
PADL: 103924323(SF3B1)
AAM: 106492421(SF3B1)
ASN: 102374184(SF3B1)
AMJ: 102562721(SF3B1)
PSS: 102457188(SF3B1)
CMY: 102934076(SF3B1)
CPIC: 101948208(SF3B1)
ACS: 100559157(sf3b1)
PVT: 110079902(SF3B1)
PBI: 103058019(SF3B1)
PMUR: 107284912(SF3B1)
TSR: 106538305(SF3B1)
PMUA: 114608017(SF3B1)
GJA: 107124750(SF3B1)
XLA: 108701497(sf3b1.L) 399336(sf3b1.S)
XTR: 100127558(sf3b1)
NPR: 108804426(SF3B1)
DRE: 446117(sf3b1)
SRX: 107719800 107731751
SANH: 107659892 107690614
SGH: 107569635 107595847
CCAR: 109096741 109096742
IPU: 108266286(sf3b1)
PHYP: 113526243(sf3b1)
AMEX: 103043813(sf3b1)
EEE: 113587562(sf3b1)
TRU: 101077688(sf3b1)
LCO: 104932521(sf3b1)
NCC: 104953348
MZE: 101471054(sf3b1)
ONL: 100696218(sf3b1)
OLA: 101159486(sf3b1)
XMA: 102230809(sf3b1)
XCO: 114148909(sf3b1)
PRET: 103481892(sf3b1)
CVG: 107095705(sf3b1)
NFU: 107389572(sf3b1)
KMR: 108238829(sf3b1)
ALIM: 106530753(sf3b1)
AOCE: 111583816(sf3b1)
CSEM: 103391643(sf3b1)
POV: 109640918(sf3b1)
LCF: 108888228 108902463
SDU: 111218216(sf3b1)
SLAL: 111659580(sf3b1)
HCQ: 109519970(sf3b1)
BPEC: 110170663(sf3b1)
MALB: 109972678(sf3b1)
SASA: 100380860(sf3b1) 106586372
OTW: 112225611 112238182
SALP: 111959884
ELS: 105016281(sf3b1)
SFM: 108926501(sf3b1)
PKI: 111840701(sf3b1)
LCM: 102350600(SF3B1)
CMK: 103182886(sf3b1)
RTP: 109920971(sf3b1)
BFO: 118424524
CIN: 100176532
SPU: 590531
APLC: 110983771
SKO: 100377153
DME: Dmel_CG2807(Sf3b1)
DER: 6541409
DSE: 6617274
DSI: Dsimw501_GD28712(Dsim_GD28712)
DYA: Dyak_GE16924
DAN: 6497839
DSR: 110178165
DPO: Dpse_GA25844
DPE: 6589591
DMN: 108162763
DWI: 6644173
DGR: Dgri_GH11234
DMO: Dmoj_GI21788
DAZ: 108611528
DNV: 115561978
DHE: 111599212
DVI: 6628195
MDE: 101891132
LCQ: 111680531
AGA: AgaP_AGAP000178
AAG: 5578620
AALB: 109422144 115269054 115269056
CQU: CpipJ_CPIJ009000
AME: 551331
BIM: 100748439
BTER: 100650395
CCAL: 108625374
OBB: 114871708
SOC: 105200232
MPHA: 105829750
AEC: 105149471
ACEP: 105626699
PBAR: 105432908
VEM: 105557974
HST: 105183419 105191224
CFO: 105250265
LHU: 105675450 105675592
PGC: 109854754
OBO: 105286713
PCF: 106786132
NVI: 100116172 100118884
CSOL: 105359668
MDL: 103579785
TCA: 660131
DPA: 109541999
ATD: 109600820
NVL: 108565710
BMOR: 101738436
BMAN: 114251214
DPL: KGM_206070
PMAC: 106709061
PRAP: 110992683
HAW: 110369983
TNL: 113506978 113507005
PXY: 105384929
API: 100161993
DNX: 107162505
AGS: 114131452
RMD: 113560301
BTAB: 109044141
CLEC: 106667738
PHU: Phum_PHUM257230
ZNE: 110840729
FCD: 110845481
DPX: DAPPUDRAFT_328912
PVM: 113805753
ISC: IscW_ISCW009360
TUT: 107368253
DPTE: 113792073 113794483
CSCU: 111612957
PTEP: 107451307
CEL: CELE_T08A11.2(sftb-1)
CBR: CBG21228
BMY: Bm1_54945
LOA: LOAG_04581
NAI: NECAME_10398
TSP: Tsp_00780
HRO: HELRODRAFT_99392
LGI: LOTGIDRAFT_199416
PCAN: 112565270
CRG: 105333111
MYI: 110459526
OBI: 106875096
LAK: 106176064
SMM: Smp_141630.1
SHX: MS3_10303
OVI: T265_11882
EGL: EGR_07151
NVE: 5514800
EPA: 110254764
ADF: 107356364
AMIL: 114965239
PDAM: 113665426
SPIS: 111326198
DGT: 114525998
HMG: 100205901 100209738(sf3b1)
TAD: TRIADDRAFT_54034
AQU: 100636997
ATH: AT5G64270
ALY: 9300968
CRB: 17874545 17876156
CSAT: 104727056 104742317 104762582
EUS: EUTSA_v10005618mg EUTSA_v10024248mg
BRP: 103837520 103873845
BNA: 106351917 106357648 106366231 106366256 106426644 111197962 111204634
BOE: 106317504 106335107
RSZ: 108827433 108832938 108856636
THJ: 104799861
CIT: 102613662
CIC: CICLE_v10010658mg
TCC: 18608254
GRA: 105762726
GHI: 107929017 107929397
GAB: 108479188
DZI: 111295361
EGR: 104419891
GMX: 100810599
GSJ: 114376192 114387961
PVU: PHAVU_006G175600g
VRA: 106775636
VAR: 108342822
VUN: 114187929
CCAJ: 109812694
MTR: MTR_2g009110
CAM: 101490836
LJA: Lj6g3v2204780.1(Lj6g3v2204780.1) Lj6g3v2204790.1(Lj6g3v2204790.1) Lj6g3v2204790.2(Lj6g3v2204790.2)
ADU: 107468562 107492449
AIP: 107621579
LANG: 109345663
FVE: 101300014 101310199
RCN: 112164510 112170100
PPER: 18767238
PMUM: 103336029
PAVI: 110747420
MDM: 103405424 103426078
PXB: 103927772
ZJU: 107404103
CSV: 101213260
CMO: 103501154
MCHA: 111011453
CMAX: 111483105 111487765
CMOS: 111430650 111446900
CPEP: 111794039 111809929
RCU: 8282974
JCU: 105631598
HBR: 110649464
MESC: 110625049
POP: 7461262 7461689
PEU: 105138652 105140556
JRE: 109002782 109002786
QSU: 111993058 112013288
VVI: 100243186
SLY: 101252641
SPEN: 107002044
SOT: 102582680
CANN: 107843751
NTA: 107769132
NSY: 104224074
NTO: 104101026
NAU: 109233095
INI: 109181539
SIND: 105155788 105155793
OEU: 111388623
HAN: 110867545 110927298
LSV: 111912055
CCAV: 112520695
DCR: 108193128 108199316 108221539
BVG: 104905458
SOE: 110782993 110801030
CQI: 110686051 110714472 110721221 110721402
NNU: 104598042
PSOM: 113298019 113310873 113318041
OSA: 4328284 9272713
DOSA: Os02t0478900-00(Os02g0478900)
OBR: 102709141 102711597
BDI: 100835688 100839729
ATS: 109753399(LOC109753399) 109781233(LOC109781233)
SBI: 8069963
ZMA: 100277544
SITA: 101780167
PDA: 103719620
EGU: 105041847 105049293
MUS: 103999839
DCT: 110108123
PEQ: 110031120
AOF: 109840343 109841206
ATR: 18427098 18437831
SMO: SELMODRAFT_120055 SELMODRAFT_230130 SELMODRAFT_404013 SELMODRAFT_97336
PPP: 112289069
CRE: CHLREDRAFT_178803
VCN: VOLCADRAFT_30174
CSL: COCSUDRAFT_46613
CVR: CHLNCDRAFT_57029
APRO: F751_1586
OLU: OSTLU_14418
OTA: OT_ostta03g00270
BPG: Bathy14g00240
MIS: MICPUN_56819
MPP: MICPUCDRAFT_46481
CME: CYME_CMB002C
GSL: Gasu_46380
CCP: CHC_T00010088001
SCE: YMR288W(HSH155)
AGO: AGOS_ADR334W
KLA: KLLA0_A09537g
KMX: KLMA_10479(HSH155)
LTH: KLTH0B08866g
VPO: Kpol_1067p8
ZRO: ZYRO0D07678g
CGR: CAGL0M13475g
NCS: NCAS_0F02230(NCAS0F02230)
NDI: NDAI_0C03570(NDAI0C03570)
TPF: TPHA_0A05400(TPHA0A05400)
TBL: TBLA_0C06730(TBLA0C06730)
TDL: TDEL_0G00700(TDEL0G00700)
KAF: KAFR_0B01550(KAFR0B01550)
PPA: PAS_chr2-1_0418
DHA: DEHA2G21450g
PIC: PICST_83464
PGU: PGUG_00058
SPAA: SPAPADRAFT_53713
LEL: LELG_04570
CAL: CAALFM_C403150WA(CaO19.2675)
CTP: CTRG_00426
COT: CORT_0E04020
CDU: CD36_43000
CTEN: CANTEDRAFT_132347
YLI: YALI0B20724g
CLU: CLUG_01851
CLUS: A9F13_21g00121
CAUR: CJI97_004315
SLB: AWJ20_1633(HSH155)
PKZ: C5L36_0C11410
NCR: NCU03042
NTE: NEUTE1DRAFT74055(NEUTE1DRAFT_74055)
SMP: SMAC_00424
PAN: PODANSg4263
TTT: THITE_2112496
MTM: MYCTH_2297042
CTHR: CTHT_0003510
MGR: MGG_00356
TMN: UCRPA7_4032
SSCK: SPSK_00668
FGR: FGSG_07051
FPU: FPSE_02737
FVR: FVEG_08126
FOX: FOXG_01757
NHE: NECHADRAFT_100028
TRE: TRIREDRAFT_76191
TRR: M419DRAFT_96063
MAW: MAC_08147
MAJ: MAA_04343
CMT: CCM_02233
PLJ: VFPFJ_05232
VAL: VDBG_04723
VDA: VDAG_04264
CFJ: CFIO01_12645
SAPO: SAPIO_CDS3240
ELA: UCREL1_426
PFY: PFICI_02016
SSL: SS1G_03093
BFU: BCIN_06g06570
MBE: MBM_01423
PSCO: LY89DRAFT_604449
GLZ: GLAREA_00756
ANI: AN2420.2
AFM: AFUA_2G13780
ACT: ACLA_073860
NFI: NFIA_088960
AOR: AO090026000203
ANG: ANI_1_746024(An02g05400)
AFV: AFLA_137290
PCS: Pc12g12160
PDP: PDIP_78890
TMF: PMAA_052390
TRG: TRUGW13939_00109
CIM: CIMG_04653
CPW: CPC735_071590
PBL: PAAG_05722
PBN: PADG_07667
URE: UREG_01851
ABE: ARB_04422
TVE: TRV_05356
AJE: HCAG_04631
BGH: BDBG_04581
PNO: SNOG_04397
PTE: PTT_09497
BZE: COCCADRAFT_9776
BSC: COCSADRAFT_27554
BOR: COCMIDRAFT_523
AALT: CC77DRAFT_1012758
ZTR: MYCGRDRAFT_59333
PFJ: MYCFIDRAFT_216436
BCOM: BAUCODRAFT_539042
NPA: UCRNP2_4216
TML: GSTUM_00007642001
SPO: SPAC27F1.09c(prp10)
CNE: CNI01130
CNB: CNBH1080
CGI: CGB_H1660W
TMS: TREMEDRAFT_41430
TASA: A1Q1_06503
TVS: TRAVEDRAFT_168211
DSQ: DICSQDRAFT_53653
PCO: PHACADRAFT_130422
SHS: STEHIDRAFT_111150
HIR: HETIRDRAFT_453495
PSQ: PUNSTDRAFT_133314
ADL: AURDEDRAFT_114545
FME: FOMMEDRAFT_72009
GTR: GLOTRDRAFT_138213
LBC: LACBIDRAFT_182440
MRR: Moror_14093
CCI: CC1G_00913
SCM: SCHCODRAFT_67264
ABP: AGABI1DRAFT54902(AGABI1DRAFT_54902)
ABV: AGABI2DRAFT223074(AGABI2DRAFT_223074)
CPUT: CONPUDRAFT_83545
SLA: SERLADRAFT_410865
WSE: WALSEDRAFT_33406
WIC: J056_001050
UMA: UMAG_05241
PFP: PFL1_03225
MGL: MGL_1549
MRT: MRET_3806
MSYM: MSY001_2450
PGR: PGTG_10087
MLR: MELLADRAFT_35537
EIN: Eint_110770
EHE: EHEL_110780
ERO: EROM_110770
MBR: MONBRDRAFT_37521
SRE: PTSG_03123
DDI: DDB_G0275957(sf3b1)
DPP: DICPUDRAFT_96126
DFA: DFA_02244(sf3b1)
EHI: EHI_049170(902.t00001)
EDI: EDI_077080
EIV: EIN_016070
ACAN: ACA1_063380
PFA: PF3D7_0308900
PFD: PFDG_02788
PFH: PFHG_01088
PYO: PY17X_0409500
PCB: PCHAS_040800(PC000448.01.0)
PBE: PBANKA_0407100
PKN: PKH_083120
PVX: PVX_119560
PCY: PCYB_084050
TAN: TA03380
TPV: TP03_0212
TOT: TOT_030000637
BEQ: BEWA_050650
BBO: BBOV_IV006950(23.m06336)
BMIC: BMR1_03g04250
CPV: cgd6_4750
CHO: Chro.60546
TGO: TGME49_205010
TET: TTHERM_00529660
PTM: GSPATT00025933001 GSPATT00025934001 GSPATT00026110001
SMIN: v1.2.036956.t1(symbB.v1.2.036956.t1)
PTI: PHATRDRAFT_16704
FCY: FRACYDRAFT_209669
TPS: THAPSDRAFT_27556
AAF: AURANDRAFT_37713
PIF: PITG_06171
PSOJ: PHYSODRAFT_288446
SPAR: SPRG_06763
EHX: EMIHUDRAFT_447448
GTT: GUITHDRAFT_92227
TBR: Tb11.01.3690
TBG: TbgDal_XI13310
TCR: 508827.100
LMA: LMJF_28_2570
LIF: LINJ_28_2780
LDO: LDBPK_282780
LMI: LMXM_28_2570
LBZ: LBRM_28_2790
LPAN: LPMP_282740
NGR: NAEGRDRAFT_31740
TVA: TVAG_332520
 » show all
Reference
  Authors
Wang Q, He J, Lynn B, Rymond BC
  Title
Interactions of the yeast SF3b splicing factor.
  Journal
Mol Cell Biol 25:10745-54 (2005)
DOI:10.1128/MCB.25.24.10745-10754.2005
  Sequence
[sce:YMR288W]
Reference
  Authors
Visconte V, Makishima H, Jankowska A, Szpurka H, Traina F, Jerez A, O'Keefe C, Rogers HJ, Sekeres MA, Maciejewski JP, Tiu RV
  Title
SF3B1, a splicing factor is frequently mutated in refractory anemia with ring sideroblasts.
  Journal
Leukemia 26:542-5 (2012)
DOI:10.1038/leu.2011.232
  Sequence
[hsa:23451]
Reference
PMID:9837997
  Authors
Habara Y, Urushiyama S, Tani T, Ohshima Y
  Title
The fission yeast prp10(+) gene involved in pre-mRNA splicing encodes a homologue of highly conserved splicing factor, SAP155.
  Journal
Nucleic Acids Res 26:5662-9 (1998)
DOI:10.1093/nar/26.24.5662
  Sequence
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system