KEGG   ORTHOLOGY: K14398Help
Entry
K14398                      KO                                     

Name
CPSF6_7
Definition
cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6/7
Pathway
ko03015  mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14398  CPSF6_7; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6/7
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14398  CPSF6_7; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6/7
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Pre-mRNA cleavage factor Im (CFIm)
     K14398  CPSF6_7; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6/7
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 11052(CPSF6) 79869(CPSF7)
PTR: 451237(CPSF7) 452068(CPSF6)
PPS: 100976540(CPSF7) 100981252(CPSF6)
GGO: 101130692(CPSF7) 101131062(CPSF6)
PON: 100174771(CPSF6) 100438768(CPSF7)
NLE: 100589466(CPSF6) 100592819(CPSF7)
MCC: 693730(CPSF7) 718331(CPSF6)
MCF: 102132185(CPSF7) 102139103(CPSF6)
CSAB: 103234423(CPSF7) 103238693(CPSF6)
RRO: 104658665(CPSF6) 104679388(CPSF7)
RBB: 108533612(CPSF7) 108543543(CPSF6)
CJC: 100387773(CPSF7) 100393328(CPSF6)
SBQ: 101034002(CPSF6) 101049705(CPSF7)
MMU: 269061(Cpsf7) 432508(Cpsf6)
MCAL: 110285274(Cpsf7) 110303575(Cpsf6)
MPAH: 110316140(Cpsf7) 110326107(Cpsf6)
RNO: 299811(Cpsf6) 365407(Cpsf7)
MUN: 110548096(Cpsf7) 110552387(Cpsf6)
CGE: 100770766(Cpsf7) 100773290(Cpsf6)
NGI: 103729114(Cpsf7) 103745081(Cpsf6)
HGL: 101706514(Cpsf7) 101723861(Cpsf6)
CCAN: 109686499(Cpsf7) 109693332(Cpsf6)
OCU: 100340648(CPSF6) 100353973(CPSF7)
TUP: 102482209(CPSF6) 102488291 102496014(CPSF7)
CFA: 474441(CPSF6) 476066(CPSF7)
VVP: 112911082(CPSF7) 112922283(CPSF6)
AML: 100468772(CPSF7) 100482011(CPSF6)
UMR: 103656971(CPSF6) 103678163(CPSF7)
UAH: 113246928(CPSF7) 113256292(CPSF6)
ORO: 101368079(CPSF7) 101386991(CPSF6)
FCA: 101082092(CPSF7) 101101394(CPSF6)
PTG: 102955022(CPSF6) 102955653(CPSF7)
PPAD: 109246543(CPSF7) 109270488(CPSF6)
AJU: 106966356(CPSF6) 106977854(CPSF7)
BTA: 504925(CPSF7) 768231(CPSF6)
BOM: 102275860(CPSF7) 102280529(CPSF6)
BIU: 109554342(CPSF7) 109559242(CPSF6)
BBUB: 102411371(CPSF7) 102416580(CPSF6)
CHX: 102176671(CPSF7) 102186747(CPSF6)
OAS: 101107398(CPSF7) 101114513(CPSF6)
SSC: 100152191(CPSF6) 100519008(CPSF7)
CFR: 102504355(CPSF7) 102505660(CPSF6)
CDK: 105094881(CPSF7) 105101081(CPSF6)
BACU: 103007949(CPSF6) 103011217(CPSF7)
LVE: 103086286(CPSF7) 103087766(CPSF6)
OOR: 101272818(CPSF7) 101286748(CPSF6)
DLE: 111173758(CPSF6) 111183890(CPSF7)
PCAD: 102990353(CPSF7) 102996967(CPSF6)
ECB: 100059688(CPSF6) 100059747(CPSF7)
EPZ: 103557876(CPSF6) 103563963(CPSF7)
EAI: 106843577(CPSF6) 106847569(CPSF7)
MYB: 102241108 102257629(CPSF7) 102258940(CPSF6)
MYD: 102759837 102761432(CPSF7) 102774983(CPSF6)
MNA: 107526807(CPSF6) 107527689(CPSF7)
HAI: 109381675(CPSF6) 109390025(CPSF7)
DRO: 112317062(CPSF7) 112318969(CPSF6)
PALE: 102895116(CPSF6) 102896098(CPSF7)
RAY: 107504404(CPSF6) 107504754(CPSF7)
MJV: 108392386(CPSF7) 108403930(CPSF6)
LAV: 100653973(CPSF7) 100666041(CPSF6)
MDO: 100013834(CPSF6) 100027234(CPSF7)
SHR: 100919609(CPSF6) 100933435(CPSF7)
PCW: 110195479(CPSF7) 110211050(CPSF6)
OAA: 100080829(CPSF6) 100088460(CPSF7)
GGA: 417844(CPSF6) 426014(CPSF7)
MGP: 100547505(CPSF6) 100550951(CPSF7) 104910964
CJO: 107310481(CPSF6) 107314199(CPSF7)
NMEL: 110392794(CPSF6) 110401201(CPSF7)
APLA: 101791371(CPSF6)
ACYG: 106046943(CPSF6) 106048271(CPSF7)
TGU: 100220791(CPSF6) 100228658(CPSF7)
LSR: 110477993(CPSF6) 110484952(CPSF7)
SCAN: 103813677(CPSF6) 103822270(CPSF7)
GFR: 102037396(CPSF7) 102037707(CPSF6)
FAB: 101808852(CPSF7) 101809963(CPSF6)
PHI: 102100654(CPSF6) 102103631(CPSF7)
PMAJ: 107204177(CPSF6) 107205337(CPSF7)
CCAE: 111930397(CPSF7) 111937516(CPSF6) 111945912
CCW: 104684129(CPSF7) 104698467(CPSF6)
ETL: 114062157(CPSF6) 114063341(CPSF7)
FPG: 101917255(CPSF7) 101919564(CPSF6)
FCH: 102051227(CPSF6) 102056603(CPSF7)
CLV: 102086263(CPSF6) 102099052(CPSF7)
EGZ: 104125245(CPSF7) 104132948(CPSF6)
NNI: 104008937(CPSF7) 104011046(CPSF6)
ACUN: 113481040(CPSF7) 113489456(CPSF6)
PADL: 103920038(CPSF6)
AAM: 106488707(CPSF6) 106494865(CPSF7)
ASN: 102379529(CPSF7) 102385283(CPSF6)
AMJ: 102562174(CPSF6) 102566408(CPSF7)
PSS: 102446542(CPSF7) 102447076(CPSF6)
CMY: 102930952(CPSF6) 102933742(CPSF7)
CPIC: 101932948(CPSF7) 101937857(CPSF6)
ACS: 100553858(cpsf6) 103279655(cpsf7)
PBI: 103055485(CPSF7) 103062526(CPSF6)
PMUR: 107284406(CPSF6) 107287934(CPSF7)
TSR: 106545942(CPSF7) 106553823(CPSF6)
PMUA: 114600696(CPSF7) 114605043(CPSF6)
GJA: 107105704(CPSF6) 107121400(CPSF7)
XLA: 446580(cpsf6.S) 495008(cpsf7.L) 733279(cpsf6.L) 779278(MGC154500)
XTR: 548671(cpsf6) 779717(cpsf7)
NPR: 108794183(CPSF7) 108804568(CPSF6)
DRE: 327069(cpsf6)
SANH: 107658967(cpsf6)
IPU: 108271016(cpsf7) 108279487(cpsf6) 108279496
PHYP: 113524552(cpsf7)
AMEX: 103027160(cpsf7) 103041605(cpsf6)
EEE: 113569869(cpsf7) 113576553(cpsf6)
TRU: 101066960(cpsf6) 101070366(cpsf7)
LCO: 104919233(cpsf7) 104940538
NCC: 104962081 104962592(cpsf6)
MZE: 101470695(cpsf6) 101475201
ONL: 100697134(cpsf7) 100697945(cpsf6)
OLA: 101163450(cpsf6) 101164290(cpsf7)
XMA: 102223253(cpsf6) 102235230
XCO: 114143154 114161152(cpsf6)
PRET: 103459275(cpsf6) 103462427(cpsf7)
CVG: 107095993(cpsf6) 107102600(cpsf7)
NFU: 107381446(cpsf7) 107385179(cpsf6)
KMR: 108229754(cpsf7) 108235066(cpsf6)
ALIM: 106521793(cpsf6) 106530739(cpsf7)
AOCE: 111571443(cpsf6) 111574067 111574613(cpsf7)
CSEM: 103378756(cpsf7) 103382791(cpsf6)
POV: 109632822(cpsf6) 109636903(cpsf7)
LCF: 108889657(cpsf7) 108894952(cpsf6)
SDU: 111224530(cpsf6) 111238383(cpsf7)
SLAL: 111654824 111663652(cpsf6)
HCQ: 109514354 109520087(cpsf6)
BPEC: 110156005(cpsf6) 110173058
MALB: 109959792(cpsf6) 109964866(cpsf7)
ELS: 105022255(cpsf7) 105023121(cpsf6)
PKI: 111843115 111848014(cpsf7) 111851107(cpsf6)
LCM: 102353491(CPSF6) 102361222(CPSF7)
CMK: 103174848(cpsf7) 103182486 103185309(cpsf6)
CIN: 100178271
APLC: 110975391
SKO: 100372147
DME: Dmel_CG7185(Cpsf6)
DER: 6544770
DSI: Dsimw501_GD13000(Dsim_GD13000)
DSR: 110191083
DPE: 6599657
DMN: 108152739
DWI: 6639517
DAZ: 108613988
DNV: 108651410
DHE: 111601033
MDE: 101892287
LCQ: 111688762
AAG: 23687584
AALB: 109431672
AME: 551973
BIM: 100749581
BTER: 100651995
CCAL: 108625072
OBB: 114874428
SOC: 105207734
MPHA: 105833267
AEC: 105147354
ACEP: 105624752
PBAR: 105434093
VEM: 105570482
HST: 105187579
DQU: 106744922
CFO: 105251856
LHU: 105673114
PGC: 109864193
OBO: 105274840
PCF: 106787364
NVI: 100121979
CSOL: 105364547
MDL: 103570499
TCA: 658420
ATD: 109594981
NVL: 108559368
BMOR: 101740584
PMAC: 106711073
PRAP: 110996516
HAW: 110373282
DNX: 107163498
BTAB: 109032082
CLEC: 106664610
ZNE: 110828295
PVM: 113820848
TUT: 107361288
DPTE: 113790258
CEL: CELE_D1046.1(cfim-2)
CBR: CBG21723
BMY: Bm1_51470
TSP: Tsp_02745
PCAN: 112558516
MYI: 110440991
OBI: 106876145
EGL: EGR_01552
EPA: 110233224
AMIL: 114951149
PDAM: 113664788
SPIS: 111320403
DGT: 114533391
HMG: 100200279
AQU: 100639441
CPAP: 110817120
EGR: 104450422
LJA: Lj6g3v0753090.1(Lj6g3v0753090.1) Lj6g3v0753090.2(Lj6g3v0753090.2) Lj6g3v0754260.1(Lj6g3v0754260.1)
ADU: 107461804
AIP: 107616938
CMO: 103504436
BVG: 104891856
DOSA: Os08t0490300-01(Os08g0490300) Os09t0476100-01(Os09g0476100)
ATS: 109735221(LOC109735221)
SITA: 101773012
DFA: DFA_11272
SMIN: v1.2.020052.t1(symbB.v1.2.020052.t1)
 » show all
TaxonomyKoalaUniProt
Reference
PMID:8626397
  Authors
Ruegsegger U, Beyer K, Keller W
  Title
Purification and characterization of human cleavage factor Im involved in the 3' end processing of messenger RNA precursors.
  Journal
J Biol Chem 271:6107-13 (1996)
DOI:10.1074/jbc.271.11.6107
  Sequence
[hsa:11052 79869]
Reference
  Authors
Yang Q, Coseno M, Gilmartin GM, Doublie S
  Title
Crystal structure of a human cleavage factor CFI(m)25/CFI(m)68/RNA complex provides an insight into poly(A) site recognition and RNA looping.
  Journal
Structure 19:368-77 (2011)
DOI:10.1016/j.str.2010.12.021
  Sequence
[hsa:11052]
LinkDB All DBs

DBGET integrated database retrieval system