KEGG   ORTHOLOGY: K14404
Entry
K14404                      KO                                     

Name
CPSF4, YTH1
Definition
cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
Pathway
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko05164  Influenza A
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03015 mRNA surveillance pathway
    K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
 09160 Human Diseases
  09172 Infectious disease: viral
   05164 Influenza A
    K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Other transcription-related factors
    Transcription termination factor
     K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA processing factors
   3' end processing
    Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) complex
     K14404  CPSF4, YTH1; cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
Genes
HSA: 10898(CPSF4)
PTR: 463572(CPSF4) 744631(CPSF4L)
PPS: 100970032(CPSF4L) 100977233(CPSF4)
GGO: 101130969(CPSF4L) 101136148(CPSF4)
PON: 100456920(CPSF4L) 100458908(CPSF4)
NLE: 100579219(CPSF4L) 100593529(CPSF4)
MCC: 698279(CPSF4L) 708119(CPSF4)
MCF: 102131983(CPSF4) 102141375(CPSF4L)
CSAB: 103243113(CPSF4L) 103246784(CPSF4)
RRO: 104660084(CPSF4L) 104672083(CPSF4)
RBB: 108537318(CPSF4L) 108538143(CPSF4)
CJC: 103788604(CPSF4)
SBQ: 101041453(CPSF4)
MMU: 54188(Cpsf4)
MCAL: 110294246(Cpsf4) 110305665(Cpsf4l)
MPAH: 110313220(Cpsf4) 110332573(Cpsf4l)
RNO: 100360200 304277(Cpsf4)
MUN: 110547341(Cpsf4l)
CGE: 100762278(Cpsf4l) 100773929(Cpsf4)
NGI: 103726468(Cpsf4) 103732798(Cpsf4l)
HGL: 101698559(Cpsf4)
CCAN: 109684551(Cpsf4l) 109685060(Cpsf4)
OCU: 100342324(CPSF4L) 100346062(CPSF4)
TUP: 102478701(CPSF4L) 102490025(CPSF4)
CFA: 106559223(CPSF4L) 489859(CPSF4)
VVP: 112910022(CPSF4) 112920651(CPSF4L)
AML: 100481121(CPSF4L) 100482615(CPSF4)
UMR: 103665698(CPSF4L) 103669986(CPSF4)
UAH: 113265149(CPSF4L) 113267910(CPSF4)
ORO: 101362800(CPSF4) 101367156(CPSF4L)
FCA: 101085423(CPSF4) 101092311(CPSF4L)
PTG: 102969305(CPSF4L) 102972171(CPSF4)
PPAD: 109251234(CPSF4) 109277006(CPSF4L)
AJU: 106978611(CPSF4L) 106981209(CPSF4)
BTA: 280875(CPSF4) 790056(CPSF4L)
BOM: 102276670(CPSF4L) 102281049(CPSF4)
BIU: 109573362(CPSF4L) 109578100(CPSF4)
BBUB: 102394376(CPSF4)
CHX: 102169823(CPSF4) 102176458(CPSF4L)
OAS: 105604798(CPSF4)
SSC: 100518830(CPSF4)
CFR: 102511596(CPSF4L) 102514002(CPSF4)
CDK: 105099358(CPSF4) 105104318(CPSF4L)
BACU: 102997544(CPSF4) 103017464(CPSF4L)
LVE: 103090101(CPSF4) 103090390(CPSF4L)
OOR: 101282912(CPSF4L) 101287378(CPSF4)
DLE: 111181918(CPSF4) 111182880(CPSF4L)
PCAD: 102995601(CPSF4L) 102996937(CPSF4)
ECB: 100059364(CPSF4) 100061214(CPSF4L)
EPZ: 103547406(CPSF4L) 103548321(CPSF4)
EAI: 106830396(CPSF4L) 106840493(CPSF4)
MYB: 102239941(CPSF4) 102242119(CPSF4L)
MYD: 102753915(CPSF4) 102770429(CPSF4L)
MNA: 107540013(CPSF4L) 107540908(CPSF4)
HAI: 109379054(CPSF4) 109387207(CPSF4L)
DRO: 112314840(CPSF4) 112316523(CPSF4L)
PALE: 102883822(CPSF4L) 102898259(CPSF4)
RAY: 107510266(CPSF4L) 107517856(CPSF4)
MJV: 108386555(CPSF4L) 108403147(CPSF4)
LAV: 100661090(CPSF4L) 100661563(CPSF4)
MDO: 100011934(CPSF4) 100028479(CPSF4L)
SHR: 100922359(CPSF4) 100928206(CPSF4L)
PCW: 110219341(CPSF4L) 110223176(CPSF4)
OAA: 100081275(CPSF4) 100093082(CPSF4L)
GGA: 416494(CPSF4)
MGP: 104913415(CPSF4)
CJO: 107320630(CPSF4)
NMEL: 110405819(CPSF4) 110407320
APLA: 101804883(CPSF4)
ACYG: 106032090(CPSF4) 106034598(CPSF4L)
TGU: 100224162(CPSF4) 115497633(CPSF4L)
LSR: 110472483(CPSF4L) 110481194(CPSF4)
SCAN: 103817613(CPSF4) 103819959(CPSF4L)
GFR: 102040035(CPSF4) 102040814(CPSF4L)
FAB: 101810258(CPSF4) 101810763(CPSF4L)
PHI: 102104905(CPSF4L) 102108749(CPSF4)
PMAJ: 107211228(CPSF4) 107212259(CPSF4L)
CCAE: 111936123(CPSF4) 111937463(CPSF4L)
CCW: 104685025(CPSF4) 109146069
ETL: 114060174(CPSF4) 114069794(CPSF4L)
FPG: 101913326(CPSF4L) 101913914(CPSF4)
FCH: 102047276(CPSF4L) 102051975(CPSF4)
CLV: 102085618(CPSF4)
EGZ: 104132635(CPSF4) 104132834(CPSF4L)
NNI: 104014349(CPSF4L) 104015231(CPSF4)
ACUN: 113485471(CPSF4) 113486686(CPSF4L)
PADL: 103914933 103918801(CPSF4)
AAM: 106489093(CDC42EP4) 106500074(CPSF4)
ASN: 102384592(CPSF4) 102385045(CPSF4L)
AMJ: 102564540(CPSF4L) 102570582(CPSF4)
PSS: 102453133 102459112(CPSF4) 106731697(CPSF4L)
CMY: 102938918(CPSF4) 102947652
CPIC: 101937238(CPSF4L) 101938169(CPSF4)
ACS: 100558379(cpsf4)
PVT: 110087192(CPSF4)
PBI: 103066449(CPSF4)
PMUR: 107298696(CPSF4)
PMUA: 114584014(CPSF4)
GJA: 107116925(CPSF4)
XLA: 108701503(cpsf4.L) 108702698(cpsf4l.S) 444766(cpsf4.S)
XTR: 493312(cpsf4) 549557(cpsf4l)
DRE: 30203(cpsf4)
IPU: 100528569(cpsf4)
PHYP: 113536298(cpsf4)
AMEX: 103032556(cpsf4)
EEE: 113584963(cpsf4)
TRU: 101069876(cpsf4)
LCO: 104932071(cpsf4)
NCC: 104959533(cpsf4)
MZE: 101469408(cpsf4)
ONL: 100698039(cpsf4)
OLA: 101173062(cpsf4)
XMA: 102231355(cpsf4)
XCO: 114160356(cpsf4)
PRET: 103468471(cpsf4)
CVG: 107104196(cpsf4)
NFU: 107376339(cpsf4)
KMR: 108236241(cpsf4)
ALIM: 106520668(cpsf4)
AOCE: 111570327(cpsf4)
CSEM: 103393309(cpsf4)
POV: 109641547(cpsf4)
LCF: 108877605(cpsf4)
SDU: 111230344(cpsf4)
SLAL: 111647589(cpsf4)
HCQ: 109527044(cpsf4)
BPEC: 110162305(cpsf4)
MALB: 109952667(cpsf4)
SASA: 106593953(cpsf4)
OTW: 112240642(cpsf4) 112251334
SALP: 111975327
ELS: 105031073(cpsf4)
SFM: 108926307(cpsf4) 114910501
PKI: 111845534(cpsf4)
LCM: 102349510(CPSF4L) 102359754(CPSF4)
CMK: 103186859(cpsf4)
RTP: 109910471(cpsf4) 109922938
BFO: 118429553
CIN: 100178032
SPU: 765046
APLC: 110989668
SKO: 100370554
DME: Dmel_CG3642(Clp)
DER: 26526950
DSE: 116800360
DSI: Dsimw501_GD27798(Dsim_GD27798)
DAN: 26514018
DSR: 110178163
DPE: 113565731
DMN: 108162775
DWI: 26529730
DAZ: 108610599
DNV: 115562049
DHE: 111599159
DVI: 26530659
MDE: 101892794
LCQ: 111678047
AAG: 23687406
AME: 412627
BIM: 100746928
BTER: 100643700
CCAL: 108622398
OBB: 114874659
SOC: 105200677
MPHA: 105832762
AEC: 105143535
ACEP: 105620774
PBAR: 105425680
VEM: 105570310
HST: 105186593
DQU: 106748418
CFO: 105249783
LHU: 105676330
PGC: 109857505
OBO: 105281584
PCF: 106787902
NVI: 100121095
CSOL: 105364202
MDL: 103572340
TCA: 655471 660072(Cpsf4)
DPA: 109533210
ATD: 109599784
NVL: 108563957
BMOR: 733099
BMAN: 114250995
PMAC: 106720820
PRAP: 111003484
HAW: 110375587
TNL: 113497864
API: 100166367
AGS: 114132174
RMD: 113553128
BTAB: 109031338
CLEC: 106665744
ZNE: 110838662
FCD: 110848086
PVM: 113806310
TUT: 107360038
DPTE: 113797423
CSCU: 111617131
PTEP: 107455792
CEL: CELE_F11A10.8(cpsf-4)
CBR: CBG06226
TSP: Tsp_06393
PCAN: 112577020
CRG: 105338165
MYI: 110453921
OBI: 106867798
LAK: 106154802
SHX: MS3_10495
NVE: 5511760
EPA: 110253844
ADF: 107347556
AMIL: 114976994
PDAM: 113684202
SPIS: 111321408
DGT: 114519656
HMG: 100212706
AQU: 100635068
ATH: AT1G30460(CPSF30) AT5G18440(NUFIP)
LJA: Lj3g3v0950950.1(Lj3g3v0950950.1) Lj3g3v0950950.2(Lj3g3v0950950.2) Lj6g3v1675410.1(Lj6g3v1675410.1)
OSA: 4341840
DOSA: Os01t0814000-01(Os01g0814000) Os06t0677700-00(Os06g0677700)
OBR: 102710602
BDI: 100837853
ATS: 109742435(LOC109742435)
SITA: 101765271
PPP: 112273394
APRO: F751_5457
SCE: YPR107C(YTH1)
ERC: Ecym_2619
KMX: KLMA_20344(YTH1)
NCS: NCAS_0A11480(NCAS0A11480)
NDI: NDAI_0A04800(NDAI0A04800)
TPF: TPHA_0M01770(TPHA0M01770)
TBL: TBLA_0C02360(TBLA0C02360)
TDL: TDEL_0C05580(TDEL0C05580)
KAF: KAFR_0D04260(KAFR0D04260)
CAL: CAALFM_C205690CA(YTH1)
SLB: AWJ20_670(YTH1)
NCR: NCU08353
NTE: NEUTE1DRAFT125898(NEUTE1DRAFT_125898)
MGR: MGG_00680
SSCK: SPSK_00840
MAW: MAC_00343
MAJ: MAA_00614
CMT: CCM_08167
BFU: BCIN_05g02650(Bcyth1)
MBE: MBM_03961
ANI: AN0298.2
ANG: ANI_1_2540014(An01g05350)
ABE: ARB_00210
TVE: TRV_05203
PTE: PTT_17055
SPO: SPAC227.08c(yth1)
ABP: AGABI1DRAFT33150(AGABI1DRAFT_33150)
ABV: AGABI2DRAFT62161(AGABI2DRAFT_62161)
MGL: MGL_1895
MRT: MRET_1912
DDI: DDB_G0270148(cpsf4)
DFA: DFA_00044(cpsf4)
EHI: EHI_067580(4.t00062)
SMIN: v1.2.018361.t1(symbB.v1.2.018361.t1)
SPAR: SPRG_16972
 » show all
Reference
  Authors
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A, Langen H, Keller W
  Title
Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase.
  Journal
EMBO J 23:616-26 (2004)
DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
  Sequence
[hsa:10898]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system