KEGG   ORTHOLOGY: K19046
Entry
K19046                      KO                                     
Symbol
casB, cse2
Name
CRISPR system Cascade subunit CasB
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19046  casB, cse2; CRISPR system Cascade subunit CasB
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19046  casB, cse2; CRISPR system Cascade subunit CasB
Genes
ECO: b2759(casB)
ECJ: JW2729(ygcK)
ECD: ECDH10B_2927(ygcK)
EBW: BWG_2495(ygcK)
ECOK: ECMDS42_2264(ygcK)
ECE: Z4068
ECS: ECs_3613(casB)
ECF: ECH74115_4012(cse2)
ETW: ECSP_3707
ELX: CDCO157_3373
ECOO: ECRM13514_3613(cse2)
ECOH: ECRM13516_3479(cse2)
ESL: O3K_05735
ESO: O3O_19915
ESM: O3M_05780
EOK: G2583_3407(cse)
ELH: ETEC_2950
ECW: EcE24377A_3061(cse2)
ECX: EcHS_A2898(cse2)
ECM: EcSMS35_2887(cse2)
ECY: ECSE_3014
EKF: KO11_09180(cse2)
EDJ: ECDH1ME8569_2669(ygcK)
ELW: ECW_m2966(cse2)
ELL: WFL_14480(cse2)
EFE: EFER_0304(ygcK)
ESZ: FEM44_03685(casB) FEM44_05340(casB)
STY: STY3069
STT: t2843
STM: STM2942
SENI: CY43_15350
SPT: SPA2798
SEK: SSPA2609
SEI: SPC_2986(tnpA)
SEC: SCH_2874(tnpA)
SEH: SeHA_C3136(cse2)
SHB: SU5_03423
SEE: SNSL254_A3152(cse2)
SEW: SeSA_A3096(cse2)
SEA: SeAg_B3070(cse2)
SENS: Q786_14180
SED: SeD_A3253(cse2)
SEG: SG2845
SEL: SPUL_2941
SET: SEN2781
SENA: AU38_14125
SENO: AU37_14135
SENV: AU39_14135
SENQ: AU40_15900
SENL: IY59_14730
SEEP: I137_14005
SENE: IA1_14100
SBG: SBG_2557
SBZ: A464_2964
SALZ: EOS98_04785(casB)
SBO: SBO_2761
ESA: ESA_02836
CSK: ES15_2922(cse2)
CTU: CTU_10460
KPU: KP1_3169(cse2)
KPP: A79E_2162
KPT: VK055_0381(casB)
KPR: KPR_4122
KPNK: BN49_1000
KVA: Kvar_0941
KOE: A225_4681
KQV: B8P98_11995(casB)
KAR: LGL98_05055(casB)
KGR: JJJ10_05850(casB)
CRO: ROD_30471
CYO: CD187_05030(casB)
CFQ: C2U38_20005(casB)
LEH: C3F35_16485(casB)
ASUB: NLZ15_05745(casB)
IZH: FEM41_00200(casB)
SERA: Ser39006_005060(casB)
SERQ: CWC46_05060(casB)
PEC: W5S_0411
PPUJ: E2566_02090(casB)
PARI: I2D83_20070(casB)
PAQU: DMB82_0001755(casB)
PVZ: OA04_04130(casB)
PPAV: LOZ86_19940(casB)
DFN: CVE23_01930(casB)
DDQ: DDI_3189
DIC: Dpoa569_003597(casB)
EAM: EAMY_2818(ygcK)
EAY: EAM_0764
EPY: EpC_08090(cse2)
EPR: EPYR_00854(ygcK)
ERJ: EJP617_02880(ygcK)
PLU: plu0747
PAY: PAU_00708
PLUI: CE143_04135(casB)
PHAU: PH4a_00620(casB)
XBO: XBJ1_3751
XBV: XBW1_4258
XNE: XNC1_3719
XNM: XNC2_3574
XDO: XDD1_0596
XPO: XPG1_0519
ETE: ETEE_2628
EDL: AAZ33_04135(casB)
LPV: HYN51_03155(casB)
PRAG: EKN56_10350(casB)
VCO: VC0395_A2672(cse)
VHR: AL538_00320(casB)
PPR: PBPRC0038
SCOT: HBA18_15030(casB)
PMY: Pmen_3759
PPSE: BN5_0769
HMI: soil367_17150(casB)
PIN: Ping_1588
MII: BTJ40_18120(casB)
MCEL: LPW13_11285(casB)
KIM: G3T16_03670(casB)
MCA: MCA0934
METL: U737_02355(casB)
MPAD: KEF85_15000(casB)
MMAI: sS8_4542
MMOB: F6R98_00785(casB)
MESL: KKZ03_17520(casB)
TSB: HMY34_15635(casB)
NWA: Nwat_1402
ATEP: Atep_23430
NTT: TAO_1714
TBOG: LT988_05105(casB)
AEH: Mlg_0953
GHL: GM160_08070(casB)
CSA: Csal_0228
HAM: HALO4334
HBE: BEI_3529
HALK: CUU95_04745(casB)
NIK: F5I99_01690(casB)
SOK: D0B54_08895(casB)
SINI: GT972_11600(casB)
TBN: TBH_C1505
EPS: L0Y14_13235(casB)
CHRI: DK842_14500(casB)
CHRB: DK843_20060(casB)
PSE: NH8B_0691
AMAH: DLM_2393
RSG: JK151_17205(casB)
PPUL: RO07_18910
PIG: EGT29_03865(casB)
PACR: FXN63_18890(casB)
CBAA: SRAA_1199
CBAB: SMCB_1598
JAG: GJA_3179
RGE: RGE_06870(cse2)
NIM: W01_09230(casB)
ABRE: pbN1_19790(cse2)
AZD: CDA09_21035(casB)
TCL: Tchl_1797
ZPA: C3497_14075(casB)
HYO: NNO_1914
GSU: GSU1386(cse2)
GSK: KN400_1352(cse2)
GBZ: JZM60_11005(casB)
GUR: Gura_0828
GLO: Glov_2478
PCA: Pcar_0958(cse2)
PPD: Ppro_2341
DDS: Ddes_0924
DEF: CNY67_05500(casB)
DDE: Dde_0863
DMS: E8L03_03330(casB)
DSX: GD604_14765(casB)
DOL: Dole_2985
DAL: Dalk_4935
SFU: Sfum_2826
BSED: DN745_02400(casB)
MNO: Mnod_5413
MIND: mvi_16030
NOH: G5V57_21900(casB)
DSH: Dshi_3216
GEH: HYN69_12330(casB)
SECH: B18_17920
GOH: B932_0092
GTI: FXF46_10010(casB)
GDI: GDI2208
GDJ: Gdia_0426
GXY: GLX_07810
AOY: EOV40_007495(casB)
RMUC: FOB66_01585(casB)
RMT: IAI58_22130(casB)
BOB: GN304_00775(casB)
PARZ: DTQ13_05050(casB)
RAP: RHOA_5003
STEL: STAQ_18430
RCE: RC1_3338
BMX: BMS_2208
HYI: K2M58_01330(casB)
STHE: T303_06240
SRAT: FY406_10320(casB)
STRG: SRT_06160
SCHJ: DDV21_004815(casB)
LDB: Ldb0870
LBU: LBUL_0795
LHH: LBH_1245
LHD: HUO_04715
LCA: LSEI_0351
LARG: LPA65_05985(casB)
LFE: LAF_0693
LFF: LBFF_1328
LBN: LBUCD034_0103(casB)
LSUA: H3M12_03735(casB)
TEY: GLW17_02300(casB)
TOO: C7K38_10765(casB)
ABAE: CL176_04460(casB)
ESR: ES1_14540
FPA: FPR_15500
STH: STH666
SALQ: SYNTR_0952
HMO: HM1_0183
LASA: L9O85_07145(casB)
ABUT: Ami103574_04820(casB)
AMEI: LV469_03205(casB)
ECOU: M1R54_04125(casB)
LPIL: LIP_1461
CDH: CDB402_0036(cas14)
CDR: CDHC03_0040(cas14)
CDA: CDHC04_0036(cas14)
CDD: CDCE8392_0034(cas14)
CDW: CDPW8_0032(cas14)
CJK: jk0647
CUR: cu1971(casF)
CUA: CU7111_1891(casF)
CRD: CRES_2076(casE)
CTER: A606_11700
COA: DR71_1111(casB)
CUT: CUTER_08705(cas14)
CRL: NCTC7448_00865(casF)
CANS: GP473_00830(casB)
CLIA: C3E79_09955(casB)
CGLU: I6J20_08960(casB)
CLIZ: G7Y31_09790(casB)
CLUJ: IAU68_11190(casB)
CQN: G7Y29_09730(casB)
CUW: LH390_07540(casB)
NFA: NFA_44260
NTP: CRH09_11700(casB)
NOZ: DMB37_15435(casB)
GOC: CXX93_16330(casB)
GPD: GII33_21475(casB)
TOY: FO059_16105(casB)
SALB: XNR_0790
SMA: SAVERM_7541(cse2)
SGR: SGR_3543
SFA: Sfla_6588
SALS: SLNWT_3609
STRP: F750_7153(cse2)
SALU: DC74_7382
STRE: GZL_p00122
SLD: T261_7084
SKY: D0C37_15750(casB)
SLAU: SLA_7111
SRJ: SRO_1950
SDX: C4B68_00535(casB)
SQZ: FQU76_31875(casB)
SNQ: CP978_08935(casB)
STIR: DDW44_05805(casB)
SGZ: C0216_31920(casB) C0216_32260(casB)
SSPO: DDQ41_20315(casB)
SCAV: CVT27_17035(casB)
SBY: H7H31_15315(casB)
SPLA: CP981_06450(casB)
SBRO: GQF42_00640(casB) GQF42_16090(casB)
SHAR: HUT13_23200(casB)
SCAL: I6J39_23175(casB)
SMOB: J7W19_26280(casB)
SROI: IAG44_41710(casB)
SGJ: IAG43_34020(casB)
SDD: D9753_15870(casB)
SGOB: test1122_19695(casB)
SDEC: L3078_04310(casB)
STRI: C7M71_014560(casB) C7M71_022835(casB)
YIA: LO772_29515(casB)
MHOS: CXR34_16670(casB)
LINS: G7067_03925(casB)
AUL: DCC27_009030(casB)
BRZ: CFK38_03555(casB)
LMOI: VV02_03385
XYL: ET495_13735(casB)
XYA: ET471_16275(casB)
CFI: Celf_0517
CIRA: LFM56_01090(casB)
OEK: FFI11_005280(casB)
CACN: RN83_11100
TDF: H9L22_10435(casB)
THAO: NI17_006480(casB) NI17_019925(casB)
TALX: FOF52_06630(casB)
NDA: Ndas_1282
NGV: CDO52_19440(casB)
TCU: Tcur_2681
AGRA: AGRA3207_005514(casB) AGRA3207_007285(casB)
TBI: Tbis_1534
FAL: FRAAL0454
NML: Namu_3053
AMD: AMED_5811
AMN: RAM_29785
AMM: AMES_5733
AMZ: B737_5733
SESP: BN6_19710
ACTA: C1701_00595(casB) C1701_26255(casB)
ALO: CRK59252
MICH: FJK98_21625(casB)
MCAB: HXZ27_02575(casB)
MCRA: ID554_00790(casB)
PLK: CIK06_17160(casB)
NHY: JQS43_23440(casB)
CAI: Caci_3908
NAV: JQS30_06375(casB)
TPYO: X956_08745
ACTT: DDD63_01065(casB)
ACTO: C3V41_12125(casB)
ACTZ: CWT12_03210(casB)
AWE: JG540_03005(casB)
AREP: ID810_02880(casB)
BADL: BADO_1330
BANL: BLAC_07150
BAST: BAST_1433
BANG: BBAG_1189
BSCA: BBSC_1931
GVA: HMPREF0424_0761(casB)
AEY: CDG81_01995(casB) CDG81_13055(casB) CDG81_17985(casB)
EKE: EK0264_07825(casB)
AFO: Afer_0987
CYA: CYA_0733(cse2)
DEH: cbdbB37
DMD: dcmb_1409
STI: Sthe_3436
TTR: Tter_1897
DGE: Dgeo_2631
DGO: DGo_PE0018(cse)
TRA: Trad_2309
TTJ: TTHB189(TTHB189)
TANT: KNN15_08005(casB)
MRB: Mrub_3018
PNL: PNK_1125(cse2)
LBJ: LBJ_2450
LBL: LBL_0662
LST: LSS_15586
LMAY: DPV73_08650(casB)
LWL: FHG68_16860(casB)
CVL: J8C06_13390(casB)
SCOR: J3U87_27280(casB)
RMR: Rmar_0482
CTE: CT1973
PAA: Paes_1417
NDE: NIDE1544
MBU: Mbur_0595
MHU: Mhun_1379
MRTJ: KHC33_12675(casB)
MPL: Mpal_1606
RCI: RCIX1149
MARC: AR505_1091
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Reference
  Authors
Nam KH, Huang Q, Ke A
  Title
Nucleic acid binding surface and dimer interface revealed by CRISPR-associated CasB protein structures.
  Journal
FEBS Lett 586:3956-61 (2012)
DOI:10.1016/j.febslet.2012.09.041
  Sequence
[eco:b2759]
Reference
  Authors
Agari Y, Yokoyama S, Kuramitsu S, Shinkai A
  Title
X-ray crystal structure of a CRISPR-associated protein, Cse2, from Thermus thermophilus HB8.
  Journal
Proteins 73:1063-7 (2008)
DOI:10.1002/prot.22224
  Sequence
[ttj:TTHB189]
LinkDB

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