KEGG   ORTHOLOGY: K19124
Entry
K19124                      KO                                     
Symbol
casC, cse4
Name
CRISPR system Cascade subunit CasC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19124  casC, cse4; CRISPR system Cascade subunit CasC
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19124  casC, cse4; CRISPR system Cascade subunit CasC
Genes
ECO: b2758(casC)
ECJ: JW2728(ygcJ)
ECD: ECDH10B_2926(ygcJ)
EBW: BWG_2494(ygcJ)
ECOK: ECMDS42_2263(ygcJ)
ECE: Z4067
ECS: ECs_3612(casC)
ECF: ECH74115_4011(cse4)
ETW: ECSP_3706
ELX: CDCO157_3372
ECOO: ECRM13514_3612(cse4)
ECOH: ECRM13516_3478(cse4)
ESL: O3K_05740
ESO: O3O_19910
ESM: O3M_05785
EOK: G2583_3406(ygcJ)
ELH: ETEC_2949
ECW: EcE24377A_3060(cse4)
ECX: EcHS_A2897(cse4)
ECM: EcSMS35_2886(cse4)
ECY: ECSE_3013
EKF: KO11_09185(cse4)
EDJ: ECDH1ME8569_2668(ygcJ)
ELW: ECW_m2965(cse4)
ELL: WFL_14475(cse4)
EFE: EFER_0305(ygcJ)
ESZ: FEM44_03680(cas7e) FEM44_05335(cas7e)
STY: STY3068
STT: t2842
STM: STM2941(yghJ)
SEO: STM14_3545(yghJ)
SEY: SL1344_2920(yghJ)
SEJ: STMUK_2930(yghJ)
SEB: STM474_3082(yghJ)
SENI: CY43_15345
SPT: SPA2797
SEK: SSPA2608
SEI: SPC_2985(yghJ)
SEC: SCH_2873(yghJ)
SEH: SeHA_C3135(cse4)
SHB: SU5_03422
SEE: SNSL254_A3151(cse4)
SEW: SeSA_A3095(cse4)
SEA: SeAg_B3069(cse4)
SENS: Q786_14175
SED: SeD_A3252(cse4)
SEG: SG2844(yghJ)
SEL: SPUL_2940
SET: SEN2780(yghJ)
SENA: AU38_14120
SENO: AU37_14130
SENV: AU39_14130
SENQ: AU40_15895
SENL: IY59_14725
SEEP: I137_14000
SENB: BN855_29910(cse4)
SENE: IA1_14095
SBG: SBG_2556
SBZ: A464_2963
SALZ: EOS98_04790(cas7e)
SSN: SSON_2907(yghJ)
SBO: SBO_2762(yghJ)
ESA: ESA_02835
CSK: ES15_2921(cse4)
CTU: CTU_10470
KPU: KP1_3167(cse4)
KPP: A79E_2164
KPT: VK055_0383(cas7)
KPR: KPR_4121
KPX: PMK1_04445(casC)
KPNK: BN49_1001
KVA: Kvar_0942
KOE: A225_4680
KQV: B8P98_12005(cas7e)
KAR: LGL98_05060(cas7e)
KGR: JJJ10_05855(cas7e)
CRO: ROD_30481
CYO: CD187_05035(cas7e)
CFQ: C2U38_20000(cas7e)
LEH: C3F35_16490(cas7e)
ASUB: NLZ15_05750(cas7e)
IZH: FEM41_00195(cas7e)
SERA: Ser39006_005065(cas7e)
SERQ: CWC46_05065(cas7e)
PEC: W5S_0412
PPUJ: E2566_02095(cas7e)
PARI: I2D83_20065(cas7e)
PAQU: DMB82_0001760(cas7e)
PVZ: OA04_04140(casC)
PPAV: LOZ86_19935(cas7e)
DFN: CVE23_01935(cas7e)
DDQ: DDI_3191
DIC: Dpoa569_003596(cas7e)
EAM: EAMY_2817(ygcJ)
EAY: EAM_0765
EPY: EpC_08100(cse4)
EPR: EPYR_00855(ygcJ)
ERJ: EJP617_02870(cse4)
MINT: C7M51_00063(casC)
MTHI: C7M52_02651(casC)
PLU: plu0748
PAY: PAU_00709
PLUI: CE143_04140(cas7e)
PHAU: PH4a_00615(cas7e)
XBO: XBJ1_3752
XBV: XBW1_4259
XNE: XNC1_3720
XNM: XNC2_3575
XDO: XDD1_0595
XPO: XPG1_0518
ETE: ETEE_2630
EDL: AAZ33_04145(cas7e)
LPV: HYN51_03150(cas7e)
PRAG: EKN56_10345(cas7e)
VCO: VC0395_A2674(cse)
VHR: AL538_00325(cas7e)
VSR: Vspart_03913(casC)
PPR: PBPRC0037
SCOT: HBA18_15025(cas7e)
PMY: Pmen_3758
PPSE: BN5_0770
PSEN: PNC201_20240(casC)
PVB: J5X90_23200(cas7e)
HMI: soil367_17145(cas7e)
PIN: Ping_1589
MII: BTJ40_18115(cas7e)
MCEL: LPW13_11280(cas7e)
KIM: G3T16_03675(cas7e)
MCA: MCA0933
METL: U737_02360(cas7e)
MPAD: KEF85_14995(cas7e)
MBUR: EQU24_20285(cas7e)
MMAI: sS8_4540
MMOB: F6R98_00790(cas7e)
MESL: KKZ03_17515(cas7e)
TSB: HMY34_15640(cas7e)
NWA: Nwat_1401
ATEP: Atep_23440
NTT: TAO_1712
TTP: E6P07_10980(cas7e)
TBOG: LT988_05110(cas7e)
AEH: Mlg_0952
GHL: GM160_08045(cas7e)
CSA: Csal_0229
HAM: HALO4333
HBE: BEI_3528(casC)
HALK: CUU95_04740(cas7e)
NIK: F5I99_01695(cas7e)
SOK: D0B54_08900(cas7e)
SINI: GT972_11610(cas7e)
TBN: TBH_C1504
EPS: L0Y14_13240(cas7e)
CHRI: DK842_14505(cas7e)
CHRB: DK843_20065(cas7e)
PSE: NH8B_0692
AMAH: DLM_2392
RSG: JK151_17200(cas7e)
PIG: EGT29_03870(cas7e)
PACR: FXN63_18885(cas7e)
HPSE: HPF_16010(casC)
CBAA: SRAA_1198(cas7)
CBAB: SMCB_1597
JAG: GJA_3178
RGE: RGE_06860(cse4)
TTW: LCC91_08365(cas7e)
IDC: LRM40_02500(cas7e) LRM40_19425(cas7e)
NLC: EBAPG3_008190(cas7e)
NIM: W01_09240(casC)
NARC: NTG6680_1121(casC)
ABRE: pbN1_19780(cas7)
QAU: KI612_17780(cas7e)
ACOM: CEW83_06420(cas7e)
AZD: CDA09_21040(cas7e)
TCL: Tchl_1799
ZPA: C3497_14080(cas7e)
HYO: NNO_1913
GSU: GSU1387(cse4)
GSK: KN400_1353(cse4)
GBZ: JZM60_11010(cas7e)
GUR: Gura_0830
GLO: Glov_2477
PCA: Pcar_0959(cse4)
PPD: Ppro_2340
DDS: Ddes_0926
DEF: CNY67_05510(cas7e)
DCB: C3Y92_05845(cas7e)
DDE: Dde_0862
DMS: E8L03_03335(cas7e)
DSX: GD604_14770(cas7e)
DOL: Dole_2986
DAL: Dalk_4937
SFU: Sfum_2827
BSED: DN745_02405(cas7e)
KMN: HW532_21065(cas7e)
MNO: Mnod_5412
MEE: DA075_08065(cas7e)
MTEA: DK419_15610(cas7e)
MIND: mvi_16040
NOH: G5V57_09460(cas7e) G5V57_21905(cas7e)
PSTG: E8M01_22900(cas7e)
DSH: Dshi_3217(cse3)
PKD: F8A10_12750(cas7e)
GEH: HYN69_12325(cas7e)
HML: HmaOT1_18365(cas7e)
MON: G8E03_16975(cas7e)
SECH: B18_17925
GOH: B932_0093
GTI: FXF46_10005(cas7e)
GDI: GDI2207
GDJ: Gdia_0425
GXY: GLX_07800
AOY: EOV40_007490(cas7e)
RMUC: FOB66_01590(cas7e)
RMT: IAI58_22125(cas7e)
NEH: E3E11_02165(cas7e)
SWF: E3E12_03290(cas7e)
BOB: GN304_00780(cas7e)
BOMB: GT348_01850(cas7e)
EBLA: JGUZn3_21190(casC)
PARZ: DTQ13_05055(cas7e)
RAP: RHOA_5002(cas7e)
STEL: STAQ_18420
AZZ: DEW08_03425(cas7e)
SROE: JL101_013315(cas7e)
RCE: RC1_3337
HYI: K2M58_01335(cas7e)
STHE: T303_06235
SSR: SALIVB_1074(ygcJ)
STF: Ssal_01145(casC)
SRAT: FY406_10315(cas7e)
STRG: SRT_06170
SCHJ: DDV21_004820(cas7e)
LDB: Ldb0871
LBU: LBUL_0796
LHH: LBH_1244(casE)
LHD: HUO_04720
LCR: LCRIS_01211(casE)
LCA: LSEI_0352
LARG: LPA65_05990(cas7e)
LFE: LAF_0694
LFR: LC40_0467
LFF: LBFF_1327
LBN: LBUCD034_0104(casC)
LSUA: H3M12_03740(cas7e)
OSI: DLJ48_08415(cas7e)
TEY: GLW17_02295(cas7e)
TOO: C7K38_10760(cas7e)
ABAE: CL176_04465(cas7e)
ESR: ES1_14550
FPA: FPR_15510
STH: STH667
SALQ: SYNTR_0951
HMO: HM1_0184
LASA: L9O85_07150(cas7e)
ABUT: Ami103574_04825(cas7e)
FMA: FMG_P0059
AMEI: LV469_03200(cas7e)
ECOU: M1R54_04120(cas7e)
AMUO: KWG62_07940(cas7e)
LPIL: LIP_1462
CGT: cgR_0735
CDI: DIP2209
CDP: CD241_2098(cas5)
CDH: CDB402_0037(cas15)
CDT: CDHC01_2099(cas5)
CDR: CDHC03_0041(cas15)
CDA: CDHC04_0037(cas15)
CDD: CDCE8392_0035(cas15)
CDW: CDPW8_0033(cas15)
CJK: jk0646
CUR: cu1970(casE)
CUA: CU7111_1890(casE)
CAR: cauri_0901(casE)
CPG: CP316_00160(cas7e)
COP: CP31_00155(cas7e)
COI: CPCIP5297_00160(cas7e)
COE: CP258_00160(cas7e)
COU: CP162_00180(cas7e)
CRD: CRES_2075(casD)
CUN: Cul210932_0041(cas7)
CUS: CulFRC11_0038(cas7)
CUQ: Cul210931_0039(cas7)
CUZ: Cul05146_0040(cas7)
CUJ: CUL131002_0039(cas7)
CTER: A606_11695
COA: DR71_1112(cas7)
CSX: CSING_09705(casE)
CUT: CUTER_08700(cas15)
CSP: WM42_1520(cas7)
CRL: NCTC7448_00866(casE)
CCHO: CCHOA_00665(casC)
CYZ: C3B44_08650(cas7e)
CANS: GP473_00835(cas7e)
CLIA: C3E79_09950(cas7e)
CPRP: I6I69_01570(cas7e)
CGLU: I6J20_08965(cas7e)
CLIZ: G7Y31_09785(cas7e)
CLUJ: IAU68_11195(cas7e)
CQN: G7Y29_09725(cas7e)
CUW: LH390_07535(cas7e)
CPOY: GP475_08610(cas7e)
NFA: NFA_44250
NTP: CRH09_11705(cas7e)
NOZ: DMB37_15430(cas7e)
NWL: NWFMUON74_40010(cse4)
GPD: GII33_21470(cas7e)
TOY: FO059_16110(cas7e)
SALB: XNR_0789
SMA: SAVERM_7540(cse4)
SGR: SGR_3544
SFA: Sfla_6589
SALS: SLNWT_3608
STRP: F750_7154
SALU: DC74_7383
STRE: GZL_p00123
SLD: T261_7085
SRN: A4G23_04622(casC)
SKY: D0C37_15755(cas7e)
SCAD: DN051_44475(cas7e)
SLAU: SLA_7112
SRJ: SRO_1951
SDX: C4B68_00540(cas7e)
SNQ: CP978_00605(cas7e) CP978_08940(cas7e)
STIR: DDW44_05810(cas7e)
SKA: CP970_05810(cas7e) CP970_06200(cas7e) CP970_40675
SGZ: C0216_31925(cas7e) C0216_32255(cas7e)
SSPO: DDQ41_20320(cas7e)
SCAV: CVT27_17030(cas7e)
SBY: H7H31_15310(cas7e)
SPLA: CP981_06445(cas7e)
SBRO: GQF42_00635(cas7e) GQF42_16095(cas7e)
STUI: GCM10017668_01830(cse4)
SHAR: HUT13_23205(cas7e)
SCAL: I6J39_23180(cas7e)
SMOB: J7W19_26275(cas7e)
SPEU: CGZ69_00430(cas7e)
SROI: IAG44_41715(cas7e)
SGJ: IAG43_34025(cas7e)
SDD: D9753_15865(cas7e)
SGOB: test1122_19690(cas7e)
SDEC: L3078_04305(cas7e)
STRI: C7M71_014555(cas7e) C7M71_022830(cas7e)
YIA: LO772_29520(cas7e)
MHOS: CXR34_16675(cas7e)
LVI: G7068_10615(cas7e)
LINS: G7067_03920(cas7e)
PSEV: USB125703_00977(casC)
AUL: DCC27_009025(cas7e)
BRZ: CFK38_03550(cas7e)
LMOI: VV02_03390
XYL: ET495_13740(cas7e)
XYA: ET471_16270(cas7e)
CFI: Celf_0518
CIRA: LFM56_01085(cas7e)
OEK: FFI11_005285(cas7e)
CACN: RN83_11105
TDF: H9L22_10430(cas7e)
THAO: NI17_006485(cas7e) NI17_019930(cas7e)
TALX: FOF52_06625(cas7e)
NDA: Ndas_1283
NAL: B005_5408
NGV: CDO52_19445(cas7e)
STRR: EKD16_00065(casC)
SAIU: J4H86_22630(cas7e) J4H86_22825(cas7e)
AGRA: AGRA3207_005513(cas7e) AGRA3207_007286(cas7e)
NCX: Nocox_35780(casC)
TBI: Tbis_1533
FAL: FRAAL0455
NML: Namu_3052
AMD: AMED_5810
AMN: RAM_29780
AMM: AMES_5732
AMZ: B737_5732
AORI: SD37_17435
SESP: BN6_19700
AHG: AHOG_15700(casC1) AHOG_20050(casC2) AHOG_20925(casC3) AHOG_21025(casC4) AHOG_23660(casC5)
ACTA: C1701_00590(cas7e) C1701_26250(cas7e)
ALO: CRK59253
MICH: FJK98_21620(cas7e)
MCAB: HXZ27_02580(cas7e)
MSAG: GCM10017556_16030(cse4)
MCRA: ID554_00785(cas7e)
PLK: CIK06_17155(cas7e)
NHY: JQS43_23435(cas7e)
CAI: Caci_3907
NAV: JQS30_06380(cas7e)
AHE: Arch_1757
APHO: JTE88_08720(cas7e)
TPYO: X956_08740
TPEC: HLG82_10155(cas7e)
ACTT: DDD63_01060(cas7e)
ACTO: C3V41_12120(cas7e)
ACTZ: CWT12_03205(cas7e)
AWE: JG540_03000(cas7e)
AREP: ID810_02875(cas7e)
FVG: I6G91_01035(cas7e)
BADL: BADO_1329
BANL: BLAC_07145
BAST: BAST_1432
BCAT: BBCT_1283
BANG: BBAG_1188
BSCA: BBSC_1930
GVG: HMPREF0421_20673(casC)
GVA: HMPREF0424_0762(casC)
AEY: CDG81_02000(cas7e) CDG81_13060(cas7e) CDG81_17990(cas7e)
EKE: EK0264_07830(cas7e)
AFO: Afer_0986
CYA: CYA_0732(cse4)
DEH: cbdbA1520
DMD: dcmb_1408
STI: Sthe_3435
TTR: Tter_1898
DGE: Dgeo_2632
DGO: DGo_PE0017(cse)
TRA: Trad_2308
TTJ: TTHB190(TTHB190)
TBC: A0O31_02502(casC)
TANT: KNN15_08010(cas7e)
MRB: Mrub_3016
PNL: PNK_1126(cas7)
VBL: L21SP4_02076(casC)
LBJ: LBJ_2451
LBL: LBL_0661
LST: LSS_15591
LMAY: DPV73_08645(cas7e)
LWL: FHG68_16865(cas7e)
CVL: J8C06_13385(cas7e)
SCOR: J3U87_27275(cas7e)
RMR: Rmar_0483
CTE: CT1975
PAA: Paes_1415
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MPL: Mpal_1605
RCI: RCIX1150
MARC: AR505_1092
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Reference
  Authors
Perez-Rodriguez R, Haitjema C, Huang Q, Nam KH, Bernardis S, Ke A, DeLisa MP
  Title
Envelope stress is a trigger of CRISPR RNA-mediated DNA silencing in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 79:584-99 (2011)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2010.07482.x
  Sequence
[eco:b2758]
LinkDB

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