Listeria innocua (serotype 6a): lin1064
Help
Entry
lin1064 CDS
T00067
Name
(GenBank) similar to autolysin (amidase)
Organism
lin
Listeria innocua (serotype 6a)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GW
Glucosaminidase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAC96295
Pasteur:
LIN01064
UniProt:
Q92CV7
LinkDB
All DBs
Position
1084046..1086370
Genome browser
AA seq
774 aa
AA seq
DB search
MINKKWMKIVMIPMLVVPMYGLTTVSGQLQNSLTGENSFVKDAQAATTASQQAFIDKIAP
AAQASQEKYHLLSSITLAQAILESGWGKSGLATQGYNLFGIKGKYNGQSVIMSTSEYVNG
EWIKIDAEFRKYPSWNESVTDHTLLLVNGTSWNKNLYKKVVDATDYKVAANELQKAGYAT
SPTYAASLIRVIETYDLAKYDVLYDKILTQKSTSGKATVTSPTGNGVWTLPYKVKGVQSV
SPASTYANKDIDLVSVATTKRGTYYQFKYNGKVIGWVDGKALTIYDSVNYDKVNVGRAKI
TSAPGNGIWSKPYNVYGREFVTNATTYAQQEIKLLREAQTAKGTYYQFSINNKTIGWIDK
RALTIYPYDSVISSKAVNLDGQITNPTGNGIWTKAYKLEGTTSVAQATQYANQDVKISEV
VETQHGTYYNISIGGRAIGWLDKNAITLYDQAEYNKAVTLDGTIKNVQGNAIWTEPYRTA
GTKLVAQAEKYANKDVQIVREAKTPRGTYYQFKSGGNVIGWLDVKAFDMYDEITSNKAVN
MEAVIENVEGNAVWTAPYKSVGVKLIGPASNYKDKTVKITREAQTSRGTYYEFSSNGKTV
GWLDKKAFKTYSTIEYDESYVRDAVVTNVSGHTVWTLPYQVYGVKSVGSASNYNNKQAKI
TRRAKTDRGIYYQFSIDGKNVGWLDERAFDVYDTVEYNNVINKTALLSNPTGNGIWSAPY
RVIGVKNVGQATSYANKTVQLVREAKTTRATYSQMSVDGKLIGWIDQRAFTNIR
NT seq
2325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaataaaaagtggatgaaaattgtaatgattccaatgctagttgtcccaatgtac
ggtttgacaactgtcagtggacaattacagaattcattaactggagaaaattcctttgtt
aaagacgctcaagctgcaacaacagcatcgcaacaagcgtttatagacaaaatagcacct
gctgcccaggcatctcaagaaaaatatcatctgttgtctagtataactttagctcaagca
attttagaatccggttgggggaaaagtggacttgctacacaaggatataatttatttggt
attaaaggaaagtacaatggacaatcagttatcatgtcaacctctgaatatgtgaatggt
gagtggattaagattgatgctgagttccgtaaatatcctagttggaacgaatctgtaact
gatcatacacttttattagtgaatggaacttcttggaataaaaacttatacaaaaaagta
gttgatgcaacagactataaagtagctgctaatgagctacaaaaagctggatatgcaaca
tctccaacttatgctgctagtttaatccgagtaattgaaacttatgatttagcaaaatat
gatgttttatacgacaaaattcttactcaaaaatccacttccggtaaagcgactgtaaca
agtccaacagggaatggtgtttggactctaccttataaagttaaaggtgtacaatctgtt
agtccagctagcacatacgctaacaaagatattgatttagtatctgttgctacaactaaa
agaggtacgtactatcaatttaaatataatggtaaagtaattggttgggtagatggaaaa
gcactgaccatatacgatagcgtcaattatgataaagtaaacgttggacgagctaagatt
acgagcgcacctggcaatggtatttggtctaaaccatacaatgtatatggacgagaattt
gtaaccaatgcaactacttatgcccaacaagaaataaaactcttacgtgaagcgcaaacc
gcaaaaggaacttattaccagtttagtattaacaataaaacaattggttggattgataaa
cgtgctttgactatctatccatatgattctgttatttctagcaaagctgttaaccttgat
ggacaaattactaacccaacaggaaacggtatttggacaaaagcatataaattagaaggc
acaacttctgtcgcccaggctactcaatatgctaaccaagatgttaaaattagtgaagtt
gttgaaactcaacatggtacttattacaatattagtatcggcggaagagcaatcggttgg
ttagataaaaatgcgattactctatatgaccaagctgagtacaataaagctgttacacta
gacggaactatcaaaaacgtacaaggtaatgctatttggacagaaccttatcggactgct
ggcacaaaattagtcgctcaagctgaaaaatatgccaacaaagatgttcaaattgtccgt
gaggcgaaaacaccaagaggaacttactaccaatttaaatcaggtggaaatgtgattggc
tggttagatgtaaaagcttttgatatgtatgatgaaataacttcgaacaaagctgtaaat
atggaagcagttattgaaaatgtcgagggaaatgctgtttggactgcaccttataagagt
gtaggtgtaaaactgattggtccagcaagtaattataaagataaaactgtcaaaataact
cgtgaagctcaaacaagtagaggaacatattatgaatttagctctaatggtaaaactgta
ggctggttagataagaaagcatttaaaacttatagtactatagaatatgatgaatcttat
gtacgtgatgcagttgtaacgaatgttagtggtcatactgtttggacattgccatatcaa
gtttatggtgtgaaatcagttgggtcagcatcaaactacaacaataaacaagctaaaatt
acaagacgtgctaaaacagatcgaggcatttattaccaattcagcattgatggtaaaaat
gtaggttggttggatgaaagagcttttgatgtctatgatacggtagaatacaataatgta
attaataaaactgcattattgagcaacccaacaggaaacggtatatggtcagcaccttat
agagttatcggtgttaagaatgtaggacaagctacctcatatgctaataaaaccgtgcaa
ttagttcgagaagcgaagacaactcgagcaacttactctcaaatgagcgtagatggtaaa
ctaattggttggattgaccaaagagcatttacgaatattagataa
DBGET
integrated database retrieval system