Lactobacillus johnsonii N6.2: T285_01460
Help
Entry
T285_01460 CDS
T02941
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
ljn
Lactobacillus johnsonii N6.2
Pathway
ljn03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ljn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
T285_01460
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ljn03400
]
T285_01460
Enzymes [BR:
ljn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
T285_01460
DNA repair and recombination proteins [BR:
ljn03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
T285_01460
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
TRCF
UvrB_inter
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
ResIII
UB2H
MFD_D3
CdvA
IstB_IS21
RecG_dom3_C
AAA_30
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHA96774
UniProt:
A0A7D9N4T7
LinkDB
All DBs
Position
315651..319148
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
