KEGG   Lacinutrix venerupis: BWR22_10365
Entry
BWR22_10365       CDS       T04680                                 
Name
(GenBank) ABC transporter
  KO
K18889  ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
lvn  Lacinutrix venerupis
Pathway
lvn02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lvn00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    BWR22_10365
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:lvn02000]
    BWR22_10365
Transporters [BR:lvn02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    BWR22_10365
SSDB
Motif
Pfam: ABC_membrane ABC_tran SMC_N AAA_21 AAA_29 nSTAND3 DUF5906 DUF87 RsgA_GTPase DUF2207_C AAA_22 AAA_23 DEAD AAA_18
Other DBs
NCBI-ProteinID: APY00697
LinkDB
Position
2281971..2283728
AA seq 585 aa
MKELQHLNKYFLKYKKQLIIGILITIISMLFKIYVPKLIGSIIDIVNNQLQNPENSISDF
KQELLNNILLIIGTAIIAGILTFFMRQYIINVSRYIEFDLKNEIYQQYQKLSLNFYKKNR
TGDLMNRISEDVTQVRMYAGPAIMYSINTITLFIVALAFMFKQAPTLTLYTIIPLPILSV
LIYLISKEIHKRSTIVQEYLSKLSTFTQEAFSGISVIKAYGIEPQTQADFTTLAYTSKEK
QLSLVRIQAFFFPMMILLIGISNILVIYIGGMQYINGEISLGNIMEFIIYVNMLTWPVAT
VGWVTSIIQRAEASQKRINEFLKIEPEIKNNTIEPSIIKGNIEFKNVYFTYDDTNIKALK
GLSFKLNSGETLAIVGKTGSGKSTILDLIGRLYDINKGQLLIDNKEIDQLNLTSLRDAIG
YVPQDAFLFSDTINNNIKFGKENATDEEVIAAAKNAQVHKNISKFTNGYQTVLGERGITL
SGGQKQRVSIARAIVKNPQILLFDDCLSAVDTETEEKILNNLKKVSAGKTTIIVSHRISS
AKNADHIIVLDDGKIVQKGTHNQLINIDGYYKELYIKQMSENYTN
NT seq 1758 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagaattacagcaccttaacaaatatttcttaaaatataaaaagcaattaataatt
ggtattttaattacaattatatctatgctttttaaaatttatgttcctaaattaattggt
tctattatagatattgtaaacaaccaattacaaaatcctgaaaactcaatttcagatttt
aagcaagaacttttaaataatattttattaattattggtactgcaattatagcaggtatt
cttactttttttatgcgtcaatatattattaacgtatcgagatatatagaattcgattta
aaaaatgaaatttaccaacagtaccaaaaactctctttaaatttttataaaaaaaataga
acaggagatttaatgaatagaataagtgaggacgtaacacaggtaagaatgtatgccgga
cctgcaattatgtatagtataaataccattacactttttatagtggctttggcttttatg
tttaaacaagcacctactttaacgttatacactataattccgcttcctattctatcggtt
ttaatttatttaattagtaaagaaatacataaacgtagtacaatagttcaagagtattta
tctaaactttcaacatttactcaagaagcttttagtggtatttcggtaattaaagcttac
ggtatagaaccacaaacacaggcagattttactacgcttgcttacacaagtaaagagaaa
caacttagtttagtacgcattcaagcgttcttttttccaatgatgattttactaattggt
attagtaatattctagttatttacattggtggtatgcagtatataaatggtgaaatttct
ctaggtaatattatggagtttattatatatgtaaacatgttaacttggcctgttgctaca
gttggttgggtaacctctattattcaacgtgctgaggcttcgcaaaagagaattaatgag
tttttaaaaattgaaccagaaattaaaaacaacacaatagaaccttctataattaaaggt
aatattgaatttaaaaatgtttattttacttacgacgatactaatattaaagcattaaaa
gggttaagttttaaattaaactctggtgaaactttagctatagttggtaaaacaggctct
ggtaaatctaccattttagatttaataggcagattgtatgatattaataaaggtcaatta
ttaatcgataataaagaaatagaccaattaaacttaacaagtttaagagacgctattggt
tatgtaccacaagatgcctttttgtttagcgacaccataaataataatattaaatttggt
aaagaaaatgcaacagacgaagaggtaattgctgctgcaaaaaacgcccaagtacataaa
aacatttcaaaatttacaaatggataccaaacagttttaggagaacgtggtattacttta
tctggcggacaaaaacaaagagtgtctattgctagagcaatagttaaaaatccacaaata
ttattatttgacgattgtctttctgcagtagatacagaaacagaagaaaaaatacttaac
aatcttaaaaaagtttcggctggtaaaacaactataatagtaagtcatcgcatttcttca
gctaaaaatgcagaccatattatagtactagacgatggaaaaattgttcaaaaaggaaca
cacaatcaacttataaacattgatggttactacaaagaactctatattaaacaaatgagt
gaaaattatactaattaa

DBGET integrated database retrieval system