Miniphocaeibacter halophilus: JFY71_09555
Help
Entry
JFY71_09555 CDS
T08075
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
mhap
Miniphocaeibacter halophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_30
E1_UFD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQK07531
UniProt:
A0A7T7ALY4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1920427..1921773)
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MFFKELLNLTTLKIQKNNVKINNEIIHIKTNNFIDNENTLNIIDGNSFNKLKDVKGNYLI
YNCNKEISLNQNINYIVTNLDNCYEIVDIVNECLYKHNNFLFLVYDIIANNRGIDELLKI
FKKEYNSNVCILSNNKKLVYNIFDFNKVNDIFSLKISKKASSRVFGYLAFENVDEKLHDS
IDKVSGITSIYIYTCINEFINSKDKFYDTLKNLSLNNFTDEDAQILKIINWNINDQYKLY
NLKLEGGLFKYRDMFVHGNKFILDYPMYLYSIIVNNNLLILLNESNLNSDKIKTNIQNYI
DKYNLDYSTIYLRKNLLNFYKAYELTKYIIDNNLNIKENIDLNLDKLIFSMSLSNDFIEM
AIPEEVIALKNYDKDKNSELLKTLYYYLIEERSLIKASKQMDVHRNSIVYRINKVNELVD
IDLEKSTSRQNILIALEILDKLNPGLIK
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttcaaagaattgttaaatttaactacacttaaaatacaaaaaaataatgtaaaa
attaataatgaaataattcatattaagaccaataattttatagataatgaaaatacatta
aatattattgatggaaattcctttaataaattaaaggatgtaaaaggtaattatttaatt
tataattgtaataaagaaatttctttaaaccaaaatatcaattacattgttacaaattta
gataattgttatgaaattgtagatattgttaatgaatgcttatataaacataataatttt
ctttttctagtatatgatattattgcgaataataggggaattgatgaattattaaaaatt
tttaaaaaagaatacaattcaaatgtatgtatcctaagcaacaataaaaaattagtttat
aatatttttgattttaataaggttaatgatatattctcccttaaaatatcgaaaaaagca
tcatctcgtgtttttggatatttagcttttgaaaatgttgatgaaaaactacacgatagc
atagacaaggtaagtggaataacttccatatatatatatacttgcataaatgaatttatt
aacagtaaggataagttttatgatacattaaaaaatttatctttaaataattttactgat
gaagatgcacagattttaaaaattattaattggaatataaatgatcaatataaactatat
aatttaaaattagaaggcggtcttttcaaatatagggatatgtttgttcatggcaataaa
tttatactagattaccctatgtacctatattctataatcgtaaataataatcttcttatt
ttattaaatgaatctaatttaaatagcgacaaaataaaaaccaacatacaaaattatatt
gataagtataatcttgattattctacaatatatttgagaaaaaatttattaaatttctat
aaagcctatgaacttactaaatatattatagataataatttaaatattaaagagaatata
gatttaaatttagataaattaatattctccatgtcactttccaatgattttattgaaatg
gctatacccgaagaggttattgctttaaaaaactatgataaagataaaaattcagaatta
ttaaaaaccctatattactatttaattgaagaaaggtctttaattaaggcatctaaacaa
atggatgttcacagaaactctatagtgtacagaattaacaaagttaatgaacttgtagat
atagaccttgaaaaatcaacttctaggcaaaatattttaatcgccttagaaatactagat
aaattaaatccaggattaataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system