Mannheimia haemolytica 89010807N: WC39_10435
Help
Entry
WC39_10435 CDS
T03749
Name
(GenBank) AT family autotransporter/adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
mhaq
Mannheimia haemolytica 89010807N
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mhaq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mhaq02000
]
WC39_10435
Transporters [BR:
mhaq02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
WC39_10435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_stalk
YadA_anchor
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKA12068
UniProt:
A0A547ERK7
LinkDB
All DBs
Position
2057818..2061969
Genome browser
AA seq
1383 aa
AA seq
DB search
MNKIYRIVWNHAKRTWIVASELSRSANKSNATNTSLTTNIIKLSTLSLALSAGFASAATY
SPTYGTIPDNNPQTSIAIGDGSKVNSTLVSTITGLEGNSGKVSTALGYNTTATADFSTAL
GGFANASFASTAVGGQATADKRSVAVGYNATAMGLREVFIGDHAGLNHSNSTEYNIGIGY
SASSNVTGNNTISIGNTAGDGTSGSHNIAIGTYANAKLAGPTTNVTSDDNIAIGNSALAN
GVNNYKTTAATGETVIGKATAVGSHANATGIVSSAYGAEANATAIHSTAIGAKSQANGDN
STAIGYEAKTSGHGATSLGYYANATANLTTAVGTNAGATSDYASAFGREANASGGSATAL
GNRATASGAASVALGVSAKATNQRTIAIGESSNASAFNATAIGRNATAEHTDSIALGSNS
VTAIAIPTTNATVNGITYSDFAGTNPIATVSIGAEGKERTITNVAAGRISLSSTDTINGS
QLYLTQQAIGNVAATTANILGGGAAVTENGNITFPTYALVNGTPDADKEGKQGRYTTVSA
ALSALNTAVISPLTFAGDTGTNFERHLGSTVKIKGGSTGILTENNIGVVADGNSTLTIKL
AEKVNLGANGSLTTGDTVVNNTGITIANGVADKPVSLTKSGLDNGGNKIANVAAGDVDTD
AVNVSQLKQAISKFATHYVSISDDGIQRANYDNSGSSGVNPMAIGVATSANGELATALGS
EAEANGERTTAVGPRATADGMNATSIGYNANANATNALAVGSAANANADTSTAIGTASTA
TATRATALGSKSEATGENSTAVGYEASSIGADSLAAGYNANASGTQSTALGNSANAGGIW
STSVGRNANAAGSSAIALGNSANAAGVASIALGVSSQATTTAAVALGQNAKATHQGSVAL
GTNSETVATVATKSATLNGNTYTFAGTTPSSTVSIGSVGNERTLTNVAAGRILDSSTDAI
NGSQLYAAYTEIDGLNTKVNELSNGALTFVDDAGTEIVRKLGTSLNVKGGADATILTDNN
IGVVATDANTLTVKLAKDIDLTPAGSVAVGNSKLNNNGLTINNGPSVTMTGVDAGKLKIT
NVADGDISPISADAVNGSQLYDTANTIATALGGNSSVNANGAVSAPSYTVVDGAPTNEVS
KTVNNVGSAITALNDAVTSPLTFAGDTGTPSQRKLGSTVTVKGGVSNESQLTDNNIGVIS
NGNGSLTVKLAKDIKVNSVTAQTVTANIAVADTVKTGDTTIDTNGLTIVGGPSITKTGIN
AAGTKVTNVKAGTEDTDAVNFSQLKATEKNINNKINNIDSKVNKVDKRLRAGIAGATATA
GLPQAYLPGKSMLATAGDTYRNEAAIAVGYSRISDNGKVIYKLTGNSNTRGDFGGSIGMG
YQW
NT seq
4152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatttatcgcattgtttggaaccatgcaaaacgaacttggattgttgcttct
gaattatcaagaagtgctaataaatctaatgcaacaaatacatcactaaccactaatatt
attaaactcagcacactaagtcttgcgctttctgcaggttttgcaagtgctgcaacctat
tcaccaacctatgggaccataccagataataacccacaaacatctatcgcaattggtgat
ggatctaaagttaactcaacactagtaagcacaataacaggcttagaaggaaatagcggt
aaagtttctacagcattagggtataacacaaccgcgacagccgatttttcaactgcatta
ggaggctttgctaacgctagttttgcttcaacagctgttggtgggcaagccactgccgat
aaacgttccgtagcagtagggtacaatgcaaccgcaatgggcttacgtgaagtttttatt
ggcgatcatgccggattaaatcactctaacagcacagaatacaatattggtattggttat
tcggctagctctaatgtaacaggaaacaatacgatttctattggtaatactgctggagac
ggtactagtggtagccacaatattgcaattggtacttatgctaatgcaaaactagcagga
cctactacaaatgtaaccagtgatgataatatcgccatcggtaattccgctcttgcaaat
ggtgttaataattacaaaactacagcagcaacaggagaaacggtaataggaaaagcaact
gctgtaggtagtcatgccaatgcaactggtattgttagctccgcctatggtgctgaagct
aacgcaacagctattcactccacagcaattggtgcaaaatctcaagcaaatggcgataac
tcaacagcaattggttatgaagcgaagacttcaggccacggtgcaacctcattaggttat
tatgcaaatgcaacagcaaatttaactactgctgttggtactaatgcgggtgcaaccagc
gattatgcttctgcatttggtcgtgaagccaatgcaagtggaggttctgcaaccgcttta
ggcaatcgtgctactgcatcaggcgcggcttctgttgcactaggggtaagcgctaaagca
acaaatcaacgcacaattgcaatcggagaatcatcaaatgcttccgcctttaatgcaacc
gctataggtcgaaatgccactgctgaacataccgattcgatagcgctaggtagcaactca
gttacagctatagccataccaactacaaatgcaactgtaaatggtattacatatagtgac
tttgctggaacaaatccaattgctacagtaagtattggggcggaaggcaaagagagaact
atcaccaatgttgctgcaggacgtatatctttaagctctacagataccataaacggttca
caattatatttaacacaacaagctataggtaatgttgctgcaacaaccgcaaatatctta
ggtggtggggcagctgttactgaaaatggaaatatcactttcccaacctacgctttagtg
aatggcacaccagatgcagataaagaaggcaaacaagggagatacactactgtttctgca
gcactaagcgcattaaacacagcggtgatcagtccgttaacctttgccggtgatacagga
actaattttgagcgccatctaggttcaacagtcaagatcaaaggcggatctacaggcata
ttaaccgagaataatattggtgttgtagctgatggcaatagtactttaaccataaaatta
gcagaaaaagttaacttaggcgctaatggttcattaacaacaggtgataccgttgttaac
aatacaggtatcaccatcgctaacggcgttgcagacaaaccggtaagtcttactaaatct
ggcttagataatggcggtaataaaatcgccaatgttgccgcaggcgatgtagatactgat
gcggtcaatgtcagtcaactcaaacaagctatcagcaaatttgcaactcattatgttagt
atttcagatgatggcattcaacgtgctaactatgataattcaggctctagcggtgttaat
ccaatggctatcggcgttgcaacaagtgctaatggtgagctggcaaccgcattaggctct
gaagcagaagcaaacggtgaacgtacaactgcagttggtcctcgcgcaacagctgatggt
atgaatgccacttctataggctacaatgcgaatgcaaatgcaacaaatgccctcgcggtt
ggttctgcagccaatgcaaatgctgatacctcaacagctattggtacagcttcaacagcg
acagctacccgtgcaactgcattaggctctaaatctgaagctaccggtgaaaattcaacc
gctgtaggttatgaagcaagttcaatcggtgcagattctcttgctgcaggctataacgca
aatgcttcgggtacacagtcaaccgctttaggtaactctgctaatgcaggtggaatatgg
tcaacttctgtgggtagaaatgccaatgctgcaggtagctctgcgattgctttaggtaat
agtgcaaatgcagccggtgtagcttctattgcattaggtgtttcatcacaagcaacaaca
actgctgcagtggctcttggccaaaatgcaaaagcaacacaccaaggttctgttgcatta
ggtactaactctgaaacagtagccacagttgcaacaaaaagtgcaacgctaaatggcaat
acatacacatttgcaggtactacgccaagctcaactgtaagtattggttctgtaggcaat
gaacgtactttaacgaatgttgcagcaggtcgtattttggactcatcaacggatgctatc
aacggttcacaactttatgctgcttataccgaaattgatggtttaaacacgaaagtgaat
gagttaagtaatggagcacttacttttgtagatgatgctggtactgaaattgttcgtaaa
ttaggtacttctctgaatgttaaaggtggggccgatgcaaccatattgactgataataat
atcggtgtagtggcaacagatgctaacacattaacagttaaattagcgaaagacattgat
ttaactcctgccggctccgtagctgttggtaattcaaaactaaataacaacggcttaacc
attaataatggcccaagtgtcacaatgacaggtgtcgatgctggcaaattaaaaataact
aatgtagctgatggtgatatttcacctatctcagcagatgcagttaatggtagccaactt
tacgatacggcaaatactattgctaccgctttaggtggtaattcaagtgtaaatgcaaat
ggtgctgtttcagccccaagctatactgtggttgatggcgctcctacaaatgaagttagt
aaaacggtcaataatgtaggctctgcaattactgcgttaaatgatgcagtaaccagccca
ctaacatttgcaggtgataccggcacgccatctcaacgtaaattaggttctactgttaca
gtaaaaggtggggtatctaacgaatcacaactaactgataataatatcggggttatttca
aatggtaatggttcattaacggttaaattagctaaagatattaaagttaattctgtcaca
gctcaaacagtaacagctaacattgctgtagccgatactgttaagactggtgatacaacc
attgatactaatggattaactattgtagggggaccgagtataactaaaacaggtattaat
gcagcaggaacaaaagtgactaacgtaaaagcaggaactgaagatactgatgcagttaac
tttagccaattaaaagcaacagaaaaaaatatcaataataagatcaataatattgattca
aaagtaaacaaagttgataaacgtttacgcgctggtattgctggtgcaactgcaaccgca
ggtttaccgcaagcatatctaccaggtaaaagtatgttagcaacggctggagatacatac
cgtaatgaagctgcaatcgcagtaggttattctcggatttcagataacgggaaggttatc
tataaattaactggtaacagcaataccagaggcgactttggtggtagtattggcatgggt
tatcaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system