Mycoplasma mobile: MMOB6180
Help
Entry
MMOB6180 CDS
T00176
Name
(GenBank) predicted hydrolase
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mmo
Mycoplasma mobile
Pathway
mmo03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MMOB6180
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmo03019
]
MMOB6180
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmo03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MMOB6180
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
Lactamase_B
Lactamase_B_2
RMMBL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAT28104
UniProt:
Q6KH27
LinkDB
All DBs
Position
762117..763931
Genome browser
AA seq
604 aa
AA seq
DB search
MQPTKLFGLGGVQEIGKSTFVLEHNKKIFIIDAGIKFADSFTTGIKGIIPDYSYLKANQD
NIQALFITHGHEDHIGGIPYLVATVKISKIFAPKIAIQFLKLKFQEHNILQKIEFIEIEK
DSIHKFGDVVVDFWTAQHSIPDAFGIRFKTSNGTVLFTGDFRFDYRPIGNFTDFSKIEQM
GKEGVTVLLSDSTNAMRPMHSPSETDILNDIKKYILEAKGKTIITAFASNLTRITAIIKL
VAEIGKKVVAFGRSMVNGIEIGRKLDYIDVEDSVFIDKKHLKNYEDNEIVILTTGSQGEQ
MAALSRMANKKHPQIDIKSGDMIIFSSSPIPGNRIQIELLINKLYKFGAEIKENKIDGYL
HTSGHAYKEEHIKIFNLTKPKYFLPYHGEYRMAIAHGNTGIETGIKEENVMIPGIGDVYY
MKNNEVWLSDEKLDLNSTFIDGQNILTINKEVFNDRSQLGESGFVDVVIAIDKSKNNVTF
KPKIISRGCFYARNSVELLEDVRNLVRSSVVYLIKNKKDWTVPDIKQIVEDRLKPYFYKA
KRRKPIIITSVLFVDEINDSIENTQPKKSNFKKKNKTSDKNPNKKTKDKTSNEDDLDFDY
DGLD
NT seq
1815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaacctactaaactatttggtcttggaggagtgcaagaaataggtaaatcaactttt
gttttagaacataacaaaaagatttttatcattgatgcaggaattaaattcgctgatagc
tttactacaggaattaaaggaattattcctgattattcttatctaaaagcaaatcaagat
aacattcaagccttatttattactcatggtcatgaagatcatattggtggaataccttat
ttagtcgcaactgttaaaatttcaaaaatttttgctcctaaaattgcaattcaattttta
aaattgaaatttcaagaacacaacattttgcaaaaaattgaatttattgaaattgaaaaa
gatagtattcataaattcggagatgttgttgttgatttttgaacagctcaacattcaatt
cctgatgcttttggaataaggtttaaaacaagtaatggaactgtattatttacaggtgat
tttaggtttgactatcgtccaattggaaactttacagattttagtaaaattgagcaaatg
ggaaaggaaggagttactgttttattaagtgattctactaatgctatgagaccaatgcat
tcaccaagtgaaactgatattttaaatgacattaaaaaatatattttagaagctaaagga
aaaactatcattacagcttttgcttctaatttaacaagaattacagcaattattaaatta
gtggctgaaattgggaaaaaagttgttgcttttggaagaagtatggtcaatggaattgaa
ataggaagaaaattagattatatcgatgtcgaagactctgtttttattgataaaaaacat
ttaaaaaattatgaagacaatgaaattgttattttaacaacaggttctcaaggagagcaa
atggctgctttatcaagaatggccaacaaaaaacaccctcaaatcgatattaaaagtgga
gatatgattatttttagttcaagtccaattccgggaaatagaattcaaattgaactcttg
attaataaattgtataaatttggggctgagattaaagaaaataagattgatggatacttg
catacttcaggccacgcttataaagaagaacatatcaaaatttttaacttaactaaacct
aaatattttttaccttatcatggtgagtatcgtatggcaattgctcatggtaatacagga
attgaaacaggaattaaagaagaaaatgtcatgattcctggaattggtgatgtttattat
atgaaaaataatgaggtttggttatctgatgaaaaattagatttaaattcaacttttatt
gatggtcaaaatattttaacaattaataaagaggtttttaatgatcgttctcaattagga
gaaagtggttttgtcgatgttgtaatcgcaattgataaatctaaaaataatgttaccttt
aaacctaaaattatttcaagaggatgtttttatgcaagaaattcagttgaattacttgaa
gatgtaagaaatttggtcagaagttcggtagtttacctaattaaaaataaaaaagattga
actgttccagatatcaagcaaattgttgaagatagattgaaaccttatttttacaaagca
aaaagaagaaaacctattattattacttctgttctttttgtggatgaaataaatgattca
attgaaaatacacagccaaaaaaatctaattttaaaaagaaaaataaaacttctgataaa
aatccaaacaaaaagacaaaagataaaacttctaatgaagatgatttagattttgattac
gatggattagattaa
DBGET
integrated database retrieval system